DNA分子标记鉴定蔬菜作物种子纯度的原理分析

对ＤＮＡ分子标记鉴定蔬菜作物种子纯度的原理进行了分析。结果认为,鉴定种子纯度以ＲＡＰＤ技术为宜。ＲＡＰＤ标记鉴定常规品种种子纯度研究中,应选择目标品种Ａ的ＲＡＰＤ图谱中出现而其它常规品种（一般５￣１０个为宜）中不出现的ＤＡＮ谱带作为鉴定纯度用的特异谱带;鉴定杂交Ｆ１品种时,应将母本有,父本无、,Ｆ１有的ＤＮＡ谱带和母本元,父本有,Ｆ１有的ＤＮＡ谱带作为特异谱带,并且在实践鉴定中二者必须联合使用。     

中国3大主产棉区棉花品种遗传多样性的RAPD及其与农艺性状关系的研究

 选择我国３大主产棉区不同年代有代表性的３０个陆地棉棉花品种，利用ＲＡＰＤ标记进行棉花品种之间分子标记遗传差异的研究。利用 Ｊａｃｃａｒｄ遗传相似系数计算了 ３０个品种的ＲＡＰＤ数据的遗传距离矩阵，按ＵＰＧ－ＭＡ方法进行聚类，发现３０个棉花品种之间的遗传距离在０．０５～１．５８之间。聚类分析表明，３０个棉花品种可分为３组，品种间的遗传关系与品种自身的系谱有关，大多数品种的遗传基础比较狭窄。同时，１９９９年的田间试验调查了３０个品种的１５个农艺性状。并对农艺性状数据和ＲＡＰＤ数据形成的树状图进行了初步比较，二者的相关系数为０．７６，达显著水平，并且二者获得的聚类结果是相似的，这一研究的遗传距离和遗传相似系数为育种者进行亲本选择和品种遗传变异评价提供了理论依据。     

利用RAPD标记鉴定豌豆栽培品种(P.sativum)和野生种(P.fulvum)

随机扩增多聚链ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）是基于聚合酶反应链（ＰＣＲ）的扩增反应。笔者应用ＲＡＰＤ技术区别Ｐ．ｓａｔｉｖｕｍ和Ｐ．ｆｕｌ－ｖｕｍ１２个品（种）系,并估测这些品（种）系之间的遗传多样性,用１２个１０－ｍｅｒ核苷酸引物扩增出１６８条染色带。估测遗传类型中遗传相似性是基于扩增产品中成对方法比较,遗传树的构建是利用无重量成组方法的平均数（ＵＰＭＧＡ）进行的。７个Ｐ．ｓａｔｉｖｕｍ栽培品种和５个Ｐ．ｆｕｌｖｕｍ材料群集为截然不同的两大组。ＲＡＰＤ的应用将为育种提供豌豆种间遗传关系资料。ＲＡＰＤ－ＰＣＲ鉴定出的物种特殊的强染色体带可以发展为稳定的物种特殊标记用于基因渗入研究。     

引物及RAPD标记数对芥菜变种聚类分析的影响

利用ＲＡＰＤ标记对１６个芥菜变种的遗传关系进行研究,并在ＵＰＧＡ聚类分析的基础上建立了亲缘关系系统树图和利用不同的引物数和不同的ＲＡＰＤ标记数对芥菜进行聚类分析。结果表明,聚类结果基本一致。即都可将１６个芥菜变种划分为３组：Ｃ组只有茎瘤芥１个变种,Ａ组和Ｂ组的变种数则略有差异。说明少至２种引物的扩增产物（２７个ＲＡＰＤ标记）也能基本反映１６个芥菜变种间的遗传关系。但随着引物数和ＲＡＰＤ标记数的减少,１６个芥菜变种间的平均遗传距离递减,即从１９种引物、２４０个ＲＡＰＤ标记的７．３４减少到２种引物、２７个ＲＡＰＤ标记的２．３４。而遗传距离的变小,使划分芥菜变种的亲缘关系更加困难。因此,在利用ＲＡＰＤ技术研究芥菜变种间的遗传关系时,有必要保证一定数量的引物和ＲＡＰＤ标记。     

芸薹种蔬菜遗传多样性的RAPD初步分析

本文对芸薹种蔬菜基因组ＤＮＡ进行了ＲＡＰＤ初步分析,并就ＲＡＰＤ－ＰＣＲ反应条件的优化进行了探讨。结果表明：各个亚种或变种的品种之间存在着丰富的遗传多样性。     

大豆育种过程中亲子遗传关系的RAPD研究初报

试验以组合８００２４×中１９亲本及其育成品系Ｂ_１，Ｂ_２为材料，用ＲＡＰＤ技术对其亲子关系进行了研究．１０个随机引物（１０ｂｐｓｅ）的ＰＣＲ扩增结果表明，双亲在遗传上有较大差异，母本８００２４有１３条特征带，父本中１９有６条特征带．其在子代中能够重组，使Ｂ_１，Ｂ_２均具有双亲ＲＡＰＤ标记的特征．但经过多代选择，双亲ＲＡＰＤ特征在育成的子代品系中的分布是不均衡的．Ｂ_１更多地继承了母本８００２４的绝大部分ＲＡＰＤ特征，遗传上更近于母本．Ｂ_２则表现出倾向于父本．这一结果与田间观察结果基本一致，说明用ＲＡＰＤ追踪育种过程，探讨亲子遗传关系是可行的．另外，试验观察到子代品系在继承双亲ＲＡＰＤ特征的同时，还出现了新的子代所特有的ＲＡＰＤ特征．产生这种超亲ＲＡＰＤ特征的真实原因及其意义有待进一步研究．     

家蚕的RAPD及其品种间差异

采用ＲＡＰＤ技术对家蚕基因组ＤＮＡ进行多态性研究，分析了各供试品种材料之间的遗传差异。结果表明，ＲＡＰＤ能反映各基因组之间丰富的多态性，聚类分析所得的各供试品种材料之间的亲缘关系和常规遗传分析的结论相一致。因此，认为ＲＡＰＤ可以作为家蚕分类及系统学研究的一种方法。     

RAPD标记在日本兵库县20个酒米品种类群划分中的应用

应用ＲＡＰＤ分子标记对日本兵库县２０个酒米品种的类群进行了研究。筛选出对不同基因型酒米品种ＤＮＡ扩增具有较好多态性的引物１１个,它们分别是Ａ０２、Ａ０８、Ｂ１８、Ｃ１５、Ｄ０３、Ｄ０８、Ｇ０５、Ｍ１１、Ｑ１６、Ｓ１３和Ｔ０６。根据这些随机引物对不同品种总ＤＮＡ具有特性性的扩增谱带,建立不同品种的ＲＡＰＤ多态性标准模式图,可以快速鉴别品种和进行纯度分析;依据扩增谱带建立０、１型数据,计算２０个酒米品     

家蚕的RAPD及其品种间差异

采用ＲＡＰＤ技术对家蚕基因组ＤＮＡ进行多态性研究，分析了各供试品种材料之间的遗传差异。结果表明，ＲＡＰＤ能反映各基因组之间丰富的多态性，聚类分析所得的各供试品种材料之间的亲缘关系和常规遗传分析的结论相一致。因此，认为ＲＡＰＤ可以作为家蚕分类及系统学研究的一种方法．     

甘薯体细胞胚胎发生遗传变异的RAPD分析

以“郑红５”等６个甘薯品种为材料,通过离体培养诱导体细胞胚胎发生与植株再生。利用ＲＡＰＤ分子标记方法,在ＤＮＡ水平上分析甘薯品种间遗传差异以及体细胞胚胎无性系的遗传变异。筛选了４５个随机引物,其中７个引物ＰＣＲ扩增后在品种间和体细胞胚胎无性系中表现ＲＡＰＤ多态性,并在相应胚性愈伤组织中检测到少数ＲＡＰＤ变异位点。证明利用ＲＡＰＤ分子标记方法鉴定甘薯体细胞胚胎发生遗传变异的可行性,以及为通过离体培养     

百合种质资源遗传多样性及亲缘关系的RAPD分析

以百合新鲜鳞叶为材料,利用RAPD分子标记技术对16份不同生态型的百合种质的遗传多样性和亲缘关系进行了分析.研究结果表明,从120条随机引物中筛选出35条有效引物,共得到769个扩增位点,其中628个位点具有多态性,占81.7%.UPGMA聚类分析结果表明.16份百合种质在阀值为0.9407处分为2个聚类群,即百合科两个不同属的植物:百合属和大百合属;阈值为0.5790处,百合属被分为3个不同的种:百合、卷丹和细叶百合.聚类结果和亲缘关系分析表明不同供试百合之间的遗传多样性较高,亲缘关系较远,且各种质遗传距离与地理距离具有一定的相关性.     

枇杷品种早钟6号与解放钟、森尾早生亲缘关系的RAPD分析

应用43个随机引物对早钟6号、解放钟和森尾早生3个枇杷品种基因组DNA进行RAPD分析,共得到255条扩增带,其中82条为共同带,单态率达32.16%,表明3个品种亲缘关系密切.对子代与父、母本扩增带中共同带的分析表明,双亲的RAPD特征均在子代中表现.用引物S71进行RAPD分析,3个品种共检测出7条扩增带,其中780bp的条带是母本解放钟的特征带,1500bp的条带是父本森尾早生的特征带,在子代早钟6号中这两条特征带同时存在,且结果稳定,在DNA水平上证实了早钟6号是解放钟、森尾早生的有性杂交后代.     

应用RAPD技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系

为了对红叶李Prunus cerasifera cv.Atropurpurea,李P.salicina和杏P.armeniaca的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据,也为了验证传统的形态学分类方法,从132个随机引物中筛选出20个引物对红叶李、李和杏的8个材料进行了基因组DNA扩增,均具有多态性,共扩增出264条带,平均每个引物产生13.2个RAPD片段.RAPD带型及聚类分析表明:RAPD技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开,红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系,各属品种之间都有不同的遗传距离,证明RAPD技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA指纹,可将参试的各品种鉴别出来,从而说明了RAPD技术能够用于种或品种之间的鉴定.图2表2参12     

应用RAPD 技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系

为了对红叶李Prunus cerasifera cv .Atropurpurea , 李P .salicina 和杏P .armeniaca 的亲缘关系、品种识别及资源保存提供分子生物学依据, 也为了验证传统的形态学分类方法,从132 个随机引物中筛选出20 个引物对红叶李、李和杏的8 个材料进行了基因组DNA 扩增,均具有多态性, 共扩增出264 条带, 平均每个引物产生13.2 个RAPD 片段。RAPD 带型及聚类分析表明:RAPD 技术能将红叶李、李属植物和杏属植物完全分开, 红叶李、李和杏之间表现出一定的亲缘关系, 各属品种之间都有不同的遗传距离, 证明RAPD 技术可作为种和属水平的分类鉴定依据;利用红叶李、李和杏品种的特异谱带结合DNA 指纹, 可将参试的各品种鉴别出来, 从而说明了RAPD 技术能够用于种或品种之间的鉴定。图2 表2 参12     

24个荸荠品种遗传多样性RAPD分析

[目的]从分子水平上了解不同地区荸荠地方品种的亲缘关系及遗传多样性,为荸荠品种资源研究和选育提供理论依据.[方法]利用RAPD分子标记技术,对24个不同地区荸荠地方品种进行遗传多样性及聚类分析.[结果]从100条RAPD引物筛选出条带清晰、多态性理想的引物15条,共扩增出83条清晰带,其中多态性带为61条,多态性比例为73.5%.24个荸荠地方品种间的遗传距离为0.0976~0.6757,平均为0 3048;UPGMA聚类分析可将24份荸荠品种分为5组,其中第4组又可分为两个亚组,野生荸荠单独归为一亚组.[结论]24份荸荠品种的遗传基础相对较狭窄,亲缘关系较近,但部分不同地区栽培品种之间仍存在一定的遗传差异性.     

杏RAPD两种凝胶电泳指纹特点及PCR扩增片段的序列分析

为更好地将RAPD技术应用于杏品种资源鉴定及遗传基础的研究,文章首次在选用11碱基长度引物的优化技术体系基础上,分别使用两种凝胶对16个杏品种RAPD的PCR扩增产物进行电泳检测与DNA指纹比较。结果表明,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量均高于琼脂糖凝胶,前者不存在或很少存在共迁移性的现象。根据两种电泳系统获得的标记信息对16个杏品种的遗传关系的分析发现,两者聚类结果存在一定差异。以此,提出了科学利用两种电泳的RAPD标记技术的策略。对随机挑选的24个片段进行克隆与测序,结果发现24个片段都是对应引物的RAPD扩增产物。在不同的11条序列中有3条是编码蛋白的基因片段,说明了RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可以扩增编码蛋白的基因片段,能够较全面客观地反映不同杏品种间遗传上的差异。     

新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析

[目的]探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据.[方法]采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究.[结果]14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图.ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质.[结论]两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据.     

Analysis of the Germplasm Resources and Genetic Relationships Among Hybrid Cymbidium Cultivars and Native Species with RAPD Markers

The random amplified polymorphic DNA （RAPD） marker was assessed to detect the genetic relationships among 48 hybrid Cymbidium cultivars from Japan, Korea, China, and USA, and 2 species of native Cymbidium. Twenty primers were screened from 100 random decamer primers, and a total of 258 DNA bands were amplified, 253 of which （98.1%） were polymorphic. The average number of polymorphic DNA bands amplified by each primer was 12.6. All cultivars were distinguishable when a number of primers were considered. Genetic similarities among the cultivars and species were estimated based on the amount of band sharing ranging from 0.364-0.817 with an average of 0.581. According to the data, a dendrogram of genetic relationship, which was constructed using the UPGMA method, showed that all the tested cultivars and native species were classified into five cluster groups with the similarity coefficient of 0.592. It revealed that the genetic relationships among tested accessions were to some extent related with their origin, flower colour, branch type, and genealogy. It further indicated that the RAPD technique is a useful tool for studying the genetic relationships among hybrid Cymbidium cultivars.     

应用RAPD标记技术研究大花蕙兰种质资源亲缘关系

利用RAPD标记技术对来自2个企业的18个大花蕙兰品种进行了检测。结果表明：从50个10碱基随机引物中筛选出15个多态性高、重复性好的引物,共扩增出92条DNA条带,其中90条为多态性带,占97.8%,平均每个引物扩增多态性带6条。18个种质之间的相似系数变化范围为0.1975～0.6704,平均相似系数为0.4761;遗传距离变化范围为0.3296～0.8025,平均遗传距离0.5239。基于RAPD的扩增结果建立了UPGMA亲缘关系聚类图,18份种质在遗传距离0.5239处被划分为4个类群。供试的18份种质间的遗传亲缘关系与其花色和花枝类型存在一定的相关性。     

东北地区野生百合遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD标记对中国东北地区6种3变种共34份野生百合试材的遗传多样性进行研究.筛选12个随机引物对其总DNA进行扩增,共扩增出101条带,其中83条带具多态性,多态性比率为82.1%,平均每个引物扩增出6.9条多态性谱带.基于 RAPD标记,利用 UPGMA构建了聚类树状图,34份野生百合资源的Nei&Li相异系数介于 0.013 7与0.601 3 之间.结果表明,中国东北地区野生百合具有丰富的遗传多样性,聚类树状图将34份试材分为2大类,第1类包括细叶百合和垂花百合,共5份试材,第2类包括卷丹、毛百合、有斑百合、大花百合、大花卷丹、朝鲜百合和东北百合,共29份试材;卷丹与有斑百合的亲缘关系较近,而与同为卷瓣组的朝鲜百合、细叶百合、大花卷丹等亲缘关系较远.细叶百合与垂花百合亲缘关系较近.