一个常染色体显性遗传视网膜色素变性家系疾病基因排除性定位分析

目的 确定一个常染色体显性遗传视网膜色素变性(autosomal dominantret initis pigmentosa,ADRP)家系中的疾病基因与3号染色体视紫红质基因的关系。方法 选择一个连续5代发病的ADRP家系,采集到该家系中16个正常个体、18个受累个体的血样。选取3号染色体上的14对用6-FAM、HEX、NED3种荧光染料标记的微卫星标记DNA引物,对该家系进行连锁分析。结果 3号染色体上的14对微卫星NDA标记位点的LOD值均≤-2,证实3号染色体上的14对微卫星标记DNA位点与该家系致病基因不连锁。结论 该家系的致病基因位于其他染色体上。     

汉族常染色体显性视网膜色素变性一家系的连锁分析及突变筛查

背景 原发性视网膜色素变性(RP)有明显的遗传异质性和表型异质性,目前已确定的致病基因较多,确定患病家系的致病基因是进行基因治疗的基础. 目的 对患常染色体显性遗传性RP(ADRP)的一个汉族家系进行致病基因的定位和基因突变分析.方法 此家系的5代21名成员纳入研究,包括12例ADRP患者和9名表型正常者.12例患者进一步接受中心视野、间接检眼镜、眼电图(EOG)、视网膜电图(ERG)检查.对22个已知的ADRP致病基因所在染色体位点进行连锁分析,以确定该家系与疾病连锁的染色体区域,随后对该区域附近的候选基因视紫红质(RHO)进行直接测序评估其突变情况. 结果 间接检眼镜检查该家系先证者眼底表现符合原发性RP表现,EOG和ERG表现为波形记录不到,视野呈向心性缩小.两点连锁分析结果显示,该家系致病基因位点与遗传标记D3S1292连锁,在θ=0.0时得到最大优势对数(LOD)值为3.6671.候选的RHO基因直接测序结果发现,该家系所有患者第53位密码子的第2个核苷酸均出现了C→G的突变,致其氨基酸由脯氨酸变为精氨酸(Pro53Arg),而该家系正常成员中未发现此突变. 结论 RHO基因的错义突变Pro53Arg与RP疾病出现共分离现象,可确定为该ADRP家系的致病基因.     

常染色体显性视网膜色素变性家系基因定位的研究与视紫红质基因突变的检测分析

对一常染色体显性视网膜色素变性 (autosomaldominantretinitispigmentosa ,ADRP)大家系进行基因定位 ,并检测该家系12名患者的视紫红质基因是否存在突变。方法 :采用多个已知位点的遗传标记对该ADRP家系进行连锁分析 ,确定致病基因的大致染色体位置 ;在所定位的染色体区域将RHO基因作为侯选基因进行直接测序检测突变。结果 :连锁分析结果发现遗传标记D3S12 92 ,当θ =0 1时有最大Lod值 =2 732 85 2 ,因此考虑该家系致病基因位于D3S12 92附近。直接测序结果发现该家系中大部分患者在RHO基因的第 3外显子序列 ,第 182密码子的第 2个碱基发生G→A置换突变 ,导致甘氨酸 (Gly)变为天冬氨酸 (Asp) ,命名为Gly -182 -Asp突变 ,而在 2例患者中则未发现突变 ;同时 ,在该家系正常成员以及正常对照者中均未发现此突变。结论 :ADRP存在分子水平的遗传异质性 ,某些ADRP是由于RHO基因突变所致。但是由于本研究所涉及的ADRP家系中尚有2名患者未找到RHO基因突变 ,故不能将Gly -182 -Asp突变认为是该家系的致病原因。在D3S12 92与RHO基因之间可能存在新的基因 ,还需进一步研究证明。     

先天性广泛眼外肌纤维化综合征一家系临床表型及基因连锁定位分析

目的 分析一个先天性广泛眼外肌纤维化综合征(CFEOM)家系的临床表型，并通过连锁分析方法来定位该家系的致病基因。方法 对家系中的所有患者进行临床检查。根据目前已知的两种常染色体显性遗传类型的CFEOM的遗传学位点12p11．2-q12(FEOM1)和16q24(FEOM3)选取微卫星进行连锁分析研究。结果 家系中4名患者具有典型的CFEOM表现。连锁分析显示，微卫星D12S59、D12S1048、D12S1648在所有患者中与疾病呈现共分离现象，其中D12S1048最大Lod值为1．91，而在微卫星D12S61和D12S1090处出现重组，表明该家系的致病基因位于这两个微卫星之间。结论此家系属常染色体显性遗传的CFEOM 1型，其致病基因定位于12p11．2-q12的D12S61和D12S1090之间。     

常染色体显性视网膜色素变性家系的基因连锁定位和候选基因的序列分析

目的对一常染色体显性视网膜色素变性（RP）家系进行致病基因的连锁定位，并对候选基因进行序列分析。方法在家系中进行全基因组扫描以确定与疾病连锁的染色体区域，对该区域附近的候选基因进行直接序列分析。结果此家系致病基因的最小可能区域（MCR）被定位于19号染色体微卫星标记D19S246和D19S601之间不到5厘摩（cM）的区域。对该区域附近的候选基因进行直接序列分析的结果并未发现致病性基因突变。结论CRX（锥杆细胞同源基因）和PRPF3l基因是该家系的非致病性基因，在19号染色体上可能存在导致常染色体显性视网膜色素变性（adRP）的新的致病基因。     

我国人睑裂狭小综合征患者FOXL2基因突变检测

目的研究分析我国人睑裂狭小综合征（BPES）两家系及6例散发病例的基因突变。方法选取染色体3q区域5个微卫星位点D3S3696、D3S1549、D3S3586、D3S1764和D3S1744进行家系连锁分析,应用聚合酶链反应（PER）和DNA测序技术对提示连锁的染色体区域内候选基因FOXL2进行突变筛查。结果家系连锁分析,将致病基因定位在3q23区D3S3696至D3S1744之间9．88cM范围,其中位点D3S1549、D3S3586的LOD最大值为2．11（θ=0．00）,D3S1764为1．51（θ=0．00）;对FOXL2基因突变筛查发现,2例散发患者有909—938dup30重复突变,1例散发患者有1041-1042insC移码突变,但两个家系中无突变。结论两个家系与3q23区域的D3S1549、D3S3586和D3S1764位点存在连锁。首次在散发患者中发现两种FOXL2基因突变,其中909—938dup30突变被认为是BPES综合征FOXL2基因两大突变热点之一。尚未发现突变的家系,其致病机制可能与FOXL2基因周围的位置效应,或是与提示连锁的3q23区域内其他基因相关。（中华眼科杂志,2006,42：409-414）     

中国人常染色体遗传的病理性近视基因定位

目的在中国人群中进行病理性近视致病基因的定位。方法1个12人的病理性近视家系（患者7名）经过研究人员告知,同意参加本研究。从每个家系成员静脉血中提取DNA,选取覆盖全基因组的330对高度杂合的微卫星DNA引物,进行基因组扫描;以常染色体显性遗传为模式,基因频率0．0133和外显率100％的条件下,运用Linkage软件进行二点连锁分析,运用Genehunter软件进行多点连锁分析。标记位点之间的遗传距离根据Genethon连锁图谱来确定。基于最低重组率原则,用cyanic软件构建单倍型。结果二点连锁分析发现15号染色体长臂上存在与病理性近视密切连锁的位点。在重组率为0的情况下,最大对数优势记分（LOD）值1．76出现在D15S1010,D15S1007和D15S1042位点;多点连锁分析也支持这个区域内存在连锁,最大NIL值为5．16。单倍型分析把这个近视眼位点局限在15q12-13上D15S1019和D15S146之间大约12cM的区间内。在已知的近视眼相关位点,包括18p11．31,12q21-23,7q36,17q21-22,4q22-q27,2q37．1,15q15-21,12q13．11-13．2,6p21．3,1q21-31,1p21和21q22．3,均没有发现明确的连锁证据。结论在15q12-13可能存在一个新的近视眼基因位点。在这个区域内至少有94个已知的基因,因此有必要对此区域进行测序寻找致病基因,这个新的基因位点的发现也证实了病理性近视存在很强的遗传异质性。     

*常染色体显性先天性缝合状白内障家系致病基因的定位

目的对我国一常染色体显性先天性缝合状白内障家系进行致病基因的定位。方法采集家系成员外周静脉血提取基因组DNA。选用美国Applied Biosystems公司提供的约400个遗传标记物进行基因扫描。数据经Linkage软件包进行连锁分析,初步确定致病基因所在染色体区域。在阳性区域内选取更高密度的荧光标记物进行精细扫描,用Cyrillic软件进行单体型分析。结果两点间连锁分析在D3S1279处获得最大对数优势记分（LOD）值Zmax=2．32（θmax=0．00）。通过精细扫描和单体型分析将致病基因定位于D3S1267和D3S1614之间约38．6厘摩（cM）区域内。结论先天性缝合状白内障家系的致病基因位于3号染色体3q21．1-q26．2约38．6cM区域内。（中华腥科杂志,2006,42：908—912）     

视网膜色素变性显性遗传家系3号染色体连锁分析

目的：用连锁分析法对三个显性视网膜色素变性家系(CY、WN、ZH)3号染色体进行分析，确定致病基因。方法：随机选取3号染色体视紫红质(rhodopsin，RH0)基因上下约5厘摩(centimorgan cM)范围内的6对微卫星标记(marker)，确立单倍体型，用两点法计算最大优势对数(LOD SCORE)值。结果：所选微卫星标记与CY、WN家系表型间LOD值呈负相关关系，而ZH家系与位点D3S3606间LOD值为2．52。结论：RH0基因为CY、WN家系的非候选基因，RHO基因可能是家系ZF致病基因。     

我国常染色体显性遗传视网膜色素变性家系中PRPF31基因新的剪切位点突变

目的　研究我国一个4代常染色体显性遗传视网膜色素变性(RP)家系患者的致病基因突变位点及临床表型特征。方法　对RP家系中的所有患者进行眼部及视觉电生理检查;对全部家系成员进行全基因组扫描及连锁分析, 对候选基因直接测序并通过限制性内切酶反应证实突变位点。结果　RP家系患者致病基因定位于染色体带19q13 4,微卫星标记物D19S589和D19S254之间不到4Mb区域。在所有患者的PRPF31基因内含子8的第一个碱基处发现一新的杂合突变(G>C),使内含子8的剪切供体由GT变为CT。RP家系患者的临床表型符合早期发病且弥漫型的RP患者类型。结论　我国该4代RP家系中的患者由PRPF31基因中一新的剪切位点的杂合突变致病(IVS8+1G>C)。     

常染色体显性视网膜色素变性家系视紫红质基因突变的检测分析

目的 观察一个常染色体显性视网膜色素变性(autosomal dominant retinitis pigmentosa,ADRP)家系的视紫红质(rhodopsin,RHO)基因突变特征。 方法 抽取20个ADRP家系成员外周血3～5 ml并提取DNA；聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增RHO基因第1～5外显子基因片段, 用直接测序法对20个DNA样本进行RHO基因突变检测。 结果 该家系中10例ADRP患者的RHO基因的第182密码子发生G→A置换突变(Gly-182-Asp)，而在2例患者和8个未患病家系成员中均未发现此突变。 结论 Gly-182-Asp突变不一定是ADRP家系的致病原因;在RHO基因附近可能存在新的基因, 但还需要进一步研究证明。 (中华眼底病杂志, 2002, 18: 256-258)     

先天性前极白内障家系致病基因的定位与候选基因突变检测

目的 对中国一常染色体显性遗传先天性前极白内障家系进行致病基因的定位与候选基因突变检测.方法 采集家系成员外周静脉血,提取基因组DNA.选用ABI公司提供的约400个遗传标记物进行基因扫描.基因扫描分初步扫描和精细扫描两步进行.首先对已报道的先天性白内障候选区域进行初步扫描,之后在阳性区域内进行精细扫描.数据经连锁分析,初步确定致病基因所在染色体区域.在阳性区域内选取更高密度的荧光标记物进行精细扫描,并进行单体型分析.候选基因直接测序检测基因突变.结果 两点间连锁分析在微卫星标记D21S1252处获得最大对数优势计分(LOD)值Zmax=3.23(θmax=0.00).精细定位和单体型分析将致病基因定位于微卫星标记D21S263和D21S266之间,遗传距离约18.47厘摩(cM),染色体位置为21q22.11-q22.3.候选基因直接测序发现CRYAA基因第3外显子第347碱基一个G→A的点突变.结论 本研究将一中国先天性前极白内障家系的致病基因定位于21号染色体21q22.11-q22.3区域内,并在CRYAA基因发现一个点突变与此家系共分离.

Abstract：

Objective To map the gene mutation responsible for autosomal dominant inherited congenital anterior polar cataract in a Chinese family. Methods Peripheral blood samples were collected from the members in this congenital cataract family. DNA was extracted from the blood samples. A genescan was performed using approximately 400 microsatellite markers (ABI). Linkage analysis was processed to define the region of mutated gene. High density primers labeled with fluorescent stain for the positive region were adopted for fine targeting and haplotype analysis was performed. Mutation detection was carried out by sequencing candidate genes. Results The maximum two-point LOD score was obtained at D21S1252,Zmax = 3. 23 ( θmax = 0. 00). After fine targeting and haplotype analysis,the mutated gene was located within a 18. 47 cM region between D21S263 and D21S266 on chromosome 21q22.11 -q22.3. Direct sequencing of the candidate gene revealed a G→ A transition in exon 3 of CRYAA. Conclusion The present study has identified a missense mutation in CRYAA associated with congenital anterior polar cataract in a Chinese family.     

常染色体显性遗传视网膜色素变性患者视紫红质基因突变的研究

目的探讨常染色体显性遗传型视网膜色素变性(autosomal dominant retinitis pigmentosa,ADRP)患者视紫红质(rhodopsin,RHO)基因是否存在突变。方法应用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增RHO第1、5外显子基因片段，以限制性核酸内切酶酶切消化技术检测38个ADRP家系的57名患者和60名正常对照者RHO第58、347密码子的突变。结果1个ADRP家系的4名患者第58密码子发生点突变，另2个ADRP家系的6名患者第347密码子也出现点突变，而对照者未发现上述两种突变。结论ADRP存在分子水平的遗传异质性，某些ADRP是由于RHO基因突变所致。(中华眼底病杂志,1998,14:108-110)     

Expression of the TIGR gene in the iris,ciliary body,and trabecular meshwork of the human eye

Purpose: To identify mutations in the rhodopsin ( RHO ) gene in Chinese patients with autosomal dominant retinitis pigmentosa (ADRP) and to measure the prevalence rate of RHO mutations in Chinese ADRP cases. Methods: Thirteen Chinese families with ADRP were clinically characterized. The complete coding region and intron splice sites of RHO were analyzed for mutations with single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis and direct genomic sequencing. Results: One of the 13 Chinese families with ADRP was found to have a new, previously unidentified RHO mutation, a change from GAG to TAG at codon 341. The mutation (E341X) results in an in-frame stop codon, leading to the truncation of the rhodopsin protein. Mutation E341X was not detected in 100 normal control individuals. Patients carrying mutation E341X reported night blindness and showed optic atrophy, vessel attenuation, and a few bone spicule-like pigments in peripheral retina at the age of 23–25 years. At the age of 30 years, visual acuity was severely impaired, peripheral visual field was greatly constricted, rod and cone ERG was not detectable, and only a slight left cone response remained. Conclusion: We have identified a novel rhodopsin mutation (E341X) in a Chinese family with ADRP. The location and character of the mutation expand the spectrum of RHO mutations causing RP. Identification of a RHO mutation in one of the 13 ADRP families studied suggests that only 7.7% of the ADRP cases in a Chinese population were caused by RHO mutations, a ratio significantly lower than that from North America or Europe.     

Assignment of the rhodopsin gene to human chromosome three, region 3q21-3q24 by in situ hybridization studies

By Southern analysis of restriction digests of genomic DNA from human-mouse somatic cell hybrids, we recently assigned the rhodopsin gene to human chromosome 3. Using in situ hybridization techniques and a mouse rhodopsin cDNA probe, we now show that the rhodopsin gene is on the long end of human chromosome 3 at region 3q21-3q24.     

Locus for autosomal recessive nonsyndromic persistent hyperplastic primary vitreous

PURPOSE: To map the disease locus in a six-generation, consanguineous Pakistani family affected by nonsyndromic autosomal recessive persistent hyperplastic primary vitreous (arPHPV). All affected individuals had peripheral anterior synechiae and corneal opacities with variable degrees of cataract and a retrolenticular white mass behind the lens. METHODS: Genomic DNA from family members was typed for alleles at more than 400 known polymorphic genetic markers, by polymerase chain reaction. Alleles were assigned to individuals, which allowed calculation of lod scores. RESULTS: A maximum two-point lod score of 4.07 was obtained with marker D10S1225 with no recombination. Two recombinations with marker D10S208 and D10S537 localized the disease within a region of approximately 30 centimorgans (cM). However, homozygosity across the region refined the arPHPV locus to 13 cM. CONCLUSIONS: Linkage analysis shows localization of nonsyndromic arPHPV to chromosome10q11-q21.     

Molecular biological study of the rhodopsin gene in Japanese patients with autosomal dominant retinitis pigmentosa]

The author analyzed codon 347 of the rhodopsin gene using PCR (polymerase chain reaction) amplification and restriction enzymes in 19 unrelated Japanese families including 28 patients with autosomal dominant retinitis pigmentosa (ADRP). An allele of codon 347 mutation was found in a family (father and daughter). Sequence analysis shows that the mutation is from CCG to CTG. This mutation appears to be the cause of one form of ADRP, since it was also found in Japanese cases of ADRP which have a different racial background from families reported by Dryja et al.