FoxO3 基因在膀胱癌中的表达、功能富集和信号通路生物信息学分析

目的:探讨叉头盒状O转录因子3(FoxO3)在膀胱癌中表达、相关生物学功能和信号通路以及与患者生存期的关系。方法:分析癌症基因组图谱数据库(TCGA)中膀胱癌患者的癌组织和正常膀胱组织中FoxO3基因表达水平。STRING数据库构建FoxO3基因相关蛋白-蛋白相互作用网络,对网络中的基因进行聚类分析,并采用cytoscape筛选网络中的关键基因。采用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对FoxO3和相关基因进行功能富集。Cox回归模型构建生存曲线,比较FoxO3高低表达组患者的总生存期(OS)和无疾病进展生存期(DFS)有无差异。结果:FoxO3表达水平在膀胱癌组织中表达水平显著低于对应的正常膀胱组织(P0.05),而FoxO3表达水平在不同临床分期膀胱癌患者的癌组织中无明显差异(P0.05)。FoxO3蛋白-蛋白相互作用网络中共有51个蛋白和587个相互作用关,各蛋白平均相互作用指数为23,网络中各个蛋白富集明显(P1-16)。FoxO3基因表达与FoxO3B基因表达呈正相关(r=0.94,P0.05),而与TIMM16基因表达呈负相关(r=–0.43,P0.05)。FoxO3低表达组膀胱癌患者的总生存期(HR=1.4,P=0.029)和无疾病进展生存期(HR=1.5, P=0.015)显著高于高表达组。结论:FoxO3在膀胱癌患者肿瘤组织中表达水平明显下调,且FoxO3低表达与患者的预后不良有关。     

Snail 基因mRNA 与结肠癌患者预后的生物信息学分析

目的:探讨Snail 在结直肠癌中的表达及其与患者预后的关系。方法:应用生物信息分析工具比对TCGA 数据库中Snail 基因mRNA 在结直肠癌组织和癌旁组织中的表达水平；在STRING 数据库中构建Snail 蛋白- 蛋白相互作用网络，并对相关蛋白功能和KEGG 信号通路进行富集。同时，回顾性分析我院69 例手术治疗的结直肠癌患者资料，根据Snail 表达水平分为高、低表达组，比较两组患者总生存期(OS)和无疾病进展生存期(DFS)的差异。采用免疫组织化学法检测患者癌组织中Snail 蛋白表达水平及其与患者临床病理特征的关系。结果:结直肠癌组织Snail 基因mRNA 表达水平明显高于癌旁组织；PDGFB 基因与Snail 呈正相关(r =0.624, P <0.05)，SLC44A4 基因与Snail 呈负相关(r = – 0.48, P <0.05)。Snail 基因在生物学过程、细胞成分和分子功能方面分别富集于组蛋白H4 脱乙酰化、ESC/E(Z)复合体和NAD 依赖性组蛋白脱乙酰酶活性(H3-K14 特异性)。KEGG 信号通路富集于肿瘤相关信号通路、Notch 信号通路、Wnt 信号通路和结直肠癌相关信号通路等。生存分析显示，Snail 高表达患者的OS 低于低表达患者(HR=1.6, P <0.05)，而Snail 高、低表达患者的DFS 差异无统计学意义(P >0.05)。Snail 蛋白在结肠癌组织中的表达率为59.2%(41/69)。Snail 蛋白高表达者在肿瘤分化程度、淋巴结转移、淋巴管侵犯率、Dukes 分期等方面均差于低表达者，差异有统计学意义。结论:Snail 基因在结直肠癌患者癌组织中表达水平上调，并可作为结直肠癌预后不良的分子标志物。     

基于生物信息学的CDK1在肺腺癌中的表达及其意义

目的通过生物信息学方法分析细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)在肺腺癌中的表达及其临床意义。方法基于癌症基因组图谱计划(TCGA)中肺腺癌患者基因表达数据分析CDK1在肺腺癌组织和正常肺组织差异表达情况,使用UALCAN分析肺腺癌中CDK1基因在不同角度下的表达差异。利用Kaplan-Meier Plotter进行肺腺癌中CDK1基因高低表达组不同情况下的生存分析。基于TCGA中肺腺癌临床数据进行CDK1表达量与总生存期的相关性Cox分析。对临床病例中与CDK1表达相关的基因序列进行基因富集分析。经STRING获取CDK1来自智人的蛋白相互作用网络。获取CDK1相关基因蛋白,通过在线网站GEPIA进行相关分析。结果基于对TCGA基因表达数据分析可知CDK1在肺腺癌中表达高于正常肺组织。通过UALCAN分析发现CDK1高表达与吸烟可能有一定的相关性。生存分析提示当CDK1基因高表达时,肺腺癌患者预后较差。将CDK1的表达量与总生存期进行单因素和多因素Cox回归分析示,CDK1高表达是肺腺癌患者生存期的独立危险因素(P=0.00)。进行基因富集分析可知CDK1高表达与DNA复制、细胞周期、癌症通路、p53信号通路密切相关。结论CDK1可能是一种潜在的肺腺癌预后相关的分子标志物。此外,DNA复制、细胞周期、癌症通路、p53信号通路可能与肺腺癌中的CDK1调节有关。     

CCNB1在原发性肝癌中的表达及临床意义

目的 探究细胞周期蛋白B1（CyclinB1,CCNB1）在原发性肝癌中的表达及临床意义。方法 从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库下载正常肝组织和肝癌组织中的CCNB1 mRNA二代测序数据及相应的临床病理资料,比较CCNB1 mRNA在肝癌及正常肝组织中的表达差异,同 时分析其表达水平与肝癌患者临床病理学特征及预后的关系,采用Cox回归法分析影响肝癌预后的危险 因素,利用生物信息学方法进行CCNB1共表达基因的GO和KECC富集分析。结果 CCNB1 mRNA在肝 癌组织中表达量明显高于正常肝组织（P＜0.001）;CCNB1 mRNA高表达与肝癌患者种族（P=0.005）、甲胎 蛋白（AFP）表达水平（P＜0.0001）、病理分级（P＜0.0001）、血管侵袭（P＜0.0001）等显著相关,CCNB1 mRNA高表达组肝癌患者总生存期（overall survival,OS）（P=0.0015）和无病生存期（disease-free survival, DFS）（P=0.0004）短于 CCNB1 mRNA低表达组,差异有统计学意义。CCNB1 mRNA表达水平是影响肝癌 患者OS（HR 1.544,95%CI 1.052～2.266,P=0.027）和 DFS（HR 1.793,95%CI 1.277～2.517,P=0.001）的 独立危险因素。富集分析提示CCNB1共表达基因主要富集于细胞增殖、细胞周期、有丝分裂细胞周期的 G1/S转换、有丝分裂细胞周期的G2/M转换等功能及细胞周期调控、p53信号通路等通路。结论 CCNB1 在原发性肝癌组织中表达上调,其异常表达水平可能成为潜在的评估肝癌患者预后的生物标志物。     

谷胱甘肽过氧化物酶1在肝癌组织中的表达及其意义的生物信息学分析

目的:通过生物信息学的方法分析谷胱甘肽过氧化物酶1(GPX1)在肝癌组织中的表达及意义。方法:从Ualcan数据库获取正常肝组织及原发性肝癌组织GPX1表达数据,在LinkedOmics中检索GPX1的共表达基因,并通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因的参与的生物学过程及功能,利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络。最后利用GEPIA数据库分析GPX1表达与肝癌患者预后的关系。结果:与正常肝组织比较,不同分期(IV期除外)、不同年龄患者肝癌组织中GPX1表达水平均明显升高,且男性肝癌患者肝癌组织中GPX1表达明显高于女性患者(均P0.05)。GPX1共表达基因主要参与基因转录、翻译、蛋白泛素化、蛋白质磺酰化、mRNA稳定性调节、蛋白酶体复合体、线粒体翻译等分子生物学过程,并参与TGF-β、mTOR、WNT、MAPK、HIF-1α、NF-κB、VEGF、Notch等信号通路及各种癌症疾病通路。10个肝癌相关基因编码的蛋白与GPX1所编码的蛋白存在互作关系。GPX1高表达患者的总生存率、无病生存率均明显低于GPX1低表达患者(P=0.048、P=0.035)。结论:GPX1在肝癌组织中高表达,且与肝癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为肝癌筛选、预后预测的标志物之一。     

结直肠癌预后分子标志物WNT10B及WNT家族对结直肠癌的影响

目的:探讨WNT10B对结直肠癌预后的影响和分子机制以及WNT家族对结直肠癌进展的影响。方法:采用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)中结直肠癌与癌旁47对样本的m RNA表达数据分析WNT家族差异表达基因,对差异基因501例结直肠癌样本进行总生存期和无复发生存期的生存分析,并对预后有影响的基因进行年龄、性别、临床分期的多因素校正预后分析及临床病理特征的相关性分析,最后进行基因富集分析(GSEA)确定分子通路。结果:WNT家族中的WNT2、WNT2B、WNT3、WNT5A、WNT5B、WNT6、WNT9A、WNT10A、WNT10B和WNT16共10个基因在癌与癌旁组织差异有统计学意义(P0.01),其中WNT5A和WNT10B对于总生存期有显著影响(P0.05),WNT10A和WNT10B对于无复发生存期有显著影响(P0.01);WNT10B校正年龄、性别、临床分期之后,对总生存期(P=0.003)和无复发生存期(P=0.08)影响仍然有统计学意义;WNT10B表达水平与患者肿瘤大小、淋巴结转移有关(P0.05),与其他临床病理特征无关(P0.05);神经活性的配体-受体相互作用信号通路和细胞黏附分子通路可能是WNT10B影响结直肠癌预后的重要分子通路。结论:WNT家族对于结直肠癌的进展有重要的影响,其中WNT10B对于总生存期和无复发生存期影响显著,可以作为结直肠癌诊断和预后的分子标志物。     

尿苷二磷酸-葡萄糖6-脱氢酶在胰腺癌组织中表达及其意义的生物信息学分析

背景与目的:尿苷二磷酸-葡萄糖6-脱氢酶(UGDH)是一种将UDP-葡萄糖转化为UDP-葡萄糖醛酸的代谢酶,通过参与糖胺聚糖在肿瘤组织中的生物合成来影响肿瘤的侵袭能力和耐药性。多项研究表明UGDH基因参与多种癌症的发生与发展,然而,目前尚无胰腺癌中关于UGDH基因的研究,因此本研究应用生物信息学方法研究UGDH在胰腺癌中的表达及其意义。方法:基于Oncomine数据库分析4个数据集中胰腺癌组织中UGDH基因的差异表达;对TCGA中胰腺癌基因表达谱和生存数据进行生存分析。基于UALCAN数据库,分析TCGA中胰腺癌UGDH基因与其他基因的表达相关性,使用Pearson系数法,获得其明显正相关与负相关的基因,分别进行GO与KEGG通路富集分析。基于HGNC数据库提供的人类所有基因的注释,提取胰腺癌中所有mRNA的表达谱,利用GSEA分析软件,进行UGDH基因在胰腺癌中的基因基富集分析;利用GeneMANIA对UGDH基因进行单基因PPI网络分析,并进一步对网络中出现的基因用Metascape进行功能富集分析,用Cytoscape的MCODE插件对网络进行关键子网络分析。结果:UGDH基因在胰腺癌组织中的表达明显上调;UGDH低表达患者较UGDH高表患者总生存率升高、生存期更长(均P<0.05)。GO富集分析发现,UGDH及其共表达基因富集于内膜系统、RNA定位、蛋白酶体蛋白分解代谢过程、核质转运、核酸运输等与癌症相关生物学过程;KEGG通路富集分析显示,差异基因显著富集于内质网蛋白加工、自噬、泛素介导的蛋白水解、蛋白质输出、剪接体、RNA转运、mRNA监测通路、病毒致癌作用、长期抑制作用、结直肠癌、N-聚糖的生物合成、胰腺癌通路、鞘脂信号通路、癌症中的蛋白聚糖、肾细胞癌、人类巨细胞病毒感染、乙肝等癌症相关通路。GSEA分析富集于泛素介导的蛋白水解作用、氨基糖和核苷酸糖代谢、氨酰生物合成、卵母细胞减数分裂、肾细胞癌、基础转录因子、鞘脂类代谢、ErbB信号通路、黏附连接、慢性粒细胞白血病、RIG-I样受体信号传导通路、促性腺激素释放激素信号通路、胰岛素信号通路、子宫内膜癌、神经胶质瘤、神经营养蛋白信号通路、内吞作用、MAPK信号通路、胰腺癌等癌症相关通路。PPI预测及关键子网络分析显示,HGS、UBE2V1、MAT2A、SUMO1在互作网络中有重要作用。结论:UGDH基因在胰腺癌组织中表达上调,且与胰腺癌发生发展及预后密切相关,本研究结果可能为今后胰腺癌发病机制及分子靶向治疗的研究提供重要线索和依据。     

乳腺癌中垂体瘤转化基因1对免疫浸润的影响及其预后价值

背景与目的 垂体瘤转化基因1（PTTG1）是一种癌基因,在多种肿瘤中高表达,可作为癌症侵袭转移的生物标志物。然而,PTTG1在乳腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系并不清楚。本研究旨在研究乳腺癌中PTTG1的表达与患者预后的关系及其对免疫细胞浸润的影响,并初步探讨PTTG1在乳腺癌发生发展中的可能作用机制。方法 利用Oncomine 4.5数据库和Kaplan-Meier Plotter数据库分析乳腺癌组织中PTTG1的表达情况及其预测患者预后的价值。Coexpedia筛选出PTTG1的共表达基因,并通过GO数据库和KEGG数据库分析其共表达基因富集的通路情况。TIMER数据库用于分析乳腺癌中PTTG1基因表达水平与免疫细胞浸润的关系。采用multiMiR的R语言包预测与PTTG1及其共表达基因相互作用的microRNA,并使用Cytoscape进行网络可视化。结果 PTTG1在乳腺癌组织中表达明显升高,且高表达PTTG1患者的预后明显差于低表达PTTG1的患者（P<0.001）。乳腺癌中PTTG1基因及其共表达基因集GO功能主要富集在核分裂、细胞器分离及染色体分离上,KEGG通路富集则集中在细胞周期、减数分裂、人类T淋巴细胞白血病病毒Ⅰ型（HTLV-1）感染和p53信号转导通路上。PTTG1的表达水平与CD4+ Th1细胞（r=0.490,P=3.52e-61）、CD4+ Th2细胞（r=0.765,P=3.7e-192）、巨噬细胞（r=0.308,P=2.8e-23）、B细胞（r=0.228,P=3.69e-13）和中性粒细胞（r=0.121,P=1.27e-04）的浸润水平呈明显正相关,与CD8+T细胞浸润水平呈明显负相关（r=-0.198,P=3.16e-10）。用multiMiR R语言数据包分析发现共有17个共同靶向PTTG1及其共表达基因的microRNA。结论 PTTG1在乳腺癌组织高表达并与患者的不良预后相关,PTTG1在乳腺癌中的表达水平与免疫浸润密切相关。PTTG1高表达可能通过调控细胞周期和p53信号通路而使得肿瘤增殖和侵袭能力增强,进而导致乳腺癌的不良预后。PTTG1可能在乳腺癌中发挥癌基因的作用,提示PTTG1可以作为乳腺癌潜在的诊断和预后标记物。     

通过目标区域DNA甲基化测序对隐源性肝癌差异性DNA甲基化谱的研究

目的本研究通过高通量目标区域DNA甲基化测序技术,获得并分析隐源性肝癌(Cryptogenic hepatocellular carcinomas,CR-HCC)与癌旁正常肝组织的差异性甲基化谱,探索引起隐源性肝癌发生的表观遗传学机制。方法我们使用SureSelectXT人甲基化测序系统(SureSelectXT Methyl-Seq Target Enrichment System)对安徽医科大学第一附属医院2017年1月至2018年5月行肝癌切除术的3例患者的肝癌及癌旁非癌组织进行了目标区域DNA甲基化测序(targeted DNA methylation sequencing),并进行生物信息分析。结果两种组织间筛选出1729个差异甲基化区域(Differentially methylated region, DMR)。通过基因注释获得DMR相关基因(DMG)2091个,其中TIRAP TFAP2A, CTTN, USP18, ICAM5 MAP3K6等均可能参与隐源性肝癌的发生。DMG的GO富集分析表明,高甲基化DMG主要富集于:RNA代谢过程的调控(P=6.60E-12)、基因表达调控(P=7.54E-12)和细胞黏附(P=3.87E-08)等项。低甲基化DMGs主要富集于蛋白结合(P=1.21E-13)、细胞外配体门控离子通道活性(P=4.75E-05)、细胞骨架蛋白结合(P=1.55E-02)等。DMR相关基因KEGG富集通路分析表明,高甲基化DMGs富集通路包括:Rap1信号通路(P=1.41E-02)、调控干细胞多能性的信号通路(P=1.26E-02)以及雌激素信号通路(P=5.91E-03)等,而低甲基化DMGs富集通路包括:癌症中蛋白聚糖(P=5.04E-03)、钙信号通路(P=7.79E-03)等通路。结论隐源性肝癌组织与癌旁组织间存在差异性DNA甲基化,其相关基因在相关通路中明显富集,为进一步研究隐源性肝癌的表观遗传机制提供线索与依据。     

PARP1表达在预测结直肠癌总体生存中的作用

目的 探讨PARP1的表达水平与结直肠癌预后的关系。方法 从基因表达综合数据库（GEO）和癌症基因图谱（TCGA）数据库下载PARP1基因的RNA-Seq数据,使用R软件绘制散点图并分析PARP1在结直肠癌和癌旁组织中的表达水平,将PARP1分为高、低表达组并进行生存分析、亚组生存分析和GSEA基因富集分析,筛选与PARP1相关的基因并进行GO、KEGG富集分析,鉴定与PARP1共表达的基因。结果 在GSE184093、GSE100179、GSE44076、GSE110225和TCGA数据集中,PARP1在肿瘤样本中的mRNA表达显著高于其在非肿瘤样本中的表达（P<0.05）;以6.93作为阈值,分为PARP1高、低表达组,PARP1高表达组患者的总体生存期（OS）、无病生存期（DFS）、疾病特异性生存期（DSS）和无进展生存期（PFS）较PARP1低表达组显著缩短（P<0.05）。在结直肠癌和癌旁组织中共筛出差异表达基因2629个,其中有765个基因与PARP1显著相关,GO分析显示PARP1相关基因与DNA聚合酶结合、组蛋白激酶活性、血小板衍生生长因子结合、卡哈尔体蛋白定位、端粒蛋白定位等有关;KEGG分析显示PARP1相关基因与DNA复制、细胞周期、错配修复等通路有关。结论 PARP1在结肠癌中表达上调,并与结直肠癌患者不良预后有关。     

Presenteeism and Absenteeism Before and After Total Hip and Knee Arthroplasty

BackgroundAbsenteeism is costly, yet evidence suggests that presenteeism—illness-related reduced productivity at work—is costlier. We quantified employed patients’ presenteeism and absenteeism before and after total joint arthroplasty (TJA).MethodsWe measured presenteeism (0-100 scale, 100 full performance) and absenteeism using the World Health Organization’s Health and Work Performance Questionnaire before and after TJA among a convenience sample of employed patients. We captured detailed information about employment and job characteristics and evaluated how and among whom presenteeism and absenteeism improved.ResultsIn total, 636 primary, unilateral TJA patients responded to an enrollment email, confirmed employment, and completed a preoperative survey (mean age: 62.1 years, 55.3% women). Full at-work performance was reported by 19.7%. Among 520 (81.8%) who responded to a 1-year follow-up, 473 (91.0%) were still employed, and 461 (88.7%) had resumed working. Among patients reporting at baseline and 1 year, average at-work performance improved from 80.7 to 89.4. A Wilcoxon signed-rank test indicated that postoperative performance was significantly higher than preoperative performance (P < .0001). The percentage of patients who reported full at-work performance increased from 20.9% to 36.8% (delta = 15.9%, 95% confidence interval = [10.0%, 21.9%], P < .0001). Presenteeism gains were concentrated among patients who reported declining work performance leading up to surgery. Average changes in absences were relatively small. Combined, the average monthly value lost by employers to presenteeism declined from 15.3% to 8.3% and to absenteeism from 16.9% to 15.5% (ie, mitigated loss of 8.4% of monthly value).ConclusionAmong employed patients before TJA, presenteeism and absenteeism were similarly costly. After, employed patients reported increased performance, concentrated among those with declining performance leading up to surgery.     

肝内胆管囊腺瘤和囊腺癌的CT、MRI及病理表现

目的探讨肝内胆管囊腺瘤和囊腺癌的CT、MRI和病理特点。方法回顾性分析经手术病理证实的6例肝内胆管囊腺瘤和2例肝内胆管囊腺癌的影像及临床病理资料，将病变的影像表现与其病理大体形态及组织学表现作对照分析。结果6例肝内胆管囊腺瘤，女4例、男2例；2例肝内胆管囊腺癌均为女性病人；8例病人平均年龄55岁。所有病灶均表现为多房囊性肿块，肿瘤囊腔各分房内常为多种液体成分，在CT上可表现为不同密度、在MRI上可表现为不同信号强度。囊内出现多发大小不等的壁结节在胆管囊腺癌内更常见，囊内有分隔但无壁结节只见于胆管囊腺瘤。在7例CT扫描中，4例胆管囊腺瘤和1例胆管囊腺癌可见囊壁或分隔上钙化，囊壁、囊内分隔及囊内结节均为轻、中度延迟增强。肿瘤中出现卵巢样间质见于3例胆管囊腺瘤和1例胆管囊腺癌，且均为女性病人。结论肝内胆管囊腺瘤和囊腺癌是肝脏不常见的囊性肿瘤，影像上多房、囊内有分隔且各分房囊内密度或信号不一致，高度提示肝内胆管囊腺瘤或囊腺癌的诊断，如囊内伴有多发大小不等的结节，则进一步提示囊腺癌的可能。但影像学表现不能区分肿瘤中有无卵巢样间质。     

The German emergency and disaster medicine and management systemdhistory and present

As well for optimized emergency management in individual cases as for optimized mass medicine in disaster management, the principle of the medical doctors approaching the patient directly and timely, even close to the site of the incident, is a long-standing marker for quality of care and patient survival in Germany. Professional rescue and emergency forces, including medical services, are the “Golden Standard” of emergency management systems. Regulative laws, proper organization of resources, equipment, training and adequate delivery of medical measures are key factors in systematic approaches to manage emergencies and disasters alike and thus save lives. During disasters command, communication, coordination and cooperation are essential to cope with extreme situations, even more so in a globalized world. In this article, we describe the major historical milestones, the current state of the German system in emergency and disaster management and its integration into the broader European approach.     

Erotic and sadomasochistic foot and shoe*

The foot is an erotic symbol of great power for primitive peoples as well as in highly advanced societies. The foot has always been a badly-treated organ, at the same time an inexhaustible source of contradictory praise and disparagement. The foot and the shoe are inseparable. Since more than 1000 years, the shoe is a sexual symbol and serves as a sexual mode of communication, because it is the cover of the erotic foot. The fetishism of the foot and the shoe has aroused marks of delirious love, always sensual, sometimes mystical. Foot sadomasochism, is a very ancient sexual perversion that consists in taking pleasure in inflicting physical pain to oneself or to others. * Communication submitted: In French, to the CIP International Congress in Buenos Aires (1996); in English, to the BOFSS Congress in Canterbury (2001) Published, in part, in French, in the Encyclopédie Médico-chirurgicale, Podologie, (Elsevier, Paris), 27-140-A-55, 1999,11p