SELDI-TOF-MS技术筛选鼻咽癌血清肿瘤标志物

摘要：目的筛选鼻咽癌患者血清蛋白差异表达并建立诊断模型,分析不同临床特征患者的血清蛋白质谱差异。方法应用SELDI技术分析102例鼻咽癌患者及118例健康对照的血清样本,Biomarker Wizard和Biomarker Pattern 软件分析两组之间的差异,建立分类树诊断模型并进行盲筛验证;进一步分析鼻咽癌不同临床分型及EB病毒感染状态对患者血清蛋白质表达谱的影响。结果发现鼻咽癌与健康对照之间有25个血清蛋白质谱峰差异有统计学意义（P<0.01), 13个蛋白峰表达下调,12个蛋白峰表达上调。经Biomarker Pattern 软件建立分类树模型,盲法验证其敏感度为97.56％,特异性为88.89％,准确率达92.63％;上行型和下行型鼻咽癌之间发现M/Z为10286Da、7569Da及8149Da的3个血清蛋白质峰差异有统计学意义（P<0.05);EB阳性和EB阴性鼻咽癌间M/Z为9354Da及4596Da的2个血清蛋白质峰差异有统计学意义（P<0.05)。结论SELDI-TOF-MS 技术可筛选出鼻咽癌差异性蛋白并建立鼻咽癌诊断的分类树模型,有望成为鼻咽癌早期诊断的辅助指标;并且用SEDLI技术可以发现一些与鼻咽癌临床特征相关的血清蛋白差异峰。     

血清蛋白质谱诊断模型在乳腺癌辅助诊断中的价值

目的 建立乳腺癌的血清蛋白质谱诊断模型,评价其在乳腺癌辅助诊断中的价值.方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测113例乳腺癌患者、103例乳腺良性肿瘤患者及92例健康女性的血清蛋白质谱,采用Biomarker Pattern(BPS)软件分析蛋白质谱,建立分类树模型,然后对模型进行盲筛验证.结果 比较乳腺癌患者与健康女性的血清蛋白质谱,筛选出12个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅰ诊断乳腺癌的灵敏度为91.9%,特异度为81.2%.比较乳腺良性肿瘤患者与健康女性的血清蛋白质谱,筛选出11个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅱ诊断乳腺良性肿瘤的灵敏度为87.9%,特异度为81.2%.比较乳腺癌与乳腺良性肿瘤患者的血清蛋白质谱,筛选出2个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅲ诊断乳腺癌的灵敏度为81.8%,特异度为78.3%.应用这些差异蛋白及分类树模型,分别对93例CA15-3阴性乳腺癌患者与36例乳腺良性疾病患者的血清、20例CA15-3阳性乳腺癌患者与36例乳腺良性疾病患者的血清进行盲筛,诊断乳腺癌的敏感度和特异度分别为80.6%和91.7%、75.0%和91.7%,明显高于传统的乳腺癌标志物CA15-3,而CA15-3阴性与CA15-3阳性乳腺癌未见明显的差异蛋白质峰.结论 应用SELDI-TOF-MS技术可筛选出乳腺癌、乳腺良性肿瘤和健康女性血清蛋白质谱存在的差异蛋白质峰,据此建立的诊断模型可用于乳腺癌的辅助诊断.     

应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片筛选鼻咽低分化鳞癌患者血清肿瘤标志物的研究

目的探讨筛选鼻咽低分化鳞癌血清肿瘤标志物的临床应用价值。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)及CM10型弱阳离子交换芯片对61例初治的鼻咽低分化鳞癌患者和72名健康人血清标本进行蛋白质指纹图谱测定,其中80例用于建模(40例鼻咽癌,40名健康人),53例用于盲法检测(21例鼻咽癌,32名健康人),用Biomarker Wizard3.01及Biomarker Pattern5.01分析软件对测得的数据进行处理及建立诊断模型。结果用建立的区分鼻咽低分化鳞癌与健康人的血清蛋白指纹图诊断模型进行盲法检测的准确性、敏感性和特异性分别为86.8%、81.0%和90.6%。其中Ⅰ、Ⅱ期鼻咽低分化鳞癌检出的准确性为73.7%,Ⅲ、Ⅳ期鼻咽低分化鳞癌检出的准确性为81.0%。结论用SELDI-TOF-MS技术与生物信息分析法筛选的血清肿瘤标志物对鼻咽低分化鳞癌的定性诊断提供了一条新途径。     

宫颈癌患者血清蛋白指纹图谱的检测及其意义

背景与目的:目前针对宫颈癌没有特异性的肿瘤标志物。表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)是最新应用的一项检测肿瘤标志物的技术。本研究应用SELDI-TOF-MS检测宫颈癌患者血清蛋白指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物并建立诊断模型,初步探讨其在宫颈癌早期诊断中的价值。方法:取91例早期宫颈鳞癌患者和15例宫颈上皮内瘤变Ⅲ级(cervical intraepithelialneoplasia,CINⅢ)患者的血清标本进行实验,同时用55名健康人血清作为对照。用弱阳离子交换芯片(weak cation exchange,WCX2)检测各血清标本获得血清蛋白指纹图谱。用Biomarker Patterns软件分析宫颈癌差异蛋白并建立诊断模型。通过盲法分析进一步验证诊断模型的可靠性,并对结果进行统计学分析。结果:在分子量1.5～20ku范围内,共检测到122个蛋白峰,其中19个差异峰有统计学意义(P<0.001)。建立了由分子量为3977和5807的两个差异蛋白组成的宫颈癌诊断模型,其敏感性为97.29%(36/37),特异性为83.78%(31/37)。扩大样本盲法验证结果,其敏感性为94.44%(51/54),特异性为94.44%(17/18)。结论:由3977和5807两个差异蛋白组成的宫颈癌诊断模型有助于区分宫颈癌和健康人群。     

表面加强激光解析电离蛋白质谱技术在乳腺癌血清学诊断中的应用

 【摘要】 目的: 探讨血清SELDI蛋白质谱技术在乳腺癌诊断方面的应用。 方法: 用表面加强目的　探讨血清表面加强激光解析电离（SELDI）蛋白质谱技术在乳腺癌诊断方面的应用。方法　用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）及WCX2蛋白获得病理确诊的101例乳腺癌患者手术前和45名健康人的血清蛋白指纹图谱,并用Biomarker Wizard和BPS软件分析差异蛋白,建立乳腺癌的分类树诊断模型,并对其进行盲法验证。 结果　乳腺癌组与健康对照组共有49个蛋白质差异有统计学意义（P＜0.05）;以其中3个蛋白质生物标志物（M／Z 5627,8124和2864）组建的诊断模型检测正确率为95 %（139／146）。经盲法验证,其灵敏度为97 %（98／101）,特异度为91 %（41／45）。结论　SELDI蛋白质谱技术可以有效的区分乳腺癌患者和健康人,其灵敏度和特异性高。SELDI在乳腺癌的诊断及乳腺癌特异性的生物标志物分子的筛选方面具有一定的应用价值。     

上行型与下行型鼻咽癌患者血清蛋白指纹图谱的检测及意义

目的:通过分析上行型与下行型鼻咽癌的血清蛋白质谱,筛选鼻咽癌蛋白质标志物,为预测鼻咽癌临床分型提供可能的简易方法.方法:应用CM10弱阳离子交换芯片和表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)分析22例上行型鼻咽癌和26例下行型鼻咽癌患者的血清标本,采用Biomarker Wizard 3.01及Biomarker Pattern 5.01分析软件对测得的数据进行处理并建立相应的检测模型.结果:通过对上行型、下行型鼻咽癌患者血清蛋白指纹图谱数据的比较,筛选出差异蛋白质峰9个(P＜0.05),相对分子量分别为2 776.27 Da,3 940.04 Da,6 440.51 Da和9 138.54 Da的4个蛋白质峰被选择用于构建分类决策树模型,该模型交叉验证总准确率为81.3%,上行型鼻咽癌患者检出率为77.3%,下行型鼻咽癌患者检出率为84.6%.分别对这4个蛋白质峰进行数据库搜索,得到4种与分子量最为接近的蛋白质.结论:应用SELDI-TOF-MS技术构建的分类决策树模型能达到区分上下型鼻咽癌患者的效果,这可能对鼻咽癌的分子分型、制定个体化治疗方案及预后预测方面有一定的临床意义,可进一步深入研究.     

表面增强激光解吸技术预测胃癌术后转移复发的临床研究

 目的　应用表面增强激光解吸（SELDI）技术筛选胃癌术后转移相关的血清蛋白质组指纹并建立预测模型。方法　应用CM10弱阳离子芯片结合表面增强飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测60例胃癌根治术后患者和26名健康对照血清样本的蛋白质谱，经过2年随访分为转移组（22例）和无转移组（38例），利用Biomarker Wizard软件比较各组间的血清蛋白质指纹图谱，Biomarker Pattern软件建立预测模型。结果　术后转移患者和健康对照相比有 74个蛋白质峰差异有统计学意义，术后无转移患者和健康对照相比有69个蛋白质峰差异有统计学意义，术后转移患者和无转移患者相比有14个蛋白质峰有显著性差异，质荷比（m／z）为4768和8841的两个蛋白质组成的诊断模型可将无转移胃癌患者与转移胃癌患者准确的分组，在学习模式下，灵敏度和特异度分别为95.46 %（21／22），86.84 %（33／38），准确度为90 %（54／60）。在测试模式下，灵敏度和特异度分别为81.82 %（18／22）和84.21 %（32／38），准确度为83.33 %（50／60）。结论　SELDI-TOF-MS技术可筛选出胃癌转移复发相关的蛋白质组指纹，在m／z为4768和8841的两个蛋白质峰建立的决策树模型可用于对术后胃癌患者转移、复发的早期预测。     

食管癌血清差异表达蛋白图谱和诊断模型的建立

摘 要：［目的］ 比较食管癌患者和健康人的血清差异表达蛋白图谱,建立食管癌诊断模型。［方法］ 收集38食管癌患者血清和40健康人血清,用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测血清蛋白表达,并用ProteinChip Software、Biomarker Patterns Software和SPSS16.0软件分析和筛选差异蛋白。［结果］ 在1kDa～10kDa范围内,得到差异蛋白144个（P<0.05）,用荷质比为M/Z 8926.478、8136.185和4476.086的峰（P<0.000001）作为食管癌的诊断模型,其灵敏度为95.0%,特异度为97.5%,准确率为97.5%,阳性预测值为100%,阴性预测值为95.2%,ROC曲线下面积（AUC）为97.5%,对食管癌癌诊断效率最大时的界值（cut-off值）为2.5%。［结论］ SELDI-TOF-MS技术可以准确筛选食管癌血清差异表达蛋白,建立的诊断模型准确性高,特异性好。     

非小细胞肺癌脑转移脑脊液蛋白质谱诊断模型的建立及其应用

目的:分析非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)脑转移患者脑脊液的蛋白质谱,建立NSCLC脑转移的蛋白质谱诊断模型.方法:采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)对29例脑转移NSCLC、23例非肿瘤和10例无脑转移NSCLC患者的脑脊液进行蛋白质谱分析,Biomarker Wizard软件统计分析3组样本的蛋白质峰,Biomarker Patterns 软件的决策树模型进行差异蛋白峰的比较和判别,建立分类决策树诊断模型,评价其诊断和应用价值.结果: 脑转移组和非肿瘤组之间有8个蛋白质峰表达差异有统计学意义,其中m/z 6 634.73蛋白质峰可把2组样本分开,灵敏度为89.66%(26/29),特异度为86.96%(20/23).进一步行交叉验证结果显示其灵敏度为80.00%(8/10),特异度为70.00%(7/10).脑转移组与无脑转移组有5个蛋白质峰表达差异有统计学意义,运用m/z 8 698.00、1 215.32和1 245.70蛋白质峰将2组样本分开,灵敏度和特异度均为100.00%(29/29).结论: 采用SELDI技术可以发现3组患者的脑脊液蛋白质峰表达差异有统计学意义,利用这些差异蛋白质建立的蛋白质谱分类决策树状诊断模型具有较高的灵敏性、特异性和准确率.     

表面增强激光解吸/电离-飞行时间质谱技术检测不同来源淋巴瘤细胞株及健康人外周淋巴细胞的差异蛋白质

 目的　应用表面增强激光解吸/电离-飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术对体外培养的人类T、B淋巴瘤细胞株和健康人外周血淋巴细胞的蛋白质进行检测，寻找差异蛋白。方法　常规培养人类T、B淋巴瘤细胞株，并从健康人外周血中分离出淋巴细胞培养，取对数生长期的细胞进行试验，使用蛋白提取液提取蛋白质，应用SELDI-TOF-MS技术进行检测，采用SPSS 13.0统计软件包进行统计学分析。结果　T、B淋巴瘤细胞株与健康人外周淋巴细胞比较，均有6个差异蛋白质。T淋巴瘤细胞株与B淋巴瘤细胞株比较有7个差异蛋白质。结论　T、B淋巴瘤细胞间及二者与健康人外周淋巴细胞比较，蛋白质组学水平均有差异。应用SELDI-TOF-MS技术对筛选淋巴瘤的分子标志物有一定价值，并可能为研究淋巴瘤的发病机制和寻找治疗靶位打下初步基础。     

血清蛋白质指纹图谱在胰腺癌诊断预后和疗效评估中的应用

目的 建立胰腺癌血清学诊断模型,探讨评估胰腺癌分期和治疗疗效的生物学标志物.方法 采用强阴离子交换(SAX2)芯片和表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)技术,测定58例胰腺癌患者和51例正常对照者的血清蛋白质指纹图谱;应用Biomarker Wizard统计软件以及决策树算法、Logistic回归和ROC曲线,建立决策树和二分类回归诊断模型.结果 在质荷比(M/Z)值为2000～30 000范围内,建立10个决策树诊断模型,其预测胰腺癌的正确率为92.9%(13/14),诊断胰腺癌的敏感性为83.3%,特异性为100%.应用Logistic回归联合多种差异蛋白峰诊断胰腺癌的曲线下面积(AUC)为0.976±0.011(P<0.001),敏感性为77.6%～91.4%,特异性为92.2%～100%.联合6个差异蛋白峰诊断胰腺癌Ⅰ与Ⅱ期、Ⅱ与Ⅲ期以及Ⅲ与Ⅳ期的AUC值分别为0.897±0.054、0.978±0.021和0.792±0.107(P<0.05).胰腺癌组中高表达的差异蛋白峰(M/Z 4016)在手术前后有下调趋势(P<0.05).结论 应用SELDI-TOF-MS技术进行胰腺癌血清蛋白质指纹图谱分析,采用统计学方法建立胰腺癌决策树和二分类回归诊断模型,对胰腺癌的诊断和鉴别诊断有一定的价值;筛选出的差异蛋白峰对胰腺癌的预后和疗效评估有一定的应用价值.     

高发区筛查人群食管鳞癌血清蛋白指纹图谱诊断模型的建立及临床价值

目的用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析食管鳞癌患者血清蛋白表达谱的改变,筛选并建立高发区食管癌血清蛋白指纹图诊断模型,探究其临床价值。方法采用CM10蛋白芯片及SELDI-TOF-MS技术,对36例食管癌患者和38例正常对照者的血清进行蛋白指纹图谱检测,支持向量机分析实验数据,建立食管癌诊断模型,采用盲法验证。结果在分子量2000～20000范围内,共检测到31个蛋白质荷比峰,差异有统计学意义(P<0.01)。以4个质荷比峰建立了食管癌诊断模型,并用留一法交叉验证作为评估模型判别效果的方法,其准确率为85.1%,敏感性为86.1%,特异性为84.2%,真阳性率为83.8%。结论由4个质荷比峰构成的诊断模型可以区分食管癌和正常对照,为高发区食管癌的筛查与诊断提供了一条新的途径。     

细胞因子诱导杀伤细胞对裸鼠胃癌移植瘤的靶向抑制作用

目的: 利用蛋白质组学基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(matrixassisted laser desorption/ionization timeofflight mass spectrometry, MALDITOF MS)技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱,建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,探讨其临床应用价值。方法: 收集河北医科大学第四医院2008年5月至9月间胸外科食管癌患者血清32例和健康志愿者血清28例,采用弱阳离子交换蛋白质芯片（WCX磁珠）提纯血清蛋白,MALDITOF MS技术进行血清蛋白质质谱检测,所得结果用ZUCI蛋白芯片数据分析系统进行分析。运用遗传算法结合支持向量机运算建立食管癌蛋白指纹图谱诊断模型;将60例标本随机分成训练组和盲法测试组,训练组为21名食管癌患者和19名健康人,盲法测试组为11名食管癌患者和9名健康人,验证诊断模型的特异性和敏感性。结果:采集食管癌患者和健康对照者的血清蛋白指纹图谱,经数据对比分析找到44个有显著性差异的质荷比峰（P<0.05）;从中筛选出差异最显著的6个蛋白质荷比峰（m/z分别为2 210、2 864、6 634、4 068、2 083和8 131）,并以此建立食管癌蛋白指纹图谱诊断预测模型;验证该模型诊断食管癌的特异性为88.9%、敏感度为100%。结论: 应用MALDITOF MS技术检测食管癌患者血清蛋白指纹图谱建立的食管癌蛋白指纹图谱诊断模型在食管癌的诊断中具有较高的敏感度和特异性。     

非小细胞肺癌放化疗患者血清蛋白质谱分析的初步研究

目的通过对非小细胞肺癌患者放化疗前后及正常对照组血清蛋白质谱的测定,筛选差异蛋白,观察治疗前后血清蛋白质组谱变化。方法应用SELDI-TOF-MS及CM-10芯片对35例正常对照组、35例治疗前非小细胞肺癌患者及26例放化疗后非小细胞肺癌患者采集的血清样品进行蛋白质指纹图谱测定,并应用BioMarker Wizard 3.01及BioMarker Pattern System 5.01分析软件对测得数据进行处理及建立诊断模型。结果非小细胞肺癌组与正常对照组共检测到251个蛋白质峰,筛选出差异蛋白质峰16个,其中肺癌组8个蛋白质峰表达升高,8个蛋白质峰表达降低。以质荷比(M/Z)为2572.1、2885.8、3870.4、4161.4、5739.7和8164.3的6个蛋白质峰为依据组合构建分类决策树模型,原始判别总准确率为87%,敏感性为91%,特异性为83%;交叉验证总准确率为76%,敏感性为80%,特异性为71%。观察16个差异蛋白质峰的表达在放化疗前后的变化,显示均发生了不同程度的变化,趋向健康对照组,其中质荷比为2572.1、2885.8、4664.8、9228.4和9396.4的5个蛋白质峰在治疗前后发生显著变化。结论SELDI-TOF-MS技术对差异蛋白的筛选及治疗疗效的判定可能有一定的意义,需要进一步研究证明。     

应用ＳＥＬＤＩ-ＴＯＦ-ＭＳ建立淋巴瘤诊断模型的研究

目的　探讨应用蛋白质组学技术研究淋巴瘤血清蛋白标志物并建立淋巴瘤人工神经网络诊断模型。方法　利用表面激光解析电离飞行时间质谱技术（ＳＥＬＤＩ-ＴＯＦ-ＭＳ）及弱阳离子交换表面（ＣＭ１０）蛋白芯片检测４７例初诊淋巴瘤患者和２１例正常对照血清蛋白质谱,采用ＣｉｐｈｅｒｇｅｎＰｒｏｔｅｉｎｃｈｉｐ软件对蛋白质谱进行差异蛋白分析,再优选４种蛋白质建立淋巴瘤诊断模型。结果　（１）淋巴瘤与正常对照的血清蛋白质谱之间有７７个差异表达的蛋白质荷比峰（Ｐ＜０.０５）,其中３５个蛋白有明显差异（Ｐ＜０.００１）,有８个蛋白质峰在淋巴瘤血清中高表达,２７个蛋白质峰低表达。（２）霍奇金淋巴瘤（ＨＬ）与非霍奇金淋巴瘤（ＮＨＬ）患者的血清蛋白质指纹图谱之间有２个差异表达的蛋白质荷比峰（Ｐ＜０.０５）,均在ＮＨＬ中高表达。（３）淋巴瘤诊断模型的灵敏度为８２.９８％,特异度９０.４８％,诊断指数（ＤＩ）１７３.４６％,Ｙｏｕｄｅｎ指数７３.４６％,阳性预测值９５.１２％,阴性预测值７０.３７％,ＲＯＣ曲线下面积ＡＺ为０.９４１。结论　淋巴瘤患者和正常对照血清之间存在特征性差异蛋白,可能对淋巴瘤的诊断和鉴别有重要意义。     

飞行时间质谱技术在乳腺癌诊断中的应用

 目的 采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱，分析健康人与乳腺癌患者以及乳腺癌患者手术前后特异性标志蛋白变化，探讨血清蛋白质指纹图谱在乳腺癌疗效评价及复发监测中的临床意义。方法 用SELDI-TOF-MS技术检测30例乳腺癌患者（术前和术后第7天）及20名健康人的血清蛋白质指纹图谱，筛选乳腺癌特异性蛋白标志物，结合支持向量机软件建立诊断模型。比较乳腺癌手术前后特异性蛋白的变化。结果 与健康人血清蛋白质谱相比，术前乳腺癌血清中有3个差异蛋白，质荷比为2043、3938的标志分子低表达，质荷比为 5639的标志分子高表达。术后质荷比为2043、3938的标志分子稳定上调，质荷比为 5639的标志分子稳定下调，差异具有统计学意义。以筛选3个特异性蛋白质峰的数据构建的诊断模型经交叉验证，灵敏性和特异性均为100 %。结论 SELDI-TOF-MS检测血清蛋白质组学图谱在乳腺癌的早期诊断、术后病情转归及监测复发等方面具有一定的临床指导意义     

应用IMAC3蛋白芯片分析食管鳞癌患者血清蛋白质谱的变化

背景与目的:血清蛋白指纹图谱技术有助于筛选与食管上皮癌变相关的分子变化。本研究通过比较食管鳞癌患者与正常对照血清蛋白表达谱的差异,筛选食管鳞癌相关血清蛋白标志物并建立诊断模型,同时探讨其在食管鳞癌血清学诊断中的意义。方法:收集68例食管鳞癌患者和44例正常对照的血清,其中建模型组90例(55例为食管鳞癌,35例为正常对照),盲法筛选组22例(13例为食管鳞癌,9例为正常对照)。采用固定金属亲和表面(immobilized metalaffinity capture,IMAC3)芯片,经表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)测定得到蛋白质谱,通过Biomarker Wizard软件比较两组人群的血清蛋白质谱的差异,经生物信息学分析得到决策树模型并进行盲法验证。结果:在质荷比(m/z)1.5～20ku范围内,共检测到78个有效蛋白峰,其中25个峰差异有统计学意义(P<0.001)。对建模型组的蛋白质谱数据,通过1000次随机抽样,得到1000个决策树。结合3倍交叉证实方法,构建了"食管鳞癌-正常对照"分组诊断的20个决策树模型。用这20个决策树来对22个盲法筛选样本进行归类预测,预测正确的样本为18个,盲法验证的灵敏度为92.31%,特异度为66.67%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术可以筛选出食管鳞癌相关的血清蛋白标志,建立的决策树模型可以对食管鳞癌做出较为准确的预测判断。     

利用SELDI-TOF-MS和蛋白质芯片技术检测大肠癌52例蛋白质谱差异表达

[目的]用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）和蛋白质芯片的生物信息学分析技术检测大肠癌和健康人群血清蛋白质指纹图谱,研究诊断大肠癌的新标志物。[方法]收集52例大肠癌（其中Dukes’A期15例,B期13例,C期18例）和21例健康人的血清标本,用WCX2蛋白芯片和SELDI-TOF-MS检测其蛋白质谱的表达。运用Ciphergen Protein Chipsoftware5.1软件判别分析处理数据和筛选标志物,以建立诊断模型。[结果]3个蛋白质峰构建的诊断模型鉴别大肠癌和正常人的交叉验证准确率、敏感性及特异性均分别为82.19%（60/73）,80.77%（42/52）和85.71%（18/21）（P〈0.05）。[结论]用SELDI-TOF-MS技术平台在蛋白质指纹图谱上可以明显区分大肠癌与健康人群,对大肠癌的辅助诊断具有一定的价值。     

应用SELDI-TOF-MS技术建立卵巢浆液性乳头状囊腺癌诊断的血浆蛋白质组学模型

目的：通过蛋白质芯片-质谱技术结合生物信息学的支持向量机方法，筛选卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者差异表达的蛋白质峰，探讨建立数学逻辑的卵巢浆液性乳头状囊腺癌诊断模型及其意义。方法：采用表面增强激光解离飞行时间质谱（surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS）技术，运用CM10蛋白质芯片（一种弱阳离子芯片）分别检测26例卵巢浆液性乳头状囊腺癌和51例对照组（其中卵巢囊肿12例、子宫肌瘤31例、卵巢良性囊腺瘤8例）的血浆标本，对所得到的质谱数据采用Biomarker Wizard软件分析，初步筛选蛋白质峰，结合生物信息学的支持向量机（support vector machines，SVM）方法建立并测试卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者以及对照组的血浆蛋白质谱诊断模型。结果：应用SELDI-TOF-MS在CM10芯片上捕获到的蛋白质，经过Biomarker Wizard软件分析筛选出了卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者与对照组的71个差异蛋白质峰（P〈0．01），利用SVM方法再次筛选获得7个蛋白质峰组成卵巢浆液性乳头状囊腺癌的蛋白质谱最优化模型，这7个蛋白质中质荷比（m／z）为4099、4477、4123、4081和3938的表达上调，质荷比（m／z）为8785和13783的表达下降。经三倍交叉验证后用盲法测定，所建模型用于卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者与对照组鉴别的敏感度和特异度分别为84．62％和96．08％，阳性预测值为92．21％。结论：蛋白质芯片-质谱技术可以快速、有效地筛选出卵巢浆液性乳头状囊腺癌患者血浆差异蛋白质，结合SVM可建立有效的蛋白质质谱诊断模型，对卵巢癌诊断方法的建立具有潜在意义。     

结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤30例诊疗分析

目的 探讨结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤的临床特征及预后影响因素.方法 对按照WHO淋巴瘤分类标准,经病理确诊的30例结外鼻型NK／T细胞淋巴瘤患者临床特点、长期生存率、预后因素进行分析.结果 30例结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤患者,以男性患者居多,中位发病年龄45岁,年轻患者鼻外型较多见,且更易合并噬血细胞综合征.实验室检查发现白细胞、血红蛋白、血小板、丙氨酸氨基转移酶、乳酸脱氢酶、清蛋白常有异常,且在生存组与死亡组之间,血红蛋白下降、血清清蛋白下降程度的差异有统计学意义.死亡患者发病年龄相对较轻,鼻外型多见,更多伴B症状、噬血细胞综合征,国际预后指数（IPI）评分较高,骨髓累及发生率较高,临床分期更晚,实验室检查异常更多.Kaplan-Meier单因素分析显示发病年龄、是否鼻腔来源、有无B症状、有无骨髓累及、是否伴发噬血细胞综合征、IPI评分、临床分期、治疗方法,以及有无白细胞、血红蛋白、血小板、血清乳酸脱氢酶、清蛋白水平异常,有无肝功能损伤等因素,均可影响预后;采用Cox回归模型进行多因素预后分析,显示有无血清LDH升高及有无骨髓累及为影响预后的独立危险因素.结论 结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤多见于中年男性,侵袭性高,病初临床表现多样.相比鼻腔NK/T细胞淋巴瘤患者,鼻外型患者发病年龄更轻,实验室异常更明显,更易伴发噬血细胞综合征,更易累及骨髓,预后更差.有无血清LDH升高及有无骨髓累及为影响预后的独立危险因素.