一株中度嗜盐菌SL21合成Ectoine的研究

从大连市普兰店盐场盐池淤泥中筛选出一株中度嗜盐细菌SL 21,对其进行形态和分子生物学鉴定.运用16 S rDNA技术建立SL 21系统发育树.该菌株为革兰氏阴性细菌,短杆状,最适生长NaCl浓度是10%.以其16S rDNA序列相似性为基础构建了包括7种相关种属在内的系统发育树.结果表明,SL 21与Halomonas venusta的同源性达到99%以上,应归属于盐单胞菌属.研究了中度嗜盐菌SL21的渗透压补偿溶质(Ectoine)的生成及生成条件.用含2 mol.L-1NaCl的肉汤培养基,在30℃条件下,培养48 h,诱导生成Ectoine为285.1 mg.L-1,其Ectoine生成的最适诱导温度是30℃,最适NaCl浓度是2 mol.L-1.     

一株耐盐菌EC51的生长特性及其系统发育分析

从大连市普兰店盐场盐池底部的淤泥中筛选出一株耐盐菌EC51,研究了分离菌株的形态和生长特性,该菌株为革兰氏阳性杆状菌.以其16S rDNA 序列相似性为基础构建系统发育树.结果表明,EC51与Bacillus Pumilus的相似性达到99%.耐盐菌EC51的渗透压补偿溶质（Ectoine）生成情况实验表明,用含2 mol/L NaCl的肉汤培养基,在30 ℃条件下培养48 h,诱导生成Ectoine为197.8 mg/L.     

嗜盐古生菌产嗜盐菌素情况的筛查研究

以Halobacterium salinarum NRC817为敏感指示菌,用双层平板法对武汉大学中国典型培养物保藏中心保藏的19株嗜盐古生菌产生嗜盐菌素的情况进行了筛查,其中15株对Hbt.salinarum NRC817表现出明显拮抗,证实了前人的观点:分泌嗜盐菌素是嗜盐古生菌的普遍特征。     

阿尔金山盐湖极端嗜盐古生菌的分离及16S rDNA序列分析

为了研究分析新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖嗜盐古生菌物种资源,对分离纯化到的极端嗜盐古生菌AJ2和AJ4,采用PCR方法扩增出其16S rRNA基因(16S rDNA),并测定了基因的核苷酸序列.基于16Sr DNA序列的同源性比较和系统发育学分析,发现菌株AJ2是Natrmema属中一个与其他成员不同的新种,命名为Natrinema ajinwuensis sp.nov.;菌株AJ4是Haloarcula属中成员argentinensis的一个亚种,取名为Haloar-cula argentinensis subsp.ajinwuensis.菌株AJ2和AJ4的16S rDNA序列已被GenBank数据库收录,其序列号分别为AY208972和AY208973.     

一株耐盐菌EC51的生长特性及其系统发育分析

从大连市普兰店盐场盐池底部的淤泥中筛选出一株耐盐菌EC51,研究了分离菌株的形态和生长特性,该菌株为革兰氏阳性杆状菌。以其16S rDNA序列相似性为基础构建系统发育树。结果表明,EC51与Bacillus Pumilus的相似性达到99%。耐盐菌EC51的渗透压补偿溶质(Ec-toine)生成情况实验表明,用含2 mol/L NaCl的肉汤培养基,在30℃条件下培养48 h,诱导生成Ectoine为197.8 mg/L。     

一株耐盐菌DL41诱导合成Ectoine及海藻糖的研究

从盐池淤泥中采集土样,用盐梯度法筛选分离得到一株耐盐微生物DL41,对其进行菌落及菌体形态、分子生物学鉴定和生长特性研究.通过PCR技术,进行16S rDNA鉴定,建立系统发育树.还研究了耐盐微生物DL41合成相容性物质Ectoine和海藻糖诱导条件.     

基于末端产物和基因序列的SRB菌系统发育分析

为实现细菌的多相分类,应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采出液中分离到8株硫酸盐还原菌.通过对菌株的气相色谱末端产物测定,16S rDNA、16S～23S rDNA间隔区(ISR)序列克隆进行菌株的系统发育分析.结果表明:8株菌分别属于Salmonella(D2、I7)、Clostridium(F4、D10、H1)、Anaerofilum(A8、A18)、Enterobacter(E1).聚类分析表明,菌株的ISR序列长度差异较大,包含的tRNA种类和数目不同,间隔区序列可以作为16S rDNA序列系统发育分类的一个有力的补充;气相色谱末端产物相似的菌株,亲源关系比较接近,可以作为细菌鉴定的依据;其中16S rDNA序列作为细菌分类的主要依据,对存在争议的菌株,应该结合形态、生理生化特征和ISR序列以及气相色谱末端产物等综合对其进行系统分类.     

聚丙烯酰胺降解菌株分离及其系统发育分析

应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采油五厂十三区聚合物配注站的母液罐中分离到一株聚丙烯酰胺降解菌株CMW,该菌株为G ,杆状,黑色圆形菌落,最适温度为38℃,最佳pH为7.8,具有硫酸盐还原功能,产H2S,严格厌氧.研究表明,该菌株能以聚丙烯酰胺为唯一碳源,降解侧链,部分官能团发生改变,质量浓度为500 mg/L时菌株具有较高的聚丙烯酰胺降解能力,其溶液黏度下降效果显著.通过形态、生理生化、16S rDNA以及16S~23S rDNA间隔区序列鉴定,可能为梭菌属的新种,暂时命名为Clostridium.sticklandiiCMW(GenBank登录号为DQ011249).16S rRNA基因序列较为保守更适合属间的鉴定,16S~23S rDNA间隔区序列包含tRNAIle和tRNAAla基因,更适合属内种间鉴定.     

新疆艾比湖细菌视蛋白基因资源研究

针对新疆艾比湖这一特定生境中的嗜盐古菌的细菌视蛋白（bacterio-opsin, bop）基因资源进行了研究.通过PCR方法扩增并测定了11株菌株的编码细菌视蛋白螺旋C至螺旋G片段的基因序列.根据该片段基因序列进行的系统发育分析表明,艾比湖获得的bop基因大部分聚类到同一个类群,具有明显的地域特征.将翻译出的氨基酸序列与已报道的相应片段进行对比表明,从艾比湖菌株获得的序列与其他菌株来源的序列间存在明显差异.这些天然的突变体,尤其是菌株AB9、AB27、AB47,都是研究细菌视紫红质（bacteriorhodopsin,BR）蛋白结构和功能的良好材料,而细菌视紫红质是人工视网膜和光子开关等的良好生物材料     

耐盐菌的研究

报道了耐盐菌的一些特性。耐盐菌的生长速度随环境盐度的升高而下降;生长素可提高耐盐菌的生长速度和耐盐浓度。重金属离子对耐盐菌的生长有明显的影响。同时还研究了,NaCl和Na2SO4混合盐对耐盐菌的影响。     

木聚糖酶产生菌的分离筛选及酶学性质

利用透明圈法从云南腾冲温泉出水口土样中粗筛出12株木聚糖酶产生菌,其中Xylan-12菌活力较高,对其进行了16S rDNA部分序列测定,经BLAST同源性分析确定其为Bacillus flavothermus。对Xylan-12产生的木聚糖酶进行了酶学性质的初步研究,结果表明,该酶的最适pH为6,最适温度为65℃。     

产絮凝剂微生物的分离与鉴定及其絮凝剂特性

从污水处理厂活性污泥中经富集、分离得到一株产絮凝剂的细菌Z-052,其发酵液对高岭土的絮凝效果达90%以上。采用16S rDNA序列分析法对该株菌进行鉴定,其核苷酸序列与Dia-phorobacter nitroreducens的同源性为98%,登录号AB076856.1,在细菌系统发育分类学上属于Diaphorobacter属。Zn2+离子对絮凝的促进作用效果最好,絮凝剂在100℃沸水中加热35 min絮凝活性下降小于5%。Z-052絮凝剂对活性炭、土壤、酵母等固体颗粒悬液的絮凝活性分别达到95.1%、80.4%和72.4%。     

一支产纤维素酶菌株的鉴定及产酶特性初步研究

本文对从皖南地区采集的森林腐木样本中,筛选获得TZT-01菌株进行鉴定.通过培养,观察菌落和个体染色形态,对其进行16SrDNA序列同源性分析,鉴定为枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis sp.）.对添加诱导物产纤维素酶的特性进行初步研究.     

利用16SrDNA序列分析和Biolog快速鉴定方法鉴定产脂肪酶菌株

采用16S r DNA序列分析和Biolog快速鉴定两种方法对分离得到的7株产脂肪酶菌株进行了分类鉴定.16S rDNA序列分析结果表明,7株产脂肪酶菌株中TCCC 11087、TCCC 11167、TCCC 11170、TCCC 11180,TCCC 11181属于不动杆菌属,株TCCC 11092、TCCC 11168属于假单胞菌属.Biolog快速鉴定结果显示,TCCC 11087、TCCC 11167、TCCC 11170.TCCC 11180、TCCC 11181 属于溶血不动杆菌,TCCC 11092属于假单胞菌属,TCCC 11168属于荧光假单胞菌.说明两种鉴定方法得到的结果一致,但16S rDNA序列分析方法只能鉴定到属,而Bioiog快速鉴定方法能对多数菌株鉴定到种.     

Isolation and identification of a sulfate reducing bacteria and sequence analysis of its dissimilatory sulfite reductase gene

A sulfate reducing bacteria was isolated from mining sewage of Daqing Oilfield by Hungate anaerobic technology. Physiological-biochemical analysis showed that the strain could utilize polyacrylamide as sole carbon and nitrogen source. The sequence analysis of 16S rDNA illustrated that the similarity of F8 and Desulfovibrio desulfuricans (AF192153) was 99%, and the similarity sequence of dissimilatory sulfite reductase gene (DSR) cloned from the strain and Desulfovibrio desulfuricans (AF273034) was 98%. Their phylogenitic analysis was basically anastomosed, and thus temporarily named as Desulfovibrio desulfuricans F8. The DSR cloned from F8 strain was 2740 bp in length consisting of three ORF, DSRA, DSRB and DSRD as a single operon (DSRABD) regulated by the same operator. DSRA contained typical conservative box of sulfate—sulfite reducing enzyme (SiteⅠand SiteⅡ), which could bind siroheme and [Fe4S4]. DSRB retained a [Fe4S4] binding site, with an uncomplimentary structure for siroheme binding. There was no conservative box in DSRD. Sequence analysis of DSR will provide a theoretical basis for quantitative detection, metabolic pathway modification through gene engineering, and sulfate reducing bacteria (SRB) suppression.