辐照后非小细胞肺癌差异表达基因的生物信息学分析

为了探讨辐射对非小细胞肺癌(NSCLC)lncRNA基因表达的影响,我们从GEO数据库中检索获得非小细胞肺癌辐照反应后Y染色体lncRNA基因表达谱数据芯片"GSE147708",并进行多个在线数据库分析.利用GEO2R筛选差异表达基因;DAVID在线工具进行GO和KEGG富集分析;String在线网站构建蛋白互作网络...     

辐照后A549细胞中差异表达lncRNAs的生物信息学筛选及预后价值分析

利用生物信息学方法筛选辐照处理后肺腺癌A549细胞中的差异表达lncRNAs,从Gene Expression Omnibus(GEO)公共数据库获得辐照后肺腺癌A549细胞的基因表达芯片GSE24876,利用GEO2R软件分析差异表达基因,利用DAVID在线数据库对差异基因进行重注释获取差异表达的lncRNAs。结果共筛选出相关的差异表达lncRNAs 33个,与未辐照处理的A549细胞相比,有4个表达上调,29个表达下调,差异均具有统计学意义。利用Gene-E软件进一步分析和验证lncRNAs的表达情况,结果与GEO2R的分析基本一致,但需进一步实验验证。预后分析的结果表明,高表达LINC00319(HR 1.21[1.02~1.42],p=0.026)和LINC01095(HR1.18[1.01~1.40],p=0.042)的肺癌患者拥有较差的总生存期。     

电离辐射对人皮肤成纤维细胞中超氧阴离子自由基浓度和…

＾６０Ｃｏγ射线１０－４０Ｇｙ照射正常人皮肤成纤维细胞，１ｈ后，细胞释放超氧阴离子自由量显著提高，其增高与照射剂量呈正相关。细胞超氧化物歧化酶活力明显下降，且与照射剂量呈负相关。组织蛋白酶Ｄ活力显著增高，其增高与照射剂量呈正相关。     

小剂量电离辐射增强小鼠免疫器官c—fos基因的表达

应用原位杂交方法观察７５ｍＧｙ Ｘ射线全身照射后不同小鼠胸腺，脾，肠系淋巴结ｃ－ｆｏｓ基因ｍＲＮＡ转录水平的变化。结果发现，假照组胸腺，脾，肠系膜淋巴结内巨噬细胞，多突起细胞，部分淋马细胞ｃ－ｆｏｓ ｍＲＮＡ有低水平基础表达；７５ｍＧｙ全身照射后ｃ－ｆｏｓ的转录水平明显增高，胸腺为１ｈ达峰值，脾脏２达峰值，肠系膜淋巴结变化幅度较小，但     

小剂量电离辐射增强小鼠免疫器官c－fos基因的表达

应用原位杂交方法观察７５ｍＧｙＸ射线全身照射后不同时间小鼠胸腺、脾、肠系膜淋巴结ｃ－ｆｏｓ基因ｍＲＮＡ转录水平的变化。结果发现，假照组胸腺、脾、肠系膜淋巴结内巨噬细胞、多突起细胞、部分淋巴细胞（主要为大淋巴细胞）ｃ－ｆｏｓｍＲＮＡ有低水平基础表达；７５ｍＧｙ全身照射后ｃ－ｆｏｓ的转录水平明显增高，胸腺为１ｈ达峰值，脾脏２ｈ达峰值，肠系膜淋巴结变比幅度较小，但持续时间较长。胸腺和脾脏阳性细胞１２ｈ基本恢复至假照水平，雨淋巴结细胞ｃ－ｆｏｓ至照后１２ｈ仍稍高于对照组。实验结果表明，小剂量电离辐射可使免疫活性细胞ｃ—ｆｏｓ的转录水平上调。     

肿瘤病人皮肤成纤维细胞离体培养及放射敏感性测定

试图通过对肿瘤病人皮肤成纤维细胞的离体培养和集落形成实验,检测正常皮肤组织的放射敏感性,为探索正常组织的辐射耐受性提供理论依据。运用组织贴块法体外培养肿瘤病人皮肤成纤维细胞;采用＾１３７Ｃｓγ射线,不同剂量照射,以克隆形成法测定细胞的放射敏感性。结果表明,肿瘤病人皮肤成纤维细胞通过体外培养能够增殖传代,不同肿瘤病人皮肤成纤维细胞的放射敏感性存在明显的个体差异。     

基因芯片技术分析20 cGy γ射线照射人淋巴母细胞中差异表达的基因谱

应用基因芯片技术对20 cGy ^60Coγ射线照射的人淋巴母细胞和对照细胞中的mRNA表达水平进行对比杂交分析,探索差异表达基因。结果发现在所分析的14112条日的基因中差异表达显著的基因（2倍以上差异）有83条,其中表达上调的有21条,表达下降的有62条,这些基因表达产物涉及到信号转导、细胞周期调节、免疫相关蛋白、细胞骨架与运动等功能基因。表明低剂量辐射对多种功能基因表达产生了影响,是调控细胞辐射反应最基本的分子基础。     

电离辐射对人皮肤成纤维细胞中超氧阴离子自由基浓度和超氧化物歧化酶与组织蛋白酶D活力的影响

６０Ｃｏγ射线１０～４０Ｇｙ照射正常人皮肤成纤维细胞，１ｈ后，细胞释放超氧阴离子自由基（Ｏ２）量显著增高，其增高与照射剂量呈正相关。细胞超氧化物歧化酶（ＳＯＤ）活力明显下降，且与照射剂量呈负相关。组织蛋白酶Ｄ活力显著增高，其增高与照射剂量呈正相关。在辐照０～４０Ｇｙ范围内，细胞释放Ｏ２量与细胞ＳＯＤ活力是负相关，而细胞释放Ｏ２量与细胞组织蛋白酶Ｄ活力呈正相关。     

电离辐射诱导EL-4淋巴瘤细胞G_1期阻滞及相关蛋白的表达

探讨X射线诱导EL 1细胞G1期阻滞及相关蛋白的表达。采用PI荧光标记 ,流式细胞术检测细胞周期的变化。用单克隆抗体免疫荧光标记 ,流式细胞术检测蛋白表达的变化。结果表明 ,2 0Gy和 4 0Gy照射后 12 72h ,G1期EL 4细胞百分数显著高于假照射组 ( p <0 0 5- p <0 0 0 1)。 4 0Gy照射后EL 4细胞 p53蛋白表达从照射后 2h开始明显增高 ,持续至照射后2 4h ( p <0 0 5- p <0 0 0 1) ;p2 1蛋白表达在照射后 2h开始明显增高 ,持续至照射后 4 8h ( p <0 0 5- p <0 0 0 1) ;GADD4 5蛋白表达在照射后 2h开始明显增高 ,持续至照射后 4 8h ( p <0 0 5- p <0 0 0 1) ;MDM 2蛋白表达在照射后 4h开始明显增高 ,持续至照射后 2 4h ( p <0 0 5- p <0 0 0 1)。结果提示 ,中等剂量X射线照射可诱导EL 4细胞G1期阻滞。p53、p2 1和GADD4 5蛋白表达在电离辐射诱导EL 4细胞G1期阻滞中起重要作用     

电离辐射诱导EL-4淋巴瘤细胞G1期阻党政军及相关蛋白的表达

探讨X射线诱导EL－4细胞G1期阻滞及相关蛋白的表达。采用PI荧光标记 ,流式细胞术检测细胞周期的变化。用单克隆抗体免疫荧光标记,流式细胞术检测蛋白表达的变化。结果表明,2．0Gy和4.0Gy照射后12-72h,G1期EL－4细胞百分数显著高于假照射组（P＜0．05－p＜0.001).4.0Gy照射后EL-4细胞p53蛋白表达从照射后2h开始明显增高,持续至照射后24h(p＜0．05－p＜0．001）;p21蛋白表达在照射后2h开始明显增高,持续至照射后48h(p＜0.05-p＜0.001);GADD45蛋白表达在照射后2h开始明显增高,持续至照射后48h(p＜0．05－p＜－0．001）;MDM2蛋白表达在照射后4h开始明显增高,持续至照射后24h（p＜0.05-p＜0.01）。结果提示,中等剂量X射线照射可诱导EL－4细胞G1期阻滞。p53、p21和GADD45蛋白表达在电离辐射诱导EL－4细胞G1期阻滞中起重要作用。     

电离辐射对小鼠骨髓细胞CDK4表达的影响

采用流式细胞术和Northern blot检测X射线全身照射后小鼠骨髓细胞CDK4转录水平和蛋白表达的变化。结果表明,2GyX射线全身照射后4－48h CDK4 mRNA转录水平及蛋白表达均明显下降;0.5-6Gy X射线全身照射后12h CDK4 mRNA水平及蛋白表达亦呈降低改变。结果提示,CDK4在电离辐射诱导的小鼠骨髓细胞G1期阻滞中可能起重要作用。     

电离辐射对小鼠胸腺细胞和脾细胞P53基因mRNA和蛋白表达的影响

采用流式细胞术和Northern blot法检测了不同剂量X射线全身照射后,小鼠胸腺细胞和脾细胞中p53基因mRNA和蛋白表达的变化。结果表明,2．0GyX射线全身照射后,小鼠胸腺细胞p53阳性细胞百分数与对照相比,在照后1h开始升高,8h达最高,以后逐渐下降。不同剂量X射线照射后,小鼠胸腺细胞和脾细胞中p53基因mRNA水平的观测结果表明,75mGy及2.0Gy全身照射后1-48h,小鼠胸腺细胞和脾细胞中p53mRNA水平均未见明显的变化;0.5-6.0GyX射线全身照射后4h,小鼠胸腺细胞和脾细胞中p53 mRNA水平亦未见明显的改变。结果提示,X射线全身照射可诱导小鼠淋巴细胞p53蛋白表达,其p53蛋白表达增加是通过转录后机制实现的。     

低剂量电离辐射在C57BL/6J小鼠肿瘤基因-放疗方案中的作用

为探讨低剂量电离辐射在C57BL／6J小鼠肿瘤基因-放疗方案中的作用,对荷瘤小鼠采用不同的治疗方案（单纯多次大剂量局部照射、单次大剂量局部照射加多次低剂量全身照射、pEgr-IL18-B7．1基因联合放疗）,观察其对肿瘤重量、全肺表面转移结节数以及肿瘤间质微血管密度的影响。结果显示,采用单纯放疗和基因-放疗与对照组相比均能显著降低肿瘤重量、全肺表面转移结节数和肿瘤间质微血管密度;单纯放疗方案中应用单次大剂量局部照射加多次低剂量全身照射与单纯多次大剂量局部照射相比,在降低治疗剂量的同时,能达到相近似的抑瘤效果。在基因-放疗方案中,基因导入联合单次大剂量局部照射后加多次低剂量全身照射的治疗效果明显优于联合应用常规多次大剂量局部照射。提示低剂量电离辐射可以通过减轻肿瘤负荷、减少肿瘤远处转移和抑制肿瘤间质血管形成,增强基因-放疗方案的抑瘤作用。     

辐射诱导人肝细胞子代基因差异表达及生物信息学分析

利用基因芯片技术和实时荧光定量RT-PCR技术,采用不同剂量60Coγ射线照射人正常肝细胞系HL-7702细胞,观察比较受照细胞克隆子代基因表达图谱的变化,筛选出差异表达基因,利用生物信息学方法分析构建基因相互作用网络图,对部分差异表达基因进行验证。结果表明,与对照组相比,共同的差异表达基因有71个,其中上调的35个,...     

γ射线致人肠皮细胞损伤的差异表达基因研究

采用ｍＲＮＡ差异展示技术分离正常和经＾６０Ｃｏγ射线照射的人肠上皮细胞株ＨＩＥＣ细胞之间的差异表达基因,为进一步揭开电离辐射对胃肠细胞损伤的分子机理奠定基础。从正常的和经γ射线照射的人肠上皮细胞中分离出差异条带共１０１条,３１个为新表达的差异片段,２９个为为高表达的差异片段,４１个为要表达的差异片段;其中１０个片段属于Ｄ－Ｔ１１Ｇ组,５９个片段属于Ｄ－Ｔ１１Ａ组,３２个片段属于Ｄ－Ｔ１１Ｃ组。从新     

γ射线致人肠上皮细胞损伤的差异表达基因研究

采用mRNA差异展示技术分离正常和经60Coγ射线照射的人肠上皮细胞株HIEC细胞之间的差异表达基因,为进一步揭开电离辐射对胃肠细胞损伤的分子机理奠定基础.从正常的和经γ射线照射的人肠上皮细胞中分离出差异条带共101条, 31个为新表达的差异片段, 29个为高表达的差异片段, 41个为要表达的差异片段;其中10个片段属于D-T11G组, 59个片段属于D-T11A组,32个片段属于D-T11C组.从新表达的差异片段中随机挑取5个片段作探针,与正常的及照射后的人肠上皮细胞总RNA进行打点杂交,进一步证实呈差异表达.结果表明,101个差异表达基因与γ辐射损伤有关,其中31个新表达基因可能与电离辐射引起正常组织损伤关系更密切.     

兔血管内皮细胞、平滑肌细胞酸性成纤维细胞生长因子受体的分析

为了解不同增殖时期血管内皮细胞（ＥＣ）、平滑肌细胞（ＳＭＣ）表面酸性成纤维细胞生长因子（ａＦＧＦ）受体的变化,并探讨ａＦＧＦ促血管内皮细胞和平滑肌细胞增殖作用的机制,以氯胺－Ｔ法＾１２５Ｉ标记的ａＦＧＦ为配体,用放射配体分析法研究静止期、增殖期血管ＥＣ、ＳＭＣ表面ａＦＧＦ受体表达的变化。结果表明,增殖期血管ＥＣ、ＳＭＣ表面ａＦＧＦ受体数量及亲和力较静止期明显增加,受体数量增加３－４倍,亲和力增加１     

电离辐射作用后粒—巨噬细胞修复的特性

运用粒－巨噬细胞集落（ＣＦＵ－ＧＭ）体外培养技术，观察了受次致死剂量＾６０Ｃｏγ射线照射的小鼠骨髓ＣＦＵ－ＧＭ的修复能力。实验测得正常小鼠每根股骨中ＣＦＵ－ＧＭ的总数和骨髓有核细胞总数分别为４．８９×１０＾４和２．４×１０＾７，经６Ｇｙ剂量照射后第３ｄ，两计数值分别下降到正常值的０．８％和４％，照射后第５ｄ出现回升。骨髓有核细胞计数和外周血白细胞数与ＣＦＵ－ＧＭ的变化规律相一致。