伊犁马催乳素受体基因的遗传多态性及其与产奶量的关联分析

试验旨在研究伊犁马催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因多态性及其与产奶量之间的关联性。以60匹伊犁马为研究对象,选取PRLR基因侧翼区的部分片段,采用PCR-SSCP技术检测其遗传多态性,并与伊犁马的日产奶量进行关联分析,研究PRLR基因的多态性与伊犁马产奶性能的关系。结果显示,PRLR基因侧翼区的2个片段均具有多态性,都存在3种基因型:AA、AB和BB,测序结果显示PRLR-P1的碱基突变位置为g.29764513 G>A,该突变为错义突变,导致其编码的氨基酸由组氨酸变成精氨酸,经关联分析发现,该突变对伊犁马日产奶量有显著影响(P<0.05);PRLR-P2的碱基突变位置为g.30106804 C>A,该突变为同义突变,未导致其编码的氨基酸发生改变,经关联分析发现,该突变对伊犁马日产奶量有显著影响(P<0.05)。伊犁马PRLR基因侧翼区的碱基突变与日产奶量之间存在关联性,且可能是影响伊犁马产奶性能的重要位点。     

伊犁马PRL、POU1F1基因多态性及其与产奶量的关联分析

为了研究伊犁马催乳素(PRL)基因、垂体转录因子(POU1F1)基因多态及其与产奶量之间的关系,试验以新疆伊犁昭苏牧场73头伊犁马母马为研究对象,利用PCR-RFLP技术分析了伊犁马PRL、POU1F1基因序列多态性,并与日均产奶量进行关联分析。结果显示,伊犁马PRL基因第二外显子上存在1个SNP:c.210CT;POU1F1基因CDS区上没有发现多态,但内含子区存在1个SNP:g.2758GA。POU1F1基因不同基因型间日均母马产奶量差异不显著(P0.05),但PRL基因c.210位点多态对伊犁马日均产奶量有显著影响(P0.05)。因此,PRL基因的多态位点有潜力用作伊犁马产奶量性状选育的分子标记。     

伊犁马GHR基因多态性及其与泌乳性能的关联分析

马奶具有较高的营养价值,但目前关于马泌乳性能方面的研究很少。本实验对伊犁马生长激素受体(GHR)基因外显子和启动子设计13对引物,以DNA混合池为模板,采用PCR-RFLP法检测188匹伊犁马GHR基因多态基因型,并分析有产奶量记录的73匹伊犁马GHR基因多态性与泌乳性状之间的关系。结果表明:在伊犁马中检测到GHR基因启动子T-562C突变,CC、TC、TT 3种基因型,其基因型频率分别0.309、0.676、0.016;C为优势等位基因,频率为0.646,T基因频率为0.354;虽然各基因型间产奶量并没有显著差异(P0.05),但各基因型的产奶量依次为TTCCTC,基因C突变为T可使产奶量有上升趋势,研究结果可为我国乳用马的选育提供一定的参考。     

伊犁马ACTN3基因外显子多态性研究

旨在鉴定新疆伊犁马ACTN3基因外显子多态位点及其单倍型,分析不同单倍型对mRNA表达量和蛋白质结构的影响,为进一步探究其基因型与运动性能的关联奠定基础。以38匹伊犁马为研究对象,通过直接测序法筛选ACTN3基因多态性位点并进行基因型分析,并通过haploview 4.2软件进行单倍型分析;利用在线软件(RNAfold和sopm)进行生物信息学分析。结果表明,在伊犁马ACTN3基因的外显子中共发现了8个多态位点,其中T9059G为错义突变,其余均为同义突变;A6206G和A11517G之间存在强的连锁,其余各突变间也存在一定程度的连锁关系;构建出的14种单倍型中,单倍型H1(GGATCCCG)为优势单倍型,各单倍型使得ACTN3基因mRNA二级结构和最小自由能发生改变,且T9059G使得蛋白质二级结构改变。结果提示,T9059G突变位点影响ACTN3蛋白质的二级结构,可能是对伊犁马运动性能产生影响的重要功能位点。     

引进品种对伊犁马产奶量改良效果的分析

【目的】对比分析引进马品种新吉尔吉斯马与伊犁马杂交后代(XY)、奥尔洛夫马与伊犁马杂交后代(AY)的产奶性状,进一步研究比较两个引进马品种对伊犁马乳用性能的改良效果,为新疆乳用马新品种培育提供理论依据。【方法】随机选取两个杂交群体中成年母马30匹,分别采集和统计样本的最高日产奶量、日均产奶量、周平均产奶量、月平均产奶量及全期产奶量,比较不同产奶量在两个杂交群体间的差异,并对同一群体中的不同产奶量进行相关性分析。【结果】两个杂交群体XY和AY的平均最高日产奶量、日均产奶量、周平均产奶量、月平均产奶量、全期产奶量分别为8.15kg、6.00kg,6.15kg、5.34kg,43.94kg、36.94kg,133.45kg、97.38kg,738.41kg、641.94kg。在最高日产奶量、周平均产奶量、月平均产奶量和全期产奶量上,杂交后代XY显著高于AY(P<0.05);不同产奶量之间呈正相关关系,不同品种的各产奶量之间相关程度不同。【结论】引进马品种新吉尔吉斯马对伊犁马的产奶性能具有较好的改良效果。     

POU1 F1基因多态性与南方荷斯坦牛产奶量的相关性分析

采用PCR-RFLP技术研究了364头荷斯坦牛POU1 F1基因第二外显子的TaqⅠ酶切位点(e2-TaqⅠ)和第六外显子的HinfⅠ酶切位点(e6-HinfⅠ)多态性,并分析了两个位点多态性与泌乳量的关系。结果表明,实验群体中这两个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态,e2-TaqⅠ位点等位基因G/A的频率为0.2706/0.7294,e6-HinfⅠ位点等位基因G/A频率为0.3228/0.6772。性状关联结果表明,两个位点的基因型与第一、二胎泌乳量相关性不明显。     

奶牛催乳素基因多态性与产奶量的关系

通过PCR-RFLP的方法,对201头武汉荷斯坦奶牛中催乳素基因Exon3的多态性进行了分析,得到3种基因型:AA、AB和BB,基因型频率分别为81.59%、16.42%、1.99%,并时不同基因型间产奶量进行了分析。结果表明:AA、AB和BB基因型奶牛的产奶量之间没有显著差异(P>0.05);但AA基因型奶牛的产奶量最高,AB基因型奶牛的产奶量次之,BB基因型最低。     

奶牛群体生长激素基因多态性与产奶量关联性

设计7对引物,利用PCR-SSCP技术检测GH基因在130头中国荷斯坦奶牛群体的遗传多态性,研究该基因对产奶量的影响。结果发现在GH基因的第3内含子、第5外显子和3′端存在多态性。GH基因第3内含子等位基因A、B的基因频率为0.775和0.225,3′端等位基C、D在奶牛群体中的基因频率为0.729和0.271,GH基因第5外显子等位基因E、F和G、H在奶牛群体中的基因频率分别为:0.507、0.138和0.259、0.096,GH基因第3内含子座位上不同基因型对305d产奶量有显著效应,AB基因型305d产奶量显著高于AA和BB型(P0.05)。     

娟珊牛LOX-1基因多态性与产奶量的关联分析

为了研究娟珊牛LOX-1基因的多态性与产奶量的相关性,试验采用PCR产物直接测序的方法,分析娟珊牛LOX-1基因内含子4和3'非编码区的多态性,统计不同基因型娟姗牛305 d的平均产奶量,然后分析娟姗牛LOX-1不同基因型与产奶量的关联性。结果表明:在娟珊牛LOX-1基因内含子4检测到2个SNPs,均有3种基因型,分别为CC、CT、TT和AA、AG、GG,但不同基因型个体间的305 d平均产奶量差异不显著(P0.05);在3'UTR区检测到1个SNP,有CC和AC 2种基因型,其中CC型为优势基因型,其频率为0.909 1,且其个体的305 d平均产奶量高于AC型(P0.05)。基因型组合效应分析发现CTAGCC为优势组合基因型,但不同的组合基因型间305 d平均产奶量差异不显著(P0.05)。     

伊犁马MyoG基因外显子1多态性与肉质性状及肌纤维性状关联分析

为寻找伊犁马肉质性能的分子标记,试验以38匹伊犁马为材料,测定肉质性状（失水率、熟肉率、剪切力）和肌纤维性状（肌纤维横截面积、肌纤维直径、肌纤维密度）,利用PCR直接测序法检测肌细胞生成素（meyogenin,MyoG）基因外显子1在伊犁马群体中的多态性,并对MyoG基因SNPs不同基因型与肉质、肌纤维性状进行关联分析。结果表明,MyoG基因外显子1检测出5个突变位点,分别为SNP1（g.31187343 A>C）、SNP2（g.31187333 G>A）、SNP3（g.31187132 C>T）、SNP4（g.31187105 C>G）和SNP5（g.31187099 C>T）,其中SNP1为错义突变,碱基A突变为C使得氨基酸由苏氨酸突变为脯氨酸,其他位点均为无义突变。SNP3和SNP4为中度多态位点,SNP1和SNP2为低度多态位点,这4个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。MyoG基因外显子1中SNP1和SNP4不同基因型个体失水率、熟肉率、肌纤维横截面积、肌纤维直径、肌纤维密度差异显著（P<0.05）;SNP3不同基因型个体熟肉率、肌纤维横截面积、肌纤维密度差异显著（P<0.05）;SNP2不同基因型个体各指标差异均不显著（P>0.05）。综上,伊犁马MyoG基因外显子1检测到5个多态位点,其中SNP1（g.31187343 A>C）、SNP3（g.31187132 C>T）和SNP4（g.31187105 C>G）位点不同基因型对肉质及肌纤维性状有显著影响,这些位点可作为伊犁马肉质性能潜在分子标记。     

HMGCR基因多态性与肉牛屠宰性状相关性分析

MHGCR是胆固醇生物合成过程中的限速酶,在内源胆固醇生物合成过程中起着重要的作用。研究以牛HMGCR基因为候选基因,采用PCR-SSCP和测序技术在利杂牛、利西杂牛、秦川牛、西杂牛和夏西杂牛五个群体共123个个体中检测遗传变异情况。结果表明,检测到AA和AB共2种基因型,没有发现BB基因型,测序分析发现一处SNP多态位点(GenBank:BC153262.1 11137TC)。不同基因型与屠宰性状的相关性分析显示,在利西杂群体中AA基因型个体与AB基因型个体相比,AA基因型个体的屠宰率和牛柳指标达到了极显著水平(P0.01),而AA基因型的上脑重显著高于AB基因型(P0.05),其余各项指标基因型间差异不显著(P0.05)。因此,HMGCR基因单核苷酸多态性对利西杂牛脂肪沉积有一定的影响,可作为影响屠宰性状的候选基因,指导肉牛的育种工作。     

INHA基因多态性与猪产仔数的相关性分析

研究选取抑制素α(INHA)基因为候选基因,采用PCR-RFLP和不对称PCR-SSCP技术检测其在大白猪、长白猪中的多态性,并对大白猪、长白猪不同基因型、合并基因型与猪产仔数的关系进行了分析。结果表明:INHA基因在长白、大白猪中存在外显子ⅡG262A位点突变,该位点引起Hin6Ⅰ限制性内切酶酶切位点的改变,G等位基因为优势等位基因,GG型为优势基因型。利用不对称PCR-SSCP结合测序发现外显子ⅡA852G位点产生突变,研究表明,B为优势基因,BB为优势基因型。基因型合并分析表明,BBGG基因型为优势合并基因型,在大白猪中,总产仔数BBGG基因型要比BCGG基因型高0.7头,产活仔数BBGG基因型要比BCGG基因型高1.5头;而在长白猪中,总产仔数BBGG基因型比BCGG总产仔数高2.0头,产活仔数BBGG基因型要比BCGG基因型高1.73头。合并基因型的遗传效应并不是各基因效应的简单相加,但却要稍高于最好的单个基因型效应。     

中国荷斯坦牛k—酪蛋白基因多态性与产奶量的相关分析

本文利用ＰＣＲ－ＲＦＬＰｓ方法对２６头中国荷斯坦牛ｋ－酪蛋白基因进行分析,用ＨｉｎｄⅢ和ＰｓｔⅠ酶切发现了多态性。     

中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因多态性与产奶量的相关分析

本文利用ＰＣＲ ＲＦＬＰＳ方法对２６头中国荷斯坦牛κ 酪蛋白基因进行分析,用ＨｉｎｄⅢ和ＰｓｔⅠ酶切发现了多态性。分析κ 酪蛋白基因型与奶产量间的关系,第１胎ＢＢ基因型高于ＡＡ基因型,第２胎及总胎次ＡＡ基因型高于ＢＢ基因型。     

麒麟鸡MCEE基因多态性与体重的相关性分析

为了探讨MCEE基因作为麒麟鸡生长性状遗传标记的可能性,试验选择1日龄健康麒麟鸡126只,采用Sanger测序法对MCEE基因的3'UTR区进行单核苷酸多态性(SNP)检测,并分析对麒麟鸡生长性状的影响。结果表明:麒麟鸡MCEE基因的3'UTR区检测到2个SNP突变位点,即第8 959位碱基的G/A转换和第9 082位碱基的C/T转换,分别命名为G8959A和C9082T;MCEE基因3'UTR区G8959A位点形成GG、GA和AA 3种基因型,C9082T位点形成CC和CT 2种基因型;MCEE基因G8959A突变位点的GG型个体21日龄体重显著高于GA型个体(P0. 05),极显著高于AA型个体(P0. 01),G为优势等位基因,基因频率为0. 655,GG型为优势基因型,基因型频率为0. 429;MCEE基因C9082T突变位点的CC型个体21日龄体重显著高于CT型个体(P0. 05),C为优势等位基因,基因频率为0. 786,CC型为优势基因型,基因型频率为0. 571。说明MCEE基因3'UTR区检测到的2个SNPs位点(G8959A和C9082T)对21日龄麒麟鸡体重有显著或极显著影响(P 0. 05或P 0. 01),G8959A位点GG基因型和C9082T位点CC基因型为优势基因型,适合作为麒麟鸡生长性状的有效遗传标记。     

HMGCR基因多态性与肉牛屠宰性状相关性分析

蛋白质作为功能基因表达的产物,直接或间接参与机体内各种生命代谢活动的调控,为人类认识各种生命活动的本质提供了直观的分子学基础.随着后基因组时代的到来,蛋白质组学必将在包括动物科学在内的众多生物学研究领域内发挥巨大的作用.论文介绍了蛋白质组学的研究现状及其在动物肉品质、奶品质、禽蛋、动物毛发和动物疾病等研究方面的应用,并对应用中的具体理论依据和技术手段进行说明.     

SIRT1基因多态性与肉牛屠宰性状相关性分析

本文以牛的SIRT1基因为候选基因,采用PCR-SSCP和测序技术在利杂牛、利西杂牛、秦川牛、西杂牛和夏西杂牛5个牛群体共129头个体中检测遗传变异情况。结果表明:检测到AA、AB、AD、BD和DD共5种基因型,测序分析发现4处SNPs多态位点(Gen Bank:NM_001192980.1:g.-382AG、-306TC、-274GC、-271GC)。5个群体中不同基因型与屠宰性状的相关性分析显示,AD和BD基因型屠宰率显著高于AB、BD基因型眼肉显著高于AA、AB、AD和DD基因型,AA基因型背膘厚显著高于AA、AB、AD和DD、BD基因型净肉率显著高于AB、AD和DD基因型均达到显著水平(P0.05)。因此,SIRT1基因单核苷酸多态性对5个牛群体的屠宰性状有一定的影响,可作为影响屠宰性状的候选基因,指导肉牛的育种工作。     

鸽载脂蛋白B基因多态性与生长性状相关性分析

利用PCR-SSCP技术和DNA测序方法检测两群体鸽apoB基因编码区序列的单核苷酸多态性,最小二乘分析表明,A57G突变位点导致的3种基因型对石岐肉鸽屠体率及灰色肉鸽屠体重、腹脂率、肝脏重有显著影响(P<0.05);对灰色肉鸽活重、腹脂重、肝脏率及石岐肉鸽活重和全净膛率有一定影响(P<0.2).多重比较显示,石岐肉鸽群体中,BB基因型个体的屠体率高于从基因型个体.灰色肉鸽群体中,BB基因型个体的屠体重、肝脏重、腹脂率均为最大.