N，N-二甲基二2-溴苯乙胺类衍生物活性与CoMFA、CoMSIA的研究

用比较分子力场分析（CoMFA）法和比较分子相似性指数分析（CoMSIA）法，建立N，N-二甲基-2-溴苯乙胺类化合物的3D—QSAR模型。CoMFA模型中，其交叉验证系数q^2=0．792，传统的相关系数R^2=0．955（R=0．978），相应立体场贡献为77．4％、静电场贡献为22．6％，优于文献的报导。CoMSIA研究中，其交叉验证系数q^2=0．757，传统的相关系数R^2=0．917（R=0．958），其疏水场、立体场、静电场贡献依次为：42．9％、39．5％、17．6％。用两种模型分别预测检测集分子的活性，结果与实验值较吻合。说明所建的模型具有较好的预测能力。通过分析CoMFA分子场等值线图，可为优化N，N-二甲基-2-溴苯乙胺类衍生物的结构提供理论指导。     

类青蒿素抗疟活性3D-QSAR研究

采用比较分子力场分析(CoMFA)法,将40个类青蒿素的抗疟活性作了定量构效关系的研究。所得模型交叉验证系数q2为0．601,非交叉验证系数r2为0．982,标准偏差SE=0．140,F=302．246,其中立体场与静电场的贡献分别为33．0％和67．0％。CoMFA离散图表明,增大C13上取代基的体积以及增强O15上取代基的电负性等,都有利于提高化合物的抗疟活性。该模型的离散图为改造此类化合物的结构提供理论依据和研究方向。     

N,N-二甲基-2-溴苯乙胺类衍生物活性与CoMFA、CoMSIA的研究

用比较分子力场分析(CoMFA)法和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)法,建立N,N-二甲基-2-溴苯乙胺类化合物的3D-QSAR模型。CoMFA模型中,其交叉验证系数q2=0．792,传统的相关系数R2=0．955(R=0．978),相应立体场贡献为77．4％、静电场贡献为22．6％,优于文献的报导。CoMSIA研究中,其交叉验证系数q2=0．757,传统的相关系数R2=0．917 (R=0．958),其疏水场、立体场、静电场贡献依次为:42．9％、39．5％、17．6％。用两种模型分别预测检测集分子的活性,结果与实验值较吻合。说明所建的模型具有较好的预测能力。通过分析CoMFA分子场等值线图,可为优化N,N-二甲基-2-溴苯乙胺类衍生物的结构提供理论指导。     

1,2,4-oxadiazole类非季胺肟胆碱酯酶重活化剂的CoMFA研究

应用比较分子力场法(CoMFA)研究一系列1,2,4-oxadiazole非季胺肟类乙酰胆碱酯酶(AChE)重活化剂的三维定量构效关系。以肟基(-c=N-OH)部分进行有效分子重叠,得到两个不同种属的CoMFA 摸型的交叉验证系数q~2>0.5,具有一定预测能力及合理性。其中,该类化合物在复活人类体外EPMP 抑制的AChE 活性的3D-QSAR 模型中q~2=0.530,非交叉验证模型相关系数r~2=0.992,标准偏差SE=0.198,F=196.7;并依据此模型设计、预测了3个理论上具有较高活性的化合物。     

应用比较分子力场分析法研究氯代苯酚化合物结构与活性的相关性

苯酚是一类对水生生物有严重危害作用的工业化合物。通过比较分子力场分析(CoMFA)法建立标题化合物对发光菌和浮萍活性的三维定量结构-活性关系(3D-QSAR)模型。其中,对发光菌的研究结果为:交叉验证系数q2=0．921,传统的相关系数(非交叉验证系数)R2=0．990。对浮萍的研究结果为:交叉验证系数q2=0．931,传统的相关系数(非交叉验证系数)R2= 0．995。取得优于文献的结果。     

DNA依赖蛋白激酶抑制剂的CoMFA研究

运用比较分子力场分析方法(CoMFA),以DNA依赖蛋白激酶(DNA-PK)抑制剂分子为研究对象,建立1组对DNA依赖蛋白激酶有抑制活性化合物的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,探索其活性数据和三维结构参数的关系,所建最佳模型交叉验证相关系数q2=0.670,非交叉验证相关系数R2=0.993,标准偏差SD=0.053,说明该模型预测能力较好.根据CoMFA模型的三维等势图可知,小体积、电负性大的取代基团,能提高该类化合物的活性,为新型DNA-PK抑制剂分子的设计提供了理论依据.     

新非核苷喹诺酮类HIV-1逆转录酶抑制剂的CoMFA研究

目的：应用比较分子力场法(COMFA)研究一系列喹诺酮类对HIV-1逆转录酶抑制活性的三维定量构效关系,为进一步抗HIV药物设计提供理论依据。方法和结果：在研究的29个化合物中,用比较分子力场法得到一个CoMFA模型,交叉验证系数为q~2=0.556,具有较高的预测能力及合理性,非交叉验证模型相关系数分别为r~2=0.998,标准偏差SE=0.044,F= 401.038;结论：此模型对设计和预测高活性的喹诺酮类HIV-1逆转录酶抑制活性的化合物有一定可靠性。     

苯酰胺类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的分子对接及三维定量构效关系研究

利用surflex-dock模块对59个苯酰胺类抑制剂和组蛋白去乙酰化酶进行了对接研究,分析了配体和受体的相互作用模式,所得结论与文献报道的实验结果符合。并利用比较分子力场分析方法(comparative molecular field anal-ysis,CoMFA)对此类抑制剂分子进行了三维定量构效关系研究,所建模型交叉验证相关系数q~2=0.640,非交叉验证相关系数r~2=0.932,有较好的预测能力。CoMFA得到的立体场和静电场的等值线图可用于指导新型药物的设计与合成。     

联苯酰胺类p38αMAPK抑制剂三维定量构效关系研究

p38α丝裂原活化蛋白激酶(p38α mitogen-activated protein kinase,p38α MAPK)是治疗类风湿关节炎的最有效的靶点之一,联苯酰胺是最近新发现的一类强效、高选择性的p38α MAPK抑制剂,本文运用比较分子力场分析(CoMFA)研究21个联苯酰胺类p38αMAPK抑制剂三维定量构效关系.建立CoMFA模型的交叉验证系数q2=0.542,非交叉验证相关系数r2=0.935,统计方差比F=43.136.预测训练集和测试集化合物活性,其值和实验值非常接近,表明模型的预测能力很好.模型显示立体场和静电场对生物活性的贡献分别为78.8%和21.2%.CoMFA模型的三维等值图可为化合物的结构改造提供理论依据.     

黄酮类化合物的3D-QSAR研究

从NCI数据库中,筛选出67个与矢车菊黄素类似的天然黄酮化合物.采用CoMFA方法研究其构效关系,构建CoMFA模型,其模型相关系数为q2=0.599,r2=0.919,验证模型的预测能力和拟合能力较好.通过分子场等势图,可直观分子周围立体和静电特征对化合物活性的影响,为设计高活性黄酮衍生物提供理论依据.     

基于近红外光谱的水蜜桃采摘期的鉴别方法

提出了一种利用近红外漫反射光谱技术结合光纤传感技术建立水蜜桃采摘期的鉴别方法.从无锡阳山镇的某大棚采摘了距最佳采摘期天数为3,2,1以及处于最佳采摘期的水蜜桃各48个,用近红外光谱仪对样品进行了光谱采集.对原始光谱进行平滑、一阶微分和多元散射校正预处理,采用主成分分析(PCA)结合偏最小二乘(PLS)法建立了水蜜桃采摘期的鉴别模型.研究显示:一阶微分和平滑组合预处理后的鉴别模型效果最好,校正集模型和预测集模型的决定系数分别为0.9279和0.9138;模型的内部交叉验证均方差(RMSECV)和预测均方根偏差(RMSEP)分别为0.3003和0.3349;水蜜桃样品校正集和预测集的鉴别正确率分别为95.13%和93.75%.结果表明:利用近红外漫反射光谱技术对水蜜桃采摘期的鉴别具有很好的应用前景.     

Random generation of industrial pipelines’ data using Markov chain model

Random generation of data sets is a vital step in simulation modeling. It involves in generating the variation associated with the real system behavior. In the industrial fabrication of construction components, unique products such as pipelines are produced. The fabrication processes are dependent on pipelines features, and complexity; randomly generating pipelines structure is imperative in the simulation of such processes. This paper investigates the nature of industrial pipelines and proposes a Markov chain model to randomly generate pipelines data structure. The performance of Markov chain model was tested against real pipelines through a three-stage validation process. The validation process includes (1) a validation based on the number of components and the pipelines components correlation analysis, (2) clustering-based model validation, and (3) model validation using similarity distances between pipelines feature vectors. The Markov chain model was found to generate a reasonable pipelines data structure when compared with real pipelines. It was found that 89% of the generated pipelines share similar properties equivalent to 0.88 (a scale from 0 (not identical) to 1 (identical)) to 85.5% of the original pipelines.     

三维氨基酸描述子(SVTD)在HLA-A*0201限制性CTL表位肽QSAR中的应用

应用新型的三维氨基酸描述子-SVTD对65个HLA-A 0201 限制性CTL表位肽进行结构表征,通过多元线性回归对其结构与活性的关系建立定量构效关系 QSAR 模型,采用内外双重验证的办法分析验证模型的稳定性,建模计算值,留一法(leave-one-out,LOO)交互检验预测值和外部样本预测值的相关系数R,Rcv,...     

基于船载太阳光度计的中国海域MODIS卫星反演气溶胶光学参数验证

利用2006~2007年中国海洋大学东方红2号科考船在中国黄海和东海海域的POM-01MK2太阳光度计气溶胶光学参数的观测资料,与MODIS反演结果进行比较,给出了光学厚度、| ngstrm指数和粒子有效半径的对比结果。结果表明：两种观测方法得到的气溶胶光学厚度的一致性较好,相关系数（标准差）达0.97（0.08）,73%的对比结果在期望误差（Δτ=±0.03±0.05τ）之内;季节分类对比结果,秋季和春季相关系数（标准差）均为0.97（0.08）;海域分类对比结果,黄海北部海域和黄海南部海域相关系数（标准差）分别为0.98（0.08）和0.76（0.10）。MODIS反演得到的| ngstrm指数偏低,相关系数（标准差）为0.67（0.23）;按季节分类得到,秋季和春季相关系数（标准差）分别为0.71（0.27）和0.62（0.19）;按海域分类得到,黄海北部海域和黄海南部海域相关系数（标准差）分别为0.87（0.07）和0.70（0.30）。粒子有效半径的对比结果偏差和离散度较大,相关系数（标准差）仅为0.31（0.10）。造成这种现象的原因可能是该海域沙尘气溶胶和人类源二次气溶胶浓度较高导致海上气溶胶光学性质同MODIS反演中使用的光学参量有较大差别。     

地棘蛙素及其相关化合物对(α4)2(β2)3型烟碱乙酰胆碱受体的3D-QSAR研究

采用比较分子场分析法CoMFA研究地棘蛙素及其相关化合物的结构与活性关系,构建了三维构效关系模型,其相关参数q2(交叉验证相关系数)=0.526,r2(非交叉验证相关系数)=0.868,说明此模型具有良好的拟合能力和预报能力。依据模型,设计了8个地棘蛙素的类似物,并定量给出其预测活性值,证明模型可为设计高活性的烟碱乙酰胆碱受体激动剂提供理论依据。     

分子电性距离矢量(MEDV-B)用于二肽的分子结构表征与生物功能预测

使用从分子一级拓扑结构出发、结合分子中非氢原子电性和键连属性以及原子间相对距离的分子电性距离矢量（MEDV-B）,对58个血管紧张素转化酶（ACE）抑制剂二肽和48个苦味（BT）二肽进行定量结构活性相关（QSAR）研究,用多元线性回归建立矢量描述子与活性观测值间相关模型,并用留一法交互校验（LOO-CV）检验其预测力,取得较满意的结果（ACE：n=58,m=10,R=0．894,RCF=0．818;BT：n=48,m=10,R=0．947,R=0．898）;再用逐步回归对变量进行筛选与优化,建立新模型,稳定性与预测力得到进一步改善（ACE：n=58,m=5,R=0．859,RCV=0．824;BT：n=48,m=5,R=0．931,RCV=0．908）。结果表明：该矢量描述子可用于二肽结构表征与生物功能预测,且计算简便。     

近红外和高光谱技术用于小麦籽粒蛋白含量预测探索

以57份小麦籽粒为样本,分别采用Vertex 70傅立叶近红外光谱仪(单籽粒测样附件)和近红外增强型高光谱成像系统采集光谱,建立预测小麦籽粒蛋白含量的模型。基于近红外的小麦单籽粒模型相关系数为0.52,交叉校验均方根误差为0.807;而基于高光谱建立的模型相关系数为0.81,交叉校验均方根误差为0.7035。结果表明:在样本量少且为籽粒形态时,可优先考虑高光谱技术替代传统的近红外单籽粒采样模式来检测样本内部品质,但其实用性还有待进一步验证。若深入结合图像信息,高光谱技术在农产品内外品质检测方面有更广阔的应用。