哺乳动物DNA甲基化与基因表达调控

DNA甲基化是基因表达的重要调控方式,是真核细胞中最常见的转录水平的修饰方式之一。DNA甲基化是一种遗传外修饰,在维持细胞正常发育和调节基因表达中起重要作用,异常的甲基化可导致肿瘤的形成,并同癌症发生发展密切相关。     

核糖开关调控基因表达的热力学与动力学机制

核糖开关是一种新型基因表达调控元件,一般存在于mRNA的非编码区内。当核糖开关与特定配体分子结合后,其构象发生相应变化,然后启动或阻断mRNA的转录、翻译、拼接等过程,行使基因调控的功能。近期研究发现,核糖开关对基因表达的调控不仅仅与配体分子的数量有关,还与mRNA转录速度有关,即存在热力学与动力学调控两种机制。对核糖开关介导的基因表达调控机制的深入了解,将促进其在生物技术及新药研究等领域的应用。     

miR-212对疾病基因表达调控的研究进展

miRNAs是存在于动植物中的一类RNA分子,每一个miRNA可以调节一个或多个基因,具有十分复杂的调节网络.根据现有研究,miRNA至少调节人类1/3的基因.miR-212是一种新发现的miRNA,它的表达在人类某些疾病的发生、发展过程中起到了非常重要的作用,在阐释相关疾病的发病机制、筛选诊断标志物、疾病的治疗、新药...     

负调控元件在异丙酚对白细胞介素2受体α基因表达调控中的作用

目的探讨负调控元件(NRE)在异丙酚对IL-2Rα因表达调控中的作用。方法将包含/删除NRE的IL-2Rα基因上游调控序列驱动的氯霉素乙酰基转移酶(CAT)报告基因质粒通过脂质体法稳定转染Jurkat细胞。转染48h后的细胞随机分为2组,对照组(C-NRE组,C-NRE-D组)及分别加入50M异丙酚组(P-NRE组,P-NRE-D组)。并在异丙酚处理5h后收集细胞,使用荧光测定法检测CAT活性。结果 NRE删除后,C-NRE-D组CAT活性较C-NRE组显著升高(P<0.05)。异丙酚处理后,P-NRE组CAT活性较C-NRE组明显降低(P<0.05),C-NRE-D组与P-NRE-D组间CAT活性无显著性差异(P>0.05)。结论 NRE是异丙酚对IL-2Rα基因表达调控的重要位点。     

MnSOD基因表达及其活性调控的研究进展

神经缺血时,神经元中线粒体的功能会发生紊乱,神经元内会产生过量的活性氧族(ROS)[1],ROS通过内在氧化应激调节因子的相互作用能够改变胞内的氧化还原状态,最终导致细胞的损伤[2].内源性的抗氧化酶可以催化降解这些ROS,保持细胞内环境的稳定.     

利用威布尔模型研究药物的尿排泄

为建立药物尿排泄的处理模型 ,采用威布尔分布模型研究药物的尿排泄 ,计算了模型参数 α、β、t0 、T0 .0 5 和 Td。结果显示 ,威布尔分布函数能拟合药物尿排泄的过程 ,参数 t0 、T0 .0 5 和 Td可以衡量药物的排泄速率。     

衰老——生理性肾虚证的HPAT分子网络调控研究

人体生命活动是有机体在内外环境作用下，由多种因素作用而维持动态的相对平衡过程。人体是一个统一的整体，机体各个系统虽各有独特的生理功能，但是它们都受神经一内分泌系统的支配。现在已经证实神经内分泌系统与免疫系统之间存在双向信息传递机制，即免疫系统不仅受神经、内分泌系统的调控，而且还能调节神经、内分泌系统的某些功能，它们拥有一套共同的化学信息、分子与受体，使这二侗系统之间得以相互交通和调节，呈多维立体网络状的联系。1977年Basedovsky首次提出体内存在神经内分泌免疫（NEI）网络的假说，已成为当前医学、生物学研究的前沿领域之一。     

GLP—1受体基因表达cAMP-PKA途径调控的研究

本文利用蛋白激酶A(PKA)的激活剂Forsolin对大白鼠胰岛素瘤细胞(RINm5F)上GLP一1受体的基因表达进行了研究。在forskolin的作用下,使类胰高血糖素肽I(GLP—1)受体的转水平明显下降,即GLP一1受体mRNA的量明显减少,出现了GLP一1受体基因表达的负调控,但forskoln可以使GLP—1受体的mRNA的稳定性增加结果表明,GLP—1受体的转录是通过cAMP—蛋白激酶A途径进行调控的,因此,影响此途径的物质对类胰高血糖素肽—1的生理功能以及在临床应用方面起着重要作用。     

链霉菌自动调控因子的研究进展

γ-丁酸内酯自动调控因子是一种由链霉菌产生的被称为微生物"激素"的小分子化合物,它控制着链霉菌次级代谢物的产生或形态分化。根据该类自动调控因子C-2位细微的结构差别分为三种类型,分别为A因子型、VB型和IM-2型。本文详细介绍了每种类型中具有代表性的自动调控因子、受体及其对链霉菌次级代谢与形态分化的调控作用,并系统地阐述了其调控网络。     

研究构建可自组织细胞极化合成调控网络

<正>来自加州大学旧金山分校和北京大学的研究人员日前在合成生物学研究中取得重大突破,设计并构建出了可自组织细胞极化的合成调控网络。相关论文"Designing Synthetic Regulatory Networks Capable of Self-Organizing Cell Polarization"发表在10月4日的《细胞》(Cell)杂志上。加州大学旧金山分校的Wendell A.Lim博士和北京大学的汤超(Chao Tang)教授是这篇论文的共同通讯作者。     

脑神经胶质瘤替莫唑胺耐药 circRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建

目的 筛选脑神经胶质瘤替莫唑胺耐药细胞株U87/TR与亲本细胞株U87的环状RNA(circRNA)差异表达谱以及构建关键环状RNA(circRNA)-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络.方法 2020年1—6月,应用circRNAs芯片检测神经胶质瘤替莫唑胺耐药细胞circRNAs差异表达谱,并进行RT-PCR验证.用miRanda数据库预测circRNA-miRNA靶向结合关系,通过miRanda v5、TargetScan、miBase数据库预测靶基因,Cytoscape软件构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络.结果 circRNA芯片结果显示,与U87细胞比较,U87/TR细胞有313个差异有统计学意义表达的circRNAs(P<0.05),其中145个显著上调,168个明显下调;RT-qPCR验证结果与芯片结果相符.miRNA靶位点预测结果显示,关键上调人环状RNAhsa_circRNA_009054,hsa_circRNA_104338(n=3,t=12.09、9.52,P=0.007、0.011)以及下调hsa_circRNA_016459,hsa_circRNA_101975(n=3,t=13.86、7.75,P=0.005、0.016)可与hsa-miR-33a-5p,hsa-miR-15b-3p以及hsa-miR-193b-5p,hsa-miR-23a-5p等多个miRNAs靶向结合,关键circRNA-miRNA-mRNA调控网络包括4个关键circRNAs,20个关键miRNAs,以及278个关键mRNAs.结论 cir?cRNA在脑神经胶质瘤替莫唑胺耐药细胞中异常表达,hsa_circRNA_009054,hsa_circRNA_104338以及hsa_circRNA_016459,hsa_circRNA_101975等关键circRNA可能通过circRNA-miRNA-mRNA调控网络参与脑神经胶质瘤替莫唑胺的耐药过程.     

放射调控Bax基因表达的pEgr-Bax载体构建和鉴定

目的：探讨放射诱导肿瘤凋亡进而治疗肿瘤的新方法，构建含Egr-1启动子和Bax基因的表达载体。方法：以Egr-1启动子和Bax为靶基因，以pIRES—EGFP质粒为载体。根据Egr-1基因的DNA序列和Bax基因的c—DNA序列设计引物，分别从bab／c雌鼠的肝细胞提取含Egr-1启动子序列的DNA，从乳腺癌细胞（MCF-7）中提取含Bax—d基因序列目的基因，克隆到空载体pIRES—EGFP中，并转化至DH5α感受态细胞中，提取质粒，进行PCR鉴定和测序确认重组载体构建成功。结果：经PCR鉴定筛出的重组体的测序结果与目的基因序列相同．重组体构建成功。结论：利用克隆技术可成功构建放射调控Bax基因靶向表达的pEgr—Bax载体。     

阿霉素肾病模型大鼠肝白蛋白基因表达的研究

阿霉素(ADR)诱导的肾病综合征模型已广泛应用于肾脏病的研究,并成为肾病研究的重要手段[1～3]。该模型类似于人类微小病变型肾病的临床表现,为进一步了解该模型大鼠蛋白代谢状态,我们采用分子杂交方法对其肝白蛋白基因转录进行了研究,报道如下。 材料与方法 1药物与试剂(1)[α-32P]dNTP购自北京亚辉生物技术公司,DEPC为美国SIGMA公司产品,异硫氰酸胍、巯基乙酸、十二烷基肌氨酸钠为SERVA公司产品。随机引物标记药盒为Promega公司产品,阿霉素为意大利 Farmitalia公司产品。鲑鱼精 DNA、聚蔗糖 Ficoll 400、聚乙烯吡咯烷酮、牛血清…     

食管癌间质胶原酶基因表达的研究

目的 研究食管癌间质胶原酶基因表达.方法 36例食管癌者术中取癌组织及正常组织;提取组织总RNA;用共扩增逆转录定量PCR方法测定间质胶原酶基因表达水平.结果 食管癌组织间质胶原酶(MMP_1)的基因表达明显高于正常食管组织;食管癌组织MMP_1基因表达水平与肿瘤大小,肿瘤组织类型无关.结论 间质胶原酶在食管癌的浸润中可能起重要作用.     

数据挖掘技术在雌激素对心血管的分子调控网络中的应用

目的探讨数据挖掘技术在雌激素对心血管的分子调控网络中的应用。方法利用 GEO₂R在线分析工具进行差异基因分析,采用 DAVID 6.8进行基因功能和通路富集分析,采用 STRING数据库进行蛋白互作网络分析,采用 MCODE算法提取核心网络。结果共筛选出 192个差异基因,将差异基因进行 GO与信号通路富集分析后发现,这些基因与脂代谢、血管生成、 PPAR信号通路、脂肪酸降解信号通路等有关。蛋白互作网络分析得到一个包含 131基因的互作关系网络, MCODE算法分析提取出其中 5个核心子网络,分别与胆固醇平衡、胰岛素分泌、铁离子平衡、血管新生以及生长激素受体信号通路等生物学功能和信号通路有关。结论应用数据挖掘技术可以发现雌激素对心血管系统的影响与脂质代谢、胰岛素分泌、血管新生和细胞生长等途径有关。     

基于贝叶斯网络的入侵容忍系统

提出一种基于贝叶斯网络的入侵容忍系统,给出系统的运行流程.用进程特性向量来表示一个具体的进程,并对进程特性进行具体的分类.提出利用贝叶斯网络模型来描述进程的运行过程,给出基于贝叶斯网络推理的进程类型概率值的计算公式,构造了用于确定进程危险程度的危险函数,并用实例说明了对入侵进程的具体识别过程.     

基于微生物互作的新天然产物发掘研究进展

在自然界中,微生物以群落状态生存,通过物种内或物种间的相互作用,不断重塑生态关系来实现共同进化。这种相互作用促使微生物合成大量复杂的次级代谢产物作为通讯工具或者化学武器,来适应环境变化,这些小分子则是药物发现的重要源泉。微生物共培养技术通过模拟自然生态关系,激活沉默基因簇来促进新型天然产物的发现。综述基于不同共培养体系的微生物天然产物挖掘最新进展,重点介绍微生物之间的相互作用机制以及沉默基因簇激活的分子机制,为微生物天然产物的化学多样性挖掘提供参考。     

膀胱癌ras基因表达的研究

本文通过免疫组织化学技术对32例膀胱癌组织 ras 基因表达进行了检测,试图探讨ras 基因表达与膀胱癌病理分级及肿瘤复发的关系。结果表示:32例膀胱癌组织 ras 基因阳性表达率的37.5%。G_1期的20%,G_2期的33.3%,G_3期的53.8%。20例初发膀胱癌 ras 基因阳性表达率的35%。化疗后复化的膀胱癌组织为41.6%。实验结果提示 ras 基因的表达水平与膀胱癌组织的病理分级及肿瘤的复发密切关系。