荧光定量RT-PCR技术在评估肿瘤化疗敏感性中的应用进展

荧光定量RT-PCR技术是目前检测组织中mRNA表达水平的一种最新的分子生物学技术。通过荧光定量RT-PCR技术检测肿瘤化疗过程中靶mRNA的动态变化可能为评估肿瘤化疗敏感性另辟蹊径,现综述荧光定量RT-PCR技术在评估肿瘤化疗敏感性研究中的应用进展。     

实时定量RT-PCR检测博尔纳病病毒方法的建立

目的 建立检测博尔纳病病毒(BDV)RNA的实时定量RT-PCR(real-time RT-PCR)方法.方法 设计BDV-p40基因特异性引物和探针,优化反应条件;并以已知的BDV-p40基因扩增产物的克隆为标准品,建立标准曲线;然后对已知BDV RNA进行实时定量RT-PCR的特异性和敏感性检测.结果 建立了特异检测BDV RNA的实时定量RT-PCR技术,并且可以检测到感染细胞中1个拷贝以上BDV RNA.结论 本技术可以直接用于BDV感染的检测和定量分析.     

羟基磷灰石抽提逆转录套式PCR检测轮状病毒

目的;建立快速、准确、灵敏的检测轮状病毒的方法。方法：用羟基磷灰石抽提轮状病毒RNA,在轮状病毒基因6片段设计引物建立RT－PCR法检测腹泻婴幼儿大便中的轮状病毒。结果：该法重复性好,特异性高,且敏感度比PAGE法至少高1000倍。108例临床标本检测表明该法检测阳性率最高为56．5％。结论：羟基磷灰石抽提RT－PCR法检测轮状病毒,快速、准确、灵敏度高,优于PAGE、ELISA和LA法。     

荧光定量RT-PCR检测OATP-E基因表达

目的：建立荧光定量RT-PCR检测肿瘤细胞有机阴离子转运多肽E(organic anion transporting polypeptide-E,OATP-E)mRNA的方法，了解乳腺癌细胞株MCF-7和对阿霉素耐药的乳腺癌细胞株MCF-7/ADR中OATP-E mRNA的表达水平。方法：构建重组质粒，绘制荧光定量RT-PCR检测OATP-E mRNA的标准曲线，并运用此方法检测MCF-7/ADR和MCF-7细胞株中OATP-E mRNA的表达。结果：荧光定量RT-PCR检测MCF-7和MCF-7/ADR细胞OATP-E的基因表达，重复10次实验所得结果平均分别为5.47×105拷贝数/μg RNA和2.82×104拷贝数/μg RNA，两者相差约19.4倍，P＜0.05。结论：成功建立了荧光定量RT-PCR检测OATP-E基因表达的方法，检测结果用绝对拷贝数表示，定量准确可靠，并有利于标准的统一。初步应用发现乳腺癌耐药株MCF-7/ADR中OATP-E mRNA的表达量比不耐药株MCF-7减少。     

实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）法与细胞培养法检测流行性感冒病毒的比较

目的：比较实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法与细胞培养法检测流行性感冒病毒的差异。方法采用实时荧光定量RT-PCR及经典的狗肾传代细胞病毒分离2种方法,同时对流感监测点送检的80份疑似流感标本检测流感病毒。结果细胞培养病毒分离的阳性数为26份,实时荧光定量RT-PCR的阳性数为36份,χ2=8.1, P<0.005。结论通过该实验,验证了实时荧光定量RT-PCR的确快速敏感,适用于实验室快速诊断。     

实时荧光RT-PCR对SARS患者血清中病毒含量的定量检测

目的:阐述SARS患者病程与血清中SARS病毒含量间的关系.方法:采用高灵敏度荧光实时定量RT-PCR方法,对156份SARS患者进行检测,同时,以9.4×109copies/L(Robert Koch Institute)灭活的SARS冠状病毒为定量标准品,病毒样颗粒为阳性对照,分析SARS-CoV阳性血清样本中的病毒含量.结果:检测试剂的灵敏度达1×105copise/L,与相关病原体没有交叉.81份血清样本中病毒含量分布在1×105～1×107copies/L之间,患者血清样本中病毒含量较低,经统计学分析,病毒含量与病程长短无明显数量关系.结论:SARS患者血清中病毒含量低,与病程没有明显的相关性.     

荧光定量检测在乙型肝炎中的应用

聚合酶链反应 ( ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ ,ＰＣＲ)技术已广泛用于核酸分析 ,它可使极微量单拷贝的特定核苷酸片段在短时间内扩增上百万倍[1] 而有利于检测。荧光定量ＰＣＲ (ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＰＣＲ ,ＦＱ -ＰＣＲ) ,采用荧光技术和闭管检测 ,克服了常规ＰＣＲ方法的主要缺点 ,具有更高的临床应用价值。我室使用广州中山医科大学达安基因诊断中心的乙型肝炎病毒荧光定量ＰＣＲ诊断试剂盒 ,测试了 4 0 6份临床血清标本 ,并同时采用酶联免疫吸附(ＥＬＩＳＡ)测定进行对照检测 ,报告…     

实时荧光定量RT-PCR与ELISA检测孕妇血清风疹病毒的比较分析

目的应用TaqMan实时荧光定量RT-PCR技术定量检测孕妇血清标本中风疹病毒RNA,并与ELISA法比较其敏感度与特异度,为孕妇早期风疹病毒检测提供迅速准确的方法。方法收集126例已确诊风疹病毒阳性孕妇血清标本与107例女性健康查体者血清标本,同时进行实时荧光定量RT-PCR核酸检测与风疹病毒ELISA法IgM抗体检测,比较两种方法的敏感度与特异度。结果以细胞培养法为金标准,实时荧光定量RT-PCR法敏感度为92.9%,特异度为98.1%。ELISA IgM抗体法的敏感度和特异度分别为97.6%,86.9%。两种方法的敏感度无显著性差异（p〉0.05）,实时荧光定量RT-PCR法的特异度明显高于ELISA IgM抗体法（p〈0.01）。结论实时荧光定量RT-PCR简便快捷、敏感性高、特异性高、定量准确,在临床风疹病毒基因检测中具有很大的应用潜力。     

应用PCR和RT-PCR检测猪内源性逆转录病毒及其意义

目的 观察猪内源性逆转录病毒（Porcine endogenous retrovirus,PERV)在中国实验小型猪的感染情况。方法 针对PREV gag区的序列，选用特异性引物，采用PCR方法检测猪肝脏、皮肤前病毒序列；以及RT－PCR方法检测血清中PERV－RNA序列。结果 该法在猪肝脏组织中可检测出PERV前病毒序列；此外，在猪血清标本亦检测出病毒序列，而其它2份HBV、HCV阳性血清及2份其它动物血清（大鼠、兔）检测结果均为阴性，说明该方法特异性较高。结论 中国实验小型猪均携带该病毒，并可以释放到血清中；采用该法具有特异、简便的特点，为进一步研究PERV感染及生物安全性奠定了基础。     

Real time RT-PCR定量检测AFP mRNA表达水平方法的建立

目的　建立realtime逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测AFPmRNA表达水平方法。方法　提取BEL740 2细胞总RNA ,进行RT PCR扩增并纯化AFP基因片段 ,构建重组质粒 ,建立realtimeRT PCR检测AFPmRNA表达水平方法。结果　重组质粒的阳性克隆效率为 81.8% ,经酶切鉴定 ,目的基因片段已插入PMD 18T载体内 ,得到realtimeRT PCR动力学曲线。结论　成功建立了realtimeRT PCR定量检测AFPmRNA表达水平方法。     

丁型肝炎病毒RNA巢式逆转录PCR检测

为了提高丁型肝炎病毒的实验室诊断水平，建立一个高敏感性和特异性的丁型肝炎病毒的检测方法。根据ＧＥＮＢＡＮＫ中ＨＤＶ的核酸序列设计出巢式引物，采用逆转录巢式ＰＣＲ方法对４０例肝炎患者进行检测。结果：２０例丁型肝炎病毒抗原阳性的ＨＤＶＲＮＡ均为阳性，１０例丁型肝炎病毒抗体阳性中ＨＤＶＲＮＡ阳性６例，１０例单纯ＨＢｓＡｇ、ＨＢｅＡｇ和抗ＨＢｃ阳性的均未检出ＨＤＶＲＮＡ。结论：巢式逆转录ＰＣＲ可以作为丁型肝炎病毒临床检测的一种方法     

实时定量PCR监测慢性粒细胞白血病患者BCR——ABL融合基因转录本水平

目的 探讨实时定量聚合酶链反应(RQ-PCR)在监测慢性粒细胞白血病(CML)患者微小残留病变、考核疗效以及预测疾病预后方面的应用.方法 应用实时RQ-PCR对84例不同病期患者之间的BCR-ABL转录本水平进行比较,并对5例慢粒患者治疗前后BCR-ABL转录本水平的变化进行监测.结果 加速期和急变期患者的转录本水平明显高于慢性期患者.对于慢性期患者,造血干细胞移植后其BCR-ABL转录本水平明显下降,甚至检测不到,格列卫治疗可获得类似结果.结论 RQ-PCR方法准确可靠,对于监测慢粒患者的微小残留病变、考核疗效以及预测慢粒急变具有重要的临床应用价值.     

实时荧光定量RT-PCR检测肝细胞肝癌中B-myb的表达及其临床意义

目的 建立B-myb mRNA表达量检测的实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测肝细胞肝癌(HCC)中B-myb的表达并分析其临床意义.方法 用实时荧光定量聚合酶链反应技术检测70例HCC患者癌组织、癌旁肝组织及18例正常肝组织中B-myb mRNA的表达情况.结果 B-myb mRNA在肝癌组织(0.0375±0.0168)及癌旁肝组织(0.0353±0.0128)中的表达水平明显高于在正常肝组织(0.0265±0.0099)中的表达水平(P＜0.05),而在肝癌组织及癌旁肝组织中的表达水平差异无统计学意义(P＞0.05).B-myb在人肝癌组织中的表达与临床分期、肝外转移及术后复发明显有关,而与门静脉癌栓、肿瘤个数、肿瘤直径、血清AFP水平及分化程度无明显关系.结论 该方法克服了传统PCR只能定性检测而不能定量检测的缺点,为研究B-myb在HCC中的表达提供了定量方法.B-myb可能与肝癌的发生、发展有关.     

应用荧光定量PCR检测SARS康复者血浆冠状病毒RNA

目的　通过对SARS临床诊断康复者血浆中冠状病毒RNA的检测 ,观察SARS临床诊断康复者血浆中携带冠状病毒的情况 ,对SARS临床诊断康复者血浆临床应用的安全性提供实验室依据。方法　采用荧光定量PCR仪 ,分别用两种不同厂家荧光定量PCR试剂、对 2 6份SARS康复者血浆进行冠状病毒RNA检测。结果　两种不同试剂检测 2 6份SARS临床诊断康复者血浆冠状病毒RNA均为阴性。结论　实验室检测发现 ,SARS临床诊断康复者血浆冠状病毒RNA为阴性 ,为进一步临床采用SARS临床诊断康复者血浆辅助治疗SARS患者的安全性提供一定的实验室证据。     

SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测肾移植患者CsA效用

目的:检测肾移植患者外周血淋巴细胞(PBL)有关细胞因子基因表达,判定环孢素A(CsA)效用,进一步验证CsA服用后2h浓度(C2)测定的必要性。方法:采用SYBR GreenⅠ荧光定量PCR对20例肾移植患者术后第7天PBL的IL-2和IFN-γmRNA表达进行检测,判定CsA的免疫抑制效用,对比CsA空腹浓度(C0)和C2与细胞因子抑制关系。结果:C2对应IL-2和IFN-γmRNA/β-actin mRNA相对模板数分别为0.038±0.006和0.018±0.004,C2对IL-2和IFN-γmRNA表达抑制率分别为(72.42±3.95)%和(69.52±6.97)%;C2与IL-2和IFN-γmRNA表达的抑制率有良好的线性关系(P<0.01);C0与IL-2和IFN-γmRNA表达的抑制率无良好的线性关系(P(0.05)。结论:SYBR GreenⅠ荧光定量PCR技术检测肾移植患者术后PBL的IL-2和IFN-γmRNA的表达,是判定CsA效用和研究免疫耐受的有效方法;C2仍为判定CsA生物利用度的重要指标。     

聚合酶链反应技术用于汉坦病毒的基因分型

应用反转录ＰＣＲ技术对国内外分离的１８株汉坦病毒基因进行了检测，结果１０株血清Ⅰ型病毒仅能用Ⅰ型引物扩增，８株血清Ⅱ型引物扩增，与既往空斑减少中和试验的分型结果完全一致。