结核分支杆菌耐链霉素耐药基因的检测

目的：探讨结核分支杆菌对链霉素(SM)的耐药分子机制,评估应用聚合酶链反应－单链构象多态性（PCR－SSCP）技术检测rpsL基因突变在结核分支杆菌对SM耐药性测定中的应用价值。方法：采用PCR－SSCP方法对71株结核分支杆菌临床分离株（其中药物敏感株35株,耐SM或含耐SM耐多药株36株）和30例耐SM肺结核病人痰标本的rpsL基因突变进行检测。结果：以结核分支杆菌H37RV为对照,35株药物敏感株的rpsL基因PCR扩增产物267bp片段SSCP图谱正常;36株耐SM分离株中,26株rpsL基因SSCP图谱异常,其突变率为72．2％。30例耐SM肺结核病人痰标本有22例PCR扩增阳性,14例SSCP图谱与H37RV株有差异,rpsL突变率为63．6％。结论：rpsL基因突变是SM耐药性的重要分子机制,PCR－SSCP技术可以快速、准确地检测结核分支杆菌rpsL基因突变,该技术有望直接用于临床标本耐药性检测。     

结核分支杆菌链霉素耐药基因的杂交检测

目的 探讨耐链霉素（Sm）结核分支杆菌的编码基因rpsL和ms的扩增以及突变情况。方法 采用PCR扩增技术对23株敏感株，32株耐药株，25例临床结核病人痰标本进行rpsL、ms基因扩增；并利用寡核苷酸探针反相斑点杂交技术对23株敏感株，32株耐药株，25例临床结核病人痰标本进行rpsL、ms基因突变检测。结果 23株敏感株、32株耐药株rpsL、ms基因扩增均阳性，阳性率100％；25例临床结核病人痰标本中rpsL基因扩增阳性率为72％，ms基因扩增阳性率为56％；rpsL基因突变率依次分别为4．3％、65．6％，50％；ms基因突变率依次分别为0、12．5％、7．2％。结论 耐链霉素（Sm）菌株的基因突变率明显高于药物敏感株；PER．寡核苷酸探针反相斑点杂交技术以其简便、快速、灵敏的特性能够为临床检测结核分支杆菌对链霉素（Sm）的耐药性提供初步依据。     

结核分支杆菌利福平和链霉素耐药基因的快速检测

目的 :评估采用聚合酶链反应 -单链构象多态性 (PCR SSCP)同时检测rpsL基因、rpoB基因突变在结核分支杆菌耐链霉素 (SM )和利福平 (RFP)耐药性测定中的应用价值。方法 :采用PCR SSCP技术对 86株结核分支杆菌临床分离株rpsL基因、rpoB基因突变同时进行检测。即首先用PCR方法同时扩增RFP、SM的rpoB基因和rp sL基因 ,然后进行SSCP分析。结果 :以结核分支杆菌H3 7RV为对照 ,41株药物敏感株的rpsL基因、rpoB基因均未见SSCP图谱异常。特异性为 10 0 %。 45株同时耐链霉素和利福平的耐药株中 ,3 4株 (75 6% )有rpsL基因图谱异常 ;41株 (90 1% )有rpoB基因图谱异常。结论 :rpoB基因突变和rpsL基因突变与结核分支杆菌耐利福平和链霉素密切相关 ,应用PCR SSCP技术可同时快速检测结核分支杆菌对链霉素和利福平耐药性。     

结核分支杆菌rpoB基因突变与对利福平耐药的关系

目的:研究结核分支杆菌耐利福平(RFP)分离株rpoB基因突变情况并评价英应用价值.方法:采用多聚合酶链式反应-单链构象多态性分析法(PCR-SSCP法)对60株结核分支杆菌rpoB基因进行检测.结果:以结核分支杆菌标准株H37Rv为对照,60株PCR扩增阳性的结核分支杆菌中,共有32株发生突变,总突变率为53.3%(32/60);24株药物敏感株有4株rpoB基因有突变,突变率为16.7%;36株耐药株中,28株rpoB基因有突变,突变率为77.8%.耐药菌株突变率明显高于敏感菌株的突变率(P<0.05).结论:rpoB基因突变是耐RFP结核分支杆菌耐药性的主要分子机制;应用PCR-SSCP可快速检测结核分支杆菌对RFP的耐药性.     

临床分离结核分枝杆菌耐药性质与rpoB、rpsL基因变异的研究

目的:对从疑似结核病患者痰液中分离的结核分枝杆菌的rpoB和rpsL基因突变情况进行研究,分别探讨其与耐利福平(RFP)和耐链霉素(SM)之间的关系.方法:采用PCR和DNA测序法对结核分枝杆菌临床分离株和1株卡介苗株(BCG)的rpoB和rpsL基因进行序列分析.结果:分离得到耐利福平27株,耐链霉素25株,经测序分析,所有利福平、链霉素敏感株rpoB、rpsL基因均未发生氨基酸突变;RFP和SM耐药株rpoB和rpsL基因的突变率各为81.5％(22/27)和76％(19/25);耐利福平以Ser531Leu突变最为常见,突变频率为55.6％(15/27),耐链霉素以Lys43Arg位突变最为常见,突变频率为72.0％(18/25).结论:rpoB和rpsL基因突变分别是结核分枝杆菌RFP和SM耐药性产生的主要分子机制,PCR-DNA测序法可快速检测结核分枝杆菌RFP和SM耐药性.     

结核分支杆菌喹诺酮耐药基因的研究

[目的]了解结核分支杆菌耐喹诺酮耐药基因突变情况,建立快速分子药敏实验方法。[方法]通过PCR—SSCP和直接测序技术(PCR～DS)分析结核分支杆菌的gyrA基因突变的情况。[结果]以结核分支杆菌标准菌株H37Rv和卡介苗做对照,30株喹诺酮敏感株的gyrA基因的SSCP图谱均泳动正常,测序分析与对照株相同。45株喹诺酮耐药株中,34株(75．6％)gyrA基因SSCP图谱泳动异常;测序证实10株为90位密码子的突变,24株为94位密码子突变,符合率100％。[结论]gyrA基因突变是结核分支杆菌耐喹诺酮的主要分子机制,PCR—SSCP可能成为测定部分结核分支杆菌耐喹诺酮株的简便、快速的方法．并有望直接用于临床标本喹诺酮敏感性试验。     

中国部分地区结核分支杆菌耐利福平、异烟肼和链酶素耐药基因的检测

目的研究我国部分地区耐利福平（RFP）、异烟肼（硼）和链酶素（SM）结核分支杆菌临床分离株rpoB基因、KatG、rpsL基因突变情况，评价其耐药分子机制。方法采用PCR和聚合酶链反应．单链构象多态性（PCR-SSCP）对373株结核分支杆菌临床分离株（其中敏感株148株，耐RFP、INH、SM株共225株）rpoB基因、KatG和砒基因进行检测。并对其中19株SSCP阴性的耐RFP株用双脱氧末端终止法进行测序分析。结果安徽省、北京市、上海市、河北省、河南省、辽宁省、吉林省结核分支杆菌耐RFP临床分离株rpoB基因突变率分别为90％、91％、90％、91％、90％、93％、91％；KatG基因突变率分别为69％、63％、71％、68％、67％、68％、65％，rpsL基因突变率71％、69％、74％、68％、70％、61％、76％，分别为经统计学处理不同地区间无显著性差异（X^2=0．46，P＞0．05）。同时rpoB基因敏感株均无突变，特异性为100％；KatG基因有3株发生突变，特异性为98％。19株SSCP阴性耐药株中经测序6株在531位密码子TCG→TIE，1株526位密码子CAC→TAC，7株发生在516位密码子GAC→GTC，5株未改变。结论我国不同地区耐利福平、异烟肼和链霉素的rpoB、KatG、rpsL耐药基因突变率大致相同，rpoB基因、KatG和rpsL基因突变分别是耐RFP、INH和SM结核分支杆菌耐药性产生的主要分子机制，PCR-SSCP可快速检测结核分支杆菌RFP、INH和SM耐药性。     

结核杆菌耐药性调查与基因突变分析

目的了解结核分支杆菌耐药性与基因突变情况,分析耐药表型与基因突变的相关性。方法从临床标本中分离培养、鉴定结核分支杆菌;应用药敏试验、单链探针反向杂交试验技术(LiPA)和基因测序分析结核分支杆菌耐药性与基因突变情况。结果50株结核分支杆菌中,12株耐异烟肼(INH),7株耐利福平(RFP),15株耐链霉素(SM),2株耐乙胺丁醇(EMB)。LiPA检测耐RFP菌株,4株rpoB基因531位TCG→TTG突变;耐INH菌株中5株KatG基因315位AGC→ACC突变;耐SM菌株中6株、SM敏感株1株rpsl基因43位AAG→AGG突变,1株耐SM菌株rpsl基因88位AAG→AGG突变;rrs基因未检测到突变;1株耐EMB菌株与1株EMB敏感株的embB基因306位发生ATG→GTG突变。结论本市结核分支杆菌的耐药性增加的趋势显著,加强监测与综合干预非常必要。     

PCR-SSCP法检测结核分枝杆菌L型rpsL耐药基因

目的 探索尘肺结核患者感染的结核分枝杆菌（MT）L型的耐药基因rpsL突变与耐受链霉素（SM）的关系。方法 用PCR—SSCP方法检测rpsL基因,与采用常规SM药敏试验（AST法）的结果进行对比分析。结果 采用AST法检测,52株结核分枝杆菌L型临床分离株中共有26株（50．0％）耐SM;PCR-SSCP法检出rpsL基因突变率为40．4％（21／52）,2种方法检测耐药株的符合率为80．8％。结论 结核杆菌L型对SM的耐药与rpsL基因突变有关。     

快速检测结核分支杆菌对异烟肼的耐药性的临床应用

目的建立快速检测结核分支杆菌耐药基因的分子药敏方法。方法要聚合酶链反应——单链构象多态性（PCR—SSCP）分析40株结核分支杆菌KatG基因突变。其中20株为异烟肼（INH）敏感株,20株为INH耐药株,用PCR—SSCP图谱鉴定扩增产物有无突变,H37RV标准株作对照．结果所有INH敏感株SSCP带普与对照相同;19株INH耐药株中8株与对照相同,11株有不同程度的差异,INH耐存KatG基因突变或缺失的阴性率为60％。结论多数结核分支杆菌INH是由于其KatGj基因突变所致,用PCR—SSCP筛选突变株可达到快速检测结核分支杆菌INH耐药的目的。     

结核分枝杆菌耐多药的基因研究

目的 探讨耐多药结核分枝杆菌耐药基因突变与耐药性的关系。方法 用聚合酶链反应和聚合酶链反应单链构象多态性分析对128株结分村以杆菌临床分离析耐利福平（rpoB)、链霉素（rpsL)和异烟肼（KatG）基因检测。结果 38株 敏感株中,各有1株（206%)测出rpoB、rpsL和KatG突变;90株耐多药析中,分别有81株（90.0%)、71株（78.9%)和63株（70.0%)测出rpoB、rpsL和KatG突变;有77株（85.6%)同时测出2种以上耐药基因突变;10株耐其他药物株中,仅有1株测出KatG基因突变。结论 85.6%的耐多药结核分枝杆菌存在2种以上耐药基因突变,且耐药基因突变率与耐药浓度有关。     

结核分枝杆菌km基因的突变情况分析

目的探讨结核分枝杆菌km基因突变的情况。方法通过传统梯度药敏试验和聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析248株分枝杆菌临床分离株耐药情况和km基因的变化。结果药敏试验耐药率为32.7%(81/248),248株分枝杆菌临床分离株的16S rDNA SSCP电泳图谱均与结核分枝杆菌标准株相同。81株耐卡那霉素分离株中,24株(29.6%)km基因SSCP泳动异常。结论其部分耐药原因可能是由于T.M耐KM药物的km基因突变所致。     

Characterization of streptomycin resistance mechanisms among Mycobacterium tuberculosis isolates from patients in New York City.

From a collection of 367 isolates of Mycobacterium tuberculosis from patients in New York City in 1994, 45 isolates (12.3%) were resistant in vitro to 2 micrograms or more of streptomycin (SM) per ml. We further evaluated these isolates for levels of SM resistance and for mutations previously associated with resistance in the rpsL (S12 ribosomal protein) gene and the rrs (16S rRNA)-coding region. Twenty-four isolates, representing nine distinct patterns of susceptibility to antituberculosis drugs, were resistant to 500 micrograms of SM per ml and shared a common point mutation at nucleotide 128 in the rpsL gene. This mutation, which substitutes lysine for arginine in the S12 ribosomal binding protein, was not present in isolates with low-level SM resistance or in SM-susceptible control isolates. Among 20 isolates with low-level SM resistance, one possessed a substitution (C-->G865) in the 912 loop of the rrs gene. No mutations in the 530 loop of the rrs coding region were detected, suggesting the presence of an alternative SM resistance mechanism in 19 isolates. Single-strand conformation polymorphisms of mutants were readily detected by a nonradioactive gel screen.     

结核分枝杆菌katG、inhA、ahpC等突变与异烟肼耐药关系的研究

目的：了解结核分枝杆菌katG、inhA、ahpC、fabG1、sodA及sodC基因突变的特征及其与耐异烟肼的关系。方法对127例活动性肺结核患者痰标本进行菌型鉴定及结核分枝杆菌药敏试验,提取结核分枝杆菌菌株DNA,应用PCR扩增katG、inhA及ahpC、fabG1、sodA及sodC基因片段,并进行DNA序列分析。结果结核分枝杆菌药物敏感试验显示127株结核分枝杆菌中,其中47株耐异烟肼,80株对异烟肼敏感,耐异烟肼率为37.01%。47株耐异烟肼中,29株存在katG和（或）inhA基因突变,其中22株（46.81%,22/47）存在katG基因单位点突变,3株（6.38%,3/47）存在inhA基因单位点突变,4株（8.51%,4/47）存在katG及inhA基因联合位点突变。22株katG基因单位点突变中,20株为AGC315ACC、AGC315AAC （42.55%,20/47）突变,2株（2.13%,1/47）分别为CTG378CCG（Leu378Pro）、ACG394ATG（Thr394Met）突变,该突变位点及突变形式尚未见文献报道。18株katG及inhA未突变结核分枝杆菌均未检测到ahpC、fabG1、sodA及sodC基因突变。结论结核分枝杆菌对异烟肼耐药主要与katG和inhA基因突变有关。耐异烟肼结核分枝杆菌临床分离株378和394新突变位点的发现为进一步研究耐药机制以及耐药结核病的快速检测提供了依据。     

耐药结核分枝杆菌链霉素耐药基因的分子流行病学研究及其快速检测

目的探讨结核分枝杆菌对链霉素的耐药分子机制，建立基于焦磷酸测序（pyrosequencing）技术的快速检测结核分枝杆菌链霉素耐药性的方法。方法用扩增后直接测序的方法检测了150株结核分枝杆菌链霉素耐药株的rpsL基因，并用pyrosequencing技术对其中20株的rpsL基因43位密码子进行了检测。结果150株链霉素耐药株中2株rpsL基因缺失，115株rpsL基因存在突变，突变率为77．7％，最主要的突变形式是43位密码子突变，pyrosequencing的检测结果与测序结果相符。结论rpsL基因突变是产生链霉素耐药的重要分子机制，pyrosequencing技术具有快速、准确等特点，适用于对耐链霉素结核分枝杆菌进行快速高通量的检测。     

基因芯片在分枝杆菌菌种鉴定及结核耐药基因检测的诊断价值

目的探讨基因芯片检测系统在分枝杆菌菌种鉴定及耐药基因检测中的临床应用价值。方法应用基因芯片技术对疑似结核病和非结核分枝杆菌病患者的痰液、尿液、胸腹腔积液、脑脊液和穿刺液等标本进行核酸检测;并对分枝杆菌阳性样本进行利福平及异烟肼的耐药基因检测。结果 91例标本中共检出结核分枝杆菌复合群16例,非结核分枝杆菌2例（戈登分枝杆菌1例、偶然分枝杆菌1例）,分枝杆菌检出总阳性率为19.8%（18/91）,其中结核分枝杆菌占17.6%（16/91）,非结核分枝杆菌占2.2%（2/91）;不同标本类型检出阳性率有差别,由高到低依次为穿刺脓液（33.3%）、痰液（24.0%）、胸腹腔积液（18.8%）、脑脊液（16.7%）和尿液（15.8%）。有57例患者同时进行了基因芯片法和涂片抗酸染色法检测,其中芯片法有16例阳性,阳性率为28.1%（16/57）,涂片法有3例阳性,阳性率为5.3%（3/57）,两种方法比较,差异有统计学意义（P〈0.01）。18例分枝杆菌阳性标本进一步进行耐药基因检测,有4例发生耐药基因突变,其中2例（1例戈登分枝杆菌）为利福平耐药相关基因,ropB基因526位点发生C→G突变,1例为ropB基因531位点发生C→T突变,还有1例为异烟肼耐药相关基因,inhA基因启动子-15位点发生C→T突变;没有检测到多重耐药株。结论基因芯片技术适用于不同标本类型的分枝杆菌菌种鉴定及耐药基因检测,操作简便快速,灵敏度高,特异性好。     

结核分枝杆菌rrs和rpsl基因突变与二线氨基糖苷类耐药关系分析

目的：了解耐二线氨基糖苷类结核分枝杆菌临床分离株rrs与rpsl基因突变特征及其与耐药的关系。方法对136株活动性肺结核患者痰标本分离的结核分枝杆菌进行菌型鉴定及结核分枝杆菌药敏试验,提取耐二线氨基糖苷类结核分枝杆菌DNA,应用PCR扩增rrs和rpsl目的片段,并进行测序、比对验证。结果从136株临床结核分枝杆菌中筛选出耐二线氨基糖苷类菌株25株（18.3%,25/136）,其中耐卷曲霉素13株（9.56%,13/136）、耐卡那霉素9株（6.62%,9/136）、耐卷曲霉素和卡那霉素2株（1.47%,2/136）、耐卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星1株（0.73%,1/136）。经测序分析,25株均存在rrs和（或） rpsl基因突变（100%,25/25）,其中双基因联合突变3株,共计两种类型：rrs A1401G和rpsl AAG43AGG、AAA121AAG （2株）;rrs A1401G和rpsl AAG88AGG、AAA121AAG（1株）;rpsl单基因双突变3株,共计两种类型：rpsl AAG43AGG、AAA121AAG（2株）;rpsl GGT11GTT、AAA121AAG（1株）,rpsl 基因的GGT11GTT突变尚未见相关文献报道,为新的突变位点;余19株为单基因单突变rpsl AAA121AAG。结论结核分枝杆菌对二线氨基糖苷类耐药与rrs和rpsl基因突变有关,rrs A1401G与rpsl基因GGT11GTT突变为进一步研究耐药机制以及耐药结核病的快速检测提供了依据。     

Mutations in gidB confer low-level streptomycin resistance in Mycobacterium tuberculosis

The global threat posed by drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis demands a greater understanding of the genetic basis and molecular mechanisms that govern how such strains develop resistance against various antituberculous drugs. In this report, we examine a new genetic basis for resistance to one of the oldest and most widely used second-line drugs employed in tuberculosis therapy, streptomycin (SM). This marker for SM resistance was first discovered on the basis of genomic data obtained from drug-resistant M. tuberculosis strains collected in Japan, wherein an association was observed between SM resistance and a mutation in gidB, a putative 16S rRNA methyltransferase. By evaluating an isogenic ΔgidB mutant strain constructed from strain H37Rv, we demonstrate the causal role of gidB in conferring a low-level SM-resistant phenotype in M. tuberculosis with a 16-fold increase in the MIC over the parent strain. Among clinical isolates, the modest increase in SM resistance conferred by a gidB mutation leads to an MIC distribution of gidB mutation-containing strains that spans the recommended SM breakpoint concentration currently used in drug susceptibility testing protocols. As such, some gidB mutation-containing isolates are found to be SM sensitive, while others are SM resistant. On the basis of a pharmacodynamic analysis and Monte Carlo simulation, those isolates that are found to be SM sensitive should still respond favorably to SM treatment, while nearly half of those found to be SM resistant will likely respond poorly. This report provides the first microbiological evidence for the contribution of gidB in streptomycin resistance and examines the clinical implications of mutations in the gidB gene.     

浙江省丽水市结核分枝杆菌临床分离株耐药性及基因突变情况

目的 调查浙江省丽水市结核病定点医院患者结核分枝杆菌（MTB）临床分离株耐药特征及耐药基因突变情况，为该地区耐药结核病防控提供依据。方法 采用荧光PCR熔解曲线法对培养自丽水市结核病定点医院结核病患者MTB临床分离株进行抗结核药物耐药性及耐药基因突变位点检测及分析。结果 242株MTB总耐药突变占16.53%(40/242)，耐多药率为4.96%(12/242)，耐药顺位分别为异烟肼>链霉素>利福平>氟喹诺酮类>乙胺丁醇。链霉素耐药株基因突变位点主要发生在rpsL43位密码子，占比为65.00%(13/20)；异烟肼耐药基因突变位点主要发生在katG315密码子，占比为76.19%(14/21)；利福平耐药基因突变位点主要发生在rpoB基因529-533位密码子，占比为61.11%(11/18)；乙胺丁醇耐药基因突变位点主要发生在embB306位密码子，占77.78%(7/9)。结论 丽水市结核患者总体耐药突变低于全国耐药水平，但耐药模式和耐药基因突变情况仍较为复杂，需进一步加强耐药结核病监测及防控工作。