银杏主要栽培品种遗传多样性分析

以44个银杏主要栽培品种为材料,应用ISSR分子标记为手段,利用5个标记所产生的16个多态位点绘制这44个银杏栽培品种的ISSR指纹图谱,对这44个栽培品种进行了区分,并结合RAPD分子标记对该栽培群体的遗传多样性进行了研究。结果表明:ISSR所估算出的平均有效等位基因数目、基因多样度和Shannon指数分别为1.730 7,0.410 1和0.596 3,而RAPD所估算出的值分别为1.573 5,0.333 1和0.497 9,说明该群体有较高的遗传多样性。ISSR技术在估算银杏遗传多样性时较RAPD更为精确。     

百合品种遗传多样性的研究方法及其进展

综述了目前百合遗传多样性的研究方法和研究动态.遗传多样性的研究主要体现在从形态学水平、细胞学水平、生理生化水平直至目前的分子水平.对形态、染色体、同工酶、随机扩增的多态性DNA（Random Amplified Polymorphic DNA,简称RAPD）等4种分析方法在百合遗传多样性研究中的应用进行了讨论,并提出在研究百合遗传多样性时,可将几种检测方法综合使用,扬长避短,建立快速有效的综合方法,从而加速百合遗传多样性的研究进程.     

百合栽培品种资源的RAPD分析

基于随机扩增多态DNA(RADP)方法分析了来自3个百合品系的15个栽培百合品种的遗传多样性和亲缘关系.从156个引物中筛选出15个引物,在检测的218个位点中,216个位点为遗传多态位点(99.08%).聚类分析结果表明:来自3个品系的百合栽培品种在遗传关系上明显地聚为3类;亚洲百合品系和东方百合品系的品种有较近的亲缘关系,二者和铁炮百合品系的品种亲缘关系较远;在同一品系内部,相同花色的百合品种具有较近的亲缘关系.     

刺五加遗传多样性的RAPD分析

选取我国东北哈尔滨地区刺五加３个居群共４９个单株的新鲜叶片，提取化基因组ＤＮＡ〈使用ＯＰＡ和ＯＰＢ系列８个随机引物进行ＰＣＲ反应，对ＤＮＡ样本做ＲＡＰＤ分析，３个居群多态ＲＡＰＤ位点的百分数分别为９３．５％，９１．３％和９７．６％；３个居的平均遗传距离分别为０．２４１，０．３６３和０．３８８；３个居群两两单株之间的平均遗传距离分别为０．３４５，０．３９０和０．４１２，结果表明刺五加种内居群内和居     

中国对虾遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态DNA技术,对中国对虾的3个野生地理群体--朝鲜半岛西海岸产卵群体及其越冬群体、黄渤海中国沿岸群体和一个人工累代养殖群体进行了遗传多样性研究.用一组随机引物,对每个群体各20尾对虾的基因组DNA进行扩增,共获得110个重复性好且谱带清晰的RAPD标记,68.2%的标记在所有个体间保持稳定的一致性,表明中国对虾的遗传多样性水平偏低.4个群体的多态位点比例在20%～33.3%之间,群体内的遗传多态度为0.0093～0.0307.群体间遗传变异高于群体内.不同群体间遗传变异水平不同,朝鲜半岛西海岸产卵群体及其越冬群体相近且高于黄渤海沿岸群体,累代养殖群体遗传变异度最低.通过成对的遗传距离分析,用非加权的组平均法构建了上述4个群体中国对虾的谱系关系图,该聚类分析的结果与中国对虾在黄渤海的地理分布相吻合.     

基于RAPD技术的红花品种遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术分析了国内11个省的20个红花品种间的遗传多样性.从筛选出的20个引物中,共扩增出209个位点,其中多态性位点178个,平均多态性比率为85.17%.采用成对算术平均数的非加权成组配对法(UPMGA)对Nei’s的一致度进行的聚类分析结果表明川红花和陕红花的遗传距离最近(0.206 5),太空1号和虞城红花的遗传距离最远(0.571 6).在遗传距离为0.38处将20个红花品种分为4个类群.其中云红3号、亳州红花、延津红花、延津大红袍、南阳红花、卢氏草红花、义县红花、白沙1号、太空1号、杞县刺红花聚为一类,该类群中大多数为河南道地红花品种,说明红花不同品种之间的遗传多样性可能与地理分布存在一定相关性.     

优质红锥种源遗传多样性的RAPD分析

采用从100个随机引物中筛选出的30个有效引物，利用RAPD技术对不同地区的10个不同生态型优质红锥种源进行遗传多样性研究．结果表明：（1）30个有效引物共扩增出290条清晰谱带，平均每个引物扩增出9．67条带．多态性条带为254条，比率为87．59％；（2）10个不同生态型红锥之间的遗传相似系数介于0．5946～0．7148之间，但不同地区红锥也存在着一定的遗传差异（遗传差异在0．2852～0.4054）；（3）用引物S3扩增出的带谱可在一次实验中区别10种不同生态地区的优质红锥，同时S3也可作为10种优质红锥材料的指纹图谱，鉴定优质红锥的种源；（4）聚类分析表明，10种优质红锥种源可聚成3个独立的类群．本文作者对它们的亲缘关系进行了推测．     

南充道地药材半夏的遗传多样性分析

目的:对南充道地药材半夏的遗传多样性进行研究,为半夏的保护利用提供参考.方法:采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对60份半夏基因组进行扩增,所获数据通过NTSYS-pc v2.1、POPGENE v1.31及Arlequin3.0进行分析.结果:从43条引物中筛选出22条条带清晰且重复性好的引物用于实验和统计分析,共扩增出88个位点,多态性位点占79.5％,表现出较高的遗传多样性.分子方差分析表明各来源地内材料间差异构成了遗传变异的主要来源.聚类分析显示,所有供试半夏可明显聚为三类,其中栽培种分布较集中.组间遗传差异分析表明大部分来源地间差异不显著,组间基因流动较频繁.结论:南充地区的半夏资源具有较高的遗传多样性;材料间遗传距离的远近与其地理来源有一定相关性,野生种的遗传背景较栽培种更为丰富,说明人为的引种、筛选、栽培已对半夏资源的多样性造成了影响.因此,应尽快建立半夏种质资源库,通过形态学、细胞学及分子生物学技术进行系统分类,为保护利用半夏资源提供理论依据和物质基础.     

北黄花菜居群遗传多样性及遗传分化

用ＲＡＰＤ方法对采自不同生的３个北黄花菜野生居群进行了遗传多样性分析,实验结果表明３个野生居群发生了一定程度的遗传分化,但遗传多样性主要还是集中于居群内部,３个北黄花菜居群的遗传多样性水平与其生境具有相关性,居群间的遗传关系与其地理分布具有一定的相关性     

利用RAPD标记分析甜瓜种质资源遗传多样性

应用17条随机引物分析了41份甜瓜种质的遗传多样性,结果表明甜瓜存在较大的遗传差异,其遗传距离的变异幅度在0．06-0．48之间,平均为0．31;厚皮甜瓜种质之间的遗传距离比薄皮甜瓜的大,而且厚皮甜瓜不同种质之间也可能存在较大的遗传距离,说明厚皮甜瓜与薄皮甜瓜之间或不同厚皮甜瓜种质之间配制的杂交组合可能有较强的杂种优势．41份甜瓜种质聚为两类：一类包括18份厚皮甜瓜、17份薄皮甜瓜和2份野生甜瓜种质,另一类包括4份厚皮甜瓜种质．     

Genetic diversity in the Yangtze finless porpoise by RAPD analysis

To estimate the genetic diversity in the Yangtze finless porpoise ( Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis), the randomly amplified polymorphie DNA technique was applied to examine ten animals captured from the Yangtze River. Out of 20 arbitrary primers used in the experiment, seventeen produced clearly reproducible bands. Calculated by Nei‘s formula d = 1-NAB/NT, the genetic distances ranged from O. 0986 to O. 5634. Compared with other cetacean populations, this genetic distance is quite low.Such a low genetic diversity suggests that this population may be suffering from reduced genetic variation,and be very fragile. More studies are needed for understanding the basis for this apparent low genetic diversity and to help protect this endangered, unique population.     

青藏高原东南部四川嵩草的遗传多样性研究

基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法分析了青藏高原东南部四川嵩草(Kobresia setchwanensis)4个居群的遗传多样性.14条随机引物共扩增出180个位点数,其中多态性位点138个.结果表明,四川嵩草4个居群的遗传多样性大小与生境有相关性,而与海拔没有明显相关性(P=0.768>0.05,r=-0.232).AMOVA数据表明,四川嵩草的遗传变异主要分布在居群内(77.45%),居群间的遗传变异占总变异的22.55%,遗传分化指数GST也显示了相似的结果(0.2101),这一结果符合风媒异交的繁育系统.从四川嵩草4个居群的遗传距离和聚类分析,以及用NTSYS对四川嵩草4个居群的的遗传距离矩阵与地理距离矩阵间的关系进行Mantel检测,结果表明,各居群间的遗传距离与地理距离之间没有明显相关性(r=0.61211,P=0.9176>0.05).     

不同种群狭叶小羽藓(Haplocladium angustifolium)重金属含量及遗传多样性

以上海市狭叶小羽藓居群为实验材料,测定不同居群植物体中的重金属元素含量,利用随机扩增多态DNA标记技术（random amplified polymorphic DNA,RAPD）对不同浓度重金属污染下的小羽藓居群的遗传多样性和遗传分化进行了初步分析．结果表明：104个检测位点中发现94个多态性位点,多态位点百分率为91．35％,总的居群的Nei基因多样性指数（H）为0．2682,Shannon指数（I）为0．4108,小羽藓种群表现出较高的遗传多样性．总的遗传居群间遗传分化系数（Gst）为0．5591,居群内遗传分化系数（协）为0．1182,居群间的变异程度远远大于居群内的变异程度．将各个样点居群的Shannon信息指数同重金属含量做相关性分析得出,Shannon信息指数的增加同Cr含量呈明显正相关,表明Cr胁迫对小羽藓种群的遗传分化有较大程度的影响．     

葡萄的随机扩增多态性DNA研究

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)对11个样品进行了研究．这11个品种包含1个欧美杂交种，一个中国野生种(Vitis．piasezkii Var．pagnucii)，9个欧亚种(Vitis．vinifera L)．选择了多态性好的7个10碱基寡聚糖核苷酸作为随机扩增的引物，在琼脂糖凝胶电泳上产生了76条带，其中63条具有多态性．各引物产生的条带从6到13不等，平均为10．86条／模板，其中9条具有多态性，表明葡萄基因的多态性十分丰富．通过遗传相似性分析表明11个葡萄基因的Nei氏相似性系数分布为0．1027-1．1787，平均相似系数为0．459．通过非加权算术平均数聚类法，获得了11个葡萄品种之间的遗传关系树图，欧亚种群，东亚种群和欧美杂种在遗传关系树图上被成功地聚为3组．本实验发现欧亚种和欧美杂种亲缘关系较近，而和中国野生种亲缘关系远．在欧亚种中，520A和S04的遗传距离最近，其次是井川1010和美人指，最大的遗传距离发生在桑无核和其他欧亚种之间．     

Genetic diversity of reared N.miichthioides population

The genetic diversity of 30 rearedNibea miichthioides individuals was analyzed by random amplified polymorphic DNA (RAPD) with 20 random primers. The result showed that the genetic diversity of reared individuals was relatively low with 15.31% polymorphism and 0.031 9 of the average difference (AD). The result also indicated that RAPD is a useful way in genetic diversity analysis of fish population.     

应用RAPD标记构建马尾松单株树遗传连锁图谱

利用马尾松（Ｐｉｎｕｓｍａｓｓｏｎｉａｎａ）崇义群体Ｃ－１６号单株上４０粒种子的胚乳为作图群体材料，用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）方法构建马尾松单株遗传连锁图谱，从被步筛选的８０个引物中，得到１６个具有多态性产物的引物，对这１６种引物进行Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ１：１分离检测（卡方检验，Ｐ＜０．０５），我们得到符合Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ１：１分离比例的ＲＡＰＤｓ标记４９个．通过对４９个标记的连锁关系进行分析，其中２９个标记分布在１２个连锁群上，总图距为４８３．３ｃＭ，平均图距为２８．４２ｃＭ，２０个标记没有连锁到任何连锁群上，需要继续进行大量标记的连续分析，构建完善的高密度的遗传图谱，使之能够对数量性状位点ＱＴＬｓ进行定位，从而进行分子标记辅助选择育种（ＭＡＳ）．     

世界双遗产四川峨眉山民族医药代表植物RAPD指纹分析

采用RAPD分子标记技术对峨眉山白术、车前草、叶下珠、黄花蒿、红花醉浆草、马兰花、马鞭草和斑鸩菊等民族药用资源进行了遗传多样性分析．从48条10-mer引物中筛选获得了15条RAPD-PCR能够扩增出重复条带的引物．这些引物扩增的RAPD-PCR图谱可用于白术、车前草、叶下珠、黄花篙、红花醣浆草、马兰花、马鞭草和斑鸠菊药材的鉴定．本研究对世界自然与文化双遗产峨眉山保护区民族药用植物的鉴定和资源保护、利用具有一定的指导意义．     

黄河三角洲柽柳群体遗传多样性RAPD分析

采用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记技术,分析了黄河三角洲主要优势树种之一柽柳(Tamarix chinensis)3个天然群体的遗传多样性及遗传分化。结果表明:26条随机引物扩增出105个可分析位点,多态位点百分比40.07%,Nei的基因多样度(h)为0.4061,Shannon多样性指数(I)为0.5917,基因分化系数(Gst)为0.0507,基因流值为9.3564。分子方差分析(AMOVA)表明,在总遗传变异中,群体间遗传变异占7.17%,群体内占92.83%。说明柽柳物种内存在较高的遗传多样性,群体的遗传变异主要存在于群体内,群体间基因交流频繁,遗传距离与地理距离具有显著相关性。     

无花果栽培品种遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建

【目的】近几年国内引进了很多的无花果新品种,但是仅依靠表型性状不能准确地区分相似品种,因此从DNA分子水平上进行无花果品种的分类和鉴定。【方法】利用SSR分子标记技术对30个无花果品种进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建。【结果】7对SSR引物在30个无花果品种中共扩增得到了24条清晰条带,平均观察等位基因数(N_a)为3.43、有效等位基因数(N_e)为3.025 6、Shannon信息指数(I)为1.126 6,多态性信息含量指数(PIC)变化从0.682 8到0.892 5,平均为0.816 4。遗传相似系数在0.291 7～1.000 0之间,平均相似系数为0.629 4,表明实验的品种间存在差异。在相似系数为0.59时将30个无花果品种分为4类。同时构建了30个无花果品种的SSR指纹图谱。【结论】基于SSR分子标记技术建立起来的无花果指纹图谱能够有效区分无花果相似品种,可以为无花果新品种的选育和品种鉴定提供科学依据。