9p21单核苷酸多态性与汉族人冠心病的易感性研究

目的探讨9p21单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与汉族人冠心病（coronary heart disease,CHD）的易感性。方法采用病例对照研究,应用荧光实时定量PCR、Taqman探针技术分析了271例急性心梗和冠状动脉造影证实的CHD病例与118例对照9p21上位点rsl333049的多态性。结果rs1333049的基因型在CHD病例组和对照组间的分布差异有统计学意义（χ2=7．15,P=0．028）,等位基因在CHD病例组和对照组问的分布差异也有统计学意义（χ2=5．08,P=0．024）oCC基因型在病例组高于对照组（32．84％VS19．49％,χ2=7．13,P=0．008）,而等位基因C在病例组高于对照组（56．64％VS47．88％,χ2=5．08,P=0．024）。调整相关因素后,多因素Logistic回归分析,结果仍然提示CC基因型是CHD的危险基因型（OR及95％CI：2．22（1．14-4．34）.结论9p2l位点I＇S1333049的多态性与汉族人CHD有关。     

浙江温州地区人群染色体9p21上rs1333049位点的单核苷酸多态性分布与冠心病的相关性

目的研究浙江温州地区汉族人群中染色体9p21上的rs1333049位点上的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与冠心病的相关性。方法对冠心病组（至少1支主要冠状动脉内径狭窄≥50.00%）181例和对照组173例,采用聚合酶链反应和基因测序方法,检测染色体9p21上rs1333049位点基因多态性。结果 3种基因型均可在rs1333049位点上检测到,并且其基因型的分布亦符合Hardy-Weinberg平衡定律。冠心病组rs13330^149位点的CC、CG基因型分布及C等位基因频率均高于对照组,差异有统计学意义（均P〈0.01）。结论 rs1333049位点G/C基因的多态性与冠心病发病相关,其中的C等位基因亦可能是浙江温州地区汉族人群冠心病患者的易感性标志之一。     

9p21染色体位点基因表达水平与冠心病病情发展的相关性

目的观察9p21染色体位点相关基因与冠心病病情发展相关性。方法采用实时荧光PCR扩增法分别测定稳定型心绞痛患者(30例)、不稳定型心绞痛患者(30例)、急性心肌梗死患者(30例)、健康人群患者(30例)的外周血9p21染色体位点相关基因[细胞周期依赖性激酶抑制基因(CDKN)2A、CDKN2B、甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)和INK4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)]表达水平,分析不同冠心病病情分期患者及健康人群外周血9p21染色体位点相关基因表达差异。结果与健康人群组比较,稳定型心绞痛组、不稳定型心绞痛组和急性心肌梗死组患者外周血9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B基因表达水平显著降低(均P0.05),而MTAP基因表达水平显著提升(P0.05),而ANRIL基因表达差异无统计学意义(P0.05)。同时稳定型心绞痛组、不稳定型心绞痛组和急性心肌梗死组患者外周血9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达水平两两比较差异均有统计学意义(均P0.05),ANRIL基因表达水平两两比较差异均无统计学意义(均P0.05)。结论 9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因与冠心病发生密切相关,且随着冠心病病情发展,9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达与正常健康人群差异越明显,9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达水平可能是汉族冠心病人群临床诊治的潜在靶基因。     

CTRP9基因多态性与冠心病的相关性

目的探讨广东地区汉族人群CTRP9基因多态性与冠心病遗传易感的相关性。方法入选冠心病患者548例和对照个体862例,利用聚合酶链式反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)技术检测CTRP9基因的两个多态性位点rs6583、rs9553238的基因型,并采用Logistic回归分析两个多态位点和冠心病的易感性。结果 rs6583和rs9553238的等位基因、基因型频率在广东地区汉族人群的冠心病组和对照组分布中均无统计学差异(P>0.05),构建的显性模型、隐性模型、加性模型在冠心病组和对照组中也无统计学差异(P>0.05);CTRP9基因单体型(rs6583-rs9553238)在这两组中仍未发现有统计学差异(P>0.05)。结论 CTRP9基因rs6583和rs9553238多态位点与广东地区汉族人群的冠心病遗传易感无显著相关性。     

结缔组织生长因子rs9399005单核苷酸多态性与冠心病的关系

目的探讨结缔组织生长因子(CTGF)rs9399005基因多态性与血清CTGF水平及冠心病的相关性。方法纳入冠心病组214例和正常对照组64例,酶联免疫吸附法检测其血清CTGF水平。采用Sanger法分析CTGF基因rs9399005单核苷酸多态性(SNP)。比较两组基线临床资料、血清CTGF和基因型分布频率。非条件Logistic回归分析CTGF rs9399005 SNP与冠心病的遗传易感性,比较不同基因型CTGF水平。分析CTGF水平与冠状动脉病变支数、冠心病严重程度的关系。结果两组年龄、吸烟、高血压、体质指数、高密度脂蛋白胆固醇、载脂蛋白A1、CTGF差异有统计学意义(P0.05)。rs9399005基因型CC、CT、TT及等位基因C和T在两组间的分布有统计学差异(χ2值分别为12.935和17.148,均P0.01)。携带CT发生冠心病的危险性是CC的1.134倍,TT是CC的1.406倍,T等位基因是C等位基因的1.327倍。血清CTGF水平在各基因型间差异有统计学意义(F=3.284,P=0.034)。各基因型间冠心病所累及的冠状动脉主要分支的差异有统计学意义(χ2=13.872,P=0.022)。结论CTGF rs9399005 SNP与冠心病的遗传易感性相关;等位基因T与冠心病严重程度、冠状动脉病变支数及血清CTGF水平相关。     

9p21位点单核苷酸多态性与无症状颅内、外动脉狭窄的关联

目的 :在无症状人群中评估9p21位点多态性与颅内、外动脉狭窄的关联。方法 :纳入889例无卒中史高血压患者,收集一般资料,检测血、尿样本并提取全血DNA。采用CT血管成像(CT angiography,CTA)评估颅内、外动脉狭窄。选取位于9p21的位点rs1333049和rs2383207进行分型。结果:纳入人群中46.2%颅内、外动脉无狭窄,21.4%仅颅内狭窄,15.4%仅颅外狭窄,17.0%颅内、外共存狭窄。所选位点在校正多重危险因素后与颅内、外共存狭窄显著相关(P=0.011和0.017);rs2383207-A等位基因携带显著与降低的狭窄程度相关(P=0.009),与较少的病变数目无关(P=0.063)。结论:9p21位点rs1333049和rs2383207与无症状颅内、外共存动脉狭窄显著相关,可用于评估全身动脉粥样硬化的水平。     

广西壮族人群SLC2A9基因多态性位点与原发性痛风的关联性研究

［摘要］　目的　探讨广西壮族人群可溶性载体2家族成员9（SLC2A9）基因单核苷酸多态性（SNPs）与原发性痛风的关联性。方法　收集广西壮族人群246例原发性痛风患者和202名健康对照者的临床资料及血尿酸（UA）、空腹血糖、甘油三酯(TG)、总胆固醇（TC）、高密度脂蛋白（HDL-C）、低密度脂蛋白（LDL-C）、肌酐（Cr）、尿素氮（BUN）等实验室指标,比较两组临床及实验室指标的差异。Taqman-MGB探针法检测SLC2A9基因4个位点(rs10489070、rs734553、rs3733591、rs16890979)的基因型,比较两组基因型及等位基因分布频率。结果　痛风组的体质量指数（BMI）、TG、TC、LDL-C、Cr、UA水平显著高于对照组（P<0.05）。有痛风石的患者年龄更大,病程更长,累及关节数更多,肾结石发生率更高,TG、TC、LDL-C、Cr、UA水平更高,差异均有统计学意义（P<0.05）。rs10489070和rs3733591在痛风组与对照组基因型及等位基因分布频率差异有统计学意义（P<0.05）,携带C等位基因的个体发生痛风的OR值分别为1.413（95%CI：1.009～1.980）和1.739（95%CI：1.331～2.271）。rs3733591（CC）（aOR=2.113,95%CI：1.536～3.951）、rs10489070（CC）（aOR=1.981,95%CI：1.123～3.156）是痛风发生的独立危险因素。rs3733591（CC）（aOR=2.358,95%CI：1.114～3.221）、rs10489070（CC）（aOR=2.115,95%CI：1.689～4.547）是痛风石发生的独立危险因素。结论　我国壮族人群中,SLC2A9基因的rs10489070（CC）和rs3733591（CC）基因型是痛风和痛风石的独立危险因素,但目前易感位点影响痛风发病的具体机制尚不明确,下一步需要进行相关SNPs功能的研究。     

胱抑素C rs1064039位点单核苷酸基因多态性与冠心病的相关性研究

目的:通过研究胱抑素C基因(CST3)rs1064039位点单核苷酸多态性(SNP),揭示其与冠心病的相关性。方法:采用病例-对照研究,选择上海市静安区中心医院心内科疑似冠心病入院的汉族530例患者为研究对象,依据冠状动脉(冠脉)造影结果分为冠心病组(320例)及对照组(210例)。提取外周血白细胞基因组DNA,应用巢式PCR直接测序技术检测CST3rs1064039位点SNP,分析该位点的基因型及等位基因频率与冠心病的相关性,及其与血胱抑素C水平的关系。结果:汉族人群中CST3基因rs1064039位点存在G/A突变,存在GG、GA和AA 3种基因型,GG型为野生基因型,无论等位基因频率或者基因型分布在冠心病及对照组均无明显差异;CST3rs1064039位点野生型纯合子携带者血胱抑素C在全体人群和对照组中的水平明显高于突变型携带者,但这种差别在冠心病组消失。结论:汉族人群中CST3基因rs1064039位点的基因多态性与冠心病发病无直接相关性,而与血胱抑素C水平相关。     

细胞色素氧化酶基因CYP1A2多态性与新疆汉族和维吾尔族人群冠心病的相关性

目的 探讨新疆地区维吾尔（维）族人群、汉族人群细胞色素氧化酶基因CYP1A2（cytochrome c oxidase P1A2）多态性与冠心病的关联性。 方法 我们采用两项独立的病例对照研究∶汉族人群389例冠心病患者(病例组）和411名健康体检者（对照组）;维族人群293冠心病患者（病例组）和408名健康体检者（对照组）。通过实时PCR对CYP1A2基因单核苷酸多态性（SNPs）rs2069522和rs2472304进行基因分型。 结果 仅在汉族人群中,SNP1 (rs2069522)基因型的分布在冠心病组和对照组之间差异均有统计学意义(P < 0.05)。而维族人群中未见显著差异。新疆汉族病例组SNP1 (rs2069522)显性模型(CC vs CT + TT)基因型频率显著高于对照组。调整混杂因素后logistic回归分析表明,新疆汉族人群CC基因型患冠心病的风险显著高于CT + TT基因型者(总体:OR = 1.982,95%CI: 1.174～3.236, P < 0.01;男性: OR = 2.671,95%CI: 1.548～4.314, P < 0.01)。 结论 新疆汉族人群CYP1A2基因中rs2069522的位点与冠心病相关。CC基因型可能是新疆汉族人群而非维吾尔族人群发生冠心病的独立危险因素。     

p21和p27基因多态性与妇科肿瘤的相关性研究

目的探讨p21和p27基因多态性与妇科肿瘤遗传易感性的关系。方法采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性方法,分析100例妇科肿瘤患者和95例健康对照者的p21基因3′非翻译区（3′UTR）和p27基因第109密码子多态性位点的基因型。结果妇科肿瘤患者p21基因突变型TT频率为26.00%,对照者为16.84%,两者相比,P〈0.01;年龄〈46岁组肿瘤患者的p21基因突变型（CT＋TT）频率为86.84%,≥46岁组为59.52%,两组相比,P〈0.01;中低分化组妇科肿瘤患者的突变型CT和TT基因型频率为76.47%,高分化组为46.67%,两组相比,P〈0.05;妇科肿瘤患者与对照者的p27基因型总体分布及V和G等位基因频率相比,P均〈0.01。结论p21基因3′UTR多态性和p27基因V109G多态性与妇科肿瘤的遗传易感性有关。     

染色体9p21上两个SNP位点与中国汉族人群心肌梗死的关系

目的研究染色体9p21上两个单核苷酸多态性（SNP）位点（rs10757274、rs2383206）在中国汉族人群中的分布,探讨其与心肌梗死（MI）的相关性。方法选择432例初发MI（MI组）及430例外科疾病（对照组）患者,用PCR-SNP Stream技术对rs10757274、rs2383206位点进行SNP分型及分析。结果MI组两个SNP位点的GG、AG基因型分布及G等位基因频率均高于对照组（P均〈0.01）。校正混杂因素后显示,两个SNP位点中的G等位基因可使MI患病风险分别提高44%和54%（P〈0.01）。结论rs10757274、rs2383206是中国汉族人群MI发生的易感位点。     

9p21.3 coronary artery disease risk locus and interferon alpha 21: Association study in an Asian Indian population

IntroductionType I Interferons (INFαs and INF β) are known to be proinflammatory cytokines that promote atherosclerosis. IFNA21 is a member of alpha Interferon gene cluster on short arm of chromosome 9. We analyzed the potential link between 9p21 coronary artery disease (CAD) risk locus and IFNA21.Objectivesa) study of association between serum IFNA21 levels and 14 demographic/clinical variables, including age, gender, diabetes, hypertension, and duration of CAD, b) study of association between high serum IFNA21 levels and 30 9p21 SNP genotypes.MethodsTo estimate serum circulating levels of IFNA21, we performed sandwich ELISA in 184 controls and 167 CAD cases. The IFNA21 levels could be classified into two broad classes: a) Low-level group: ≤15.6 pg/ml b) High-level group: >15.6 pg/ml. We also performed SNP genotyping for 30 SNPs at 9p21 locus in all study subjects using Sequenom MassARRAY technology. Statistical software SPSS (Version 21) was used to analyze the data obtained.ResultsOur analysis indicates that there could be an association of high IFNA21 levels with variables – gender, age, and duration of CAD in the study population. SNPs rs10757272 (TT), rs10757274 (GG), rs10757283 (TT), rs1333045 (CC), rs1333048 (CC), rs1333049 (CC), and rs4977574 (GG) showed significant risk association with high-level IFNA21 group.ConclusionsIFNA21 may be involved in inflammatory processes in an age-dependent manner and in progression of CAD. This IFNA21-mediated mechanism may be more active in females. Several 9p21 SNPs may modulate inflammatory processes mediated by IFNA21 and may, therefore, contribute to pathophysiology of CAD.     

载脂蛋白M基因rs707921位点多态性与冠心病易感性的关系

目的检测载脂蛋白M(ApoM)基因rs707921位点的基因多态性,探讨其与冠心病(CHD)的相关性。方法采用单荧光标记探针技术检测111例CHD患者及248例对照组的ApoM rs707921位点单核苷酸多态性,分析其基因型和等位基因频率的分布情况。结果 ApoM rs707921位点3种基因型(AA型、AC型和CC型)在CHD组中分布频率为1.8%、13.5%和84.7%,在对照组中分布频率为2.0%、25.4%和72.6%,两组差异有统计学意义(P=0.039);ApoM rs707921位点A、C等位基因的频率在CHD组和对照组中分布频率分别为8.6%、91.4%和14.7%、85.3%,两组比较差异有统计学意义(P=0.023)。CHD组中AC+AA基因型者甘油三酯水平显著低于CC基因型者(P=0.043)。CHD组rs707921位点多态性不同基因型间冠状动脉病变严重程度差异无统计学意义(P0.05)。结论ApoM基因rs707921位点A等位基因可能降低CHD的发病风险,但与CHD的严重程度无关。     

基质金属蛋白酶9及其启动子C-1562T基因多态性与冠心病的相关性研究

目的探讨基质金属蛋白酶9（MMP-9）及其启动子C-1562T基因多态性在冠心病发病中的作用及其临床意义。方法入选163例患者,冠心病组103例,其中急性冠脉综合征（ACS）组71例,稳定型心绞痛（SAP）组32例;对照组60例。采用限制性内切酶片段长度多态性（PCR—RFLP）法鉴定MMP-9启动子C-1562T基因型,所有患者均行冠脉造影检查明确冠状动脉病变情况。结果①冠心病组MMP-9启动子-1562C／T基因型频率较对照组增高,-1562T型等位基因频率增高,差异有统计学意义。②冠心病患者MMP-9浓度较对照组明显升高,差异有统计学意义。③有T型等位基因患者MMP-9浓度较无T型等位基因患者升高,差异有统计学意义。④冠心病与其危险因素logistic回归分析提示,吸烟、高血压、高脂血症、肥胖、MMP-9启动子-1562T型等位基因为冠心病的危险因素。结论MMP-9启动子C-1562T基因多态性与冠心病的发病可能相关,T型等位基因可能是冠心病患者遗传易感性基因标志之一。MMP-9启动子C-1562T型等位基因可能引起MMP-9表达增高。     

基质金属蛋白酶1基因-519A/G多态性与冠心病发病的关系

目的 研究中国北方汉族人群中基质金属蛋白酶1(MMP1)基因-519A/G单核苷酸多态性与冠心病发病的关系.方法 采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术结合琼脂糖凝胶电泳和基因测序等方法,检测经冠状动脉造影证实的517例冠心病患者和380例健康对照者MMP1-基因-519A/G多态性位点的基因型和等位基因分布,分析两组人群MMP1基因型和等位基因型频率的差异.结果 中国北方汉族人群中存在MMP1基因-519A/G单核苷酸多态性.MMP1基因-519A/G单核苷酸多态的AA基因型在冠心病组和对照组间的分布差异有统计学意义[67.70%(350/517)比40.26%(153/380),OR=1.64,P＜0.001,95%CI:1.44～1.86],A等位基因携带者冠心病发病的相对危险度为1.49(P＜0.001,95%CI:1.33～1.69).亚组分析显示,AA基因型在急性冠状动脉综合征(ACS)组和稳定性心绞痛组间的分布差异有统计学意义[68.81%(278/404)比51.76%(44/85),P＜0.01,95%CI:1.04～1.27].A等位基因携带者发生ACS的相对危险度为1.11(P＜0.05,95%CI:1.01～1.21).不稳定性心绞痛组与急性心肌梗死组比较,AA基因型和A等位基因的分布差异无统计学意义.结论 中国北方汉族人群中存在MMP1基因-519A/G单核苷酸多态性.MMP1基因-519A/G单核苷酸多态性与冠心病的发病相关,A等位基因携带者发生ACS的危险性增加.     

MLPA技术在检测胰腺癌细胞系9p21大片段缺失中的应用

目的:评价MLPA技术检测染色体9p21区大片段缺失的有效性及判断缺失边界的准确性,并探讨染色体9p21区大片段缺失的意义.方法:利用MLPA技术检测胰腺癌细胞系PANC-1和BxPC3的9p21区缺失情况,并利用常规PCR实验对MLPA缺失边界进行验证.结果:MLPA检测发现PANC-1和BxPC3均存在累及MTAP、CDKN2A和CDKN2B等基因大片段缺失的情况.PCR实验证实MLPA对PANC-1端粒侧的缺失边界判断准确.PANC-1细胞系染色体9p21区大片段缺失的端粒侧缺失断点位于MTAP基因内.结论:MLPA技术是检测染色体9p21大片段缺失的有效方法,能准确判断大片段缺失边界范围,适合于aCGH检测后大样本筛查.PANC-1细胞系中染色体9p21区大片段缺失可能改变MTAP基因结构.     

汉族人群C反应蛋白基因多态性与冠心病和C反应蛋白水平相关性研究

目的研究汉族人群中C反应蛋白(CRP)基因启动子区-717A/G和-390C/A/T单核苷酸多态性(SNP)的分布以及与冠心病(CHD)和CRP水平的相关性。方法选取2007年10月至2008年5月北京医院住院患者分为CHD组(111例)及对照组(101例)。-717A/G位点运用限制性酶切长度多态性(RELP)的方法检测基因多态性,-390C/A/T位点运用序列特异性的聚合酶链反应(SSP)检测多态性。为排除其他危险因素的干扰,综合考虑与CHD相关的其他危险因素,运用Logistic回归的方法分析相关性。结果在汉族人群中-717A/G多态性各种等位基因与基因型研究对象的CRP水平差异无统计学意义,各等位基因频率和基因型频率在CHD和对照组中分布差异无统计学意义。-390C/A/T多态性与CRP水平相关,-390C/A/T多态性的等位基因频率(P<0.05)基因型频率(P<0.05)在两组之间差异有统计学意义。分析CHD相关危险因素发现该位点依然与CHD显著相关,带有T等位基因的个体得CHD的概率是不带T等位基因个体的2.66倍。结论-717A/G多态性与CRP水平和CHD未见相关;CRP基因-390C/A/...     

基质金属蛋白酶9及其基因多态性与冠心病的相关性研究

基质金属蛋白酶（MMPs）是细胞基质降解所必需的锌离子依赖性的内源性蛋白酶家族,是细胞外基质（ECM）的主要生理性调节物质,在基质成分合成和降解的过程中起着重要的作用。对血管系统的基质成分而言,最重要的MMPs是胶原酶和明胶酶。其中明胶酶-B（即MMP-9）在细胞外基质重塑中具有重要作用,在许多病理损伤方面,如冠状动脉粥样硬化斑块不稳定、心室重塑、心力衰竭进展及心血管疾病预后等中亦扮演着重要的角色。     

MMP-9基因启动子C1562T多态性与老年冠心病易感性的相关性研究

目的探讨基质金属蛋白酶9(MMP-9)基因启动子C1562T多态性与老年冠心病(CHD)易感性的相关性。方法纳入2009年3月~2012年12月北京航天总医院年龄≥60岁的CHD患者168例作为CHD组,纳入同期健康体检者208例作为对照组。取外周血标本提取DNA,采用聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测MMP-9基因启动子C1562T基因型,比较两组间MMP-9基因多态性频率分布的差异。结果 MMP-9基因启动子区C1562T多态性基因型和等位基因频率分布在CHD组和对照组之间差异有统计学意义(P0.05)。CHD组1562T等位基因频率明显高于对照组(20.8%vs.13.0%,P=0.004),携带T等位基因个体患冠心病的风险是C等位基因的3.97倍(OR=3.97)。不同临床类型的CHD患者在基因型及等位基因分布方面的差异无统计学意义(P0.05)。结论 MMP-9基因C1562T多态性与老年CHD的发生有关联,T等位基因可能是冠心病发病的遗传易感基因。