编码日本血吸虫Argonaute蛋白全长cDNA克隆、表达及初步鉴定

目的获得编码日本血吸虫Argonaute基因的全长cDNA,并进行克隆和重组融合蛋白表达。方法利用RACE技术获得编码日本血吸虫Argonaute基因的全长cDNA并对其进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR(Realtime PCR)分析该基因在日本血吸虫中的转录情况。原核表达保守功能域蛋白和全长蛋白,利用保守功能域重组融合蛋白免疫昆明系小鼠制备多克隆抗体。免疫印迹(Western blot)进行免疫学分析。结果本研究获得了一个编码日本血吸虫Argo-naute基因的全长cDNA,其完整开放阅读框为3 030 bp,编码1 009个氨基酸,预测分子量为111.7 kDa。生物信息学分析表明该基因编码的蛋白序列具有Argonaute家族蛋白的典型结构域特征,且与人、鼠Argonaute蛋白具有较高的同源性。Real-time PCR分析表明该基因在7,14日龄的日本血吸虫童虫中转录较高。Western blot分析制备的多抗具有较高的特异性并能识别全长融合蛋白。结论获得了编码日本血吸虫Argonaute基因的cDNA及重组蛋白,为进一步研究该蛋白的功能奠定了基础。     

编码日本血吸虫Argonaute 3蛋白全长cDNA的获得及初步研究

目的获得日本血吸虫Argonaute3(Ago3)蛋白的全长编码cDNA并对其初步分析。方法利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)获得日本血吸虫Ago3蛋白全长编码cDNA,利用原核表达系统对此蛋白片段进行重组表达,采用亲和层析法纯化重组蛋白,并免疫动物制备多克隆抗体。利用Western blot技术分析该蛋白在日本血吸虫中的表达。结果采用RACE获得了日本血吸虫Ago3蛋白编码全长cDNA,长度为2772bp;利用原核表达系统获得了该蛋白片段的重组融合蛋白,并制备了多克隆抗体;Western blot分析表明,该抗体与日本血吸虫全虫蛋白在分子量约为100kDa处具有特异性反应。结论获得了编码日本血吸虫Ago3蛋白的全长编码cDNA,并制备了多克隆抗体,为进一步研究该蛋白的功能奠定了基础。     

日本血吸虫SjBT基因的获得与生物信息学分析

目的　从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新基因 ,为防治日本血吸虫病提供药物靶标或候选疫苗。　方法　构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,用序列标签法随机挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移法测序获取其全长cDNA ,并进行生物信息学分析和登录。　结果　获得了 1个日本血吸虫新基因 ,全长 14 3 9bp ,编码 44 3个氨基酸 ,与肝片形吸虫微管蛋白基因具有 79%的同源性。编码蛋白的理论分子质量为 7.2 198ku ,等电点为 9.12 ;抗原表位可能位于cDNA序列 3 73～ 3 96处。　结论　表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术有利于发现日本血吸虫新基因。     

日本血吸虫SjBT基因的获得与生物信息学分析

目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum，Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新基因，为防治日本血吸虫病提供药物靶标或候选疫苗。方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库，用序列标签法随机挑取重组阳性克隆进行测序，对部分序列进行步移法测序获取其全长cDNA，并进行生物信息学分析和登录。结果获得了1个日本血吸虫新基因，全长1439bp，编码443个氨基酸，与肝片形吸虫微管蛋白基因具有79％的同源性。编码蛋白的理论分子质量为7．2198ku，等电点为9．12；抗原表位可能位于cDNA序列373～396处。结论表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术有利于发现日本血吸虫新基因。     

日本血吸虫Wnt受体蛋白Fz5编码基因的克隆及其在不同发育时期虫体的表达差异

目的克隆含开放阅读框（ORF）的日本血吸虫SJCHGC08304全基因序列,分析此基因编码蛋白的Wnt受体种类,了解该基因在血吸虫不同发育阶段的mRNA表达差异。方法采用RACE技术从日本血吸虫7d肝期童虫和42d成虫组织中扩增获得日本血吸虫SJCHGG08304全基因序列,通过生物信息学工具分析该基因的完整ORF;同源性分析该基因编码蛋白的种类和功能;运用荧光定量PCR技术分析该基因在日本血吸虫不同发育阶段虫体中的表达情况。结果获得日本血吸虫新基因,该基因ORF含2604bp,编码867个氨基酸,理论分子量为98．264kD。实时定量分析该基因在18d童虫表达量最高,其他依次为14d童虫、42d雄虫、32d成虫、虫卵、23d成虫、27d成虫,而在42d雌虫中没有检测到该基因。结论该基因的氨基酸序列具有典型Wnt受体家族蛋白特征,生物信息学方法同源性分析表明与非洲爪蟾Fz5蛋白的同源性最高,通过比较分析推测为编码日本血吸虫Wnt受体Fz5蛋白基因,命名该基因为sjFz5基因（GenBank登录号：EU370926）,其在血吸虫的不同发育时期中有不同程度的差异表达。     

日本血吸虫普遍性结合酶E基因的获得和分析

目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新基因,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,登录GenBank,利用BLAST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较;并利用pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析.结果获得了1个日本血吸虫新基因普遍性结合酶E基因(ubiqui-tin-conjugating enzyme E,AY251608),长854bp,编码149个氨基酸,与人类普遍性结合酶E具有55%的同源性,编码蛋白的理论分子量为7.149 8 kDa,等电点为8.01;抗原表位可能位于氨基酸序列373～396处.结论步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因.     

日本血吸虫亲环素A和乳酸脱氢酶编码基因的克隆及序列分析

目的　识别和克隆日本血吸虫新基因。方法　对本实验室获得的EST进行同源性分析 ,识别血吸虫新基因 ;根据EST设计引物 ,用锚着PCR法从cDNA文库中扩增出新基因全长cDNA ,并将其克隆入原核表达载体 pGEX - 4T - 1,用生物信息学技术对获得的编码基因进行结构与功能的分析。结果　EST同源性分析得到一个完整编码基因 ,开放阅读框(ORF) 4 95bp ,编码 16 4个氨基酸 ;锚着PCR法获得另一EST的 3’端所缺序列 ,得到完整编码阅读框 ,其ORF 999bp ,编码 332个氨基酸。利用生物信息学技术确定它们分别为日本血吸虫亲环素A(CyPA)和乳酸脱氢酶 (LDH)的编码基因。重组质粒经双酶切及测序鉴定证明日本血吸虫CyPA和LDH原核表达质粒构建成功。 结论　克隆到日本血吸虫亲环素A和乳酸脱氢酶编码基因的全长cDNA ,为进一步的功能研究打下了基础     

日本血吸虫线粒体相关蛋白的基因克隆及特性鉴定

目的为探索血吸虫病疫苗的新路径,对日本血吸虫线粒体相关蛋白的基因克隆及特性鉴定.方法分析本室筛选日本血吸虫成虫cDNA文库获得的一cDNA片段(Sj338/24)的开读框序列,在其上下游分别设计引物A和B,并以该cDNA片段为模板进行PCR扩增后将该片段重组于pGEM-T中并进行DNA测序鉴定及检索.再经酶切后将该基因片段亚克隆入表达载体pGEX-6P-1,并进行蛋白表达、纯化及抗原性鉴定.结果该目的基因PCR产物全长共487bp,其开读框由459bp组成,编码153个氨基酸残基组成的多肽.DNA序列同源性分析发现,Sj338克隆基因与人及褐鼠的线粒体外膜蛋白的部分编码基因较高度同源.重组质料pPEX-6P-1/Sj338能高效融合表达,融合蛋白的分子量为43kDa.SDS-PAGE和Western blot检测结果表明,重组蛋白rSj338具有良好的抗原性.结论·Sj338可能为日本血吸虫线粒体相关蛋白的基因,重组蛋白有望成为新的疫苗侯选分子.     

中华按蚊水通道蛋白(AsAQP)cDNA克隆与序列分析

目的克隆中华按蚊水通道蛋白(AsAQP)基因的cDNA全长序列,分析其基因序列特征,为研究AsAQP的生物学功能提供分子基础。方法根据已报道的昆虫水通道蛋白(AQP)氨基酸序列的保守区域,采用兼并引物从中华按蚊cDNA中获取AsAQP基因片段,在此基础上利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆该基因cDNA全长序列,并用生物信息学方法对获取的序列进行分析。结果利用兼并引物从中华按蚊成蚊cDNA中分离到AsAQP基因片段,利用RACE技术克隆到该基因的全长cDNA。序列分析表明,该基因cDNA全长762 bp,编码253个氨基酸,蛋白分子量约为63.2 kD。生物信息学分析表明,AsAQP具有典型的6个跨膜区结构和2个天冬酰胺酸脯氨酸丙氨酸(NPA)结构,该结构是主要内在蛋白(MIP)家族典型的结构特征。AsAQP与致倦库蚊(Culex quinquefasciatus)AQP及埃及伊蚊(Aedes aegypti)AQP蛋白的同源性分别为76%和78%。氨基酸序列聚类分析表明,AsAQP与其他蚊种的水通道蛋白遗传距离较近。结论利用兼并引物结合RACR技术首次获得了编码AsAQP基因的cDNA全长序列,该基因属于MIP蛋白家族成员,具有典型的功能域,为进一步研究该蛋白的功能奠定了基础。     

日本血吸虫钙调神经磷酸酶B基因的获得和分析

目的　从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的蛋白基因 ,为日本血吸虫病的防治提供侯选疫苗和药物靶点。方法　构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA ,并进行生物信息学分析和登录。结果　获得了 1个日本血吸虫新基因 -钙调神经磷酸酶 (Calcineurin ,CaN)基因B(AY2 2 0 75 1) ,长 12 6 6bp ,编码 16 9个氨基酸 ,含有 2个“EF -hand”Ca+2 结合区域 ,与曼氏血吸虫CalcineurinB有 84 %的同源性。结论　步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因     

OR-1, a member of the nuclear receptor superfamily that interacts with the 9-cis-retinoic acid receptor.

We have cloned a member of the nuclear receptor superfamily. The cDNA was isolated from a rat liver library and encodes a protein of 446 aa with a predicted mass of 50 kDa. This clone (OR-1) shows no striking homology to any known member of the steroid/thyroid hormone receptor superfamily. The most related receptor is the ecdysone receptor and the highest homologies represent < 10% in the amino-terminal domain, between 15-37% in the carboxyl-terminal domain and 50-62% in the DNA binding domain. The expression of OR-1 appears to be widespread in both fetal and adult rat tissues. Potential DNA response elements composed of a direct repeat of the hexameric motif AGGTCA spaced by 0-6 nt were tested in gel shift experiments. OR-1 was shown to interact with the 9-cis-retinoic acid receptor (retinoid X receptor, RXR) and the OR-1/RXR complex to bind to a direct repeat spaced by 4 nt (DR4). In transfection experiments, OR-1 appears to activate RXR-mediated function through the DR4. Therefore OR-1 might modulate 9-cis-retinoic acid signaling by interacting with RXR.     

Cloning and characterization of the retinoid X receptor from a primitive crustacean Daphnia magna

Terpenoid hormones function as morphogens throughout the animal kingdom and many of these activities are mediated through members of the retinoid X group of nuclear receptors (RXR; NR2B). In the present study, RXR was cloned from the water flea Daphnia magna, a primitive crustacean of the class Branchiopoda, and characterized with respect to phylogeny, developmental expression, and hormonal regulation. The full length daphnid RXR cDNA was cloned by initial PCR amplification of a cDNA fragment from the highly conserved DNA-binding domain followed by extension of the fragment using RACE PCR. The full length cDNA was 1888 base pairs in length and coded for a 400 amino acid protein that exhibited the five-domain structure of a nuclear receptor superfamily member. The RXR protein shared significant identity with other NR2B group members. Phylogenetic analyses of the ligand-binding domain of the receptor revealed that daphnid RXR clustered with RXR from decapod crustaceans on a branch of the phylogenetic tree that was distinct from RXRs known to bind retinoic acids and juvenile hormones. Daphnid RXR mRNA levels were greatest in embryos that were early in development and progressively declined through the initial five stages of embryo development. Adult females expressed higher levels of RXR mRNA than did males and exposure of females to the terpenoid mimic pyriproxyfen reduced RXR mRNA to levels approaching levels in males. RXR mRNA levels in males were refractory to pyriproxyfen. These results show that branchiopod crustaceans dynamically express RXR which should be evaluated as a candidate receptor for the terpenoid hormone methyl farnesoate which functions as a sex determinant in these organisms.     

湖北钉螺髓样分化因子88的鉴定及其在抗血吸虫感染固有免疫中的地位

目的克隆、鉴定湖北钉螺(Oncomelania hupensis)髓样分化因子88(MyD88)基因,并通过观察感染日本血吸虫前后钉螺各组织中MyD88 m RNA表达水平的变化,探讨其在抗血吸虫感染固有免疫中的地位。方法通过c DNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of c DNA ends,RACE)获取湖北钉螺MyD88全长c DNA序列,预测其蛋白结构域,并进行多序列比对及保守区域分析,构建系统进化树。使用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-q PCR)技术检测MyD88基因在血吸虫感染前后钉螺各组织中的表达变化。结果湖北钉螺MyD88全长c DNA开放阅读框(Open reading frame,ORF)1 406 bp,编码468个氨基酸,蛋白N端和C端分别存在死亡结构域和TIR(Toll/interlrukin-1 receptor,TIR)结构域。与其他软体类MyD88氨基酸序列比对,相似性为38%~52%;系统进化树提示钉螺MyD88和光滑双脐螺MyD88起源于共同的祖先基因。q PCR结果显示,检测的所有组织中均有MyD88 m RNA的表达,其中血淋巴细胞中表达最为丰富。感染日本血吸虫后,除钉螺头足外,MyD88 m RNA在肝脏、生殖腺、血淋巴细胞等组织中均有上调表达,以血淋巴细胞中上调表达最显著。结论湖北钉螺存在依赖MyD88的TLRs(Toll-like receptors,TLRs)信号通路,MyD88分子可能在钉螺对抗日本血吸虫感染的固有免疫中发挥重要作用。     

日本血吸虫TOM34基因的克隆和表达分析

目的 克隆、表达日本血吸虫线粒体外膜转运酶34基因(SjTOM34),并对其生物特性进行初步研究。方法 应用RT-PCR方法从42 d日本血吸虫成虫cDNA中扩增SjTOM34基因,并进行生物信息学分析。应用实时定量RT-PCR方法分析了SjTOM34基因在日本血吸虫不同发育阶段虫体中的表达状况。构建了SjTOM34基因重组原核表达质粒,并在大肠杆菌中进行表达,Western blotting分析了重组抗原的免疫原性及该蛋白在不同发育阶段虫体中的表达情况,利用免疫组化方法观察了该蛋白在虫体内的分布情况。结果 获得了SjTOM34的基因序列,其开放阅读框(ORF)为1 083 bp。该基因在所检测的不同发育阶段童虫和成虫中均有表达,其中在35 d虫体中的表达量略高于其他时期的虫体。成功构建了重组的原核表达质粒并且在大肠杆菌中获得表达,重组蛋白在上清和沉淀中都有存在,并且具有较好的免疫原性,在所检测的各时期虫体中均可检测到该蛋白的存在,并且主要分布在虫体的实质组织中。结论 获得了日本血吸虫SjTOM34基因,初步明确了该基因在日本血吸虫童虫和成虫中的表达情况,及在成虫中的分布。     

抗日本吸虫卵单克隆抗体的制备和免疫化学的鉴定

Monoclonal antibodies (McAbs) were generated from mice immunized with soluble egg antigen (SEA) of Schistosoma japonicum. Five of which were specific to SEA of S. japonicum. The isotype of these McAbs was IgG1. Immunoblotting showed that the approximate molecule weight of the antigens recognized by the McAbs were 22 kDa, 116 kDa and greater than 200 kDa respectively. At least 3 isomorphs of the 22 kDa antigen recognized by 1E1 were found at pI 4.6-6 with 2-D Western blot. Moreover, immunoprecipitation using 125I-labeled S. japonicum SEA demonstrated that only one band corresponding to 30 kDa was recognized by 1E1.     

日本血吸虫肌动蛋白cDNA的克隆表达及其免疫保护功能

根据曼氏血吸虫肌动蛋白cDNA SmAct2设计一对引物,以日本血吸虫中国大陆株成虫mRNA为模板,用RT－PCR法扩增出一大小为1131bp的cDNA片段,测序后分析序列推断该片段为编码肌动蛋白基因的完整阅读框cDNA,与SmAct2 cDNA序列同源性为92％。该其克隆到载体pET28a( )中,在大肠杆菌BL21中获得了较高量的表达,融合表达产物分子量约为43kDa。利用日本血吸虫成虫粗抗原免疫大白所得抗血清对该表达产物进行Western印迹检测,在预测位置出现了明显的识别条带,说明所克隆的cDNA表达产物具有良好的抗原性。用该表达产物免疫昆明系小鼠,攻击血吸虫尾蚴以进行保护性实验。结果 其减虫率为28.4%,减卵率为29.2%,初步结果显示血吸虫肌动蛋白具有一定的免疫保护功能。