单核苷酸多态性的遗传变异与结直肠癌相关性研究进展

第二代测序技术和人类基因组计划的完成有助于发现基因组单个核苷酸变异的多样化,大量碱基突变位点成为遗传性疾病、基因-环境相关性疾病的易感位点。结直肠癌作为常见的恶性肿瘤,其发病率在中青年人群中持续上升,因此有必要探索结直肠癌早期筛查和诊断的可靠方式。单核苷酸多态性在所有遗传变异中最为丰富,同时也影响结直肠癌发生及进展和临床诊疗效果。深入探究单核苷酸多态性与结直肠癌相关性有助于对结直肠癌预防、诊断、治疗等方向提供新的思路。     

B7-H1基因rs4143815位点多态性与结直肠癌发病风险的关联研究

目的：B7-H1是肿瘤免疫治疗的一个靶点,位于其3'-非翻译区的rs4143815位点C/G多态性可影响其与miR-570的结合,进而影响B7-H1的表达。本研究旨在探讨B7-H1基因rs4143815位点多态性与结直肠癌发病风险的相关性。方法：采集215例结直肠癌患者和236例年龄性别匹配的健康对照人群外周静脉血,并收集手术切除结直肠癌和癌旁正常组织样本65例,直接测序法检测B7-H1基因rs4143815多态性,运用卡方检验分析B7-H1基因rs4143815多态性与结直肠癌发病风险的相关性;定量PCR检测B7-H1 mRNA表达。结果：结直肠癌和对照组中均检测到B7-H1基因rs4143815多态性的3种基因型,即CC、CG和GG基因型。结直肠癌和癌旁正常组织中均检测到B7-H1 mRNA的表达。与CC基因型相比,GG和CG/GG基因型显著增加了结直肠癌的发病风险[GG与CC相比：OR_调整=1.99,95% CI （1.19,3.34）,P=0.008;CG/GG与CC相比：OR_调整=1.58,95% CI （1.06,2.36） P=0.02]。与C等位基因相比,G等位基因显著增加了结直肠癌的发病风险[OR_调整=1.48,95% CI （1.14,1.93）,P=0.004]。B7-H1 mRNA在结直肠癌组织中的表达明显高于癌旁组织（P=0.02）,并且B7-H1基因rs4143815位点GG基因型携带者B7-H1 mRNA水平明显高于CC基因型携带者（P=0.03）。结论：B7-H1基因rs4143815位点GG基因型可能通过增加B7-H1 mRNA表达,进而增加了结直肠癌的发病风险。     

RASSF1基因SNP与陕西地区结直肠癌发病风险关系的研究

目的:探讨RASSF1基因第三外显子G133T和第六外显子A315G单核苷酸多态性(SNP)与陕西地区汉族人群结直肠癌(CRC)易感性的关系。方法:采用基于人群的病例对照研究,聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测61例CRC和122例健康对照个体RASSF1基因多态位点的基因型频率分布,比较不同基因型与CRC发生风险的关系。结果:RASSF1基因G133T多态的T等位基因频率在CRC患者组为24.6%,显著高于健康对照组的6.1%(P=0.00)。与G/G基因型相比,携带G/T基因型的个体CRC的发病风险显著增加,经性别、年龄、吸烟状况、GIC家族史校正后的OR值为2.33(95%CI=1.05-5.15)。RASSF1基因A315G多态的G等位基因频率在CRC患者组为25.4%,显著高于健康对照组的11.9%(P=0.00)。根据个体吸烟状况进行分层分析发现,与A/A基因型相比,携带A/G基因型和G等位基因(A/G+G/G基因型)可显著增加吸烟个体CRC的发病风险,经性别、年龄、GIC家族史校正后的OR值为4.5(95%CI=1.65-12.28)。根据GIC家族史进行分层分析发现,与A/A基因型相比,携带A/G基因型或G等位基因(A/G+G/G基因型)可显著增加GIC家族史阳性个体CRC的发病风险,经性别、年龄、吸烟状况校正后的OR值为3.78(95%CI=1.39-10.19)。结论:携带RASSF1基因G133T多态的T等位基因(G/T+T/T基因型)可能显著增加陕西地区人群CRC的发病风险。携带RASSF1基因A315G多态的G等位基因(A/G+G/G基因型)可能显著增加陕西地区人群CRC的发病风险。分层分析发现,G等位基因(A/G+G/G基因型)可能显著增加吸烟个体和GIC家族史阳性个体CRC的发病风险。     

miR-155侧翼序列rs767649A/T多态性与结直肠癌的相关性分析

摘 要：［目的］分析miR-155侧翼序列rs767649A/T多态性与结直肠癌的相关性。［方法］ 收集154例结直肠癌和203名健康对照人群外周静脉血样本,TaqMan探针法分析rs767649A/T多态性。［结果］ TT基因型显著增加了结直肠癌的发病风险（TT与AA相比：OR=2.11,95%CI：1.12～3.98,P=0.02;TT与AA/AT相比：OR=1.92,95%CI：1.09～3.38,P=0.02）。与A等位基因对比,T等位基因显著增加了结直肠癌的发病风险（OR=1.40,95%CI：1.04～1.90,P=0.03）。分层分析显示,rs767649A/T多态性与结直肠癌临床分期、分化程度和淋巴结转移等临床特征均无关。［结论］　miR-155侧翼序列rs767649A/T多态性可能是结直肠癌发病的危险因素。     

SCN10A rs12632942 单核苷酸多态性与结直肠癌化疗奥沙利铂外周神经毒性的相关性

[摘要] 目的：探讨SCN10A基因外显子区rs12632942 位点多态性与结直肠癌（CRC）患者化疗奥沙利铂外周神经毒性（OXLIPN）的相关性。方法：选取2011 年1 月至2013 年6 月广州医科大学附属第二医院、南昌大学第二附属医院、广州市白云区中医医院319 例接受含奥沙利铂（OXL）化疗方案的CRC患者（均为中国中南地区汉族）血液标本,常规提取DNA、PCR扩增及分析SCN10A外显子多态位点rs12632942 基因型,评估OXLIPN程度。通过单因素卡方检验、Logistic 多因素回归分析评估外显子多态rs12632942 基因型与OXLIPN 的相关性。结果：319 例CRC 患者rs12632942 基因型：AA134 例、AG156 例、GG29 例,rs12632942 基因型频率符合哈温平衡（P>0.05）。rs12632942 的AG+GG基因型与Ⅱ~Ⅳ度OXLIPN相关（P<0.01）,是发生Ⅱ~Ⅳ度OXLIPN的独立危险因素（OR=2.044,95%CI=1.231~3.392,P<0.01）。结论：SCN10A基因外显子区rs12632942AG+GG基因型的CRC患者易感Ⅱ~Ⅳ度OXLIPN。     

XRCC1单核苷酸多态性与结直肠癌风险的关系

背景与目的:X线交叉互补基因1(X-ray repair cross complementing group 1,XRCC1)编码蛋白在DNA单链断裂修复和DNA碱基修复过程中起重要作用.该基因外显子多态性的存在可影响编码蛋白的功能活性,最终使机体对癌症的易感性发生变化.本研究旨在探讨该基因外显子最常见的3处单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)--C26304T、G27466A和G28152A与结直肠癌风险的关系.方法:以聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)和限制性片段长度多态性(restrictive fragment length polymorphism,RFLP)分析方法,检测207例结直肠癌病例和621例成组匹配的正常对照XRCC1 C26304T、G27466A和G28152A基因型,并比较不同基因型与结直肠癌风险的关系.采用EH Linkage Software 1.2统计分析软件对研究对象的单体型分布进行预测.结果:年龄、性别、身体质量指数(body mass index,BMI)等个体特征,以及吸烟、饮酒等常见环境暴露因素的分布和/或构成比在结直肠癌病例组和对照组间差异均无显著性(P＞0.05).对XRCC1各多态基因型检测分型发现,结直肠癌病例组携带26304T、27466A和28152A变异等位基因的频率分别为29.95%、11.22%和28.22%,对照组分别为32.87%、12.34%和27.27%,各多态等位基因在两组间分布均没有显著性差异(P＞0.05).各多态基因型分布经x2拟合优度检验均符合Hardy-Weinberg平衡定律,且在两组间都没有显著性差异(P＞0.05).没有观察到各多态基因型与结直肠癌发病风险存在显著相关关系(P＞0.05).单体型分析发现,各变异等位基因在病例组和对照组内均存在遗传连锁不平衡现象,CGG、CGA、CAG和TGG是最常见的4类单体型,其在两组的分布频率总和分别为95.54%和96.64%,然而在两组间同样不存在显著性差异(P＞0.05).结论:我国浙江省嘉善县人群中,XRCC1 C26304T、G27466A和G28152A基因多态性与结直肠癌发病风险不存在相关性,然而各变异等位基因存在遗传连锁不平衡现象,CGG、CGA、CAG和TGG是最常见的4类单体型.     

VEGF基因-460T/C单核苷酸多态性与河北地区汉族人群肺癌发病风险相关性分析

目的:研究血管内皮生长因子(VEGF)基因启动子区-460T/C单核苷酸多态性(SNP)与河北地区汉族人群肺癌发病风险的关系。方法:采用基于医院的病例-对照研究方法,采集200例肺癌患者和204名健康对照的静脉血,同时记录其病史和个人相关资料。以蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取外周血白细胞DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法和引物介导的限制性聚合酶链反应(PIRA-PCR)方法检测VEGF-460T/C多态性位点的基因型。结果:肺癌组VEGF-460C/T SNP C等位基因频率(27.5%)明显高于对照组(20.1%),两组比较差异有统计学意义,χ2=6.109,P=0.013。肺癌组与对照组的T/T、T/C+C/C基因型频率分别为52.2%、47.5%和63.2%、36.7%,差异有统计学意义,χ2=4.445,P=0.029。与T/T基因型相比,携带C等位基因(T/C+C/C)的基因型可显著增加肺癌的发病风险;与T/T基因型相比,携带C等位基因(T/C+C/C)的基因型可显著增加不吸烟人群的发病风险。与T/T基因型相比,携带C等位基因的基因型(T/C+C/C),明显增加肺鳞状细胞癌及小细胞癌发病风险。结论:VEGF-460T/C SNP可能与肺癌发病风险相关。     

哺乳动物雷帕霉素靶蛋白基因多态性（rs2295080）与结直肠癌患者预后的关联性研究

[目的]对哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)基因多态性(rs2295080)与结直肠癌患者预后的相关性进行分析.[方法]随访行结直肠癌根治术的488例患者,提取患者静脉血标本的DNA并进行基因分型,分析mTOR rs2295080多态性与结直肠癌患者生存预后的关联.[结果]在结肠癌患者中,rs22995080 GG基因型携带者的预后生存较TG/TT基因型明显下降(HR=3.07,95％CI:1.15～8.22).同时发现该作用在中分化(HR=3.74,P=0.008),无淋巴结转移(HR=11.87,P＜0.001)和Ⅱ期(HR=14.74,P＜0.001)的结肠癌患者中更加明显.而在直肠癌患者中,rs2295080 TG/GG基因型较TT基因型可明显提升患者的预后生存(HR=0.48,95％ CI:0.23～0.99).该保护作用在无远处转移(HR=0.28,P=-0.0 11)和Ⅲ期(HR=0.21,P=0.019)的直肠癌患者中更加明显.[结论] mTOR rs2295080可能与结直肠癌患者的生存相关并可作为结直肠癌预测预后的生物标志物.     

EGF＋61基因多态性与结直肠癌的相关性研究

目的探讨表皮生长因子（EGF）G61A位点（EGF＋61）多态性与结直肠癌发生、发展的关系。方法应用多聚酶链式反应一限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）技术,检测中国人群中174例结直肠癌患者和227例正常对照者中EGF＋61位点的基因型,分析其基因型及等位基因的分布频率。结果EGF＋61位点AA基因型及A等位基因在对照者中的分布频率均高于结直肠癌患者（7．0％VS5．7％,30．4％vs29．0％）,但其差异均无统计学意义（P〉0．05）。EGF＋61位点AA基因型及A等位基因在不同临床病理分期结直肠癌中的分布频率及规律不一,但其差异均无统计学意义（P〉0．05）。结论在中国人群中,EGF＋61位点的基因多态性与结直肠癌的发生和发展无密切相关性。     

DNA修复基因XPD751单核苷酸多态性与 结直肠癌化疗疗效的相关性

 目的 研究结直肠癌患者DNA修复基因XPD751单核苷酸多态性与铂类药物化疗敏感度的关系。方法 经病理学确诊的晚期结直肠癌患者98例,均行草酸铂联合5-氟尿嘧啶的方案（FOLFOX）治疗。所有病例化疗前抽取静脉血并提取DNA,采用多聚酶链反应 限制性片段长度多态性分析（PCR RFLP）技术检测XPD751单核苷酸多态性。比较不同基因型与化疗疗效的关系。结果 （1）XPD751 Lys/Lys、Lys/Gln和Gln/Gln基因型频度分别为76（77.55%）、17（17.35%）和5（5.10%）。（2）XPD751 Lys/Lys、Lys/Gln 和Gln/Gln基因型有效率分别为50.00%、29.41%和20%,比较Lys/Lys、Lys/Gln的有效率,两者之间的差异有统计学意义（χ²=4.04,P<0.05）。在调整性别、年龄及不同转移部位的影响后,XPD751 Lys/Gln基因型患者化疗失败的可能性是Lys/Lys 基因型患者的3.8倍,OR=3.8,95%CI为0.985~14.698。结论 DNA修复基因XPD751单核苷酸多态性与结直肠癌对FOLFOX方案化疗敏感度相关,检测XPD751单核苷酸多态性可能成为预测结直肠癌患者接受FOLFOX方案化疗敏感度的指标。     

FGFR3基因单核苷酸多态与绝经前乳腺癌易感性的关联研究

目的 探讨FGFR3基因单核苷酸多态(SNPs)与女性绝经前乳腺癌的风险关系。方法 采用多重单碱基延伸SNP分型技术(Snapshot)检测FGFR3基因的rs2234909和rs3135848的SNP基因型在绝经前乳腺癌患者和绝经前正常女性人群中的频率,并分析不同SNP基因型与绝经前乳腺癌发病的风险关系。结果 FGFR3基因rs2234909和rs3135848的SNP基因型的频率在乳腺癌与对照组间无统计学差异(P＞0.05)。Logistic回归分析结果显示,对于rs2234909位点,相比较于TT基因型,TC和TC+CC基因型和乳腺癌的发病风险无显著相关性(OR=1.035,95% CI:0.680~1.575,P=0.874;OR=0.985,95% CI:0.638~1.521,P=0.945);对于rs3135848位点,相比较于TT基因型,TC、CC和TC+CC基因型与乳腺癌的发病风险无关(OR=1.177,95% CI:0.846~1.636,P=0.333;OR=0.948,95% CI:0.287~3.137,P=0.931;OR=1.162,95% CI:0.548~1.112,P=0.360)。rs2234909位点突变的乳腺癌患者与未突变者相比,组织学分级(显性模型:P=0.032;共显性模型:P=0.024)以及Ki67指数(显性模型:P=0.056;共显性模型:P=0.044)显著增高;rs3135848位点突变及两位点均突变与乳腺癌患者临床病理特征无显著相关性(P＞0.05)。结论 FGFR3基因的rs2234909和rs3135848两位点基因多态性与乳腺癌易感性无明显相关性;而rs2234909位点突变在绝经前乳腺癌患者中与组织学分级和Ki67指数呈正相关,可能提示预后不良。     

BRCA1相关A蛋白复合物基因单核苷酸多态性与三阴性乳腺癌易感性研究

背景与目的：BRCA1突变与三阴性乳腺癌发病相关目前已得到学者公认。该研究旨在分析BRCA1相关A蛋白复合物相关基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与三阴性乳腺癌发病风险的关系,寻找和确定与汉族人群三阴性乳腺癌遗传易感性相关的基因型和单体型。方法：2008年-2011年间414例在复旦大学附属肿瘤医院接受原发性乳腺癌手术的三阴性乳腺癌患者和354例健康妇女进入本病例对照研究。通过对Abraxas、BRE、Rap80、NBA1和BRCC36基因组DNA的37个SNP位点的检测,分析它们与三阴性乳腺癌的相关性。研究者随后检测了652例其他类型乳腺癌和890例健康女性的DNA以证实发现的SNP是否为三阴性特有的遗传相关位点。结果：该研究在第一步研究中发现,NBA1启动子区rs7250266位点突变的G等位基因在三阴性乳腺癌患者中的频率显著低于在正常女性中的频率(0.14 vs 0.19,P<0.01)。对rs7250266位点基因分型显示：与携带CC基因型个体比较,携带GC型个体的三阴性乳腺癌的发病风险显著降低(GC∶OR=0.70,95%CI：0.51~0.97;GG∶OR=0.48,95%CI：0.21~1.07,P=0.03)。单体型分析也证实NBA1基因的不同单体型间三阴性乳腺癌发病风险不同。第二步的研究结果显示,rs7250266位点突变在非三阴性的乳腺癌与正常人群中差异无统计学意义(0.19 vs 0.18,P=0.85)。结论：NBA1基因的rs7250266位点的单核苷酸多态性与汉族女性的三阴性乳腺癌发病风险相关,其突变型等位基因携带者罹患三阴性乳腺癌的风险低于野生型等位基因携带者。     

凋亡基因Caspase3和Caspase7单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性研究

目的 Caspase家族的SNP在乳腺癌、头颈部肿瘤、食管癌、肺癌等癌症中研究较多,而Caspase3,7的SNP与中国人群胃癌发病风险之间的研究较少。本实验旨在利用大样本研究Caspase3和Caspase7基因的SNP与胃癌遗传易感性的关系。方法 收集东北地区胃癌病例1 000例、对照组1 036例血液标本,进行基因组DNA提取。根据NCBI的dbSNP数据库和HapMap数据库,对Caspase 3,7选择潜在的SNP位点,所选位点均位于Caspase3,Caspase7的3′UTR。对Caspase 3,7的SNP位点运用Taqman探针法进行基因型分型。病例对照之间不同变量构成比差异采用双侧χ²检验,对每个位点进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验后,采用χ²检验比较病例组和对照组的单个位点基因型频率差异,再通过单因素和多因素Logistic回归模型分析基因型与疾病的关联,对每个位点分层分析比较不同性别、年龄、吸烟、饮酒状况亚层之间基因型与疾病的关联。结果 病例组与对照组的吸烟、饮酒状态以及年吸烟包数(Pack-years)构成存在统计学差异(P＜0.05)。所选位点基因型频率符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P＞0.05)。将带有风险等位基因的基因型组合后进行分析,显示出针对两个基因来说,带有两个风险基因型的个体比带有0~1个风险基因型的个体患病风险增加了69.6%,调整了协变量影响后带有3个风险基因型的个体比带有0~1个风险基因型的个体患病风险增加了27.6%,带有大于1个风险基因型的个体比带有0~1个风险基因型的个体患病风险增加了35%。两个基因组合之后的分层分析中,年龄≤60岁、男性、从不吸烟、年吸烟包数≤25、胃非贲门腺癌的亚层中风险基因型与疾病有统计学关联,即具有更显著的危险性。结论 本研究所选取的四个位点的SNP均与胃癌风险无关。但通过多因素分析Caspase3、Caspase7的四个位点,带有2个风险基因型比带有0~1个风险基因型的个体患病风险增加。此外,通过分层分析Caspase7的两个位点,其在年龄≤60岁,从不吸烟,年吸烟包数≤25包和非胃贲门腺癌人群中患病风险更为明显。     

XRCC1基因多态性与卵巢癌对铂类药物化疗敏感性的相关性研究

目的 探讨X线修复交叉互补基因1（XRCC1）Arg194Trp和Arg399Gln位点多态性与卵巢癌对铂类药物化疗敏感性之间的关系。方法 选取82例首次术后以铂类为基础化疗达6个周期的卵巢癌患者,采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析（PCR RFLP）检测外周血XRCC1 Arg194Trp和Arg399Gln位点的基因型,分别比较两个位点的不同基因型与化疗敏感性及两个位点之间的关系。结果 XRCC1 Arg194Trp存在3个基因型,即Arg／Arg、Arg／Trp、Trp／Trp,基因分布频率分别为47.6％、43.9％、8.5％;XRCC1 Arg399Gln亦存在3个基因型,即Arg／Arg、Arg／Gln、Gln／Gln,基因分布频率分别为25.6％、40.2％、34.1％。XRCC1 Arg399Gln 的不同基因型在FIGO分期和年龄分组中的差异均有统计学意义（P＜0.05）。化疗敏感组与不敏感组两个位点多态性基因型之间的差异均有统计学意义（P＜0.05）。XRCC1 Arg194Trp的Trp／Trp和Arg 399Gln的Gln/Gln基因型比Arg／Arg基因型更易对铂类药物产生耐药性,比值比分别增加至13.50倍（95％CI：1.461～124.739）和7.65倍（95％CI：2.012～29.088）。同时携带Arg194Trp Arg／Trp和Arg399Gln Gln／Gln基因型的患者对化疗不敏感率高达84.62％（OR=22.00,95％CI：2.534～190.998;P＜0.05）。结论 XRCC1 Arg194Trp和Arg399Gln位点基因多态性与卵巢癌对铂类药物的化疗敏感性相关,并且两位点之间存在联合效应。     

XPD基因单核苷酸多态性与乳腺癌易感性Meta分析

目的既往关于核苷酸剪切修复通路中,着色性干皮病基因D(xeroderma pigmentosum group D,XPD)基因单核苷酸多态性Lys751Gln和Arg156Arg与乳腺癌易感性关系研究的结论存在争议。本研究采用Meta分析方法定量评价Lys751Gln和Arg156Arg与乳腺癌易感性关系。方法全面检索CNKI、万方、Pubmed、Cochrane Library和EMBASE数据库中关于Lys751Gln、Arg156Arg与乳腺癌易感性关系的文献,Rev Man 5.0和StataSE 12.0软件进行Meta分析,合并OR值及95%CI绘制森林图。逐一剔除每项研究进行敏感性分析,漏斗图法和Begger’s检验判断发表偏倚,假阳性结果报告率(false positive report probability,FPRP)评价假阳性错误概率。结果共纳入37篇文献,包括17 692例乳腺癌患者和18 325例对照。Lys751Gln位点CC基因型相对于AA基因型是乳腺癌发生的危险因素,OR=1.27,95%CI为1.07~1.50,P=0.01,FPRP值为0.043;显性模型OR=1.13,95%CI为1.02~1.24,P=0.02,FPRP值为0.082;隐性模型OR=1.24,95%CI为1.05~1.46,P=0.01,FPRP值为0.082。亚组分析结果中发现,仅在非亚洲人群中该关联差异有统计学意义,AC相对于AA,OR=1.07,95%CI为1.01~1.13,P=0.01;CC相对于AA,OR=1.30,95%CI为1.08~1.57,P=0.01;显性模型OR=1.17,95%CI为1.04~1.31,P=0.01;隐性模型OR=1.26,95%CI为1.05~1.52,P=0.01。未得到Arg156Arg位点与乳腺癌发生有意义的结果,P>0.05。结论 XPD基因Lys751Gln位点与乳腺癌的发生存在一定的关联,尚未发现Arg156Arg位点与乳腺癌的发病有关。     

PTEN基因单核苷酸多态性与乳腺癌的关系

目的:研究PTEN基因-9C/G单核苷酸多态性与中国汉族女性人群乳腺癌之间的相关性。方法:采用基于人群的病例-对照研究,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法进行基因分型,检测210例中国汉族女性乳腺癌患者和210例健康女性的PTEN基因-9C/G多态性。结果:PTEN基因-9C/G位点(rs11202592)多态性基因型分布频率在两组间比较无显著性差异(P=0.862)。PTEN基因-9C/G单核甘酸多态性不同基因型间在ER、Her-2表达上无显著性差异(P>0.05)。结论:PTEN基因-9C/G位点多态性与中国汉族女性乳腺癌易感性无明显关联,ER、HER-2表达同此位点多态性也无明显关联。     

Single nucleotide polymorphisms in breast cancer susceptibility gene 1 are associated with susceptibility to lung cancer

BRCA1 is a tumor suppressor that has been found to be involved DNA synthesis during cell replication. In a recent study, the single nucleotide polymorphism (SNP), rs799917, in BRCA1 was found to be associated with the development and progression of various types of tumor. In the present study, the association between rs799917 and susceptibility to lung cancer was evaluated in a Han Chinese population in the Liaoning Province of China. The BRCA1 rs799917 genotypes (C/C, C/T and T/T) were analyzed using TaqMan quantitative PCR in 682 patients with lung cancer and 694 healthy controls, and the results were analyzed using a Student''s t-test, a χ² test and logistic regression analysis. Individuals carrying the C/T or T/T genotype had a lower risk of lung cancer compared with those carrying the C/C genotype [odds ratio (OR), 0.741; P=0.021; and OR, 0.610; P=0.011, respectively). The C/T + T/T genotype group had an even lower risk (OR, 0.709; P=0.005) compared with that in the C/C genotype group. In the stratified analyses of non-smokers, individuals with the C/T or T/T genotype had a lower risk of developing lung cancer compared with that in those carrying the C/C genotype (OR, 0.681; P=0.013; and OR, 0.569; P=0.021, respectively). The stratified analyses of the BRCA1 rs799917 polymorphism based on pathological type, chemotherapy and radiotherapy, showed that in the squamous cell carcinoma, non-chemotherapy and non-radiotherapy subgroups, individuals with the T/T genotype had a lower risk of lung cancer compared with that in those carrying the C/C genotype (OR, 0.454; P=0.007; OR, 0.485; P=0.002; and OR, 0.599; P=0.020, respectively). In conclusion, the T allele of the rs799917 SNP in BRCA1 was associated with a lower risk of lung cancer in the ethnic Han Chinese population in Liaoning Province and may represent a protective factor against lung cancer.     

Meta-Analysis of the Association between the rs8034191 Polymorphism in AGPHD1 and Lung Cancer Risk

Background: Possible associations between the single nucleotide polymorphism (SNP) rs8034191 in theaminoglycosidephosphotransferase domain containing 1 (AGPHD1) gene and lung cancer risk have been studiedby many researchers but the results have been contradictory. Materials and Methods: A computerized searchfor publications on rs8034191 and lung cancer risk was performed. Odds ratios (ORs) with 95% confidenceintervals (CIs) were calculated to assess the association between rs8034191 and lung cancer risk with 13 selectedcase-control studies. Sensitivity analysis, test of heterogeneity, cumulative meta-analysis, and assessment ofbias were also performed. Results: A significant association between rs8034191 and lung cancer susceptibilitywas found using the dominant genetic model (OR=1.344, 95% CI: 1.285-1.406), the additive genetic model(OR=1.613, 95% CI: 1.503-1.730), and the recessive genetic model (OR=1.408, 95% CI: 1.319-1.503). Moreover,an increased lung cancer risk was found with all genetic models after stratification of ethnicity. Conclusions: Theassociation between rs8034191 and lung cancer risk was significant using multiple genetic models, suggestingthat rs8034191 is a risk factor for lung cancer. Further functional studies of this polymorphism and lung cancerrisk are warranted.     

2q35 rs13387042和8q24 rs13281615单核苷酸多态性与中国东北汉族绝经前妇女乳腺癌风险关系

背景与目的：乳腺癌作为中国女性最常见的恶性肿瘤,每年的新发数量和死亡数量分别占全世界的12.2%和9.6%,但与中国乳腺癌患者明显相关的基因多态位点至今尚不清楚。本研究旨在探讨2q35 rs13387042和8q24 rs13281615单核苷酸多态性与中国北方汉族绝经前妇女乳腺癌风险关系,为预防和治疗乳腺癌提供循证依据。方法：采用多重单碱基延伸单核苷酸多态性分型技术(SNaPshot)分析方法,检测了280例绝经前乳腺癌患者和287例绝经前正常对照者2q35 rs13387042和8q24 rs13281615多态性位点基因型,并比较不同基因型和等位基因与乳腺癌风险的关系。结果：2q35 rs13387042多态性位点基因型频率在乳腺癌和对照样本之间差异有统计学意义(P=0.017);8q24 rs13281615多态性位点基因型频率在乳腺癌和对照样本之间差异无统计学意义(P=0.967)。Logistic回归分析结果显示,对于2q35 rs13387042位点,与GG相比,GA和GA+AA基因型携带者显著增加乳腺癌的患病风险(OR=1.793,95%CI：1.177～2.733,P=0.007;OR=1.691,95%CI：1.122～2.550,P=0.012),而AA携带者与乳腺癌的患病风险无关(OR=0.572,95%CI：0.104～3.153,P=0.521);与G等位基因相比,A等位基因显著增加乳腺癌的患病风险(OR=1.505,95%CI：1.033～2.193,P=0.033)。对于8q24rs13281615位点,与AA相比,AG、GG和AG+GG基因型携带者与乳腺癌的患病风险无关(OR=0.992,95%CI：0.660～1.490,P=0.968;OR=1.047,95%CI：0.642～1.708,P=0.853;OR=1.007,95%CI：0.682～1.487,P=0.971);与A等位基因相比,G等位基因不增加乳腺癌患病风险(OR=1.021,95%CI：0.809～1.288,P=0.863)。结论：本实验证实2q35 rs13387042多态性位点能够增加中国北方汉族绝经前妇女乳腺癌易感风险,而8q24 rs13281615多态性位点与中国北方汉族绝经前妇女乳腺癌易感性无明显相关性。     

单核苷酸多态性与肺癌放射性食管炎相关性的研究

目的 探索肺癌放疗中单核苷酸多态性与放射性食管炎的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)方法分析了DNA损伤修复通路、凋亡通路和炎症因子相关的加个基因37个单核苷酸多态性位点的基因型,观察放疗中和放疗结束后3个月内发生的≥2级放射性食管炎与其相关性.170例病理证实的不可手术的肺癌患者(非小细胞肺癌127例,小细胞肺癌43例)接受了45～70 Gy(平均60 Gy)的放疗,其中三维适形放疗132例,常规放疗38例;单纯放疗41例,放化疗129例(序贯放化疗78例,同步放化疗51例).结果 170例中发生≥2放射性食管炎40例,其中2级36例,3级4例.单因素分析结果显示放疗技术、同步放化疗与放射性食管炎的发生有关(P=0.032、0.049),多因素分析结果接近统计学水平(P=0.072、0.094).相关性分析显示TGF-β1-509T和XPD 751Lys/Lys基因型为放射性食管炎的风险基因型(χ2=5.65,P=0.017,χ2=3.84 P=0.048).结论 TGF-β1-509C/T和XPD Lys751Gln多态性与肺癌放射性食管炎的发生有显著相关性.