Gaussian计算结果到HyperChem数据文件的转换程序

分析了量子化学软件包Gaussian和HyperChem程序计算结果的数据结构，利用C语言编制了一个数据转换程序，从而可以利用HyperChem软件的强大图形显示功能实现Gaussian计算结果的图形显示。     

使用MATLAB绘制原子轨道和电子云图形

绘制原子轨道和电子云图形是量子化学、结构化学研究和教学的重要内容。以氢原子为例，以MATLAB为程序开发语言，设计了一种精确、快速、简便地绘制原子轨道和电子云图形的应用程序。介绍了该程序设计的过程，给出了源程序和运行结果示例，并讨论了MATLAB的三维球坐标图形、四维图形的绘制技术。研究结果表明MATLAB是解决结构化学数值计算和数据可视化问题的一种非常有效的工具。     

通有数字化仪管理软件GDMS的设计与实现

在图形系统中，图形的数字化输入是很重要的功能。ＧＤＭＳ系统以专业图形元件库、命令库、属性库和语音库为基础，实现了系统组成对用户的开放性，提高了图－数转化效率和准确率。该系统具有通用性，可以作为任何图形系统的图形数字化输入子系统。     

支持方案设计的手绘图形输入工具

手绘图形输入是表达设计意图，实现抽象概念与具体图形间相互转换的自然而有效手段之一、提出并初步实现了一个面向方案设计、采用在线图形识别方法和相似性相关反馈技术的手绘图形输人工具．在线图形识别方法将用户输入的笔画经过图形预处理、特征识别、图形拟合和规整等过程，即时地识别和预测用户的基本图形构造意图；相似性相关反馈技术则在基本图形按其空间和时间关系组合后，利用图形构成及其空间关系与图形模板的相似性计算，及时地捕捉和反馈用户输入图形的组成意图．实验表明：该工具具有很好的基本图形识别效果和良好的用户交互特性，为方案设计工具的研究提供了新的思路．     

基于笔画划分的手绘交通事故现场图识别

将手绘草图识别技术融于交通事故现场图形的识别中，提高了事故现场图的绘制效率。针对现场图形的基本特征，引入直线、折线、圆扣圆弧四种基本图素，将用户输入的具体图形划分为多笔画的组合，经过图形特征识别、图形拟合扣规整过程，实时地识别扣预测用户的基本图形构造意图。基本笔画按其空间关系组合后，利用图形构成与图形模板作相似性计算，及时捕捉扣反馈用户输入图形的组成意图，达到理想的现场图形识别效果。     

数字化仪图形输入编程

本文介绍了工作站环境下如何利用数字化仪进行图形输入，以及输入图形的屏幕显示和绘图仪输出。作者给出了自己的实现方法和思想。     

工程图形的一种自动跟踪算法

工程图形的一种自动跟踪算法方卫宁，梁锡昌重庆大学机械传动实验室（６３００４４）工程图形输入一直是计算机图形学及ＣＡＤ技术中急待解决的难题之一，近几年来相继问世的各种扫描仪为图形的快速输入开辟了新的途径。然而，通过扫描仪获得的图形信息都是二值点阵信息。...     

PC Linux集群系统量子化学从头计算性能研究

个人计算机性能的提高与Linux操作系统的发展使基于PC的Linux集群系统成为量子化学高性能计算的平台。本文研究了Gaussian 98程序在PentiumⅢ与Pentium 4计算机建立的两组小型集群系统中的运算性能。通过设计的5个计算样例，对Hartree-Fork、DFT、MP2级别的单点能量计算、几何结构优化、频率和NMR等化学性质计算在16个并行节点内的速度增长性与扩展性进行了分析和讨论，指出了主节点计算能力对整个集群系统效益的影响，结果表明各类计算作业在8-12节点内有着较好加速性，频率与MP2作业超过12节点后并行效益迅速下降，NMR计算在16节点时仍有较高速度增长性。     

PC Cluster的建立和技术探讨

以RedHat6.2为操作系统建立基于DQS（Distributed Queueing System，分布式队列管理系统）的计算集群系统（PC Cluster)。该系统提供Gaussian98、GAMESS2000、Xiamen99给用户进行的量子化学计算，用户根据作业的大小选择所要使用的CPU的个数，如单CPU计算、双CPU并行计算、四CPU并行计算（由2台服务器来完成）。本文主要对构建过程中出现的有关技术和解决方法进行深入的探讨。整个PC Cluster有良好的性价比，且安全可靠、运算速度快，它有望发展成为一个重要的科学计算系统。     

面向瘦客户机的嵌入式操作系统的研究

介绍了瘦客户计算的概念，在研究了瘦客户机操作系统要考虑的问题的基础上，分析了Linux作为瘦客户机操作系统的可行性，并对操作系统的内核、函数库、图形用户接口、中文显示和输入等方面进行了详细的分析，提出了相应的解决方法。     

个人计算机和工作站上计算化学软件性能的综合测评

选择Gaussian 98大型计算化学软件包,设计了两组具有代表性的测试算例,在多种个人计算机和工作站硬件、系统软件平台上进行计算性能的综合测试、分析和评价。指出目前高端PC机采用Linux操作系统时性能完全可匹敌最快的工作站,为计算化学研究者选择和构架高性能、价格比的计算机系统提供参考。     

苯的计算化学红外光谱表征及其与实验结果对比

本研究用GaussView软件模拟苯的分子结构,用量化计算软件Gaussian 03W的密度泛函法,在B3LYP/6-31G基组水平上,优化苯分子结构、计算能量和频率,及其红外光谱,并与实验结果对比。根据成键轨道(natural bond orbital,NBO)和电子密度计算结果,探讨苯的稳定性,分子轨道能量,原子静电荷分布规律和前沿分子轨道组成的特征,计算得出HOMO和LUMO的能量差是0.25191 eV,HOMO是比较大的负值(-0.24819 eV),说明苯有较好的稳定性,看来采用纳米TiO_2光催化方法降解苯是可行的。     

Quantum correlations in Gaussian states via Gaussian channels: steering,entanglement, and discord

Here we study the quantum steering, quantum entanglement, and quantum discord for Gaussian Einstein–Podolsky–Rosen states via Gaussian channels. And the sudden death phenomena for Gaussian steering and Gaussian entanglement are theoretically observed. We find that some Gaussian states have only one-way steering, which confirms the asymmetry of quantum steering. Also we investigate that the entangled Gaussian states without Gaussian steering and correlated Gaussian states own no Gaussian entanglement. Meanwhile, our results support the assumption that quantum entanglement is intermediate between quantum discord and quantum steering. Furthermore, we give experimental recipes for preparing quantum states with desired types of quantum correlations.     

3,4-次甲二氧桂皮酰胺化合物定量构效关系的量子化学研究

采用Gaussian98程序量子化学从头算法对9种3，4-次甲二氧桂皮酰胺化合物进行了量子化计算。并对计算得到的轨道能量、轨道组成、电荷密度、净电荷等性质进行了分析，将它们与实验得到的生物活性参数做了相关曲线，并对某些参量进行了线性回归，得到了回归方程。计算结果表明3，4-次甲二氧桂皮酰胺化合物的抗惊生物活性与分子的近前沿分子轨道LUMO( 3)能级和轨道组成存在一定的相关性。我们预测这类药物分子在与受体作用时，可能与受体之间发生电子转移，形成电子转移配合物，从而发挥药效。羰基和烯键部位应为此类化合物的活性部位。     

基于Rocks的高性能集群平台搭建与应用

高性能计算是实现大规模并行计算的有效途径,本文论述了如何构建一个高性能集群,介绍了集群安装工具--Rocks,分析Rocks安装机制、特点以及Rocks如何管理集群,利用Rocks搭建了一个基于Linux的高性能集群平台,并在该平台上实现了量子化学软件Gaussian的应用,进一步测试了Rocks系统的性能。     

GaussDal: An open source database management system for quantum chemical computations

An open source software system called GaussDal for management of results from quantum chemical computations is presented. Chemical data contained in output files from different quantum chemical programs are automatically extracted and incorporated into a relational database (PostgreSQL). The Structural Query Language (SQL) is used to extract combinations of chemical properties (e.g., molecules, orbitals, thermo-chemical properties, basis sets etc.) into data tables for further data analysis, processing and visualization. This type of data management is particularly suited for projects involving a large number of molecules. In the current version of GaussDal, parsers for Gaussian and Dalton output files are supported, however future versions may also include parsers for other quantum chemical programs.For visualization and analysis of generated data tables from GaussDal we have used the locally developed open source software SciCraft.

Program summary

Title of program: GaussDalCatalogue identifier: ADVTProgram summary URL:http://cpc.cs.qub.ac.uk/summaries/ADVTProgram obtainable from: CPC Program Library, Queen's University of Belfast, N. IrelandComputers: AnyOperating system under which the system has been tested: LinuxProgramming language used: PythonMemory required to execute with typical data: 256 MBNo. of bits in word: 32 or 64No. of processors used: 1Has the code been vectorized or parallelized?: NoNo. of lines in distributed program, including test data, etc: 543 531No. of bytes in distribution program, including test data, etc: 7 718 121Distribution format: tar.gzip fileNature of physical problem: Handling of large amounts of data from quantum chemistry computations.Method of solution: Use of SQL based database and quantum chemistry software specific parsers.Restriction on the complexity of the problem: Program is currently limited to Gaussian and Dalton output, but expandable to other formats. Generates subsets of multiple data tables from output files.     

间位吡啶自由基多通道分解反应的反应机理和动力学研究

使用Gaussian98程序包,在B3LYP/6-311 G**基组水平上,我们充分地研究了间位吡啶基自由基分解反应的反应机理。过渡态和产物之间的联系用IRC计算。使用经过ZVPE校正后的相对能量构造出了位能面剖面图。用振动模式分析和电子布居分析研究了所有的反应通道以揭示其反应机理,表明该反应的主要产物为3,-4吡啶炔、HCN和丁二炔。     

苯基脲类衍生物的抑菌活性和量子化学计算

本文利用单片纸蝶法测定了14个苯基脲类化合物抑制金黄葡萄球菌和大肠杆菌的抑制活性；采用量子化学计算方法中的PM3软件进行了量化计算，计算结果与活性测试结果基本相吻合。     

镍(Ⅱ)配合物[Ni(Hpydc)_2]·3(H_2O)的合成结构和量子化学研究

氯化镍与吡啶-2,6-二甲酸(H_2pydc)反应,合成六配位镍配合物[Ni(Hpydc)_2]·3(H_2O),经元素分析、IR和X-射线衍射表征分子结构,该化合物晶体学参数:单斜晶系,空间群P2(1)/n,晶体学数据:a=1.36774(14)nm,b=1.00348(10)nm,c=1.375 87(14)nm,β=115.135 0(10)°,V=1.7096(3)nm~3,Z=4,Dc=1.729 g/cm~3,μ,(MoKα)=1.202 cm~(-1),F(000)=912,R_1=0.0362,wR_2=0.093 3[对I>2σ(I)的衍射]和R_1=0.0510,wR_2=0.1004(对所有的衍射)。共收集9064个数据,其中独立衍射点3018个,可观察衍射[I>2σ(I)]点2293个用于结构精修。配合物的Ni(Ⅱ)原子关于配基原子形成变形八面体。利用量子化学G98W软件,在Lan12dz基组对配合物的稳定性、前沿分子轨道组成及能量进行研究。     

基于AM1量子化学方法的醇胺类缓蚀剂在模拟混凝土孔溶液中对钢筋缓蚀作用研究

用电化学极化曲线的方法评价了几种醇胺化合物在混凝土模拟孔溶液中对钢筋的缓蚀效果,用Gaussian03程序中的AM1方法计算了这几种醇胺化合物的量子化学参数,并采用最小二乘法,分别将它们的前线分子轨道能级、氮氧原子上的净电荷、分子偶极距以及热力学参数与相对缓蚀效率进行拟合.用所拟合的方程预测了这些醇胺的缓蚀效率,预测结果与实验结果基本相符.