RAPD技术及其在鱼类育种上的应用

ＲＡＰＤ技术是以ＰＣＲ为基础的一种分子标记,具有简单快速,ＤＮＡ需要量少等优点。本文主要介绍该技术的产生背景、原理和特点。探讨了ＲＡＰＤ在水产经济动物的标记鉴定,遗传作图,系统发育和进化,亲缘关系、种群划分和群体遗传多样性方面的应用。     

四种淡水鱼的RAPD分析

用RAPD技术分析了四种淡水鱼-鲫鱼、鳊鱼、草鱼及鲢鱼的种间和种内的遗传变异。用30个随机引物进行了RAPD扩增，其中29个引物得到扩增产物，选取其中11个带纹清晰、多态性较丰富的引物的扩增图谱进行遗传距离的计算，并进行聚类分析，同时获得四种淡水鱼各自的特异性标记。     

RAPD技术在水产动物种质资源研究中的应用

对水产动物的种质资源进行鉴定和评价 ,其方法主要是从形态学、经济性状、同工酶、线粒体DNA和核 DNA等几方面分析。对 DNA的研究以前主要测量 DNA的含量和分子量的大小 ,现在已深入到 DNA序列的测定和功能基因的标记等层次。 RAPD技术目前已被广泛应用。　　一、RAPD技术的原理　　随机扩增多态性 DNA(Random AmplifiedPolymorphic DNA,简称 RAPD)技术由 Williams等 (1 990 )首先运用 ,它是建立在聚合酶链反应 (Polyinerase Chain Reaction,PCR )技术基础上的一种检测基因组 DNA多态性、基因组遗传标记的方法。其原理是…     

RAPD技术及其在虾、蟹类研究中的应用

RAPD技术即随机扩增多态DNA (RandomAmplifiedPolymorphicDNA)技术 ,是由美国科学家Williams等〔1〕和Welsh等〔2〕两个研究小组在聚合酶链式反应 (PolyineraseChainReaction ,PCR)技术的基础上发展起来的 ,它是一种用于检测基因组DNA多态性和基因组遗传标记的方法。目前已被广泛应用于系统发育研究、动植物种类鉴定、基因图谱构建、种群的遗传分析、人类基因组研究等领域〔3〕。我国的虾、蟹增养殖已有相当长的历史 ,但虾类的增养殖 ,其品种选育还刚刚起步 ,“野捕家养”的种苗供给系统和近亲交配加剧了虾类的种质退化和优良性状…     

采用RAPD技术筛选马口鱼性别差异相关分子标记

选用SBSA和SBSB两组随机引物（各20条）分别对马口鱼卵巢DNA和精巢DNA进行RAPD扩增,并用1．5％的琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果。结果表明,在40条随机引物中,有11条引物可以扩增出明显的雌雄性别差异条带,条带范围以SBSA5、SBSA6、SBSA9、SBSA16、SBSA19、SBSA20、SBSB2、SBSB3、SBSB9、SBSB16、SBSB17为主。运用RAPD筛选获得马口鱼性别DNA标记将有助于了解其调控雌雄性别发生的差异基因,为进一步的遗传育种提供基础。     

RAPD技术在鱼类研究中的应用

RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA, 随机引物扩增多态DNA)技术是1990年由Williams和Welsh两个研究小组同时发展起来的一项DNA多态检测技术.RAPD技术与其他分子标记技术相比具有独特的优势,在生物种群遗传结构分析、遗传多样性检测、物种亲缘进化关系鉴定、基因连锁图谱的构建和基因定位与分离等得到了广泛应用,在鱼类研究中也有了一定应用,并取得相应成果,主要表现在以下方面.     

RAPD技术及在甲壳动物遗传多样性中的应用

介绍了RAPD技术的特点、原理及在甲壳动物遗传多样性研究中的优点,并综述了近几年RAPD技术在甲壳动物遗传多样性研究中的进展。     

RAPD技术在鲍育种中遗传关系分析与应用

本研究通过对盘鲍、皱纹盘鲍、两者的杂交子一代（F1）及本地多年养殖的杂交鲍的DNA进行RAPD分析,探讨鲍种质演变遗传学现象。结果表明杂种子一代与两亲本的遗传差异并不对等,更偏向皱纹盘鲍：本地鲍的多态位比例最低,表明本地杂交鲍在遗传上发生了种质变化。     

合浦珠母贝3个养殖群体的RAPD分析

利用RAPD标记技术检测了广西省北海市、海南省三亚市、广东省深圳市等 3个地理种群养殖合浦珠母贝(Pinctadamartensii)基因组DNA的多态性 ,并对其遗传结构进行了初步分析。从 4 0个随机引物中筛选出 13个10bp引物 ,它们在 3种群中共扩增出了 14 0条DNA片段 ,3种群共有片段 16条 ,DNA片段数分别为 5 8、91和 71条 ,多态性位点比例分别为 4 1 4 % ,6 5 0 %和 5 8 4 %。遗传距离分析表明 ,广西种群与广东种群的亲缘关系较近 ,而与海南种群亲缘关系较远。 13个引物中 ,引物S11和S3 58扩增出的 3种群指纹图谱差异显著 ,可作为 3种群鉴定的分子标记。     

RAPD技术及其应用的现状

RAPD技术以其快速、简便、高效等优点,已广泛应用于多个学科和领域。本文综述了这一技术在物种鉴定、动植物分类、群体遗传学、基因定位、人类疾病研究及法医学等各方的应用,并肯定了此技术的应用前景。     

分子遗传标记及其技术在水产生物中的研究与应用

本总结了现代生物学所发展出来的各类分子标记，并对分子标记技术在水生生物中的研究和应用进行了一简单综述。     

利用中国明对虾单对杂交亲本及其F↓（2）群体构建RAPD遗传连锁图谱

由中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)单对杂交亲本(G♀和G♂)及其F2为作图群体,构建了中国明对虾RAPD分子标记的遗传连锁图谱。109个引物共产生284个符合孟德尔分离规律的位点,符合1∶1孟德尔分离类型的位点共234个,符合3∶1孟德尔分离类型的位点50个。利用拟测交理论分别构建中国明对虾雌虾、雄虾的遗传连锁图谱。107个1∶1分离标记分布于雌虾连锁图谱中,包括31个连锁群,图谱总长度为1 406.1 cM,所有标记间的平均间隔为18.5 cM;91个1∶1分离标记分布于雄虾连锁图谱中,包括26个连锁群,图谱总长度为1 187.7 cM,所有标记间的平均间隔为18.27 cM;利用F2自交模型构建了雌虾和雄虾共同的分子标记,35个3∶1分离标记分布于雌雄共有的连锁图谱中,包括10个连锁群,图谱总长度为432.9 cM,所有标记间的平均间隔为17.3 cM。     

RAPD技术在水产动物中的研究和应用

RAPD技术是在PCR基础之上发展而来的一种DNA多态性检测方法,具有方便、快捷、经济等特点。概述了RAPD的反应原理及特点,总结了RAPD在水产动物群体遗传结构分析、亲缘关系分析和基因图谱构建等方面的作用,并肯定了RAPD技术在水产动物中的应用前景。     

分子遗传标记在我国鲫鱼遗传研究中的应用

我国的鲫属(Carassius)隶属鲤科(Cyprinidae),鲤亚科(Cyprininae)。我国有两个种和一个亚种,普通鲫鱼(C.auratus),除西藏外各地均有分布,黑鲫(C.caraussius),仅分布在新疆额尔齐斯河流域,银鲫(C.auratusgibelio)亚种,分布于黑龙江流域犤1犦。鲫鱼在我国各地分布很广且有许多变异的地方品种如湖南的红鲫、江西的彭泽鲫、云南的高背鲫等。改革开放以来,我国鱼类科学工作者又引种驯化,选育和改良了一些经济性状好的品种如白鲫、湘鲫、湘云鲫、异育银鲫等,这使我国鲫鱼品种资源尤为丰富。20世纪80年代初遗传学家Botstein等发现了第一个DNA分…     

应用RAPD标记对东方(鱼屯)属进行种类鉴别及其聚类分析

利用RAPD技术对红鳍东方、假睛东方、暗纹东方和从日本引进的红鳍东方4个种进行了遗传标记鉴别研究.在事先优化的条件下,20个随机引物共扩增出134条谱带清晰、重复性高的DNA片段,其中多态性片段77条.结果证实每一种均有其特异性扩增图谱,可作为种鉴定的依据;用UPGMA和NJ等方法进行聚类,构建的系统树与借助形态学和生化特征进行的传统分类结果一致.研究表明,RAPD作为一种新的分子标记,在海洋动物遗传鉴定方面具有巨大的潜力.     

变性梯度凝胶电泳（DGGE）是一种遗传指纹图谱技术

变性梯度凝胶电泳（Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE）作为一种遗传指纹图谱技术,在微生物生态学中受到普遍关注。     

遗传连锁图谱及其在鱼类遗传育种中的应用

基因组图谱的构建 ,是遗传学研究的一个重要领域 ,它是对基因组进行系统性研究的基础 ,也是动植物遗传育种和人类遗传病诊断的依据 ,它将使标记辅助选择技术的应用成为现实 ,从而可能从根本上改变传统的育种方法 ,进一步改良畜禽品种和大幅度提高畜禽生产效率。因此 ,从 1 91 3年 ,ＡＨＳｔｕｒｔｅｖａｎｔ在果蝇的性染色体上确定了 6个性连锁位点 ,构建了第 1张连锁图至今 ,科学家已经在人类及动植物的基因图谱构建方面做了大量的工作。近年来 ,许多国家投入大量的人力、物力 ,对陆生农业经济作物及牛、猪、鸡等畜禽进行了遗传图谱的构建…     

DNA指纹技术及其在水产上的应用

ＤＮＡ指纹技术及其在水产上的应用ＤＮＡＦＩＮＧＥＲＰＲＩＮＴＩＮＧＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹＡＮＤＩＴＳＡＰＰＬＩＣＡＴＩＯＮＩＮＦＩＳＨＥＲＩＥＳ张跃朱新平罗建仁夏仕玲中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州５１０３８０）ＺｈａｎｇＹｕｅＺｈｕＸｉｎｐｉｎ...     

军曹鱼全基因组微卫星特征分析与多态性标记的筛选及应用

为更好地开发军曹鱼(Rachycentron canadum)高多态性微卫星分子标记,本研究基于军曹鱼全基因组测序结果,利用MISA1.0软件对其简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)的位点信息进行检索及分析。结果显示,基因组中共筛选出1~6个核苷酸为重复单元的SSR位点344 820个,其中,以单核苷酸重复序列最多(174 146个),占SSR总数的50.50%;其次为二核苷酸重复和三核苷酸重复序列,分别占SSR总数的30.23%和14.02%。在SSR包含的重复单元中,单核苷酸重复以A/T类型为主,AC/GT是二核苷酸的优势重复单元类型。军曹鱼基因组SSR核心序列重复次数在4~275次范围内波动,单核苷酸SSR重复数为10的最多,二核苷酸SSR重复次数为6的最多。本研究设置长度≥12 bp为筛选高多态性SSR位点的标准,共获得361 684个位点。在上述位点中随机选取100个候选位点进行基因分型检测,利用从中筛选到多态性较高的10个SSR标记分别对北海、陵水、硇洲、徐闻和三亚5个养殖群体进行遗传多样性分析,145尾个体中共检测到69个等位基因,观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)平均值分别为0.628、0.706和0.653。相关研究表明,军曹鱼基因组中SSR位点类型较为丰富、多态性潜能较高,从中筛选获得的多态性SSR标记可为军曹鱼分子标记辅助育种、群体遗传多样性评价等研究提供有力支持。