长沙市食品从业人员致泻大肠埃希菌实时荧光多重PCR检测结果分析

目的了解长沙市食品从业人员致泻大肠埃希菌感染、分布及毒力基因携带情况。方法抽取长沙市9个单位258例食品从业人员为研究对象,采用实时荧光多重聚合酶链反应(PCR)检测致泻大肠埃希菌。结果致泻大肠埃希菌感染率为15.5%(40/258),其中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)占10.9%(28/258),肠致病性大肠埃希菌(EPEC)占3.1%(8/258),肠出血性大肠埃希菌(EHEC)占1.6%(4/258),未检出肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)和肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)。28株EAEC携带uidA基因26株,aggR+pic基因13株,astA基因27株,携带率分别为92.9%、46.4%、96.4%;8株EPEC全部携带eae和uidA基因;4株EHEC中3株携带eae基因,且都携带stx1+stx2基因。结论建立持续监测致泻大肠埃希菌的机制和深入研究其分子流行病学理论,除了为监管部门制订和评价公共卫生措施提供基础数据,对评价食品安全状况,有效控制传染源、保护人民群众健康具有重要意义。     

安徽省马鞍山市2014-2018年腹泻患者中致泻性大肠埃希菌病原学及流行特征分析

目的了解安徽省马鞍山市腹泻患者中致泻性大肠埃希菌（DEC）的感染情况、毒力基因、耐药性以及分子分型,为DEC的防治提供依据。方法2014 — 2018年,对马鞍山市三家哨点医院门诊急性腹泻患者粪便标本进行DEC的分离、鉴定与毒力基因检测,并对阳性菌株进行药敏试验及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型。结果1 711份腹泻粪便标本中有120份检出阳性,共分离得到123株DEC,标本检出阳性率为7.01%。 DEC阳性病例年龄分布以0～5岁的婴幼儿及20～39岁青壮年为主;病例集中在夏季（6 — 8月）。 DEC分型中以肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）和肠致病性大肠埃希菌（EPEC）为主,分别占58.54%和31.71%。 123株DEC菌株的药敏试验结果显示,超广谱β-内酰胺酶（ESBL）阳性菌株耐药严重,所有菌株耐≥6种药物。 PFGE分子分型产生119种带型,带型相对分散,相似度为49.7%～97.7%。结论2014 — 2018年马鞍山市腹泻患者DEC的感染类型以ETEC和EPEC为主,存在年龄及季节分布特征,本地分离DEC菌株的耐药程度较为严重,PFGE带型分散,应控制抗生素的滥用,重点关注ETEC或EPEC的流行风险。     

联合分子检测法对腹泻患者粪便中致泻性大肠埃希菌的调查

  目的  采用胃肠道感染测试条（FA GI）联合实时聚合酶链式反应（PCR）直接检测法,回顾性调查山东省青岛市腹泻患者致泻性大肠埃希菌（DEC）的感染情况及菌株基因型,并与传统方法进行比较,探讨不同检测方法在腹泻监测中的应用。  方法  对2018年青岛市2家哨点医院采集的263份腹泻粪便标本,采用传统培养法分离大肠埃希菌并送至青岛市疾病预防控制中心,利用多重PCR方法鉴定DEC;同时采用FA GI联合实时PCR的方法直接检测粪便中的DEC。 将每5份粪便样标本混合为1份混合样品,用FA GI进行检测,再用实时PCR方法检测阳性混合样品中的单个样品。  结果  263份标本中,采用传统分离培养联合多重PCR法检测,15份样品阳性,阳性率为5.7%。 其中,肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）、肠集聚性大肠埃希菌（EAEC）、肠侵袭性大肠埃希菌（EIEC）阳性的标本分别为7、4、3、1份。 采用FA GI联合实时PCR直接检测法检测,阳性样品35 份,阳性率为13.3%。 其中ETEC、EAEC、EPEC、EIEC阳性的标本分别为12、12、9、2份。 2种方法均未检到产志贺毒素大肠埃希菌（STEC）阳性的标本。 2种方法毒力基因检测结果一致。 EAEC、ETEC、EPEC携带的主要毒力基因分别为pic、estIb和eae。  结论  FA GI联合实时PCR直接检测法显著提高了粪便中DEC的检出率,敏感性和特异性高,省时省力,可以辅助DEC常规监测,准确地反映DEC的流行和分布情况,为DEC的防控提供有力的实验室依据。     

儿童肠道感染中致泻性大肠埃希菌的检测

目的了解儿童肠道感染中致泻性大肠埃希菌的感染情况。方法对95份腹泻患儿粪标本中分离出的大肠埃希菌,用荧光聚合酶链反应（PCR）的方法检测毒力基因,鉴定致泻性大肠埃希菌。结果检测出15株阳性菌株,阳性率为15．8％,其中肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）6株、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）4株、弥散聚集性大肠埃希菌（DAEC）4株和肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）1株。结论致泻性大肠埃希菌是引起儿童腹泻的主要致病菌,临床实验室应加强对致泻性大肠埃希菌的检测。     

2016年福建省永安及南平监测点五种致泻性大肠埃希菌监测分析

目的 对福建永安及南平两个检测哨点2016年的281份腹泻病例进行5种致泻性大肠埃希菌病原检测,为病例的确诊及致泻性大肠埃希菌流行病学的提供实验数据.方法 收集281份其他感染性腹泻病例(排除霍乱、菌痢、伤寒副伤寒)的粪便标本,接种麦康凯平板,选取初步生化符合大肠杆菌的菌落,然后用致泻性大肠埃希菌多重PCR和单重PCR检测方法确定其致病型别.结果 281份腹泻病例粪便标本共检出致泻性大肠埃希菌17株,检出率6.05%,其中aEPEC 4株,ETEC 6株,EAEC 7株,其他型别未检出.结论 福建地区致泻性大肠埃希菌致病型别以aEPEC,ETEC,EAEC为主,多重PCR检测方法能有效的对致泻性大肠埃希菌病进行确诊及了解菌株的毒力基因携带情况,并为我省的致泻性大肠埃希菌的流行病学资料的积累及疾病防控提供快速客观的依据.     

2015~2019年北京市海淀区食源性腹泻患者致泻大肠埃希氏菌型别分布和耐药性分析

目的　分析北京市海淀区食源性腹泻患者致泻大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)的感染状况、型别分布和耐药情况,为致泻大肠埃希氏菌的防控和临床合理用药提供科学依据。方法　对2015~2019年海淀区食源性疾病监测哨点医院送检的1 810份腹泻患者粪便标本直接划线接种在麦康凯培养基上培养,挑取可疑菌落进行生化鉴定、毒力基因测定,对确认为致泻大肠埃希氏菌的菌株进行药敏检测。结果　1 810份粪便标本中检出致泻大肠埃希氏菌214株,检出率为11.8%,各年度的检出率差异有统计学意义（χ2=10.858,P=0.028）。检出的致泻大肠埃希氏菌共有4种型别,其中集聚性大肠埃希氏菌（EAEC）96株（44.9%）,产肠毒素大肠埃希氏菌（ETEC）89株（41.6%）,肠道致病性大肠埃希氏菌（EPEC）24株（11.2%）,肠道侵袭性大肠埃希氏菌（EIEC）5株（2.3%）。在12种抗生素的药敏试验中,70株（32.7%）全部敏感,144株（67.3%）耐药;氨苄西林的耐药率最高（54.7%）,其次是四环素（38.8%）和复方磺胺（36.9%）,对3种及以上抗生素的多重耐药率为46.3%。结论　北京市海淀区2015~2019年致泻大肠埃希氏菌感染以EAEC和ETEC为主,耐药菌株的多重耐药谱广。应加强对抗生素的使用管理,延缓耐药株的产生和传播。     

2014－2017年烟台市腹泻病患者中致泻性大肠埃希菌的检测与病原特征分析

目的 了解烟台市腹泻病患者中致泻性大肠埃希菌（DEC）的感染状况和致病型分布特点，对社区和综合医院中两家哨点医院腹泻门诊的腹泻患者进行DEC监测，为DEC的防治提供依据。 方法 采用全自动毛细管电泳仪对生化反应符合DEC特征的菌落进行聚合酶链式反应确认，根据5种DEC特征基因，确定型别。 结果 在1 174例腹泻病患者的粪便中共检出生化反应鉴定为DEC的268株，进行基因确认25株，感染率为2.13%，其中肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）15株，占阳性菌株的60.00%，肠产毒性大肠埃希菌8株、肠致病性大肠埃希菌2株、肠出血性大肠埃希菌和肠侵袭性大肠埃希菌均未检出，毒力基因pic占53.33%，20 ~ 44岁年龄组患者检出率最高（64.00%），6 — 10月检出率为84.00%。 结论 烟台市DEC感染的致病型以EAEC为主，基因型以pic为主，DEC感染年龄主要集中在20 ~ 44岁年龄组，全年均有感染，夏秋季多发，应注意加强季节性防控。      

肠聚集大肠埃希菌在瑞士腹泻和无腹泻儿童中的流行

引起腹泻的大肠埃希菌可分为6种,包括肠聚集大肠埃希菌(enteroadherent escherichia coli,EAEC)、肠出血性大肠埃希菌(EHEC)、肠致病性大肠埃希菌( enterophathogenic esche richia coli,EPEC)、肠产毒性大肠埃希菌(enterotoxin of esche richia coli,ETEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(enteroinvasive esche richia coli,EIEC)和弥散性粘附大肠埃希菌。EAEC作为儿童腹泻源的重要性仍有争论,本文采用 PCR方法检测 EAEC的质粒 pCVD432,从而判定EAEC在瑞士腹泻儿童中的重要性。1.资料与方法:用标准的培养方法和 PCR方法测定 Zu…     

2013－2019年北京市顺义区腹泻病例分离致泻性大肠埃希菌耐药特征分析

  目的  对2013 — 2019年北京市顺义区2家哨点腹泻病例分离的致泻性大肠埃希菌（DEC）进行耐药特征分析。  方法  收集2013 — 2019年北京市顺义区2家哨点医院腹泻病例粪便标本,进行DEC分离培养、生化鉴定与分型鉴定,抗菌药敏感性试验使用微量肉汤法,耐药特征分析包括耐药率、非敏感率、多重耐药率和耐药谱分析。  结果  腹泻病例DEC检出率为9.53%（232/2434）、肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）占56.47%（131/232）、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）占27.16%（63/232）、肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）占16.38%（38/232）。 DEC多重耐药率为33.19%（77/232）,共有90种耐药谱型;ETEC多重耐药率为17.56%（23/131）,共有36种耐药谱型;EPEC多重耐药率为58.73%（37/63）,共有42种耐药谱型;EAEC多重耐药率为44.74%（17/38）,共有23种耐药谱型。 耐药率≥30%的抗菌药ETEC有萘啶酸（NAL）、氨苄西林（AMP）, EPEC有AMP、四环素（TET）、复方新诺明（SXT）、磺胺异恶唑（Sul）、NAL,EAEC有NAL、AMP、SXT、Sul、TET。 2013 — 2016年与2017 — 2019年两个时间组试验抗菌药差异性比较发现:ETEC对AMP、头孢唑啉（CFZ)、TET、头孢吡肟（FEP）、氨曲南（AZM）、氨苄西林/舒巴坦（AMS）耐药水平上升,对Sul耐药水平下降;EPEC对庆大霉素（GEN）耐药水平下降;EAEC对头孢噻肟（CTX）、GEN、多西环素（DOX）耐药水平下降。  结论  北京市顺义区腹泻病例中,DEC具有较高的流行强度,ETEC、EPEC和EAEC的流行与耐药均具有较为独立的特征,耐药形势依然严峻;值得应引起公共卫生和临床部门的广泛关注。     

吉林省致泻大肠埃希氏菌分子分型与耐药性研究

目的了解吉林省食源性疾病患者中致泻大肠埃希氏菌的毒力基因分布、流行特征、耐药情况、以及PFGE分子分型特征,为致泻大肠埃希氏菌的监测、爆发预警、耐药抗生素规避使用提供依据。方法对2016年从吉林省食源性疾病患者粪便中获得的26株致泻大肠埃希氏菌进行生化鉴定、多重PCR检测毒力基因、MIC微量肉汤稀释法药敏实验以及PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型。结果26株致泻大肠埃希氏菌中13株(50%)为EAEC;7株(26.92%)为EPEC;4株(15.38%)为ETEC;2株(7.69%)为EHEC;对四环素、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑、环丙沙星耐药极为严重,分别高达92.30%、88.46%和84.62%;XbaI酶切后进行PFGE脉冲场凝胶电泳分为23个型别。结论吉林省腹泻患者中致泻大肠埃希氏菌感染类型以EAEC为主,存在混合感染情况;耐药、多重耐药情况较为严重应加强规范抗生素的使用;在DNA水平上呈现出多态性。     

2013-2020年北京市海淀区成年人致泻大肠埃希菌流行特征和分型研究

目的 掌握北京市海淀区成年人致泻大肠埃希菌(DEC)流行特征和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型特点.方法 对2013-2020年在3家哨点医院就诊的1961例成年人腹泻患者粪便或肛拭子标本进行DEC检测,对其中66株DEC菌株进行PFGE分型试验.结果 成年人DEC检出率为9.54％(187/1961),产肠毒素大肠埃希...     

非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株血清型鉴定及主要毒力基因分析

目的 了解中国不同来源非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株血清型及主要毒力基因的流行情况。方法 采用O抗原基因簇特异性聚合酶链反应（PCR）结合全套O抗血清凝聚法确定O血清群,以PCR扩增和测序fliC基因确定H型;采用PCR方法对所有菌株进行stx1、stx2、eae及ehxA基因检测。结果 434株非O157 STEC分离株中,除不可分型菌株外,共检测出82种O血清群和28种H型,其中O20:H30、O2:H32和O2:H45为优势血清型。stx1、stx2和stx1+stx2 3种志贺毒素基因型的检出率分别为25.35%、64.98%和9.68%,而eae和ehxA基因的阳性率分别为3.92%和32.95%。仅15株菌同时携带3种毒力基因,且主要为血清型O26:H11的腹泻患者分离株。结论 我国非O157 STEC分离株血清型复杂多样,同时检测eae和ehxA基因对于发现高致病潜力的菌株具有重要参考价值。     

多重PCR方法鉴定六类致泻性大肠埃希菌和志贺菌

目的 建立一种快速检测和鉴定六类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的多重PCR方法。方法 根据六类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的毒力基因eae、stx1、stx2、elt、estIa、estIb、aggR、ipaH、afaD及16S rRNA基因rrs建立多重PCR反应体系,优化引物浓度、PCR反应条件等,评价该方法的特异性和灵敏度,并用该方法鉴定本实验室保存的174株致泻性大肠埃希菌和24株志贺菌,将结果与单重PCR、本实验室已建立的鉴定五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的多重PCR方法结果进行对比。结果 10对PCR引物均可特异性扩增相应基因片段。该反应体系对174株致泻性大肠埃希菌和24株志贺菌的鉴定结果与单重PCR检测结果一致,本研究的多重PCR检测下限可达4.56 101 CFU/反应(1.14 104 CFU/ml)。结论 本研究采用毒力基因及内参照基因建立的多重PCR方法可在一个反应体系中鉴定和区分致泻性大肠埃希菌和志贺菌,为临床快速检测、疾病预防控制实验室筛查、腹泻的暴发溯源等提供了方便快捷的技术支持。     

Identification of diarrheagenic Escherichia coli by a new multiplex PCR assay and capillary electrophoresis

Diarrheagenic Escherichia coli (DEC) is a set of the most common pathogens causing diarrhea. DEC strains are classified into five pathotypes based on the possession of different virulence genes: enteropathogenic E. coli (EPEC), enterohemorrhagic E. coli (EHEC) or Shiga toxin-producing E. coli (STEC), enteroaggregative E. coli (EAEC), enterotoxigenic E. coli (ETEC), and enteroinvasive E. coli (EIEC). The development of an easy-to-use method to detect the specific virulence genes and distinguish the pathotypes is essential for the diagnosis and surveillance of DEC infections. In this study, a multiplex PCR assay (mPCR) specific to nine virulence genes and an internal control was designed for the identification of five DEC pathotypes. A temperature switch PCR (TSP) strategy was used in the PCR amplification. The PCR products were detected by capillary electrophoresis. The limit of detection (LOD) of the 10-plex reaction was 5 × 10³ copies/reaction for stx2 and 5 × 10² copies/reaction for the other targets. The mPCR showed very high specificity, and inclusivity and exclusivity were both 100%. When the mPCR assay was used for the detection of 221 cryopreserved diarrhea specimens, DEC colonies were detected from 49 specimens, and the positive rate was 22.2%. The mPCR assay was sensitive and specific, and the amplified product could be analyzed easily. Thus, this method could be used effectively to identify the suspected colonies of DEC in the primary culture of the specimen.     

Development of a multiplex polymerase chain reaction assay for diarrheagenic Escherichia coli and Shigella spp. and its evaluation on colonies, culture broths, and stool

Detection of diarrheagenic Escherichia coli (DEC) typically depends on identification of virulence genes from stool cultures, not on stool itself. We developed a multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay that detects key DEC virulence genes (stx1, stx2, eae, bfpA, ipaH, LT, STh, aaiC, aatA). The assay involved a multiplex PCR reaction followed by detection of amplicon(s) using Luminex beads. The assay was evaluated on over 100 colony and broth specimens. We then evaluated the assay using DNA extracted from stool, colony pools, and Gram-negative broths, using stool spiked with known quantities of DEC. Performance of the assay on stool DNA was most quantitative, while stool broth DNA offered the lowest limit of detection. The assay was prospectively evaluated on clinical specimens in Tanzania. Stool DNA yielded higher sensitivity than colony pools compared with broth DNA as the standard. We propose using this assay to screen for DEC directly in stool or stool broths.