虚拟组合化学分子库的程序设计、实现与应用

介绍了一个组合化学基本工具程序：虚拟组合化学分子库生成程序(Virtual Combinatorial Library Enumerator,VCLE)。以Accelrys公司Accord开发包为基础用C／C 语言进行开发,支持微软公司Windows系统上和太阳微系统公司的Solaris操作系统。VCLE通过解析通式反应,以通式反应物为模板把实际反应物裁剪为取代基,再把取代基连接到通式产物对应的取代位置上,从而组合出以通式产物为骨架的大量分子结构。作为药物发现研究的方便工具,VCLE既可以运行于桌面系统也可以运行于服务器上。     

基于UNIX的守护进程程序研制

守护进程是运行在后台的一种特殊进程。它独立于控制终端并且周期性地执行某种任务或等待处理某些发生的事件。守护进程是一种很有用的进程。UNIX的大多数服务器就是用守护进程实现的,比如,Internet服务器INETD、Web服务器HTTPD等。同时,守护进程完成许多系统任务,比如作业规划进程CROND、打印进程IPD等。     

商用POS系统软件设计

概述ＰＯＳ系统的应用技术。介绍商用ＰＯＳ系统的构成、工作原理、软件模块的功能、设计及实现方法，指出该软件具有的特点。     

一种用SMILES码构建虚拟组合化学库的新方法

提出了一种利用SMILES码构建虚拟组合化学库的新方法。该方法用SMILES码代表骨架和侧链,通过对其进行排列组合生成虚拟组合化学库。用户可设定ADME筛选条件对生成的库进行初筛,以舍弃在理论上药代动力学行为不好的分子。该法通过构建一个抗2型糖尿病药物虚拟组合化学库(A2DDVCL)而得到了验证。A2DDVCL建立在过氧化物酶增殖体活化受体(PPAR)配体的基础上,拟从其中发现治疗慢性代谢疾病特别是2型糖尿病的药物。     

一种嵌入式操作系统休眠唤醒后程序自动运行的方法

针对目前采用休眠方式来实现嵌入式系统快速启动后,一些动态进程或进程的执行过程不能正常恢复而导致进程不能按照原来的方式正常运行的情况,运用一种新的方法 ,实现了基于休眠的嵌入式操作系统启动后,自动运行任何形式的目标脚本和应用程序。     

应用系统日志守护程序的设计

日志信息对应用系统的有效管理维护至关重要。本文详细叙述了怎样使用IPC消息队列来编写应用系统的日志守护程序及应用程序产生日志数据的调用接口的方法,并给出了主要的程序代码。     

浅谈人像组合系统的设计

介绍了刑侦人像组合系统主要内容及工作原理。同时,设计了人像组合系统功能模块及相关工作流程。     

基于数据库信息的取代基选择

虚拟组合衍生程序能够快速地根据选定的取代基生成大量的虚拟分子,问题在于选择什么样的取代基,才更有目的地控制衍生分子,使它们与受体的结合有更大的成功保障.通过统计数据库中蛋白质残基及其对应的配体取代基,就可以根据目标受体的残基情况,选择那些统计频率较高的取代基,这样比随机地选择取代基会更有目的性,设计的配体更有可能与蛋白质残基有效地发生作用.因此,这是一种新型的、基于数据库信息的概率式取代基选择方法,简称SSDI.SSDI用统计概率的方式,回答了组合衍生所面l临的选择什么样取代基的问题.     

组合化学及其在药物开发中的应用

介绍了组合化学的基本概念和相关技术。组合化学起源于固相多肽合成,目前在包括药物开发在内的许多领域都得到了成功的应用。采用组合化学技术可以在短时间内迅速制备大量的化合物。介绍了化合物库的合成方法和分析、筛选方法。组合化学技术与高通量筛选技术相结合,在现代药物开发中已经起到了非常重要的作用。     

运用组合化学筛选分子印迹聚合物敏感材料

本文报道了运用组合化学进行分子印迹聚合物敏感材料筛选的研究。对25个聚合物进行了筛选,得到了选择性好的分子印迹聚合物。     

基于组合测试模式的集成虚拟仪器软件测试

针对集成虚拟仪器提出了一个有效的软件测试方法,满足了实际工程的需要.通过建立电子测量工作站的Petri网模型,分析虚拟仪器软件的特点,运用组合测试、分割测试、实时性测试等策略生成并优化测试用例集,对电子测量工作站软件进行测试,不仅提高了测试用例的效率,且降低了测试成本.     

基于Linux守护进程的分析与实现

针对Linux环境下的守护进程daemon，分析了一般性守护进程的编写方法，并提出若干见解．通过总结归纳进而为设计和开发守护进程提供了有意的参考，给出了基于Linux守护进程实现的主要思想。     

Development and commercialization of the MiniBlock synthesizer family: a historical case study

The MiniBlock synthesizer family began as an internal development project meant to meet an immediate technology need within a large pharmaceutical company (BMS). By adopting a rapid iterative design philosophy, the team was able to meet immediate business production needs while simultaneously driving toward a final design that was optimized for the intended application—in this case, parallel synthesis. The burden of maintaining production and support for a proprietary internal technology led BMS to seek a commercial partner (MT). After commercialization, the partners worked together to extend the product line. MT focused on new features to appeal to a wider user base (larger volume formats, temperature control and agitation accessories, and so on), while BMS focused on optimizing a companion reactor for an entirely new application (the XT-Plus).The result of this uncommon collaboration is that the MiniBlock and XT families are now used by almost every one of the top 30 major pharmaceutical companies in the world. Many companies in more than 20 countries have based their compound synthesis workflow around these platforms, confirming the applicability of the reaction blocks beyond the confines of a single pharmaceutical company. The collaboration and the reactor have been acknowledged with several industry awards including the 1999 ALA Achievement Award from the Association for Laboratory Automation and the 2003 Thomas Alva Edison Patent Award from the Research and Development Council of New Jersey. In addition, they have been featured in a number of industry trade publications.^{73, 74, 75, 76 and 77} We believe that this collaboration may be a useful model for future technology innovation and adoption in the laboratory environment.     

Subclasses of solvable problems from classes of combinatorial optimization problems

Well-known subclasses of solvable problems from classes of combinatorial optimization are reviewed. For solvable problems such as the traveling salesman problem, location problem, assignment problem, and clustering problem, the changes in the objective function on a given ordering of combinatorial configurations are analyzed. Translated from Kibernetika i Sistemnyi Analiz, No. 2, pp. 97–105, March–April 2009.     

Multicriteria combinatorial optimization problems on a set of polypermutations

The studies on multicriteria combinatorial optimization are continued. A possible approach to solving multicriterion problems is developed and substantiated. An algorithm is developed and implemented. Some peculiarities of efficient solutions to multicriterion problems are described. __________ Translated from Kibernetika i Sistemnyi Analiz, No. 2, pp. 152–160, March–April 2008.     

一类组合优化问题的混合进化算法

针对问题空间为全排列集合的一类组合优化问题,提出了一种混合进化算法。在自然进位制编码的基础上,算法采用了遗传算法的单点交叉算子和进化规划的高斯扰动算子,并运用了精英保留策略;算法实现时采用逐位运算法实现大数值运算,避免了运算溢出,减少了运算量。分析和模拟计算结果表明,新算法具有可行性、有效性和通用性。     

通用属性注册协议及其在嵌入式Linux中的实现

文章介绍了嵌入式Linux下的通用属性注册协议(GARP)及其各种应用协议在路由器中的实现原理。该设计利用守护进程在用户空间实现GVRP、GMRP等各种GARP的应用协议,并利用内核空间的tty设备使各种应用协议都可以以统一的方式在用户空间进行维护,克服了传统开发方式系统性不强的缺点,并具有维护灵活、扩展方便的特点。本实现已应用于高速宽带路由器的研发项目中。