ERIC-PCR和PCR-DGGE技术分析壳聚糖对抗生素引起肠道菌群失调小鼠的影响

目的应用肠杆菌基因间重复共有序列基因扩增(ERIC-PCR)和聚合酶链式反应——变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析壳聚糖对抗生素致肠道菌群失调小鼠的影响。方法 SPF级昆明小鼠24只,每组8只,依次分为模型组(N)、壳聚糖高(CS-H)和低浓度组(CS-L),盐酸左氧氟沙星灌胃6d后使用相应药物灌胃24d,收集鼠便,提取粪便细菌DNA,利用ERIC-PCR和PCR-DGGE电泳获得肠道菌群指纹图谱,主成分分析(PCA)和聚类分析(UPGMA)研究肠道菌群整体差异,并鉴定优势条带序列。结果 ERIC-PCR表明菌群失调组小鼠肠道中细菌条带减少明显,以300bp左右的条带为特征条带,PCR-DGGE显示屎肠球菌为优势菌型;壳聚糖灌胃小鼠肠道菌群结构组成发生改变,乳酸菌成为优势菌型。结论壳聚糖扶持乳酸菌等益生菌、抑制肠球菌等病原菌的增殖,起到益生元的作用进而调节肠道微生态均衡。     

小鼠肠道菌群失调与调整的实验观察

本文定量检测４０只小鼠新鲜大便中的优势菌群。依次为类杆菌、乳杆菌、大肠杆菌和肠球菌。作者用抗生素抑制小鼠肠道正常菌群,再以鼠伤寒沙门氏菌感染这些小鼠,加重了肠道菌群失调,小鼠失去定值抗力。然后将鼠粪制剂,丽珠肠乐进行分组调整,并以抗生素 伤寒沙门氏菌不治疗作阴性对照组;肉汤＋鼠伤寒沙门氏菌不治疗作对照组,连续观察一周。     

基于ERIC-PCR技术研究酪蛋白糖巨肽对小鼠肠道菌群结构的影响

目的了解酪蛋白糖巨肽(CGMP)对小鼠肠道中微生物群落结构及其动态变化的影响。方法采用ER IC-PCR技术分析鉴定在灌胃小鼠CGMP期间其肠道菌群结构的变化情况。在实验的第0、3、5、7、10、15和21天(灌胃停止后1周)分别提取对照组和CGMP组小鼠粪便总DNA,以此为模板进行PCR反应,获得肠道微生物群落的ER IC-PCR指纹图谱。结果小鼠个体在一段时间内微生物群落演替不明显,群落相似性较高。对照组小鼠肠道菌群多样性指数范围为1.75±0.06,CGMP组多样性指数范围为1.89±0.04,二者之间差异有统计学意义。结论小鼠肠道内的微生物群落非常丰富,普遍存在共有的优势菌群,且优势菌群的群落结构较为稳定;CGMP能够显著增加小鼠肠道菌群的多样性;聚类分析结果显示:对照组小鼠个体在不同时间的肠道菌群结构相似性较高,且ER IC-PCR指纹图谱没有明显的规律;CGMP组小鼠个体的ER IC-PCR指纹图谱被明显地分成2个亚族,说明小鼠灌胃CGMP 3~5 d后,其肠道菌群的群落结构开始发生明显变化。     

肠道菌群失调对小鼠造血因子水平的影响

目的:观察肠道菌群失调后小鼠造血因子水平的变化.方法:采用抗生素脱污染造成小鼠肠道菌群失调的动物模型,用ELISA的方法检测血清白细胞介素-3(IL-3)、粒-巨噬细胞集落刺激因子(GMCSF)的含量.结果:菌群失调后小鼠血清IL-3和GM-CSF的含量均低于对照组(P＜0.01);双歧杆菌数量与IL-3和GM-CSF含量存在显著正相关.结论:肠道菌群失调可影响机体造血功能.     

加替沙星对小鼠肠道菌群的影响

目的 了解加替沙星正常剂量用药和非正常剂量用药方式对小鼠肠道菌群的影响.方法 24只昆明小鼠随机分为3组,每组8只,对照组只灌胃生理盐水,另外2组分别按正常剂量和正常剂量的一半给小鼠灌胃加替沙星溶液,7 d后无菌采取小鼠粪便,观察各组小鼠粪便中双歧杆菌、类杆菌、乳酸杆菌、大肠埃希菌及肠球菌数量.结果 加替沙星灌胃7 d后,与给药前相比,肠杆菌和肠球菌药敏结果无明显变化.灌胃前后肠杆菌对CIP、LEV、GAT、AM、CRO、AMK、NOR均敏感,肠球菌对AM、LEV、VA、GAT均敏感,对NOR、CIP、CRO敏感性不同.2种用药方式可导致大肠埃希菌数量显著减少(P＜0.05),肠球菌数量稍有增加(P＞0.05).而双歧杆菌、乳酸杆菌和类杆菌数量无明显变化(P＞0.05).结论 加替沙星2种用药方式短时期对肠道菌群影响不大(肠杆菌除外),不易产生耐药性.其杀灭肠杆菌的作用远大于对厌氧菌的作用.     

ERIC-PCR指纹图谱技术分析糖尿病小鼠肠道细菌群落变化

目的通过比较1型糖尿病模型组和空白对照组雄性小鼠肠道菌群结构的变化,探索糖尿病造模与肠道菌群的关系。方法收集造模2周后空白对照组(n=5)、STZ造模成功组(n=5)和造模不成功组(n=3)ICR小鼠的新鲜粪便样品,提取粪便样品的总DNA,ERIC-PCR扩增形成DNA指纹图谱,借助多变量统计分析方法研究各组样品肠道菌群结构上的异同。结果ERIC-PCR指纹图谱结合偏最小二乘法(PLS-DA)分析表明造模成功组和造模不成功组小鼠的肠道菌群结构显著区别于空白对照组,而造模不成功组小鼠的肠道菌群结构与造模成功组仍有一定的区别。结论STZ诱导的1型糖尿病会造成小鼠的肠道菌群结构的变化,而部分小鼠造模失败可能与这些小鼠的肠道菌群结构有关。     

基于PCR DGGE的小鼠肠道菌群基因组提取方法的建立

通过比较4种小鼠粪便细菌总DNA提取方法对基于PCR-DGGE检测的肠道菌群多样性分析的影响,旨在建立适于PCR—DGGE的小鼠肠道微生物宏基因组提取的稳定、经济、快捷的方法。采用SDS裂解法、某国产市售粪便DNA提取试剂盒、改进的化学裂解法、改进的溶菌酶法4种方法提取小鼠粪便细菌总DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、细菌16S rRNAV3区PCR扩增结合DGGE对提取结果进行比较分析。SDS裂解法和国产市售试剂盒2种方法提取粪便细菌总DNA均未得到理想结果,另2种方法均能够检测到粪便中20种左右的细菌。改进的化学裂解法和改进的溶菌酶提取法的建立为基于PCR—DGGE进行肠道菌群结构的定量及定性分析提供了可靠的前提基础和实验保障。     

PCR-DGGE技术评价抗生素诱导的肠道菌群失调

目的 利用PCR-DGGE技术结合活菌计数评价抗生素引起的肠道菌群失调.方法 SPF级BALB/c雌性小鼠连续4 d灌胃头孢曲松溶液125 mg/ml,0.4 ml/d,运用基于细菌16S DNA的PCR-DGGE技术结合活菌计数分析小鼠肠道菌群变化.结果 活菌计数结果与PCR-DGGE图谱显示,头孢曲松处理3 d后小鼠肠道菌群出现严重失调.结论 PCR-DGGE技术可直观而灵敏地显示抗生素处理过程中肠道菌群的动态变化,适用于评价抗生素引起的肠道菌群失调.     

菌群检测值的模式识别分析法判断肠道菌群失调的研究

本文对１０名患有腹泻或肠炎的患者和１０名健康者做了肠道五种优势菌群的检测，应用模式识别对两组菌群检测值进行分析。结果，图形上两组清楚地分为两处，有明显的分界线。表明，５种菌群数值在两组间具有明显差异。经评估，可知该方法平均诊断预报能力可达７５％以上。     

全科广谱治疗仪对由抗生素导致小鼠肠道菌群失调的调整作用

用盐酸林可霉素导致小鼠肠道菌群失调,然后用ＱＫ－ ＣＯＩＣ 型全科广谱治疗仪进行照射,并分别于４ｄ和７ｄ 采取照射组与自然恢复组小鼠粪便,对肠杆菌（ＥＭＢ） 、肠球菌（Ｅｃ） 、乳杆菌（Ｌｂｓ） 、双歧杆菌（ＢＳ） 和类杆菌（Ｂｄｂ）进行菌群分析。结果照射组４ｄ 菌群便有所恢复,７ｄ 时已基本恢复正常,与自然恢复组比有显著差异（ｐ ＜ ０．０５） 。     

Orthogonal array design in optimizing ERIC-PCR system for fingerprinting rat's intestinal microflora

AIMS: The aim of the present study was to rapidly optimize enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC)-PCR amplification systems for fingerprinting rat's intestinal microflora. METHODS AND RESULTS: Orthogonal array design and statistic analysis methods were attempted to rapidly optimize ERIC-PCR reaction system for fingerprinting intestinal microflora. The results showed that variations of the four factors (Mg(2+), dNTP, primer and HotstarTaq polymerase concentrations) changed the fingerprinting patterns significantly. The order of effects of those factors on fingerprinting patterns was primers (F = 274.000, P = 0.000), Hotstar Taq polymerase (F = 197.000, P = 0.001), Mg(2+) (F = 181.000, P = 0.001) and dNTP (F = 27.000, P = 0.011). The optimal ERIC-PCR condition was containing 200 micromol l(-1) dNTP, 2.5 mmol l(-1) Mg(2+), 0.4 micromol l(-1) primer, 1 U HotstarTaq DNA polymerase namely 25 microl reaction system, which is proved to be a simple, fast and reliable method suitable for fingerprinting rat's intestinal microflora. CONCLUSIONS: The results suggest that Mg(2+), dNTP, primer and HotstarTaq polymerase concentrations play important roles on ERIC-PCR fingerprinting patterns. Orthogonal array design is a considerable method to optimize ERIC-PCR reaction system for its rapidness, simplicity, potential to investigate mutual effects of parameters. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: It is the first report on optimization of ERIC-PCR amplification systems for fingerprinting intestinal microflora using orthogonal array design or statistic analysis methods and systematically observing the effects of variables of reaction conditions.     

小鼠肠道菌群失衡模型建立

目的利用抗生素干扰小鼠肠道菌群建立轻重程度的菌群失衡小鼠模型。方法选用不同浓度的头孢曲松钠,行小鼠灌胃,取盲肠内容物连续观察培养优势菌群变化。结果优势菌群失衡组小鼠与对照比较,盲肠体积增大,盲肠指数升高。头孢曲松钠8g/(kg·d)剂量连续灌胃8d,造成重度失衡模型,小鼠肠道只能检出肠杆菌属、链球菌属,且数量被抑制在103CFU/g以下。头孢曲松钠5g/(kg·d)剂量连续灌胃8d,造成轻度失衡模型,小鼠肠道双歧杆菌属、链球菌属和韦荣球菌属数量降至105左右,类杆菌属降至104左右。消化球菌属降至103左右,而其他菌属如乳酸杆菌属、肠球菌属和肠肝菌属等数量显著降低。结论亚致死剂量头孢曲松钠灌胃可以建立肠道菌群重度失衡模型。     

ERIC-PCR分子杂交技术分析大熊猫肠道菌群结构

目的了解大熊猫肠道微生物区系结构的相似性和稳定性,并找出大熊猫肠道微生物群落结构的变化与健康状况的关系。方法对上海动物园及上海野生动物园所饲养的3只大熊猫2次采集的粪便样品进行微生物群落总DNA的抽提,并以此为模板获得反映肠道微生物群落结构特征的ERIC—PCR和Southern杂交指纹图谱,比较各DNA样品指纹图谱的相似性指数。结果除国庆(大熊猫)的第1次采集的样品(当时处于腹泻状态),其他各DNA样品的ERIC-PCR及Southern杂交指纹图谱的相似性都达到85％～100％;佳斯及川川(大熊猫)2个个体2次采集的样品之间ERIC指纹图谱的相似性分别为93％和87％,而国庆腹泻时的样品与健康时的样品之间则为71％。结论大熊猫不同个体之间肠道微生物群落结构比较相似,而且同一个体在不同时期表现出比较高的稳定性,但当个体的健康出现问题时肠道优势菌菌群结构有一定波动。所采用的DNA提取方法、ERIC—PCR和Southern杂交指纹图谱的高度重复性证明了之一分子生态学技术在大熊猫肠道微生物区系动态监测中的可行性。     

运动对小鼠肠道菌群的影响

目的 利用PCR-DGGE方法比较运动小鼠和正常小鼠肠道菌群的结构和数量变化,研究运动对肠道菌群的影响。方法 从5只正常Balb/c小鼠和5只运动C57BL/6J小鼠的粪便中提取细菌基因组总DNA,用聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）的方法获得小鼠肠道菌群分布图谱,对图谱进行相似性、多样性以及优势条带的序列分析。结果 PCR-DGGE结果图显示运动小鼠肠道菌群的多样性明显增加,优势菌群发生转变,序列分析表明变形菌门明显减少,厚壁菌门成为优势菌型。结论 运动会对小鼠肠道菌群产生影响。     

肠道菌群变化对实验小鼠肠黏膜免疫的影响

目的探讨肠道菌群变化对肠黏膜相关淋巴组织的影响。方法通过变性梯度凝胶电泳（Denatu-ring gradient gel electrophoresis,DGGE）法研究了三种不同级别实验小鼠即清洁级小鼠、SPF小鼠和普通小鼠肠道菌群的组成,并用免疫组织化学（immunohistochemistry,IHC）方法研究了此三种不同级别的实验小鼠肠黏膜相关淋巴组织sIgA阳性细胞分布情况。结果普通小鼠肠道细菌种类最多,其sIgA阳性细胞分布最多,肠道不同部位之间sIgA分布情况差异有显著性（P〈0.05）,小肠和大肠之间的阳性细胞分布差异极显著（P〈0.01）;其次是清洁级小鼠,其肠道不同部位之间菌种组成差异无显著性,小肠和大肠之间的阳性细胞分布差异有显著性（P〈0.05）;SPF小鼠肠道细菌种类最少,故其sIgA阳性细胞分布最少,且其肠道不同部位之间菌种组成差异无显著性,小肠和大肠之间的阳性细胞分布差异无显著性（P〉0.05）。结论随着动物微生物控制级别的增高,肠道微生物多样性递减;sIgA阳性细胞与肠道细菌种类正相关。     

阿如拉7味散对肠道菌群失调小鼠免疫功能及肠道菌群多样性的影响

目的 研究阿如拉7味散对抗生素诱导肠道菌群失调小鼠的免疫功能和肠道菌群多样性的影响。 方法 选取50只清洁级昆明小鼠,分为正常对照组、自然恢复组、阳性对照组、阿如拉7味散低剂量组(0.5 g/mL)和阿如拉7味散高剂量组(1.0 g/mL)。将所有小鼠用头孢曲松钠和盐酸林可霉素混合药液灌胃制备肠道菌群失调模型,第8天起各组小鼠相应药物连续治疗7 d,实验结束时进行样品采集。采集血清和回肠组织,采用ELISA法检测血清中的IgG、IFNγ和TNFα含量以及回肠组织中的sIgA含量;采集盲肠内容物,采用高通量测序技术检测肠道菌群多样性;采集胸腺和脾脏,测定免疫器官指数。 结果 阿如拉7味散低、高剂量可显著提高抗生素诱导肠道菌群失调小鼠的脾脏指数(P0.05)和血清IgG含量(P>0.05)无显著影响。各用药组与自然恢复组相比,尤其阿如拉7味散低剂量组,小鼠肠道菌群丰富度和多样性明显升高。 结论 阿如拉7味散对抗生素诱导肠道菌群失调小鼠具有提高免疫器官指数、增强肠道免疫功能和改善肠道菌群的作用。     

旋毛虫感染小鼠肠道菌群变化的研究

目的通过观察黑龙江株旋毛虫感染小鼠肠道分泌物中分泌型免疫球蛋白A、肠道菌群的变化,探讨感染小鼠肠道菌群的变化。方法分别于小鼠感染黑龙江株旋毛虫后7、14、21、28和35d,观察模型组及对照组小鼠肠道分泌物中的分泌型免疫球蛋白A、肠道双歧杆菌、乳酸杆菌、肠杆菌、肠球菌的菌群变化。sIgA采用放射免疫法检测。结果模型组sIgA分泌水平在感染后14d达高峰,随后缓慢下降但始终保持高水平（P〈0．01）。模型组肠道双歧杆菌的数量在感染后7d略低于对照组（P〈0．05）,第14天降至最低水平,随后逐渐升高,至感染后35d恢复正常水平。乳酸杆菌的数量在感染后7d略低于对照组,第14天降至最低水平,随后逐渐增加（P〈0．05）。肠杆菌的数量在感染后7d略高于对照组,感染后14d明显高于对照组,随后始终保持下降趋势（P〈0．05）。肠球菌在感染后7d略高于对照组（P〈0．05）,在14d明显高于对照组,随后缓慢下降,至感染后35d恢复正常水平。结论旋毛虫感染小鼠sIga的分泌在肠道免疫中发挥重要作用,同时也影响肠道菌群;肠道菌群的变化可能与旋毛虫感染小鼠免疫系统中sIgA的分泌有关。     

Effect of antibiotics on the human intestinal flora in mice

Antibiotics used during selective decontamination were studied for their effect on the human intestinal flora in mice. Polymyxin B and neomycin were found to eliminate Escherichia coli from the gastrointestinal tract but did not alter total numbers of obligate anaerobes. Neomycin induced an increase of the percentage of gram-negative obligate anaerobes. Cephradine did not affect the numbers of obligate and facultative anaerobes but increased the percentage of gram-negative obligately anaerobic rods in the flora. The selective effect of polymyxin B and neomycin on the flora is accounted for by a relative insusceptibility of the anaerobic flora as compared with E. coli. Low concentrations of polymyxin B and neomycin were detected in caecal supernatants. This was found to be due to strong binding of both antibiotics to the solid fraction of intestinal contents.