甲型流感病毒H9N2亚型毒株血凝素基因特性的研究

目的　了解人甲型流感病毒H9N2亚型毒株的来源及从分子生物学角度来弄清不同宿主来源的H9N2亚型毒株间相互关系。方法　病毒在鸡胚中传代 ,从收获的尿囊液中提取病毒粒RNA ,通过逆转录合成cDNA。cDNA通过PCR进行扩增 ,接着PCR产物用纯化试剂盒进行纯化。而后 ,RNA序列测定是采用双脱氧链末端终止和克隆法。最后用MegAlign( 1.0 3版 )和Editseq( 3.69版 )软件进行种系发生学分析。结果　从中国所分离出的H9N2亚型毒株。它们的HA1与HA2间裂解部位的氨基酸序列均为R S S R ,除一株鸽病毒其HA蛋白分子上仅含 7个潜在的糖基化位点外 ,而其余的均含 8个。 6株H9N2毒株HA蛋白分子上氨基酸序列有 2 - 16个不同 ,这些不同分布在 2 4个不同的位点上。近来在中国同时流行着多种HA基因系的H9N2亚型毒株。结论　人甲型流感病毒H9N2亚型毒株可能性最大来自鸡的H9N2毒株 ,而不是来源于鸽的H9N2毒株。但 ,H9N2毒株是否具有人传人能力 ,至今仍不清楚。在中国同时流行着多种HA基因系的H9N2毒株。     

Characterization of hemagglutinin gene of influenza A virus subtype H9N2

Objective　To determine the origin of human influenza A (H9N2) virus and the relationship among H9N2 strains isolated from different hosts, on the basis of molecular biology. Methods　Viruses were passed in embryonated hen eggs, and virion RNA was extracted from allantoic fluid and reverse transcribed to synthesize cDNA. cDNA was amplified by PCR and the PCR product was purified with a purification kit. Afterwards RNA sequence analysis was performed by dideoxynucleotide chain termination and a cloning method. Finally, phylogenetic analysis of the sequencing data was performed with MegAlign (version 1.03) and Editseg (version 3.69) softwares. Results　The amino acid sequences at the cleavage site between HA1 and HA2 domains of H9N2 viruses isolated in China are R-S-S-R. One pigeon strain contains seven potential glycosylation sites on the HA protein molecule, while all others have eight. There are 2 to 15 differences of amino acid sequences distributed at 24 different positions on the HA protein molecules among six H9N2 viruses. The H9N2 viruses with multiple lineages of HA genes were co-circulating in China recently. Conclusion　The highest possibility is that human influenza A (H9N2) virus was derived from Chicken H9N2 virus, and not derived from pigeon H9N2 virus. However, it is still unknown whether the H9N2 virus could transmit from person to person. The H9N2 viruses with multiple lineages of HA genes are co-circulating in China.     

Potential infections of H5N1 and H9N2 avian influenza do exist in Guangdong populations of China

Background Southeast China is one of the sites of influenza origin. During 2003-2004, nine avian influenza outbreaks took place in Guangdong Province. But no human case was reported. To examine the status of potential human infection by human influenza （H1N1, H3N2） and avian influenza （H5N1, H7N7, H9N2） in the avian influenza epidemic area of Guangdong Province, China, we conducted a seroepidemiologic survey in the people of this area from April to June of 2004.
Methods Three out of 9 H5N1 avian influenza affected poultry areas in Guangdong were randomly selected, and the population living within 3 kilometers of the affected poultries were chosen as the survey subjects. One thousand two hundred and fourteen people were selected from 3 villages at random. Human and avian influenza antibody titers were determined by hemagglutination-inhibition （HI） test and microneutralization test （MNT）.
Results The positive rate of antibody to H5N1 was 3.03% in the occupational exposure group and 2.34% in general citizens group; that of H9N2 was 9.52% in the occupational exposure group and 3.76% in the general citizens group. Moreover one case in the occupational exposure group was positive for H7N7. One year later, all previously positive cases had become negative except for one H5N1-positive case.
Conclusion The observations imply that H5N1 and H9N2 avian influenza silent infections exist in Guangdong populations.     

Emergence of truncated PB1-F2 protein of H3N2 influenza virus during its epidemic period in Jiangsu Province, China

Background PB1-F2 protein has been proven to increase the pathogenicity of influenza A virus （IAV） strains in primary infection and in secondary bacterial infection. It can also regulate the activity of viral polymerase. However, it was shown in another retrospective study that a portion of IAVs do not express full-length PB1-F2 protein during virus development; different kinds of stop codons cause exits in the open reading frames and form PB1-F2 gene products with the corresponding genotypes. Truncated PB1-F2 in human H3N2 IAVs has long been detected in North America but its evolution in China is still unclear. Methods Influenza-like illnesses （ILls） from the whole of Jiangsu Province were collected and inspected to determine the type and subtype of the viruses. A portion of isolates collected in the epidemic period were selected as samples for later whole-genome sequencing, and the exact sequences were determined and analyzed. Results H3N2 influenza virus was one of the epidemical strains which had been prevalent during 2009-2010, in Jiangsu. Five H3N2 isolates with truncated PB1-F2 protein （25aa） were detected in influenza samples from Nanjing and Xuzhou, while seven similar H3N2 isolates were also reported in Niigata, Japan. Conclusion This emergence indicates the possibility that there has been transmission of the H3N2 virus between the two countries.     

双重荧光定量RT-PCR快速检测流感病毒H1、H3亚型的研究

目的 利用荧光定量RT-PCR技术建立一种快速检测流感病毒H1、H3亚型的方法.方法 根据H1、H3亚型流感病毒HA基因的相对保守序列,设计两对引物及其相应的Taqman探针,利用一步法RT-PCR试剂盒建立优化反应体系后,将荧光定量RT-PCR的产物采用10倍稀释法,即107～100 copies/μl,再次用荧光定量PCR方法检验建立体系的灵敏度和重复性,并建立相对定量标准曲线;利用多种流感病毒和具有相似临床症状的呼吸道病毒检验建立体系的特异性.结果 H1和H3亚型流感病毒的检测灵敏度为102 copies/μl,扩增效率分别为101.35％和113.28％,标准曲线相关系数大于99％,重复性良好,特异度实验未发现有非特异性扩增.结论 本研究建立的双重荧光定量RT-PCR技术可以快速、准确地检测H1、H3亚型流感病毒.     

金刚烷胺修饰物抗禽流感病毒的作用机制

目的：初步探讨金刚烷胺修饰物（NAM）抗禽流感病毒的作用机制,为抗禽流感病毒新药NAM的开发提供实验依据。方法：对狗肾细胞（MDCK）进行体外培养,分为正常对照组,病毒对照组和受试物组。①采用细胞病变法结合MTT法检测NAM对禽流感病毒（H5N1）的抑制作用,受试物组分为先加入NAM后感染病毒、先感染病毒后加入NAM和感染病毒的同时加入NAM,观察3种方式NAM对禽流感病毒的半数抑制浓度(IC50)和治疗指数(TI);②采用神经氨酸酶抑制实验检测NAM对神经氨酸酶的活性影响。结果：① 3种不同的实验方式NAM剂量对数与细胞保护率均呈正相关关系（r 分别为0.95、0.95和0.99,P均<0.05）,且NAM与保护率存在量效依赖关系。先加入NAM后感染病毒,NAM的IC50为15.32 mg·L-1,TI为103.31;先感染病毒后加入NAM,NAM的IC50为30.78 mg·L-1,TI为28.10;感染病毒的同时加入NAM,NAM的IC50为203.92 mg·L^-1,TI为4.24。②NAM具有一定的流感病毒神经氨酸酶抑制活性,其IC50为87.36 mg·L^-1。结论：NAM对穿入细胞后的禽流感病毒有较好的抑制作用,同时干扰病毒吸附和侵入细胞的脱壳过程也有一定的作用,能够在一定程度上抑制病毒的神经氨酸酶活性。     

H3N2流感病毒变异株抗原性的分子学研究

目的研究分离的H3N2流感病毒变异株的分子学抗原特性。方法将国内分离确认的几株甲3亚型流感病毒进行双向交叉血凝抑制实验，比较抗原性差异；同时进行HA1基因特性分析。结果从抗原性及HA1基因特性分析看出A／深圳／1／99与A／福建／151／2000和A／广东／448／2001差异较小，而与以前流行株A／京防／47／92差异较大。结论A／深圳／1／99发生抗原变异，但变异不大，未产生大规模流行。     

不同职业暴露人群感染H5N1禽流感病毒风险性分析

目的了解长沙地区不同类型禽类职业暴露人群高致病性禽流感H5N1亚型病毒的抗体分布状况,分析不同职业暴露人群H5N1感染的风险性。方法采集菜市场家禽屠宰零售人员、大型家禽饲养企业工人和农村个体家禽散养人员的血清标本,用单放射免疫扩散溶血技术（SRH）检测H5N1抗体。结果市场零售人员、农村个体家禽散养人员、企业饲养人员H5N1感染率分别为25%、1%和1.92%,男性从业人员H5N1抗体阳性率为10%,女性为23.88%。结论市场零售人员感染H5N1风险性远高于农村散养人员和企业饲养人员,不同职业人员中女性H5N1抗体阳性率高于男性从业人员。     

纳米银对流感病毒H3N2灭活作用的探讨

[目的]探讨纳米银(Nanosilver,NaAg)对流感病毒H3N2的灭活作用。[方法]采用血球凝集试验、鸡胚培养法、MTT分析法、血球吸附试验探讨NaAg对流感病毒H3N2的灭活作用。利用透射电镜、流式细胞仪检测病毒诱导细胞的凋亡。[结果]NaAg/H3N2组血球凝集试验效价为1∶2,鸡胚尿囊液血凝效价低于1∶2,流感病毒H3N2对照组血球凝集试验效价、鸡胚尿囊液血凝效价均为1∶1024,二者比较差异具有显著性意义(P<0.001);NaAg溶液在狗肾MDCK细胞上最大无毒浓度为25μg/mL;流感病毒H3N2在MDCK细胞上半数感染浓度(TC ID50)为10-3.5/0.1 mL。等体积的50μg/mL NaAg与40 TC ID50流感病毒H3N2溶液室温充分混和作用2 h后感染MDCK细胞,细胞的存活率为(98.16±2.67)%,而20 TC ID50流感病毒H3N2感染MDCK细胞,细胞的存活率为(35.21±1.45)%,二者比较差异具有非常显著性意义(P<0.001)。25μg/mLNaAg溶液有效抑制了20 TC ID50流感病毒H3N2诱导MDCK的细胞凋亡。[结论]纳米银对流感病毒H...     

2009年新型甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因进化分析

目的:探讨2009年新型甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因的进化及NA基因编码蛋白抗原性、酶活性位点、糖基化位点变异情况。方法:从NCBI基因库检索获得43株不同年代不同地域甲型流感病毒NA基因序列,用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0（MEGA 4.0）软件进行基因进化分析和氨基酸序列分析。结果:2009年新型甲型H1N1流感病毒与禽H5N1流感病毒NA基因的同源性达到85％,潜在抗原位点氨基酸分布相同;所有毒株的酶活性中心位点高度保守,但糖基化位点有变异。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒的NA基因可能来源于禽H5N1流感病毒;神经氨酸酶抑制剂治疗有效。     

甲型H1N1流感病毒裂解疫苗与流行性感冒裂解疫苗同期接种不良反应的对比分析

目的通过比较甲型H1N1流感病毒裂解疫苗(甲流疫苗)和流行性感冒裂解疫苗(普流疫苗)同期接种的不良反应,分析甲流疫苗的安全性。方法收集2种疫苗接种记录,对其中记录的不良反应进行流行病学统计分析。结果甲流疫苗接种156 738人次,发生不良反应18人,发生率11.48/10万;普流疫苗接种116994人,发生不良反应7人,发生率5.98/10万。分析发现,甲流疫苗接种的不良反应发生率与全国水平、普流疫苗相当;此外2种疫苗接种的不良反应在职业、年龄及性别分布上相同;2种疫苗的不良反应发生率在16～25岁年龄段、学生中较高,且有随着年龄段的升高,发生率有下降的趋势(rs=-0.999,P<0.001)。此外,2种疫苗接种后发生不良反应的临床症状除肌肉痛外,其余症状的发生无统计学差别。结论综上所述,甲流疫苗临床观察时间短、接种后有发生不良反应的可能,但总体来看,接种甲流疫苗是安全有效的,能有效保护甲流的易感人群。     

奥司他韦治疗甲型H1N1流感的疗效及不良事件观察

目的评价奥司他韦治疗甲型H1N1流感的疗效及安全性。方法回顾性分析口服奥司他韦治疗甲型H1N1流感患者的咽拭子病毒核酸阴转时间、退热时间、热程及发生的不良事件与奥司他韦的关系。结果口服奥司他韦后72h内咽拭子甲型H1N1流感病毒核酸阴转;55例患者发热后的第1～6d使用奥司他韦治疗,退热时间无明显差异,但越早使用热程越短;重症病例使用奥司他韦后热程较未使用者平均缩短1.17d（P〈0.05）;使用奥司他韦抗病毒治疗患者中,5例发生不良事件,其中3例为不良反应,2例与奥司他韦无关。结论口服奥司他韦治疗甲型H1N1流感相对安全有效,宜早期使用。     

甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与宿主蛋白的相互作用的初步研究

目的利用酵母双杂交技术研究甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与人类宿主蛋白的相互作用,为该病毒蛋白的功能研究和致病机制提供理论依据。方法以本实验室分离和鉴定的甲型H3N2流感病毒A/Guangdong/7028/2010为模版,构建pGBKT7-PB1-F2重组载体,利用Y2HGold酵母双杂交系统,从人类通用cDNA文库中筛选与其相互作用的蛋白。结果成功构建含诱饵蛋白基因的pGBKT7-PB1-F2重组载体,转化酵母自激活和毒性实验显示为阴性;酵母双杂交实验显示Y2HGold和Y187酵母的结合率为5.22%,符合实验要求;经筛选和验证后,得到3个与截短型PB1-F2蛋白有相互作用的阳性克隆,分别为钾/钠ATP酶β1亚基、热休克蛋白40和白介素-2受体γ亚基。结论初步推断截短型H3N2流感病毒PB1-F2蛋白可能影响流感病毒在宿主细胞中的复制功能和凋亡调控。     

重症甲型H1N1流感并肺炎的临床和影像学特点分析并文献复习(附39例病例报道)

目的 探寻新型重症甲型H1N1流感的发病规律,积累诊治经验.方法 回顾性分析中南大学湘雅二医院2009年甲型H1N1流感病房收治的诊断为重症甲型H1N1流感并肺炎的39例患者的临床和影像学特点,并结合文献复习.结果 发病年龄2岁11月～57岁.既往有基础疾病的患者11例(28.2％),肥胖症1例(2 6％),妊娠4例(10.3％).起病均有流感样症状(100％),10( 25.6％)例出现活动后气促.血气分析提示4例为I型呼衰,3例为低氧血症.胸部影像学表现主要为毛玻璃样模糊阴影的背景下,有局部散在、片状的高密度影,既有急性肺间质改变的表现,又有局灶肺实变的表现,但几乎未见典型的大叶性肺炎影像学改变.39例均为确诊病例.入院后立即给予奥司他韦抗病毒治疗,37例病例痊愈,2例患者死亡.结论 年龄较大(大于60岁)的人群中发生重症甲流的病例很少,孕妇在此次甲型H1N1流感病毒流行中感染后较易发展为重症;重症主要并发肺炎,以双下肺野分布的磨玻璃样模糊阴影为其典型的影像学表现;发病时间超过48小时仍不应放弃奥司他韦抗病毒治疗.     

新型甲型H7N9流感病毒神经氨酸酶基因进化分析

目的探讨2013年新型甲型H7N9流感病毒神经氨酸酶(NA)基因的进化,及其编码蛋白重要氨基酸位点的变异情况。方法从美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库和全球禽流感基因共享数据库(GISAID)下载不同年代、不同地区甲型流感病毒N9亚型的NA基因序列,利用MEGA 5.05和BioEdit软件对基因的核苷酸序列和氨基酸序列进行分析。结果 2013年新型甲型H7N9流感病毒NA基因与2010年捷克共和国H11N9禽流感病毒的相似性达到96%;新型流感病毒存在5个氨基酸的缺失;其中1株新型病毒可能的酶活性位点发生了变异。结论 2013年新型甲型H7N9流感病毒的NA基因可能是由H11N9进化而来;氨基酸的缺失可能是造成人感染和较高病死率的原因。     

Hospitalized patients with novel influenza A (H1N1) virus infection: Shanghai, June–July 2009

Background From late May 2009, sporadic imported cases of novel influenza A （HIN1） were continuously confirmed in Shanghai, but there were few reports on its clinical presentation in China. The aim of the study was to investigate the demographic and clinical features of the laboratory-confirmed cases and the treatment with oseltamivir. Method We performed a retrospective study in the Shanghai Public Health Clinical Center （SHAPHC）, reviewing the medical records of the laboratory-confirmed patients derived from June 10 to July 20, 2009. Results A total of 156 cases were enrolled, of whom 152 had a history of recent travel. The mean age was 22.6 years and 89 cases （57.1%） were males. The most common symptoms were fever, cough, and sore throat, with children more likely to run a temperature above 38.5℃ than adults. The mean leucocyte count was 5.4×10^9/L, the mean neutrophil count 3.2×10^9/L and the mean lymphocyte count 1.4×10^9/L. Other findings included a normal range or elevated level of C-reactive protein （CRP） and glutamic-pyruvic transaminase and a normal or decreased level of prealbumin; the levels of prealbumin and CRP were significantly lower in the children than in the adults. Fifty-two patients had abnormal chest CT results, with small unilateral or bilateral pulmonary infiltrates, axillary and mediastinal lymphadenopathy and local pleural thickening, while no cases showed symptoms of hypoxia. All the patients received oseltamivir and recovered without complications, but the duration of fever and virus shedding were significantly longer in the children than in the adults. Conclusions Travel-related circulation may be an important reason for the H1N1 epidemic in the non-epidemic areas, and the virus caused mild respiratory symptoms. The infection in children was more severe in terms of prealbumin levels, temperature, the duration of fever and virus shedding. Oseltamivir was effective for H1N1, but more effective in the adults than in the children.     

2009年新型甲型H1N1流感流行特征及防控措施

自2009年3月墨西哥发现首例甲型H1N1流感病例以来,截至2009年5月29日已有53个国家和地区正式报告15 510例确诊病例,2009年4月29日,世界卫生组织（WHO）已将全球流感大流行警告级别从4级提升到5级,并且还有进一步升级的可能。引发此次疫情的病原体是一种之前从未在人和猪身上出现过的新型甲型H1N1流感病毒。该新病毒对奥司他韦（达菲）和扎那米韦较敏感,但对金刚烷胺和金刚乙胺具有抗药性。人群对该病毒普遍易感,经由人-人形式传播。甲型流感在潜伏期内有传播能力,因此必须对密切接触者进行严格检疫;民众应做到勤洗手,咳嗽、喷嚏、吐痰时使用纸巾掩住口鼻等预防措施以减少传播机会。公共场所良好的通风条件、个人良好的卫生习惯和健康状况是预防该病的关键。     

2010年青海省流感病毒病原学监测及H3亚型HA1基因序列分析

目的监测青海省2010年季节性流感病毒型与亚型分布,并了解2010年部分A/H3N2分离株血凝素(HA)基因变异情况。方法采集全省各监测哨点医院鼻咽双拭子标本,接种MDCK细胞,采用标准抗血清鉴定阳性分离株型与亚型,并对2010年部分H3亚型流感病毒进行HA基因测序,分析HA基因变异情况。结果2010年全省哨点医院送检标本中共分离63株流感病毒,其中42株为A/H3N2,B型15株,AH1N1流感病毒6株,型与亚型有明显分布强弱特征。选取10株H3N2亚型分离株进行HA序列分析,发现与同期南京分离株接近,与WHO2010年度疫苗推荐株相距甚远,不在同一分支。结论 2010年青海省流行的H3N2亚型流感病毒的抗原性和基因特性发生了改变。     

2009年新型甲型H1N1流感病毒聚合酶编码基因进化分析

目的:探讨2009年新型甲型流感病毒(A/H1N1)聚合酶PA、PB1和PB2编码基因的进化规律。方法:从NCBI流感病毒基因数据库下载2009年新型甲型H1N1流行株的PA、PB1和PB2聚合酶编码基因序列以及人、猪和禽流感病毒相应的参考序列,采用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0（MEGA4.0）软件比对和修剪此次流行株的代表序列及所有参考株序列并构建系统树,再比对和修剪此次流行株的代表序列及人A/H1N1病毒各年代(1918~2008年)参考序列并构建系统树,同时比对此次流行株的代表序列及人A/H1N1各年代(1918~2008年)参考序列编码PB2蛋白的氨基酸序列。结果:不同地区分离的2009年新型甲型H1N1流感病毒的聚合酶PA、PB1和PB2编码基因均具有高度同源性,并聚集在一个独特的进化支上,与猪流感病毒对应基因接近。三者均与2005年美国爱荷华州分离的人A/H1N1病毒基因(A/Iowa/CEID23/2005/H1N1)具有高度的相似性。2009年新型甲型H1N1流感病毒、2005年美国爱荷华州流行的H1N1 (DQ889682)病毒PB2蛋白第627位氨基酸与禽类流感病毒相同,均为谷氨酸,而与其他人A/H1N1 (1918~2008年)病毒的赖氨酸不同。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒聚合酶基因可能来源于2005年美国爱荷华州分离的人A/H1N1病毒,禽流感病毒可能参与了聚合酶基因的重排过程。     

新型甲型H7N9流感病毒血凝素基因进化分析

目的探讨2013年4月流行的新型甲型H7N9禽流感病毒的表面蛋白血凝素(HA)基因的进化,以及氨基酸的变异情况。方法从美国国家生物技术信息中心(NCBI)和全球禽流感基因共享数据库(GISAID)中下载H7N9流感病毒以及有代表性的H7N2、H7N3、H7N7亚型流感病毒的HA基因序列,运用Molecular Evolutionary Genetics Analysis(MEGA)version 5.05软件进行序列分析,用邻接法构建基因进化树;通过氨基酸序列分析HA蛋白受体结合位点、糖基化位点和裂解位点的变化。结果 2013年新型甲型H7N9流感病毒与2011年浙江禽类H7N3流感病毒株(JQ906573.1)的相似性达到95.3%～95.6%;受体结合位点氨基酸发生变异,为Q226L,5个糖基化位点高度保守;HA裂解位点位于aa339和aa340之间,仅有1个碱性氨基酸:R。结论 2013年新型甲型H7N9流感病毒HA基因是由中国禽类H7亚型进化而来,Q226L变异导致的受体结合位点的变化可能是新型流感病毒具有人感染性的原因。