贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α基因启动子区的单核苷酸多态性

目的: 了解贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α (tumor necrosis factor alpha, TNF-α)基因启动子区的基因多态性.方法: 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP) 和序列特异性引物-PCR(SSP-PCR) 方法,对贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区已知的5个多态性位点进行基因分型检测,并用统计学方法分析各位点基因型、等位基因频率及其组间差异.结果: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238(G,96%;A,4.0%)、-308(G,92%;A,8%)、-857(C,65.0%;T,35.0%)、-863(C,80.0%;A,20.0%)、-1 031(T,48.0%;C,52.0%).结论: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性具有独特的特征,这为TNF-α基因多态性与疾病的相关性研究提供了基础资料.     

河南省汉族人群肿瘤坏死因子α基因启动子区单核苷酸多态性

目的研究河南省汉族人群无关个体217例肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因启动子区的-238G/A、-308G/A、-850C/T、-863C/A共4个单核苷酸多态性(SNPs)位点的遗传多态性。方法采用限制性酶切片段长度多态性(RFLP),结合质量分数6%聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染法对SNPs位点进行分型。结果选择的TNF基因上4个SNPs位点等位基因和基因型频率分布在河南省汉族人群均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,各等位基因频率均大于5%,等位基因最小频率分布在5.8%～14.1%。4个SNPs位点共观察到21种组合基因型,杂合度为0.461。根据SHEsis软件推测出11种单体型,单体型多样性为0.608。结论河南省汉族人群TNF基因4个SNPs位点及其组成的单体型具有较高的多态性,在法医学实践中有一定的应用价值,同时为人类遗传学的研究提供基础资料。     

汉族人群中肿瘤坏死因子-β基因多态性与精神分裂症、心境障碍的关联研究

目的 探讨肿瘤坏死因子-β（tumor necrosis factor-β，TNF-β）基因G252A多态性与精神分裂症、心境障碍是否关联。方法 收集65个核心家系，采用PCR-RFLP技术对G252A多态性基因分型，进行传递不平衡检验。结果在女性组（X^2=5．26，10=1，P〈0．05）和发病年龄≤25岁早发组（X^2=6．76，10=1，P〈0．01），G252A多态性与精神分裂症相关联；在早发组（X^2=5．00，10：1，P〈0．05）G252A多态性与心境障碍相关联，无性别差异（P〉0．05）。结论 在中国汉族人群中TNF-β基因可能是精神分裂症和心境障碍的共同易患基因之一，并可能影响发病年龄。     

汉族人群中肿瘤坏死因子-β基因多态性与精神分裂症、心境障碍的关联研究

目的 探讨肿瘤坏死因子-β(tumor necrosis factor-β,TNF-β)基因G252A多态性与精神分裂症、心境障碍是否关联.方法 收集65个核心家系,采用PCR-RFLP技术对G252A多态性基因分型,进行传递不平衡检验.结果 在女性组(χ2=5.26,v=1,P＜0.05)和发病年龄≤25岁早发组(χ2=6.76,v=1,P＜0.01),G252A多态性与精神分裂症相关联;在早发组(χ2=5.00,v=1,P＜0.05)G252A多态性与心境障碍相关联,无性别差异(P＞0.05).结论 在中国汉族人群中TNF-β基因可能是精神分裂症和心境障碍的共同易患基因之一,并可能影响发病年龄.     

肿瘤坏死因子α基因多态性与脑梗塞的相关性

目的探讨肿瘤坏死因子α(TNFα)启动子多态性与脑梗塞(CI)的相关性。方法用序列特异性引物和荧光染料SYBR Green Ⅰ聚合酶链式反应(PCR)结合熔链曲线分析，对42例脑梗塞患者(CI组)和31例健康者(对照组)的肿瘤坏死因子α多态性进行分型。结果TNFα等位基因分布频率在CI组和对照组之间的差异无显著性。结论肿瘤坏死因子α基因多态性与CI的发病可能无关联。     

肿瘤坏死因子α及β基因多态性与河南汉族原发性高血压的相关性

目的探讨肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因-308G>A多态性及β(TNF-β)基因252A>G多态性与河南汉族原发性高血压的相关性。方法对河南汉族人群130例高血压患者(高血压组)和197例健康对照者(对照组),采用限制性扩增片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法检测TNF-α基因-308G>A多态性及TNF-β基因252A>G多态性。结果高血压组TNF-α-308G>A多态性中GA+AA基因型频率明显高于对照组(χ2=6.407,P<0.05);高血压组A等位基因的频率也明显高于对照组(χ2=4.781,P<0.05),高血压组中TNF-α-308G>A中A等位基因(+)的人群即基因型GA+AA者的舒张压明显高于GG纯合子基因型的人群(P<0.05);TNF-β基因252A>G多态性各基因型及等位基因频率在高血压组和对照组的分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论TNF-α基因-308G>A多态性与河南汉族原发性高血压的发生有关,TNF-β基因252A>G多态性与河南汉族原发性高血压无关联。     

肿瘤坏死因子-α基因多态性与中国汉族人群乙肝病毒感染的相关性研究

目的  探讨中国汉族人群肿瘤坏死因子-α（TNF-α）基因单核苷酸多态性（rs1800629和rs361525）与乙型肝炎病毒（HBV）感染的相关性。方法  用TaqMan探针对纳入的1 097例样本进行TNF-α、rs1800629和rs361525位点多态性检测,血样本包括429例慢性HBV感染者（CH组）、429例乙肝感染后自发清除者（SR组）及239例健康对照者（HC组）。结果  ①CH组与SR组比较,rs1800629 GA基因型与G等位基因与感染后病毒的自发清除有关[基因型：■=0.369,P =0.000;等位基因：■=2.210,P =0.000;显性模型（GG vs GA+AA）：■=0.536,P =0.000]。②CH组与SR组比较,SNP rs361525 GA基因型或A等位基因与感染后病毒的自发清除密切相关[基因型：■=0.288,P =0.000;等位基因：■=0.549,P =0.000;显性模型（GG vs GA+AA）：■=0.634,P =0.000]。结论  TNF-α基因多态性与中国汉族人群HBV病毒感染后的自发清除密切相关。

     

北京地区慢性乙型重型肝炎患者肿瘤坏死因子基因多态性相关性分析

目的：探讨肿瘤坏死因子（TNF-α）基因启动子-238G／A、-308G／A、-857C／T、-863C／A等位基因多态性和血清TNF-α水平与慢性重型乙型肝炎的相关性。方法：2002年12月至2005年12月北京佑安医院住院慢性重型乙型肝炎患者98例,慢性乙型肝炎患者211例。采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析方法检测TNF-α启动子-238G／A、-308G／A、-857C／T、-863C／A等位基因多态性。结果：两组-863C／A、-238G／A位点的等位基因（X^62=0．61,P=0．436;X^2=0,001,P=0．976）,基因型频率比较差异无统计学意义（X^2=1．16,P=0．552;X^2=0．63,P=0,486）。两组比较TNF-α-308G／A和-857C／T等位基因差异都具有统计学意义（X^2=59．01,P=0．000;X^1=11．59,P=0．000）;-308GA和-857TT基因型频率显著高于慢性乙型肝炎组（X^2=28．06,P=0．000;X^2=19．69,P=0.000）,差异有统计学意义。-308GA与-857TT基因型与慢性重型乙型肝炎有显著性关联OR=4．176;95％ CI2．416-7．216;OR=6．09;95％CI2．652-14．001。慢性重型乙型肝炎患者血清TNF-α水平明显高于慢性肝炎患者,两组比较差异有统计学意义（t=3,951,P=0．000）。结论TNF-α-308GA与-857TT基因型携带者感染HBV后可能增加成为慢性重型乙型肝炎的风险。TNF-α基因启动子区基因多态性与北京地区汉族人群中慢性重型乙型肝炎的发生可能密切相关。     

上海地区汉族人群IL-17B基因单核苷酸多态性的研究

目的:研究上海地区汉族人群IL-17B基因单核苷酸多态性及其分布特征,并与国外数据库进行比较。方法:随机选取190例上海地区汉族个体,对IL-17B基因启动子、外显子及临近的内含子区的PCR产物直接测序,检测基因内SNPs。所得结果与美国国立生物技术信息中心(NCBI)的SNP数据库(dbSNP)进行比较。结果:在所有研究对象中共发现6个SNPs,主要位于非编码区;6个均为替换型SNPs,其中1个为三态替换型SNP。有5个SNP在dbSNP数据库中已报导,但有11个数据库已报导的SNPs,在本次研究中未能证实。结论:中国汉族人群IL-17B基因多态性的分布与dbSNP数据库中的资料存在差异,为在汉族人群中研究IL-17B基因相关疾病提供可靠数据。     

肿瘤坏死因子的基因多态性和脓毒症易感性

位于人类主要组织相容性复合体Ⅲ类基因区内的TNF基因有多态性，这些多态性与个体对脓毒症的易感性、发展、预后密切相关。本文综述TNF基因多态性与脓毒症的关系，发现可以寻找判断预后的基因标志，还可以为脓毒症的免疫基因治疗奠定基础.     

重庆地区汉族人群穿孔素和颗粒酶B基因多态性分析

目的:研究重庆地区汉族人群穿孔素(Perforin,PRF1)和颗粒酶B(Granzyme B,GZMB)基因多态性分布特征及连锁不平衡,为研究PRF1和GZMB基因多态性与疾病相关性提供前期实验依据.方法:采用直接测序法对100名重庆地区健康儿童的PRF1和GZMB基因单核苷酸多态性(SNPs)进行分析.结果:①在重庆地区汉族儿童PRF1基因外显子3发现多态性3877C>T和3955C>T.在GZMB外显子2、外显子3、外显子5分别发现多态性1273G>A,1804A>G及1815C>G,3151T>C及3186A>G,其中1815>G和3186A>G是本研究新发现的多态性位点.②不同种族和地区PRF1及GZMB基因SNPs分布不同.PRF1基因两个多态性位点在重庆地区人群中呈现强烈的连锁不平衡(D'=0.996).GZMB基因的5个多态性位点两两连锁不平衡.结论:在重庆地区汉族人群PRF1和GZMB基因中共发现7个多态性位点,其中2个为首次发现.PRF1和GZMB基因多态性在重庆地区汉族人群中均存在显著连锁不平衡.     

我国汉族人群MxA基因-88位点的基因多态性研究

【目的】研究我国汉族人群MxA基因-88位点的基因多态性。【方法】采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)方法进行MxA基因-88位点的基因多态性(SNP)分型。【结果】我国汉族人群MxA基因-88位点的GG、GT、TT基因型构成分别为47.3%、43.5%和9.2%,与越南和日本的基因型构成无差别(χ2=1.56,P=0.816)。同时,该位点的G和T等位基因构成分别为69%和31%,与越南和日本的人群该位点的等位基因构成相近(χ2=0.49,P=0.783)。【结论】我国汉族人群MxA基因-88位点的基因多态性与其他民族可能相同。     

Wnk1基因多态性与汉族人缺血性卒中的关联分析

目的：探索赖氨酸缺乏蛋白激酶1（Wnk1）基因单核苷酸多态性（SNP）与中国汉族人群缺血性卒中的关系。 方法：收集2008年1月～2009年12月新疆5所医院294例汉族缺血性卒中患者（病例组）和同期外科系统住院治疗的其他无脑梗死疾病的汉族患者314例（对照组）进行病例对照研究。用标签SNP（tSNP）策略选择Wnk1基因10个SNP位点（rs3858703、rs11611246、rs7305065、rs1990021、rs34408667、rs12309274、rs1012729、rs956868、rs12828016、rs953361）。SNP基因分型检测采用多重SNaPshot平台。用t检验、卡方检验和logistic回归分析对数据进行统计分析,用Haploview软件进行连锁不平衡分析和单倍型分析。 结果：病例组饮酒（37.1%）、高血压病（62.9%）、糖尿病（18.0%）、高脂血症（36.4%）患者比例均高于对照组（均P<0.01）,而吸烟者比例在两组间差异无统计学意义（P>0.05）。所有位点基因分型缺失率均在1%以下。除rs34408667位点外,其余tSNP均通过Hardy-Weinberg平衡检验。Wnk1基因第四内含子rs11611246位点与汉族缺血性卒中相关。T等位基因在病例组中的分布频率低于对照组（30.3%与35.7%,P=0.046）。进行性别分层后发现,rs11611246 T等位基因是汉族男性缺血性卒中发病的保护因子。GT基因型及TT基因型在病例组男性中的分布频率分别为43.3%及7.2%,而在对照组男性中的分布频率分别为43.1%及15.2% （P=0.038）。加性遗传模型显示T等位基因携带者发生缺血性卒中的风险是对照组的0.702倍（95%CI：0.517~0.953,P=0.023）。调整年龄后差异仍然存在（P=0.022）,进一步调整年龄、体质量指数、吸烟、饮酒、高血压、糖尿病、高脂血症等混杂因素后,差异仍然存在（P=0.008）。未发现Wnk1基因其余9个SNP位点与汉族人脑梗死相关。 结论：Wnk1基因第四内含子rs11611246多态性影响中国人缺血性卒中的发生。 rs11611246位点T等位基因可能是汉族男性发生缺血性卒中的保护因素。     

GSDMB和ZPBP2基因单核苷酸多态性与宁夏汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究

目的 分析GSDMB基因rs7216389位点及ZPBP2基因rs11557467、rs12936231位点单核苷酸多态性与宁夏汉族系统性红斑狼疮(SLE)发生的相关性.方法 采用病例-对照关联研究,利用Taqman基因分型系统检测144例SLE患者和322例正常对照者的3个SNP位点,分析组间基因型及等位基因频率的分布差异.结果 2组3个SNP位点基因型频率差异无统计学意义(P＞0.05);患者组rs11557467 T、rs12936231G、rs7216389C等位基因频率均小于对照组,但差异无统计学意义(P＞0.05).结论 GSDMB基因rs7216389位点及ZPBP2基因rs11557467、rs12936231位点单核苷酸多态性与宁夏汉族人群SLE发生无相关性.     

广东地区汉族人MBL基因启动子区SNP的研究

目的研究广东汉族人群甘露聚糖结合凝集素(MBL) 基因启动子单核苷酸多态性(SNP) 。方法抽提人外周血白细胞基因组DNA,建立SSP-PCR及分子灯塔实时荧光PCR技术,检测MBL基因启动子区SNP位点-550(G/C,称H/L等位基因) 、-220(G/C,X/Y等位基因) 和 4(C/T,P/Q等位基因),分析其单倍型及基因型频率。结果从167人中检出等位基因型LYP/LYP 10例(5.9%)、HYP/LYQ 7例(4.2%)、LYP/LYQ 94例(56.3%)、LXP/LXP 6例(3.6%)、LYQ/LYQ 4例(2.4%)、LXP/LYQ 29例(17.4%)、HYP/LYP 3例(1.8%)、HYP/LXP 2例(1.2%)、HYP/HYP 12例(7.2%)。结论广东地区汉族人群MBL基因启动子区SNP等位基因型以LYP/LYQ和LXP/LYQ为主。     

基质金属蛋白酶基因启动区3个单核苷酸多态性与河南汉族群体慢性心力衰竭遗传易感性关联研究

目的探讨基质金属蛋白酶(MMPs)基因启动区rs1799750、rs3025058及rs227610单核苷酸多态性(SNP)与河南汉族群体慢性心力衰竭(CHF)发病风险的相关性。方法采用限制性扩增片段长度多态性(PCRRFLP)方法检测124例CHF患者(CHF组)和144名健康者(对照组)的3个SNP,运用SHEsis软件分析数据。结果CHF组rs1799750的1G等位基因频率较对照组显著降低(P<0.01),1G1G基因型频率也较对照组显著降低(P<0.01)。CHF组1G6A单体型的频率显著低于对照组(P<0.01)。结论河南汉族群体中rs1799750位点1G等位基因和单体型1G6A可能会降低个体CHF的患病风险。     

我国汉族人群SARS患者MxA基因-88位点的多态性研究

[目的]研究我国汉族SARS患者MxA基因-88位点的基因多态性.[方法]应用PCR-RFLP的研究方法进行MxA基因-88位点的基因多态性（SNP）分型.[结果]我国汉族SARS患者MxA基因-88位点的GG、GT、TT基因型构成分别为51.7%、36.7%和11.7%,与健康人群该位点的基因型构成无差别（x^2=0.855,P=0.642）.同时,该位点的G和T等位基因构成分别为70%和30%,与健康人群该位点的等位基因构成相近（x^2=0.033,P=0.857）.[结论]我国汉族SARS患者MxA基因-88位点的基因多态性与健康人群无显著性差异.     

精氨酸加压素基因rs66818855A/G和rs1078152C/T在广西健康人群中的分布

目的研究精氨酸加压素（AVP）基因单核苷酸多态性（SNP）位点rs66818855和rs1078152在广西健康人群中的分布,并对 比不同种族间AVP基因型及等位基因频率分布的差别。方法采用单碱基延伸的聚合酶链反应（PCR）技术和DNA测序法检测 303例广西人AVP基因多态性,分析广西人群这两个位点的基因型和等位基因的分布频率,并与人类基因组计划公布的欧洲 人、中国北京汉族人、日本人和非洲人的基因多态性分型数据比较,分析这5个人群人类的基因型及等位基因的分布频率。结 果在我国广西人群中存在AVP基因rs66818855和rs1078152多态性,分别有AA、AG、GG,CC、CT、TT三种基因型。与人类基 因组计划公布的欧洲人、非洲人、日本人和中国北京人的单核苷酸多态性分型数据进行比较,AVP基因rs66818855、rs1078152 位点基因型和等位基因频率在广西人群和欧洲人群的差异具有统计学意义（P均<0.01）;rs66818855位点等位基因频率与非洲 人相比差异具有统计学意义（P<0.05）。结论在广西地区人群中存在着AVP基因多态性。广西人群AVP基因多态性的分布与 其他种族人群比较存在有差异,这种差异也许是与AVP相关的疾病在不同地区人群间发病率不同的原因之一,对于群体遗传学 及人类学的研究可能起非常重要的作用。     

吉林汉族人群ERAP1基因3'UTR单核苷酸多态性与原发性高血压的关联性分析

目的:探讨ERAP1基因在高血压患者外周血中的表达,鉴定ERAP1基因3'UTR区与原发性高血压有关联的候选单核苷酸多态性(SNPs)位点。方法:在吉林地区汉族人群中选取高血压患者300例(高血压组)及正常对照者233名(对照组)进行病例对照研究,采用ELISA法检测研究对象的外周血中ERAP1表达水平,混池测序法鉴定ERAP1基因 3'UTR区SNPs位点,采用PCR测序的方法对研究对象进行测序分型。结果:高血压组患者外周血中ERAP1表达水平明显低于对照组 (P<0.05);ERAP1基因 3'UTR区鉴定出2个SNPs位点E20-790G >A和E20-816C >T,E20-816C >T位点的等位基因及基因型频数分布在高血压组和对照组间差异有统计学意义(P<0.05);排除混杂因素后,Logistic回归分析,E20-816C>T位点CT基因型频数在高血压组中显著降低(P<0.05,OR=0.145,95% CI:0.031-0.675)。结论:在吉林地区汉族人群中,ERAP1基因E20-816C>T位点多态性可能与原发性高血压有关联,高血压中CT基因型频数的降低可能与ERAP1表达下调有关联。