石英谐振靶基因组合检测仪振荡电路的研究

目的：研究石英谐振组合靶基因检测仪自激式振荡电路。方法：电路设计满足石英谐振相位和幅度两个基本驱动条件，在振荡电路后加一级放大电路，使输出的信号幅度能够达到TTL电平，并经过波形变换和整形后，输出方波信号，送到计算机上的频率计数卡。结果：设计的振荡电路稳定性好，液相中起振能力强，结论：该振荡电路能满足石英谐振组合靶基因检测仪的需要。     

靶DNA长度对压电传感器基因杂交效应的影响

目的：探讨靶DNA长度对压电传感器基因杂交效应的影响，方法：在压电传感器阵列上固定20碱基的巯基DNA序列作为探针后分别与不同长度的含互补片段的靶序列进行杂交，计算机采集并分析传感器频率数据，比较各靶DNA长度下杂交达到平衡所需时间，杂交前后频率差，并计算杂交动力学参数。结果：随靶DNA长度增加，杂交时间有延长趋势。在靶DNA长度为20－108个碱基时，其频率变化值与碱基数呈线性关系。而225，379，654个碱基时的频率变化反应则明显降低，结合常数变化不明显，而解离常数呈增大趋势变化，使平衡常数逐渐减少，结论：在威武央晶体传感器阵列上，频率变化值随靶序列长度增长而增大但反应效率不一样。     

压电基因传感器阵列的初步构建

目的　初步构建适于临床基因检测的新方法即压电基因传感器阵列。方法　制作 2× 5型基因传感器阵列 ,在阵列各检测池的银膜上通过巯基修饰法固定合成大肠杆菌肠毒素基因探针 ,而后与各靶序列进行杂交 ,以自制集成电路及电脑软件对频率数据进行采集与分析。结果　 12h内 ,气相对照检测池频率变化± 2Hz ,液相对照检测池频率变化± 4Hz ;基因探针固定后频率下降 ( 4 8± 5 )Hz ;与完全配对的靶序列杂交 ,0 .5h达到稳定状态 ,并使频率下降 ( 4 3± 5 )Hz ;与有 1～ 2个碱基错配的序列杂交 ,频率下降仅分别为 ( 2 1± 5 )、( 7± 5 )Hz ,与 3个碱基错配的序列及不相关序列杂交 ,频率无明显变化。结论　初步构建的基因传感器阵列有很好的稳定性和特异性 ,敏感性尚待进行一步提高。     

纯化鼻咽组织全基因组表达谱在筛选鼻咽癌相关靶基因中的应用

目的:通过全基因组寡核苷酸基因芯片构建鼻咽部纯化组织基因表达谱,筛选鼻咽癌相关靶基因。方法:采用RNA保护技术保护组织标本,显微切割纯化分离鼻咽癌组织标本中的癌细胞、鼻咽部非癌组织标本中的黏膜上皮细胞,提取每一例纯化组织标本RNA,线性扩增获得足量aRNA,标记探针后与HG-U133. Plus 2. 0杂交,构建每一例鼻咽部纯化组织标本基因表达谱,通过组间信息比对筛选鼻咽癌相关靶基因。结果:鼻咽癌组与非鼻咽癌组基因表达谱比对,筛选出了与鼻咽癌发病相关的候选靶基因。通过鼻咽癌标本中颈部转移组和非颈部转移组表达谱比对,找出了与鼻咽癌颈部淋巴结转移相关的候选靶基因。结论:利用全基因组基因芯片构建基因表达谱,可准确、高效地筛选出鼻咽癌相关的候选靶基因。     

第三军医大学研制成功组合靶基因传感芯片及其自动检测仪

第三军医大学“九五”科技攻关项目“组合靶基因传感芯片及其自动检测仪的研制与开发”于 2 0 0 2年 4月 11日在重庆市通过国家科技部验收 ,该项目成功研制并开发出具有我国自主知识产权的新型实用阵列式生物芯片。该仪器主要特点 :(1)将压电石英谐振传感器技术与生物芯片技术相结合 ,独创性地综合传统基因芯片“集成”、“可寻址分析”和“并行处理”等特点 ,在进行生物传感器芯片加工工艺优化、探针固定方法选择以及提高芯片检测灵敏度和特异性的基础上 ,成功地构建出有别于荧光杂交芯片的压电石英传感器阵列生物芯片 ,具有无须标记、无须…     

离子强度对压电传感器基因杂交动力学的影响

目的：探讨盐离子浓度对压电传感器基因杂交动力学的影响。方法：设计并合成金黄色葡萄球菌耐药基因探针及与其完全互补的靶序列，在石英谐振压电传感器阵列上进行杂交，杂交缓冲液中含5种NaCl浓度，计算机采集并分析传感器频率数据得出杂交动力学参数，同时比较各盐离子浓度下杂交达到平衡所需时间，杂交前后的频率差，平衡后频率波动幅度大小。结果：随NaCl浓度增加，结合速率常数，杂交平衡常数，最大杂交量均呈现明显增大趋势。而离解速率常数呈下降趋势，杂交前与杂交平衡后的频率差值增大，同时，杂交平衡后频率波动幅度相应增大，杂交达平衡所需时间延长。结论：一定的盐离子浓度促进基因杂交，但盐离子浓度过高则对晶体振荡性能产生负面影响。     

基于生物信息学对心肌梗死与不稳定型心绞痛差异靶基因的研究分析

目的:探究心肌梗死与不稳定型心绞痛的生物学机制,为后期临床研究提供航向。方法 :基于GEO数据库对基因芯片GSE29111进行挖掘,再利用GWAS数据库对差异靶基因进行二次筛选,最后进行生物信息学分析。结果 :运用GEO数据库GEO2R鉴定到的差异靶基因,有188个蛋白点表达有统计学差异(P<0.05);经GWAS数据库基因位点(gene/region)P值设定:-log10P≥3筛选与心肌梗死与不稳定型心绞痛相关的差异靶基因共7个,分别是MACF1、TANC2、PSMF1、CD59、MYO18B、GALNT10、TFPI。运用Metascape基因注释工具,发现这7个差异靶基因主要与蛋白水解的负调节、创伤愈合有关。运用David工具对这7个差异靶基因在线进行GO分析及KEGG分析发现,这些差异靶基因与内肽酶活性的负调控、凝血、肽链内切酶抑制剂活性、肌动蛋白结合和补体系统有关。结论:心肌梗死与不稳定型心绞痛差异靶基因主要与肽链内切酶抑制剂活性及补体系统相关联,主要调控的差异靶基因是CD59、TFPI。     

多参数自动检测仪对生物安全柜气流流速的快速检测

采用生物安全柜多参数自动检测仪（BSC01-10S）对各级实验室生物安全柜的气流流速进行检测。检测结果表明：该自动检测仪操作简便、快速，而且能实时检测流速，检测结果准确、数据重复性好；检测数据还证实，它能完成III级生物安全柜气流流速的自动准确检测。     

FXR及其作用的靶基因

核受体（nuclear receptor）是一类配体依赖的转录因子。是一个迄今约有150个成员的大家族，它包括甾体激素受体，非甾体激素受体以及大量的配体尚待鉴定功能不清的孤儿受体（orphan nuclear receptors）。近年研究发现几种孤儿核受体，包括肝脏X受体（liver X receotor，LXR）、法尼醇受体（farnesoid Xreceptor，FXR）、肝受体同源物-1（liver receptor homology-1，LRH-1）、小分子异源二聚体伴侣（smallheterodimer partner，SHP）及它们介导的信号途径在调节胆固醇及胆汁酸代谢平衡方面起重要的作用。而目前与胆汁酸代谢关系较明确的是FXR。现就FXR及其作用的靶基因综述如下。     

HIV基因芯片的初步研究

目的建立HIV基因检测芯片的分析技术。方法分离HIV1U26942基因限制性显示片段作探针,应用PixSys 5500点样仪将探针打印在氨基包被的玻片上制作基因芯片。然后与随机引物荧光标记的HIV样品进行杂交,以分析限制性显示基因片段的杂交动力学。经杂交后清洗和干燥,扫描芯片进行检测。结果对基因检测芯片的制作与检测的实验条件进行了初步研究并筛选了12个限制性显示基因探针。结论建立的检测芯片的实验方法可行且较特异。     

石英谐振传感器液相稳定平台构建及检测HCMV的实验研究

目的 建立石英谐振压电基因传感器检测系统液相稳定平台并应用该检测系统实时检测链置换扩增(Strand displacement amplification,SDA)反应。方法 ①观察以金属夹具式和粘胶式两种检测池连接方式构成的传感器在液相中的频率稳定性;②以巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)为检测对象,建立SDA反应系统;③传感器检测系统对HCMVSDA反应进行实时检测。结果 ①新型金属夹具式可调节及可换式传感器检测池可实现传感器在液相中的频率稳定性;②SDA反应可引起压电基因传感器的频率持续下降;③在一定范围内核酸杂交所引起的频率下降幅度随加入的靶序列浓度提高而增大。结论 成功构建压电基因传感器液相检测稳定平台并实现对SDA反应的实时检测;该系统可直接检测基因组DNA并可广泛应用于病原微生物的临床检测。     

全自动生化分析仪清洁剂的初步研制

目的研制一种廉价,高效的全自动生化分析仪清洁剂国产试剂,在保证质量的前提下,降低试剂成本。方法利用析因设计、研究表面活性剂与其他成分间协同及拮抗作用,运用最佳浓度组成复合配方对使用过的管道管壁进行清洗,然后对清洗后的仪器做相关分析及日常应用。结果经过严格的比对实验,稳定性实验等,发现医疗仪器处理前后对比分析中,各项统计学指标差异均无统计学意义。结论新型清洗剂廉价、清洗效果佳,准确性好。适合做全自动生化分析仪管道的清洗,具有广泛推广应用价值。     

肺通气功能测定多媒体教学软件的设计与实践

本文介绍了肺通气功能多媒体教学软件的设计与制作过程,包括整体框架构想、准备素材、制作平台、编写脚本和设计版面等.通过在基层医院的推广应用,证明该多媒体教学软件有助于提高学习者的学习兴趣与学习效率,可以成为传统教学方式的有益补充.     

临床生化全自动分析仪模拟训练课件的设计与应用

介绍了临床生化全自动分析仪模拟训练课件的设计思想、模块结构和功能特点，通过视频教学、理论教学和模拟操作平台教学，使学生获得了高级分析仪器的学习与训练，指出其为医学检验教学提供了一种新的教学资源。     

基于软件工程理论的网络课件研发

通过对网络课件现状的分析,提出为保证课件的开发质量,应该把软件工程理论应用于网络课件开发中的观点,并在传统的瀑布模型的基础上给出了网络课件的开发模型,同时进行了较为详细的对象模型分析。     

颏顶位片X线头影测量分析软件的研制

目的:针对颜面不对称畸形诊断困难的临床需要,研究开发颏顶位片(SMV)X线头影测量软件.方法:用Visualbasic语言设计SMV X线头影测量分析软件.将髁突中点连线作水平轴,其垂直平分线作对称轴,作为X线头影测量的参照系统.然后根据下颌骨的解剖标志,选择测量项目的定点与测量项目.该软件可进行下颌骨7个线距项目及2个角度的测量.结果:SMV通过扫描仪扫描,确定比例,定点,显示定点及坐标,测量数据 ,然后存储数据.所得数据即可用来对颜面不对称畸形进行分析、诊断与研究.结论:SMV X线头影测量分析软件的研究开发为颜面不对称畸形的诊断与研究开创了一种新的方法.     

基因芯片筛查亚溶解型C5b-9刺激大鼠肾小球系膜细胞基因表达差异的研究

目的:应用高通量的基因芯片技术筛查亚溶解型C5b-9(sublytic C5b-9)介导大鼠肾小球系膜细胞(glomerular mesangial cells, GMCs)的基因表达谱的变化?方法:体外分离?培养大鼠GMCs,人工质控sublytic C5b-9复合物的形成,并用其刺激培养GMCs,然后分别提取sublytic C5b-9刺激GMCs 40 min?3 h及未刺激对照组细胞的总RNA?经逆转录合成生物素标记的cDNA探针,然后与基因芯片杂交(涵盖31 000个转录本,代表28 000个基因)?经Affymetrix Scanner 3000 扫描芯片荧光信号图像?GCOS1.4读取数据后将差异表达基因注释于GO基因功能分类体系,分析其相应的功能?结果:芯片检查数据显示,sublytic C5b-9刺激GMCs 40 min 时上调2倍以上及下调2倍以上的基因分别为4 124个和2 234个,刺激3 h时上调2倍以上及下调2倍以上的基因分别为4 512个和2 859个;而sublytic C5b-9刺激GMCs 40 min和3 h后同时上调2倍以上及下调2倍以上的基因分别为2 325个和1 419个?sublytic C5b-9刺激GMCs表达差异基因其功能主要涉及生物学过程调节?生物调节?定位相关?刺激应答?生长发育?增殖?代谢过程?细胞生理过程?多细胞机体过程等?结论:Sublytic C5b-9 刺激GMCs确能引起基因表达谱的变化?     

用基因芯片筛选早期大肠癌相关基因

目的 用基因芯片技术筛选早期大肠癌相关基因. 方法 利用HG-U133Plus2.0基因芯片,对大肠腺瘤组织、癌组织和正常组织基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析. 结果 腺瘤组织与正常组织比较,表达差异2倍以上基因及ESTs共有1892个,其中表达上调的485个,表达下调的1407个.腺瘤组织和癌组织同时与正常组织比较,有602个表达相同的基因及ESTs,其中表达上调2倍以上的125个,表达下调2倍以上的477个. 结论 602个腺瘤与癌表达相同的基因可能与早期大肠癌的启动和演化有关.     

Characteristic gene expression profiles in the progression from normal gastric epithelial cells to moderate gastric epithelial dysplasia and to gastric cancer

Background  Gastric cancer ranks high among the most common causes of cancer-related death worldwide. This study was designed to explore key genes involved in the progression of normal gastric epithelial cells to moderate gastric epithelial dysplasia (mGED) and to gastric cancer.

Methods  Twelve pairs of mGED tissues, gastric cancer tissues, and normal gastric tissues were collected by gastroscopy. Total RNA was then extracted and purified. After the addition of fluorescent tags, hybridization was carried out on a Gene chip microarray slide. Significance analysis of microarrays was performed to determine significant differences in gene expression between the different tissue types.

Results  Microarray data analysis revealed totally 34 genes that were expressed differently: 18 highly expressed (fold change >2; P <0.01) and 16 down-regulated (fold change >2; P <0.01). Of the 34 genes, 24 belonged to several different functional categories such as structural molecule activity, extracellular regions, structural formation, cell death, biological adhesion, developmental processes, locomotion, and biological regulation that were associated with cancer. The remaining 10 genes were not involved in cancer research. Of these genes, the expression levels of Matrix metalloproteinase-12 (MMP12), Caspase-associated recruitment domain 14 (CARD14), and Chitinase 3-like 1 (CHI3L1) were confirmed by semi-quantitative RT-PCR. A two-way clustering algorithm divided the 36 samples into three categories and the overall correct classification efficiency was 80.6% (29/36). Almost all of these genes (31/34) showed constant changes in the process of normal gastric epithelial cells to mGED to gastric cancer.

Conclusions  The results of this study provided global gene expression profiles during the development and progression from normal gastric epithelial cells to mGED to gastric cancer. These data may provide new insights into the molecular pathology of gastric cancer which may be useful for the detection, diagnosis, and treatment.