流感病毒RNA聚合酶PA亚基重组质粒pQE32一PA一2转化效率的实验研究

目的 将甲型流感病毒RNA聚合酶PA亚基的基因工程重组质粒PQE32一PA一2转化入受体菌，并优化转化条件，以建立其高效、快速的转化体系。方法 以大肠杆菌DH5α菌株为受体菌，研究了氯化钙溶液浓度(0、25、50、75、100、l50mmol／L)，热休克温度(0、30、37、42、50℃)，转化时间(7、l5、30、45、60、75、90、105、120min)及转化后的温浴时间(0、0．5、l、1．5、2hr)对基因工程重组质粒pQE32一PA一2转化效率的影响。结果 氯化钙溶液浓度及热休克温度对转化效率的影响极为显著，转化时间在一定范围内对转化效率有明显的影响，而转化后的温浴时间对转化效率的影响不明显。结论 在本实验条件下，以75mmol/L氯化钙制备感受态细胞，转化30分钟，经42℃热休克作用90秒后直接涂平板选择转化子，可获得高效、快速的转化效果。     

流感病毒RNA聚合酶的分离与纯化

目的：建立分离、纯化流感病毒RNA聚合酶PB1、PB2和PA 3P蛋白的有效方法,为进一步研究3P蛋白的结构和功能奠定基础。方法：用甘油、CsCll及CsTFA不同介质的密度梯度超速离心法进行分离,用SDS-PAGE电泳及Western blot法检测3P蛋白,用尿素变性PAGE检测vRNA。结果：用甘油密度梯度离心,可从病毒粒子中分离由NP、3P和RNA组成的RNP。将纯化的RNP用CsCl和甘油双组分不连续密度梯度离心,可形成NP和3P-RNA两部分,使NP与3P-RNA分离。进一步将3P-RNA在CsTFA-甘油双组分不连续密度梯度介质中进行超速离心,可有效地将3P与RNA分离,获得较纯的3P蛋白。3P位于离心管的上半部分,而RNA则位于离心管的近底端部可有效地将3P与PNA分离,获得较纯的3P蛋白。3P位于离心管的上半部分,而RNA则位于离心管的近底端部分。结论：用甘油、CsCl-甘油和CsTFA-甘油分步超离心法可有效地从流感病毒粒子中纯化出离纯度的流感病毒RNA聚合酶。     

人绒毛膜促性腺激素α亚基cDNA克隆、表达及纯化

目的 从人绒毛膜组织中克隆人绒毛膜促性腺激素α亚基(HCGα)cDNA，构建表达载体并进行了表达、纯化，为进一步研究HCGα在多种肿瘤及异常妊娠中的作用作前期准备。方法 提取新鲜人绒毛膜组织总RNA，利用RT—PCR技术扩增出HCGα cDNA，克隆于表达载体PGEX4T-1，酶切鉴定后测序，测序证实序列正确，并转化大肠杆菌BL21，IPTG诱导表达融合蛋白GST-HCGα。超声破菌后上清经谷胱甘肽Sepharose 4B亲和层析纯化，沉淀包涵体经变性：透析复性等处理，用SDS—PAGE电泳、Western印迹分析产物。结果 琼脂糖凝胶电泳结果显示RT—PCR扩增片段大小约280bp，同预计片段相符。SDS—PAGE电泳显示诱导表达的产物经初步处理后有36kd左右的一条明显新增条带，与预期分子量相符，Western印迹证实此结果。融合蛋白主要以包涵体形式存在。结论 成功地从人绒毛膜组织中克隆出HCGα cDNA，克隆基因在大肠杆菌中获得了较高水平的表达，表达产物有较好的免疫特异性。     

具有野生起点的丙型肝炎病毒RNA依赖的RNA聚合酶表达质粒的构建

目的 构建具有野生起点的丙型肝炎病毒ＲＮＡ依赖的ＲＮＡ聚合酶表达载体。方法 根据疏水性分析选定待表达的丙型肝炎病毒非结构基因５ｂ区大部分基因。以聚合酶链反应扩增泛素基因,逆转录－聚合酶链反应扩增丙型肝炎病毒ＲＮＡ依赖的ＲＮＡ聚合酶基因。限制性酶切长度多态性分析重组克隆,并以ＤＮＡ序列分析方法最终确认。     

HIV-1基因限制性显示片段的克隆与序列分析

目的　克隆并分析经限制性显示－聚合酶链反应（ＲＤ－ＰＣＲ）扩增的ＨＩＶ－１基因片段。方法　将所有ＨＩＶ－１基因片段 分成１０组并进行ＲＤ－ＰＣＲ扩增,纯化各组ＰＣＲ产物后将之克隆至Ｔ载体上并快速鉴定。从阳性克隆中提取质粒,扩 增靶片段并测序。结果　序列分析表明,所扩增的片段均属于ＨＩＶ基因。结论　改良了一种多片段的克隆及鉴定方法并 用于限制性显示扩增片段的克隆。     

pSIREN/PB1 siRNA重组质粒抗甲型流感病毒研究

目的研究重组质粒pSIREN/PB1在鸡胚尿囊液中干扰甲型流感病毒复制的效果。方法设计1对编码PB1siRNA的寡核苷酸序列,经退火互补形成双链,再克隆至带有U6启动子的RNAi ready pSIREN-shuttle线性化载体,转化大肠杆菌JM109感受态细胞,双酶切和测序鉴定重组质粒pSIREN/PB1。大量提取重组质粒pSIREN/PB1,用脂质体进行包裹后,按每只鸡胚90μg质粒量接种于10日龄鸡胚尿囊腔,4血凝单位甲型流感病毒液分别于质粒接种后0h、24h、48h接种于鸡胚尿囊腔,流感病毒接种48h后收集无色澄清尿囊液进行血凝实验检测流感病毒效价。结果甲型流感病毒PB1基因的siRNA编码序列成功克隆至pSIREN质粒载体。经酶切和测序分析,重组质粒pSIREN/PB1中的siRNA编码序列均完全正确。将脂质体包裹的pSIREN/PB1质粒和病毒液同时注射入鸡胚尿囊腔后,收获的甲型流感病毒效价最低。结论成功构建了表达甲型流感病毒PB1siRNA的重组质粒pSIREN/PB1,并且它可以抑制鸡胚中流感病毒复制。此研究进一步证实了RNA干扰对流感病毒复制的抑制作用,为开发流感基因防治新方法奠定了基础。     

生殖支原体粘附蛋白基因片段的克隆和表达

生殖支原体粘附蛋白基因片段的克隆和表达张秀英孔繁荣朱学骏陈洪生殖支原体细胞膜有顶端结构表面覆有绒毛样物质，可能是致病的主要原因，具有粘附功能的粘附蛋白位于细胞膜的顶端结构中［１］。我们根据粘附蛋白的已知基因序列设计了一对引物，扩增得到了编码为生殖支原...     

HIV—1基因限制性显示片段的克隆与序列分析

目的：克隆并分析经限制性显示－聚合酶链反应（RD－PCR）扩增的HIV－1基因片段。方法：将所有HIV－1基因片段分成10组并进行RD－RCR扩增,纯化各组PCR产物后将之克隆至T载体上并快速鉴定。从阳性克隆中提取质粒,扩增靶片段并测序。结果：序列分析表明,所扩增的片段均属于HIV基因。结论：改良了一种多片段的克隆及鉴定方法并用于限制性显示扩增片段的克隆。     

NMDA受体亚基NR1的体外表达及功能检测

目的：体外表达ＮＭＤＡ受体亚基ＮＲ１并了解其电生理学特性,探讨体外表达受体亚基的意义。方法：将克隆的ＮＭＤＡ受体亚基ＮＲ１质粒ＤＮＡ经体外转录成ＲＮＡ,显微注射到爪蟾卵母细胞后进行受体表达,采用双电极电压钳位技术记录表达的ＮＲ１亚基的激活电流。结果：注射ＮＲ１亚基ＲＮＡ的爪蟾卵母细胞能表达出具有电生理学功能的受体,其激活电流能被Ｄ－ＡＰ５阻断等特性,说明该表达的ＮＲ１亚基具有ＮＭＤＡ受体的功能。结     

2009年新型甲型H1N1流感病毒聚合酶编码基因进化分析

目的:探讨2009年新型甲型流感病毒(A/H1N1)聚合酶PA、PB1和PB2编码基因的进化规律。方法:从NCBI流感病毒基因数据库下载2009年新型甲型H1N1流行株的PA、PB1和PB2聚合酶编码基因序列以及人、猪和禽流感病毒相应的参考序列,采用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0（MEGA4.0）软件比对和修剪此次流行株的代表序列及所有参考株序列并构建系统树,再比对和修剪此次流行株的代表序列及人A/H1N1病毒各年代(1918~2008年)参考序列并构建系统树,同时比对此次流行株的代表序列及人A/H1N1各年代(1918~2008年)参考序列编码PB2蛋白的氨基酸序列。结果:不同地区分离的2009年新型甲型H1N1流感病毒的聚合酶PA、PB1和PB2编码基因均具有高度同源性,并聚集在一个独特的进化支上,与猪流感病毒对应基因接近。三者均与2005年美国爱荷华州分离的人A/H1N1病毒基因(A/Iowa/CEID23/2005/H1N1)具有高度的相似性。2009年新型甲型H1N1流感病毒、2005年美国爱荷华州流行的H1N1 (DQ889682)病毒PB2蛋白第627位氨基酸与禽类流感病毒相同,均为谷氨酸,而与其他人A/H1N1 (1918~2008年)病毒的赖氨酸不同。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒聚合酶基因可能来源于2005年美国爱荷华州分离的人A/H1N1病毒,禽流感病毒可能参与了聚合酶基因的重排过程。     

人禽流感H5N1毒株PB1基因突变分析

目的 通过对人禽流感H5N1毒株PB1基因序列的变异分析,揭示毒株PB1基因的特征与进化.方法 检测广东地区人禽流感H5N1毒株PB1基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PB1基因序列,采用DNA Star Lasergene软件对检索的人禽流感H5N1毒株PB1基因核苷酸序列进行比对和分析,并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析.结果 将50株毒株PB1基因核苷酸序列按同源性分成两组:1997-1998年毒株为第1组(G1),2003-2006年毒株为第2组(G2).PB1基因74个氨基酸发生位点置换,占9.78%(74/757).PB1基因Ks值为26.1×10-6～39.8×10-6Nt/d,Ka值为3.91×10-6～5.59×10-6 Nt/d,检验结果显示,基因进化受到负选择性压力.2003-2006年毒株(G2)丢失G757,引起氨基酸结构改变;同时糖基化位点也较1997-1998年毒株减少了1个糖基化位点NES382-384.结论 目前PB1基因进化分成两组,自发突变作用影响PB1基因进化;PB1基因与PB2基因的进化途径在时间特征和区域特征方面类似.2003-2006年毒株PB1基因氨基酸结构和糖基化位点均有改变.     

Emergence of truncated PB1-F2 protein of H3N2 influenza virus during its epidemic period in Jiangsu Province, China

Background PB1-F2 protein has been proven to increase the pathogenicity of influenza A virus （IAV） strains in primary infection and in secondary bacterial infection. It can also regulate the activity of viral polymerase. However, it was shown in another retrospective study that a portion of IAVs do not express full-length PB1-F2 protein during virus development; different kinds of stop codons cause exits in the open reading frames and form PB1-F2 gene products with the corresponding genotypes. Truncated PB1-F2 in human H3N2 IAVs has long been detected in North America but its evolution in China is still unclear. Methods Influenza-like illnesses （ILls） from the whole of Jiangsu Province were collected and inspected to determine the type and subtype of the viruses. A portion of isolates collected in the epidemic period were selected as samples for later whole-genome sequencing, and the exact sequences were determined and analyzed. Results H3N2 influenza virus was one of the epidemical strains which had been prevalent during 2009-2010, in Jiangsu. Five H3N2 isolates with truncated PB1-F2 protein （25aa） were detected in influenza samples from Nanjing and Xuzhou, while seven similar H3N2 isolates were also reported in Niigata, Japan. Conclusion This emergence indicates the possibility that there has been transmission of the H3N2 virus between the two countries.     

A型流感病毒核蛋白原核表达载体的构建与表达

目的:构建A型流感病毒核蛋白(NP)的原核表达质粒,分析其在大肠杆菌中的表达状况.方法:采用逆转录聚合酶链式反应技术从A型流感病毒基因组中扩增出编码核蛋白的基因片段,克隆至pGEM-T Easy载体,PCR筛选阳性克隆并测序.经酶切后将目的片段亚克隆至表达载体pGEX-4T-1,转化大肠杆菌BL2(CDE3),PCR和酶切鉴定转化菌落.将阳性菌落经异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)诱导,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳和免疫印迹分析目的蛋白的表达.结果:RT-PCR扩增出NP基因序列,将其亚克隆至表达载体pGEX-4T-1构建成重组表达质粒,并在BL2(CDE3)中表达了NP融合蛋白.结论:成功构建A型流感病毒NP的重组表达质粒,并在大肠杆菌中表达了NP融合蛋白.     

甲型H1N1流感病毒裂解疫苗与流行性感冒裂解疫苗同期接种不良反应的对比分析

目的通过比较甲型H1N1流感病毒裂解疫苗(甲流疫苗)和流行性感冒裂解疫苗(普流疫苗)同期接种的不良反应,分析甲流疫苗的安全性。方法收集2种疫苗接种记录,对其中记录的不良反应进行流行病学统计分析。结果甲流疫苗接种156 738人次,发生不良反应18人,发生率11.48/10万;普流疫苗接种116994人,发生不良反应7人,发生率5.98/10万。分析发现,甲流疫苗接种的不良反应发生率与全国水平、普流疫苗相当;此外2种疫苗接种的不良反应在职业、年龄及性别分布上相同;2种疫苗的不良反应发生率在16～25岁年龄段、学生中较高,且有随着年龄段的升高,发生率有下降的趋势(rs=-0.999,P<0.001)。此外,2种疫苗接种后发生不良反应的临床症状除肌肉痛外,其余症状的发生无统计学差别。结论综上所述,甲流疫苗临床观察时间短、接种后有发生不良反应的可能,但总体来看,接种甲流疫苗是安全有效的,能有效保护甲流的易感人群。     

流感病毒H1N1感染后宿主细胞MTH1基因表达的研究

目的 观察H1N1型流感病毒诱导的MDCK细胞抗氧化相关修复基因MTH1表达量的变化.方法 MDCK细胞培养后,H1N1型流感病毒感染0、1、3、6、12、24、48 h,在各时间点经RT-PCR反应检测细胞内MTH1基因的相对表达量.结果 甲型H1N1流感病毒感染后0、6、12 h,MTH1基因的表达量与正常对照组差异无统计学意义;感染后1、3 h MTH1基因的表达量显著高于正常对照组;感染后24、48 h表达量显著低于正常对照组.结论 H1N1流感病毒感染细胞的MTH1基因表达的增加,可能增加细胞对DNA氧化损伤的修复能力,在流感发生和防御机制中起到作用.     

3种核酸提取方法检测甲型H1N1流感病毒的比较

目的选择常见的3种核酸提取方法,比较其对低拷贝数甲型H1N1流感病毒核酸检测的敏感性差异,为实验室应用和结果的评价提供依据。方法对已确定阳性的甲型H1N1流感病毒标本,作10^-1～10^-4系列稀释,选用Promega公司全自动核酸提取仪及配套试剂盒、QIAGEN公司Rneasy Mini Kit和国产H公司提取试剂盒3种核酸提取方法提取上述标本核酸模板,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（荧光RT—PCR）对其进行评价。结果在对不同拷贝数流感病毒的检测中,3种核酸提取方法以Promega公司全自动核酸提取仪提取效率最高,以此提取效率作为100％,则QIAGEN Rneasy Mini Kit和国产H公司提取试剂盒的平均提取效率依次为83．27％、55．70％。经方差分析,3种方法之间存在显著性差异（P〈0．05）。结论各试剂之间提取核酸的效率存在显著差异,建议根据实际情况采用合适的核酸提取试剂和方法。     

广州地区新型甲型H1N1流感患者病毒RNA检出率与病程关系的研究

目的 探讨2009年新型甲型H1N1流感患者病毒RNA检出率与人群年龄分布和病程变化的关系.方法 选取广州地区新型甲型H1N1临床病例共248例,对151例进行病程动态咽拭子采样833份,统计分析患病人群年龄分布和采用荧光定量RT-PCR方法对不同病程的患者咽拭子标本进行甲型HINl流感病毒RNA的检测,并采用趋势x~2检验探讨标本阳性率与不同发病时间的关系.结果 发病人群以青壮年为主,主要集中在10～20岁(57.26%)和20～30岁(22.18%)两个年龄段.对咽拭子标本阳性率随发病时间的变化进行趋势x~2结果显示标本阳性率随着病程的延长而下降(x~2=9.784,P=0.002).讨论此次研究表明新型H1N1流感患者主要集中在青壮年人群中,且有最长可达10天以上的病程,标本阳性率随着病程的延长而下降.

Abstract：

Objective To study the relation of the detection rates of the novel influenza virus A/H1N1 RNA in clinically confirmed patients in the 2009 pandemic with the age distribution of the patients and the disease course. Methods A total of 151 clinical patients with H1N1 infection were enrolled in this study, from whom 833 dynamic throat swab samples were obtained for detecting the H1N1 RNA using real-time PCR. A statistical analysis of the age distribution was performed among the patients with different disease courses. Chi-square for trend test was used to study the correlation between the detection rates of H1N1 RNA and the time of disease onset. Results The majority of patients were young with their ages ranging from 10 to 20 years (57.26%) and 20 to 30 years (22.18%). Chi-square for trend test revealed that the positivity rates of the throat swabs in the patients decreased with the prolongation of the disease course (x~2=9.784, P=0.002). Conclusion Most of the H1N1 patients are young within the age range of 10-30 years, and the longest disease course can exceed 10 days. The positivity rates of throat swabs from the H1N1 patients decreases with the prolongation of the disease course.