ISSR在蝴蝶兰亲缘关系分析中的初步应用

通过对退火温度、镁离子浓度、聚合酶浓度等因素进行优化,建立了适合蝴蝶兰ISSR分析的优化反应体系,并将此体系用于分析22个蝴蝶兰品种/品系.从80个引物中筛选出14个引物,共扩增出188条片段(多态性条带比例为84%),表明供试品种/品系间具有丰富的遗传多态性.并且检测出了19条品系特异性条带,可用来鉴定供试蝴蝶兰中的11个品系.22个品种/品系在遗传距离L=0.254处可分为8个组,两个最大的组分别代表红色系和白色系,可见聚类情况与花色特征比较一致.     

利用ISSR分析6种绞股蓝属植物的遗传多样性与亲缘关系

目的 对绞股蓝属(Gynostemma BL.)6种植物的遗传多样性与亲缘关系进行分析.方法 利用ISSR标记技术对57条引物进行初筛,选择其中适合的11条引物对材料进行遗传多样性分析,并根据遗传距离构建UPGMA聚类图.结果 11个ISSR引物共检测到120个位点,平均每个引物检测到10.91个位点,多态性比率(PPB)达到98.33%,6个物种的多态性比率分布于34.17%～1.67%之间,Shannon信息指数(Ⅰ)为0.414 5,Nei's基因多样性指数(He)为0.2707,G.pentaphyllum,G.Ccardiospermum,G.longipes,G.yixingense,G.laxuflorum的分类处理与形态学研究结果基本一致,G.pentagynum与G.longipes遗传距离最近.结论 ISSR分子标记适合于绞股蓝属植物遗传多样性研究.     

樱属植物核型参数及种间亲缘关系分析

统计了18份樱属植物的核型数据,借助DPS软件用最大距离法进行聚类分析,探讨了属内系统结构和种间亲缘关系。结果表明:樱属染色体基数x=8,染色体数目有2n=16、2n=24以及2n=32;染色体类型有4种,正中部着丝点染色体(M),中部着丝点染色体(m),近中部着丝点染色体(sm),近端部着丝点染色体(st);随体常见,核型类型有2A、2B、1B 3种;野生类群多为二倍体,栽培品种多倍化现象显著;大叶早樱(Cerasus subhirtella)、‘十月樱’(C.subhirtella‘Autumnalis’)、东京樱花(C.yedoensis)、山樱花(C.serrulata)聚为一类,支持黑果组(C.sect.Sargentella)成立;二倍体酸樱桃(C.vulgaris)、甜樱桃(C.avium)聚为一类,支持芽鳞组(C.sect.Cerasus)成立;虽然红山樱(C.jamasakura)与山樱花表型相似,但聚类结果显示二者遗传距离较远,前者与钟花樱(C.campanulata)遗传距离较近;本属栽培种类多倍化程度高于野生种类且有多个倍性,与其二倍体祖先表现出较远的遗传距离;聚类分析难以解释栽培种的起源。与传统的经典分类结果不同,矮生樱亚属(C.subg.Microcerasus)与典型樱亚属(C.subg.Cerasus)在聚类图上没有明显地分开。     

果蝇姊妹种间亲缘关系的聚类分析

本文以聚丙烯酰胺凝胶电泳（ＰＡＧＥ）技术分析了金色果蝇复合种（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａａｕｒａｒｉａｓｐｅｃｉｅｓｃｏｍｐｌｅｘ）的５个姊妹种共１７个地理种群及其它种类的５个地理种群的８种同工酶酶谱，根据其中７种酶（Ａｍｙ、Ａｏ、Ｅｓｔ、α－Ｇｐｄｈ、Ｍｄｈ、Ｍｅ、Ｔｙｒ、Ｔｏ）的条带特征按Ｆｏｒｇｕｓｏｎ及Ａｑｕａｄｏ　＆Ａｖｉｓｅ的公式分别计算遗传相似系数及遗传距离，以类平均法（ＵＰＧＭＡ）进行了聚类分析，绘制出８个种类共２２个地理种群的生化系统树，结合姊妹种间无选择杂交可能组合的结果讨论了ａｕｒａｒｉａｓｐｅｃｉｅｓｃｏｒｎｐｌｅｘ各姊妹种间的亲缘关系、种化模式及分布在日本Ｋａｍｅｔｏｋｕ岛上的Ｄ．ｔｒｉａｕｒａｒｉａ发生分化的可能性。     

甘肃南部双盾木属植物的ISSR分析

采用ISSR技术分析了甘肃南部分布的4种双盾木的遗传多样性和遗传分化．根据研究结果,指出4种双盾木属总的多态位点百分率（PPB）很高,达100％。其遗传多样性很丰富,但在种间的分布是不均匀的,结果与Nei’s基因多样度和Shahnon信息指数的遗传多样性分析结果一致,根据非加全算术平均聚类法以及ISSR特征图谱可以将不同种区分开来,得出ISSR分子标记可很好地用于双盾木属的分子鉴定和遗传背景研究的结论。     

贵州报春花属植物的新分布

通过标本鉴定和查阅相关资料,发现了贵州报春花科Primulaceae报春花属Primula植物的6个新分布种,它们是广东报春Primula kwangtungensis W.W.Sim、倒卵叶报春P.rugosa Balakr.、香海仙报春P.wilsonii Dunn、霞红灯台报春P.beesiana Forr.、中甸海水仙P.monticola （Hand.-Mazz.） Chenet C.M.Hu和香花报春P.aromatica W.W.Smith et Forr.。     

4种木麻黄亲缘关系的RAPD分析

应用RAPD枝术对普通木麻黄(Casuarina equiseti folia)，粗枝木麻黄(C.gluca)，细枝木麻黄(C．cunninghamaina)和滨海木麻黄(Allocasuarina littoralis)的亲缘关系进行分析，从40个引物中筛选出18个重复性好、稳定性高的有效引物．18个有效引物共扩增出690条DNA带，其中多态性条带318条，占总扩增条带的46．09％．对扩增出来的690条DNA带进行聚类分析，结果表明：木麻黄属(Casuarina)的普通木麻黄、粗枝木麻黄和细枝木麻黄的平均遗传距离为0．30，其中细枝木麻黄和粗枝木麻黄的遗传距离特别小，为0．19；而异果木麻黄属(Allocasuarina)的滨海木麻黄与其他3种木麻黄的平均遗传距离为0．65．RAPD聚类分析结果表明，4种木麻黄之间的亲缘关系与血清学和化学分类学的结果一致，说明RAPD分子标记技术适用于木麻黄植物的遗传多样性研究．     

报春花科5种植物的花粉形态研究

利用扫描电子显微镜首次对报春花科3属5种植物的花粉形态进行了观察研究，报道了花粉形态特征。探讨了花粉形态特征在分类学上的意义。结果表明花粉形态、大小和萌发沟及外壁雕纹可作为属和种的分类依据。     

四棱豆属7个栽培种ITS序列亲缘关系分析

对四棱豆属栽培品种nrDNA ITS序列进行克隆测序,并进行序列比较与品种间亲缘关系分析.结果表明:(1)供试品种间ITS序列的变异小,GC含量低,为51.4%～51.6%.(2)供试四棱豆品种间遗传变异范围在0.0000～0.0009,表明四棱属内nrDNA ITS区存在一定的遗传变异,但变异较低,表明供试材料间亲缘...     

10种卷柏属药用植物的红外光谱鉴别及部分种间亲缘关系探讨

利用红外光谱技术对卷柏属10种药用植物进行了比较鉴定研究.结果表明,10种植物样品通常具有10个共有红外吸收峰,但又具有各自的特征吸收峰(卷柏、垫状卷柏、疏叶卷柏、细叶卷柏、异穗卷柏等),或所有吸收峰的组合具有种间特征性.可利用整体峰形及吸收峰的数目、位置(cm~(-1))、强度等特征,尤其是指纹区(1 250～400 cm~(-1))的上述特征,对各个种进行有效的鉴别.根据光谱图的相似程度,推测异穗卷柏Selaginella heterostachys、细叶卷柏S.labordei及伏地卷柏S.nipponica之间具有较密切的亲缘关系,江南卷柏S.maellendorffii与中华卷柏S.sinensis的关系也较接近;并结合形态解剖学等方面的差异,提出将薄叶卷柏的变异类型作为它的一个变种处理.研究证实,红外光谱操作简便、快速,可有效辅助用于近缘植物种的分类鉴定,辅助解决鉴定中的某些疑点问题,推断部分种间的亲缘关系.     

利用ISSR分析野生蘑菇与双孢蘑菇的遗传多样性

利用ISSR分子标记对一批野生蘑菇进行分子鉴别，从选用的60 个ISSR 引物中，筛选出11 个引物，对供试的14个菌株基因组DNA 进行扩增，获得的指纹图谱清晰稳定、多态性强.结果表明，在获得的116个条带中，74.1％是多态性条带,相似系数从0.32到0.72.用NTSYS 软件进行聚类分析，野生蘑菇与双孢蘑菇的相似系数较低，最高的仅在0.7的水平上.研究结果表明，该批野生蘑菇有明显的遗传多样性，可以作为蘑菇杂交育种的资源.     

藜豆种质资源遗传多样性的ISSR分子标记分析

利用ISSR标记构建了9份藜豆种质的指纹图谱,并对其遗传多样性进行评价。结果表明,从35条引物中筛选出8条重复性好的多态性引物进行PCR扩增,共扩增出64条带,其中多态性条带50条,多态性比例为78.1%。应用其中3条多态性ISSR引物(UBC889、UBC812、UBC825)的12条特异性条带,可以有效区分供试的9份藜豆种质资源。藜豆种质间的遗传相似系数变化范围在0.47⁰.97之间。利用UPGMA聚类分析,在相似性系数为0.73处可将9个藜豆种质资源划分为3个类群,其亲缘关系与种质地理来源之间存在一定关联性。     

我国东部6个鸭儿芹群体遗传多样性的ISSR分析

基于ISSR分子标记,对采自浙江磐安大盘山、临安清凉峰、临安昌化、金华北山双龙洞附近、金华北山朝真洞附近和上海奉贤(栽培)的6个鸭儿芹(Cryptotaenia japonica Hassk.)群体的70个样本进行了遗传多样性分析.从9条筛选出的ISSR引物共扩增出149条带,其中136条具有多态性,多态性条带百分率为91.28%.基于ISSR标记计算了6个鸭儿芹群体的遗传多样性指数,发现它们的Nei的基因多样性指数(H)为0.1971,Shannon信息多态性指数(I)为0.3086,Nm指数为0.3343.6个群体遗传分化系数Nm为0.5993,表明59.93%的遗传分化存在于群体间,40.07%的遗传分化存在于群体内,群体群体间的基因流为0.3237,表明供鸭儿芹群体之间基因流较小,遗传漂变已造成鸭儿芹群体之间较强的遗传分化.基于136个位点,构建了反映各样本间遗传亲缘关系的系统聚类图,结果表明,从70个样本中可以区分出5个类群,其中金华北山采的两个群体为一个类群,与地理位置有很强的对应性.因此,在今后的鸭儿芹引种栽培时,应注意从不同产地的鸭儿芹种源中进行引种,以丰富栽培种的遗传多样性.     

ISSR标记在辣椒资源遗传多态性分析中的初步应用

用筛选到的12个ISSR(InterSimpleSequenceRepeat)引物对我国11个辣椒农家品种进行扩增,结果共扩增出66条带,其中差异条带26条,多态条带比率(PPB)为39.39%;品种特异条带7条,占总条带数的10.61%.基于Jaccard遗传相似性系数的NeighborJoining聚类分析将11个品种分为两组,这两组辣椒品种内部的平均遗传距离分别为0.150和0.134,两组之间的遗传距离为0.194.以扩增条带表型为基础的主成分分析显示:有2个主成分累计贡献率为68.88%,分别占到57.51%和11.37%;以这2个主成分对11个辣椒品种作图,可以将11个辣椒品种分为两组,每组所含辣椒品种与聚类分析的结果相同.     

濒危植物五小叶槭(Acer pentaphyllum Diels)天然种群遗传多样性的ISSR标记分析

五小叶槭(Acer pentaphyllum Diels)是中国四川特有野生珍稀濒危植物,仅分布于雅砻江中上游干旱河谷地带;探索其遗传多样性特征可以为其遗传资源的保护和利用提供理论依据.本文采用ISSR技术对五小叶槭的5个野生种群的44份材料进行遗传多样性分析,8条引物总共检测到38个位点,其中多态性位点35个,多态位点百分率(PPL)平均为90.21%.应用分析软件Popgen32分析得出:在物种水平上,五小叶槭的香农多样性指数(I)为0.3924,Nei氏基因多样性指数(H_e)为0.2498;种群间基因分化系数(G_(st))为0.3722,种群间的基因流(N_m)为0.8433,这表明五小叶槭的遗传变异主要存在于种群内.在种群水平上,香农多样性指数(I)为0.2125, Nei氏基因多样性指数(H_e)为0.1456.结果表明木里、九龙三垭宫和康定这3个种群的遗传多样性水平较高,而雅江和九龙洛莫种群遗传多样性较低.通过Mantel检测,种群间遗传距离和地理距离之间没有显著相关性.