2021年洛阳市食源性疾病沙门氏菌血清型、耐药及分子分型研究

目的 分析2021年洛阳市食源性疾病沙门氏菌血清型、耐药以及PFGE型别。方法 对2021年洛阳市食源性疾病沙门氏菌进行血清分型、用微量肉汤稀释法进行药敏实验，采用BioNumerics 7.6软件对PFGE酶切片段聚类分析。结果 2021年洛阳市共监测375份标本，检出沙门氏菌46株（12.37%）,20岁以下人群阳性率最高（45.65%），阳性病例主要集中在第2和第3季度（80.43%）；肠炎沙门氏菌为主导血清型，共有15种血清型；氨苄西林耐药率最高（91.30%），其次是萘啶酸（82.61%），多重耐药菌株占比66%;PFGE分型获得27种带型，27株肠炎沙门氏菌相似度在79.1%～100%，优势带型为DX16，包含10株菌。结论 洛阳市2021年沙门氏菌性食源性疾病中的优势血清型是肠炎沙门氏菌，菌耐药状况较为严重，PFGE条带既有优势带型又呈现多态化。     

液相悬浮芯片技术在沙门氏菌血清分型中的应用优势

目的探讨液相悬浮芯片技术对食品风险监测和哨点医院食源性疾病监测中分离的沙门氏菌株血清型别鉴定的可行性及适用性。方法对已分离出的沙门氏菌用传统玻片凝集试验进行血清分型,同时采用液相悬浮芯片技术对沙门氏菌的O抗原、H抗原、AT抗原基因进行分型鉴定。结果 2012—2019年共收集沙门氏菌215株,可分出38种血清型,其中96%可用液相悬浮芯片技术进行完整分型,且与传统血清凝集结果相符。其中有11株不能用玻片凝集法分型的沙门氏菌,有8株用SSA试剂盒能成功分型。结论液相芯片技术具有高通量、高灵敏度、高特异性等优点,可在短时间内完成常见沙门氏菌血清型的鉴定。相对传统血清凝集法在检测时间上有明显优势,特别是在处理沙门氏菌暴发疫情时,对沙门氏菌血清快速分型至关重要。     

珠海市沙门氏菌性食源性疾病情况分析

目的 了解珠海市食源性疾病中沙门氏菌的检出及菌株血清型变化等情况。方法 采集食源性疾病相关样品按WS/T13-1996和GB／T4789．4-2003进行检测。结果 珠海市2003～2004年食源性疾病中检出沙门氏菌54株，主要在2～3月和6～9月食源性疾病相关样品检出，经血清学分型鉴定有8种血清型。结论 由沙门氏菌引起的食源性疾病在珠海市有两个多发季节(梅雨季节和夏季)，菌株具有血清型多样化的特点，有一定的年度差异。     

2016-2020年天津市滨海新区食源性疾病主动监测沙门氏菌分析

目的 分析天津市滨海新区食源性疾病主动监测沙门氏菌病原学及流行病学特征。方法 对2016-2020年滨海新区食源性疾病主动监测病例粪便标本培养并分离出的沙门氏菌，按照《国家食源性疾病监测工作手册》中规范程序开展血清型鉴定及药敏试验。结果 2 726例食源性疾病主动监测病例检出沙门氏菌阳性131例，检出率4.81%,2020年最高，为11.79%。0～5岁组检出率最高，为10.91%。优势血清型为肠炎沙门氏菌及鼠伤寒沙门氏菌，分别占47.33%和13.74%。131株沙门氏菌耐药率较高的为萘啶酸48.09%、氨苄西林47.33%、四环素34.35%，耐药率较低的为亚胺培南1.53%、阿奇霉素1.53%、头孢西丁2.29%。109株为耐药菌株，占83.21%。结论 滨海新区食源性疾病主动监测病例中沙门氏菌检出率以0～5岁儿童较高，耐药情况较严重，应持续动态监测沙门氏菌血清分型及药敏结果。     

2017-2021年河南省洛阳市腹泻患者沙门氏菌血清型分布及耐药与分子分型研究

目的 分析河南省洛阳市腹泻患者沙门氏菌的血清型分布、耐药状况及分子分型，为食源性疾病防控工作提供依据。方法 收集2017-2021年洛阳市2家哨点医院944份腹泻患者粪便样本，进行沙门氏菌的分离鉴定和血清学分型；采用微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性试验，通过脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分子分型聚类分析。结果 944份样本共检出70株沙门氏菌，检出率7.4%，其中3岁以下患者最常见（37.1%）。共鉴定出17个血清型，肠炎沙门氏菌占据优势，占47.1%。对氨苄西林和萘啶酸的耐药率最高，分别为85.7%和78.6%；有12株菌对10种及以上抗生素全耐药，仅亚胺培南对所有菌株均敏感；多重耐药菌共59株，占84.3%。PFGE聚类分析相似度为49.2%，分为43种型别，部分不同血清型沙门氏菌PFGE型别相似。结论 洛阳市腹泻患者检出的沙门氏菌血清型和基因型呈现多样化，存在多人感染同一基因型的情况，菌株多重耐药情况严重。     

2013-2020年福建省泉州市食源性疾病沙门氏菌血清型及耐药分析

目的 分析2013-2020年福建省泉州市食源性疾病病例监测中所检出的沙门氏菌血清型,并分析耐药性。方法 选择2013-2020年福建省泉州市食源性疾病监测哨点医院采集的从腹泻患者生物标本中分离的沙门氏菌株115株,采用玻片凝集方法进行沙门氏菌血清型鉴定,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果 血清型鉴定表明分属于5个血清群,包括B群(73.04%)、C1群(3.48%)、C2群(4.35%)、D群(15.65%)及E1群(2.61%);包含24种血清型,以B群血清型检出最多(9种,占37.50%),其中主要血清型为圣保罗沙门氏菌(27.83%)、鼠伤寒沙门氏菌(26.09%)以及阿雷查瓦莱塔沙门氏菌(9.57%)。分离的菌株对12种抗生素产生耐药,其中对头孢唑林、阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素4种抗生素全部耐药。结论 2013-2020年福建省泉州市食源性疾病监测哨点分离的沙门氏菌血清型分布呈多态性,对多种抗生素产生较高的耐药性。     

沙门菌血清分型和脉冲场凝胶电泳分子分型在流行病学调查中的应用

沙门菌造成的食物中毒和食源性疾病暴发是全球性的公共卫生问题.对人感染的沙门菌进行血清分型,进一步对同一血清型菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型,可以增强识别食源性疾病暴发的能力,发现暴发病例,掌握流行趋势,追溯感染源头.此文对沙门菌血清分型和脉冲场凝胶电泳分子分型的研究进展及应用作了综述.     

龙湾区副溶血性弧菌血清分型和耐药性研究

目的:掌握龙湾区副溶血性弧菌的血清型分布及耐药水平,为防治副溶血性弧菌所致食源性疾病的发生,指导临床合理用药提供依据。方法:对检出的副溶血性弧菌采用血清凝集试验进行血清分型;采用K-B法进行药敏试验。结果:2009年-2010年分离得到的47株副溶血性弧菌中1,9株食物中毒株中完全分型18株,共分出4个血清型,以O3群、O4群为主,占47.4%和36.8%;28株食品污染物株中完全分型28株,共分出6个血清型,以O1群为主,占32.1%。对头孢曲松等10种抗生素完全敏感。结论:要重点防治由O3群、O4群及抗生素耐药的副溶血性弧菌引起的食源性疾病。     

沙门氏菌在食品与食源性疾病中分布及病原特征分析

目的 了解食品中沙门氏菌的污染状况及食源性疾病中沙门氏菌的发病率,探讨食品与食源性疾病的相关性,为更好的预防食源性疾病提供科学依据。方法 采用分离培养方法及生化实验进行沙门氏菌检测鉴定,并应用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验、玻片凝集法进行血清学试验及PFGE方法进行分子分型。结果 80件生禽肉中检出沙门氏菌21株,阳性率为26.3%;60件生畜肉中检出4株,阳性率为6.7%,两者差异有统计学意义(χ²=9.885,P=0.002)。采集1 230件腹泻患者肛拭子,检出沙门氏菌80株,阳性率为6.5%,沙门氏菌血清型以鼠伤寒和肠炎沙门氏菌为主,药敏结果显示食品和患者肛拭子中检出的沙门氏菌都对AMP、NAL、SUL、STR耐药比较严重,而对CAZ、CFX、GEN、IMI、AZI、CT、PB、AMI、MEM、KAN都比较敏感,PFGE分子分型结果显示食品与患者中检出的部分沙门氏菌有100%同源性。结论 上海市松江区生禽肉中沙门氏菌污染严重,食品和患者中部分菌株具有同源性,结果提示食品与食源性疾病有一定的相关性,同时为食品安全风险监测提供基础数据。     

食品中沙门氏菌血清及PFGE分型研究

目的了解吉林省食品中分离的沙门氏菌血清型与脉冲场凝胶电泳（PFGE）基因分型,探索沙门氏菌的分子多态性。方法将从市售鸡肉、鸡胴体、中式凉拌菜及婴儿配方奶中分离出的10株沙门氏菌进行血清学分型、PFGE分子分型,BioNumerics version软件分析比较同源性。结果 10株沙门氏菌血清型分别为4株肠炎沙门氏菌,3株里定沙门氏菌,2株阿贡纳沙门氏菌和1株雷摩沙门氏菌。PFGE聚类分型结果主要分为4型：1型4株,相似度超过95%;2型3株,又分2个亚型,亚型间的相似度为78%;3型2株,相似度为100%;4型1株。结论吉林省食品中沙门氏菌具有不同血清学及PFGE型别,相同来源和血清型的菌株PFGE型别显示高度同源性。     

2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的分子型别分析

目的研究2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的型别,了解本地菌株分子流行病学特征。方法对66株肠道沙门菌临床分离株进行血清分型和多位点序列分型(MLST)。对其中主要血清型:鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果分布于21个血清型的66株沙门菌分成26个ST型别。发现一株纽波特沙门菌为新型ST1690。菌株血清型与MLST型别数据库中所对应的血清型符合率为100.00%。9株甲型副伤寒沙门菌的PFGE带型完全一致(P7型),与先前杭州流行菌株有差异(P1-P6型)。6株肠炎沙门菌分成4个PFGE型,型间最小相似性为92.70%。13株鼠伤寒沙门菌分为11个PFGE型,型间最小相似性为71.70%。7株萨雷甲尼沙门菌分成4个PFGE型别,型间最小相似性为91.00%。结论近年杭州腹泻病人中流行的肠道沙门菌菌株主要血清型为鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎等。甲型副伤寒沙门菌菌株在杭州出现了新PFGE型别。MLST数据可以对沙门菌血清学鉴定提供一定的帮助。     

Laboratory-based surveillance of non-typhoidal Salmonella infections in Guangdong Province, China

Salmonella is one of the most common foodborne pathogens in humans. Laboratory-based surveillance for non-typhoidal Salmonella infection was conducted in Guangdong Province, China to improve understanding about the disease burden and detection of dispersed outbreaks. Salmonella isolated from patients with diarrhea were sent from 16 sentinel hospitals to local public health laboratories for confirmation, serotyping, antimicrobial susceptibility testing, and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). PFGE patterns were analyzed to identify clusters representing potential outbreaks. Between September 2009 and October 2010, 352 (4%) Salmonella isolates were obtained from 9167 stool specimens. Salmonella enterica serotype Typhimurium (45%) and Salmonella enterica serotype Enteritidis (13%) were the most common serotypes, and multidrug resistance was high, especially in Salmonella Typhimurium isolates. PFGE patterns of obtained Salmonella isolates were found to be diverse, but a unique PFGE pattern comprising 53 Salmonella Typhimurium isolates were found to occur almost exclusively in infants. Epidemiologic studies are ongoing to determine whether a common exposure is the source of the Salmonella Typhimurium strain frequently isolated from infants.     

Web-based surveillance and global Salmonella distribution, 2000-2002

Salmonellae are a common cause of foodborne disease worldwide. The World Health Organization (WHO) supports international foodborne disease surveillance through WHO Global Salm-Surv and other activities. WHO Global Salm-Surv members annually report the 15 most frequently isolated Salmonella serotypes to a Web-based country databank. We describe the global distribution of reported Salmonella serotypes from human and nonhuman sources from 2000 to 2002. Among human isolates, S. Enteritidis was the most common serotype, accounting for 65% of all isolates. Among nonhuman isolates, although no serotype predominated, Salmonella enterica serovar Typhimurium was reported most frequently. Several serotypes were reported from only 1 region of the world. The WHO Global Salm-Surv country databank is a valuable public health resource; it is a publicly accessible, Web-based tool that can be used by health professionals to explore hypotheses related to the sources and distribution of salmonellae worldwide.     

库克沙门菌引起的食物中毒病原学检测

目的:检测从食物中毒事件中分离到的致病菌的生物学特性,确定食物中毒的病原。方法:参照GB4789.4-2010的方法,对检出的菌株进行表型的鉴定;采用WHO推荐的改良K-B纸片法对检出的菌株进行抗生素敏感试验;运用PFGE方法对检出的菌株进行分子分型及流行病学特征分析。结果:从5份粪便样品中检出5株库克沙门菌,从3份剩余食物中检出1株库克沙门菌,共计6株菌。血清抗原式均符合[1,3,19:g,m:-];生物学性状和药敏试验结果一致;PFGE带型完全一致。结论:本次食物中毒是由库克沙门菌污染引起;PFGE技术适用于菌株的同源性分析和传染源的追踪。     

2018—2021年北京市沙门菌血清型及喹诺酮类耐药表型和基因型分析

目的 分析2018—2021年北京市肠道门诊哨点医院分离到的沙门菌血清型及喹诺酮类药物耐药表型和耐药基因的流行情况。方法 采用玻片凝集法鉴定血清型;微量肉汤稀释法测定药物敏感性;全基因组测序数据通过与MLST和ResFinder数据库比对,查询ST型别和耐药基因。结果 228株沙门菌共检出42种血清型,51种ST型。其中肯塔基沙门菌、肠炎沙门菌和黄金海岸沙门菌等9种血清型比较常见。77株沙门菌（33.8%）对萘啶酸耐药;40株（17.5%）对环丙沙星和左氧氟沙星耐药;38株（16.7%）对吉米沙星耐药。不同血清型对喹诺酮类药物的耐药性不同。228株沙门菌共筛选出5种喹诺酮耐药基因:qnrS（23.7%）、aac(6’)-Ib-cr（8.3%）、qnrB（6.6%）、OqxAB（1.3%）和qepA（0.4%）;喹诺酮耐药决定区存在gyrA和parC的7种氨基酸突变:以parC:T57S（70.2%）最常见,其次是gyrA:D87N（14.9%）、parC:S80I（14.5%）、gyrA:S83F（14.5%）、gyrA:D87Y（7.9%）、gyrA:D87G（5.3%）和gyrA:S83Y（1.8%）。在组合突变中,以parC:S80I-gyrA:D87N-gyrA:S83F三突变,并伴随parC:T57S最多。耐药基因和突变位点在9种常见血清型中的检出率存在差异。结论 北京市沙门菌血清型及ST型种类繁多,携带喹诺酮耐药基因以qnrS、aac(6’)-Ib-cr和 qnrB为主,存在gyrA和parC多个位点突变并协同作用。应持续监测血清型和耐药性,以指导临床有针对性合理用药。     

沙门菌脉冲场凝胶电泳分型与血清型的对应关系

目的分析沙门菌脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)与血清分型之间的对应关系.方法选择中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络PulseNet China沙门菌监测数据中鼠伤寒(Typhimurium)、肠炎(Enteritidis)、德尔卑(Derby)、阿贡纳(Agona)及山夫登堡(Senftenberg)前五位常见血清型菌株共1230株,进行PFGE聚类分析,以血清分型作为参照进行比对.确定这5种血清型PFGE优势带型的共有条带.结果1230株菌株中,1149株经PFGE预测的血清型与实际血清型一致,PFGE预测血清型的准确率为93.4%.5种血清型经PFGE预测的血清型阳性预测值多在90.0%以上、阴性预测值均在95.0%以上.结论PFGE聚类对5种常见血清型沙门菌血清分型具有较好的提示及验证作用.     

一株罕见发酵蔗糖的贝坎道夫沙门菌鉴定与探讨

目的:对一株从冻贻贝中分离的沙门菌进行鉴定与探讨。方法:结合传统生化反应、荧光定量PCR检测、16S rDNA检测以及血清学分型鉴定方法。结果:该菌生化反应及PCR反应符合沙门菌属,经16S rD-NA鉴定为肠道沙门菌,血清学抗原式为9,46:e,h:1,2。结论:该菌是一株罕见的发酵蔗糖的贝坎道夫沙门菌(S.Bergedorf)。该菌为国内首次报道检出。     

2006-2011年福建省沙门菌监测菌株血清型分布及耐药性分析

目的分析福建省沙门菌监测病人菌株血清型分布和耐药性情况。方法依据我省制定的沙门菌监测方案,在全省5个地市设立沙门菌监测点开展工作。结果2006～2011年共分离出449株沙门菌,均为肠道沙门菌内的亚种I和亚种HIb,分属于10个群（11个亚群）,39个血清型,其中A～F群占98．89％,鼠伤寒和肠炎沙门菌是我省检出率最高的2种血清型。同时我省新增了1个P群及10个血清型（变种）。鼠伤寒沙门菌仍是我省严重耐药的血清型,沙门菌多数菌株对萘啶酸、链霉素、磺胺、甲氧苄啶、复方新诺明、四环素、氨苄西林有不同程度的耐药,对三代头孢、环丙沙星、阿莫西林＋棒酸多数菌株敏感。结论鼠伤寒和肠炎沙门菌为我省2个主要的血清型,多数菌株对萘啶酸、链霉素、磺胺类、四环素、氨苄西林有不同程度的耐药。     

建立Taqman探针实时荧光PCR检测食品中肠炎沙门氏菌的方法

目的利用Taqman探针实时荧光PCR检测食品中肠炎沙门氏菌。方法根据沙门氏菌属共有基因序列和肠炎沙门氏菌的特异序列分别设计2组引物及探针,运用实时荧光PCR进行特异性、灵敏性及模拟样品的检测实验。结果采用沙门氏菌属探针可检测到25种不同血清型沙门氏菌(共49株),而11株阴性对照菌株未得到扩增;利用肠炎沙门氏菌探针可从25种不同血清型的沙门氏菌(共49株)和11株阴性对照菌株中特异性的检测出全部15株肠炎沙门氏菌;以肠炎沙门氏菌系列稀释度菌液DNA为模板进行实时荧光PCR扩增,菌株的模板浓度与Ct值之间呈现良好线性关系,线性系数(R2)0.993,扩增效率87%,最低检测浓度260cfu/mL;分别接种肠炎沙门氏菌于四种样品进行模拟样品检测,实时荧光PCR检测结果与经典培养鉴定方法的检测结果相吻合。结论实时荧光PCR检测食品中肠炎沙门氏菌的方法特异性强、敏感度高,可应用于食品中肠炎沙门氏菌的检测。     

2013年泰州市健康从业人员携带的沙门氏菌耐药状况以及分子分型研究

目的 了解泰州市健康从业人员携带的沙门氏菌血清型分布、耐药状况以及分子分型特性,为食源性沙门氏菌病的防治提供检测依据。方法 将2013年泰州市健康从业人员分离的58株沙门氏菌进行生化鉴定、血清学分型、药敏试验以及脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)分子分型,并运用BioNumeries软件分析菌株之间的流行病学关系。结果 58株沙门氏菌分为8种血清型,主要以蒙德维的亚沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌为主。药敏试验表明,58株沙门氏菌对四环素和萘定酸耐药性最高;多重耐药谱显示耐2种抗生素及以上占39.66%,最高耐10种抗生素。PFGE结果表明,同一血清型的沙门氏菌有多个PFGE带型,相似度大于50.00%,且均有带型100.00%一致的菌株存在。结论 泰州市健康从业人员携带的沙门氏菌耐药谱广,耐药性较强;基因型呈多态分布,但具有流行相关性;各血清型都有100.00%同源菌株,应结合流行病学调查,做好预防控制工作。