MALDI-TOF MS用于临床微生物检验中常见菌鉴定的应用探讨

目的通过比较两种微生物鉴定系统基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和Vitek 2Compact,评价MALDI-TOF MS在临床常规分离微生物中的应用价值。方法对比MALDI-TOF MS和Vitek 2Compact系统的菌种数据库,筛选出MALDI-TOF MS菌库中新增菌种,统计该院自2015年5月MALDI-TOF MS投入使用起至2016年12月新增菌种被检出的菌株及频次,以及高置信度鉴定临床常见致病菌的检出频次。结果 MALDI-TOF MS较Vitek 2Compact菌库中新增205种菌株,在2015年5月至2016年12月临床微生物检验中共检出206次,且MALDI-TOF MS系统高置信度鉴定4种临床常见致病菌共286例。结论 MALDI-TOF MS菌种数据库更大、准确度高,更能满足临床微生物检验的需求,适于更广泛地投入到临床微生物鉴定的应用中。     

MALDI-TOF MS在临床微生物样本直接检测中的应用

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（ MALDI-TOF MS）是近年来发展起来的一项新兴的微生物鉴定技术,与传统的生化表型鉴定方法和分子生物学方法相比,MALDI-TOF MS具有操作简单、快速、准确和经济的特点。鉴于其对培养出的纯菌落鉴定的准确性和稳定性,MALDI-TOF MS也可被应用于临床样本的直接检测,包括阳性血培养瓶、中段尿、脑脊液等。本文主要就MALDI-TOF MS用于直接检测临床样本的原理、流程、鉴定效能及其研究进展等方面做一综述。     

MALDI-TOF MS在临床微生物检验中的应用

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是一种软电离质谱,适用于分析蛋白质等生物大分子物质,可用来绘制微生物的蛋白质图谱,达到鉴定的目的。基于MALDI-TOF MS的蛋白质谱技术具有快速、准确、敏感性高、高通量等特点,目前已应用于细菌和真菌的鉴定,其在微生物耐药性分析、分型和毒力研究等科研领域的应用也初有成效,尚有巨大的发展空间。本文就以MALDI-TOF MS为代表的蛋白质谱技术在微生物检验和科研中的应用作一综述。     

MALDI-TOF MS自建数据库对非结核分枝杆菌鉴定的应用价值

目的 构建基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)非结核分枝杆菌(NTM)鉴定数据库并评价其应用价值.方法 收集2018年1月—2021年5月临床分离NTM菌株72株,分别采用直接同源序列比对法和MALDI-TOF MS法进行菌种鉴定,MALDI-TOF MS以"自建数据库+MBT DB5989数据...     

应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定常见细菌和酵母菌

目的 应用MALDI-TOF MS鉴定临床常见病原菌.方法 复苏560株临床分离株,其中革兰阳性细菌(G+ )260株、革兰阴性细菌(G-)180株、酵母菌60株、肠道致病菌60株.MALDI-TOF MS鉴定结果与Vitek2 Compact全自动微生物鉴定系统比对,结果差异菌株采用16S rDNA测序验证.结果 MALDI-TOF MS与Vitek2 Compact鉴定结果比较,G+细菌鉴定符合率为94.6％( 246/260),G-细菌鉴定符合率为96.7％ (174/180),酵母菌鉴定符合率为95.0％ (57/60),肠道致病菌鉴定符合率为93.3％( 56/60).15株鉴定结果不符的菌株经16S rDNA测序确认,结果与Vitek2Compact和MALDI-TOF MS鉴定符合率分别为26.7％ (4/15)和66.7％( 10/15).结论 MALDI-TOF MS可用于常见病原微生物鉴定,其快速、低成本的特点具有推广价值.     

MALDI-TOF MS技术在鲍曼不动杆菌鉴定及同源性分析中的应用

目的评价基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对我院鲍曼不动杆菌属的鉴定及同源性分析的能力。方法对2014年9月至2015年2月我院29株经PhoneixTM100全自动微生物鉴定仪鉴定为鲍曼不动杆菌属的菌株进行MALDI-TOF MS鉴定,用MALDI-Biotyper软件进行同源性分析,并用16S rRNA基因测序进行验证。结果 MALDI-TOF MS鉴定结果为鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)26株,院内不动杆菌(Acinetobacter nosocomialis)3株。MALDI-TOF MS鉴定为院内不动杆菌的3株菌株的16S rRNA基因测序结果显示,2株为院内不动杆菌,1株为鲍曼不动杆菌。26株质谱鉴定为鲍曼不动杆菌的菌株分为2大簇(Ⅰ型,Ⅱ型),Ⅱ型又分为2小簇(Ⅱa、Ⅱb)。Ⅰ型、Ⅱ型分布在我院4个病区。结论MALDI-TOF MS技术鉴定鲍曼不动杆菌精准,可以鉴别鲍曼不动杆菌和院内不动杆菌。MALDI-Biotyper数据库软件进行同源性分析十分快捷。     

MALDI-TOF MS在临床微生物实验室的应用研究进展

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flightmass spectrometry,MALDI-TOF MS)是近年发展起来的一种新型软电离质谱技术,目前不但应用于肿瘤、风湿性关节炎、阿尔茨海默病等的诊断,还可用于微生物鉴定,为微生物的鉴定带来了革命性的变化。MALDI-TOF MS是简便快速、高通量、低成     

自建MALDI-TOF MS霉菌数据库的研究

目的建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)霉菌数据库,提高引起临床相关感染的各种霉菌的鉴定能力。方法收集临床标本来源的霉菌266株,纯培养后进行霉菌18S rDNA扩增测序,获得菌种鉴定结果。选取210株霉菌用于数据库的构建,通过甲酸萃取法提取蛋白,应用MALDI-TOF MS配套的FlexControl软件收集蛋白谱图,采用Biotyper软件构建评价数据库。其余56株霉菌用于数据库鉴定能力的验证,分别用商品化数据库、自建的MALDI-TOF MS数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,应用χ2检验比较数据库的鉴定率差异。结果自建本地化MALDI-TOF MS霉菌鉴定数据库包含19个菌属,67个菌种,共计204株霉菌的质谱图。用于数据库验证的56株霉菌中,用商品化数据库鉴定正确18株,鉴定正确率为32.1%,用扩展数据库鉴定正确51株,鉴定正确率为91.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论自建霉菌数据库提高了霉菌的鉴定能力,从而有助于临床霉菌感染的病原诊断和治疗。     

MALDI-TOF MS在短期培养后胸腹腔积液中细菌快速鉴定的应用

目的 对临床胸腹腔积液样本进行短期培养,使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)进行细菌鉴定,以建立可用于胸腹腔积液的快速细菌检测方法。方法 收集360例细菌感染的胸腹腔积液(胸腔积液163例、腹腔积液197例),所有样本分为三份:一份常规培养并使用微生物鉴定仪检测; 第二份直接离心集菌后用MALDI-TOF MS鉴定; 第三份与营养肉汤混合并短期培养2 h,离心洗涤后用MALDI-TOF MS鉴定。以微生物鉴定仪结果作为金标准,评估MALDI-TOF MS对短期培养后胸腹腔积液中致病菌的鉴定效能。结果 MALDI-TOF MS对短期培养后两种样本的正确检出率分别为94.5%和90.9%,总的未检出率只有7.5%; 单一细菌生长的样本鉴定结果与常规方法符合率达到94.1%; 能从混合细菌生长的样本中准确鉴定优势菌。结论 经过短期培养后的胸腹腔积液样本,MALDI-TOF MS检出率高,结果可靠; 所需时间比常规培养缩短至少12 h,可为临床准确快速提供病原菌报告。     

基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术在病原菌鉴定中的应用

目的探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)在快速鉴定血流感染病原菌的应用价值,并分析MALDI-TOF MS方法鉴定病原菌的准确性。方法收集321例血流感染患者的血液标本进行血培养,微生物室细菌培养结果均为阳性。从血培养阳性瓶中取病原菌至分离胶促凝管中,应用MALDI-TOF MS对富集的病原菌进行菌种鉴定。同时,对血培养瓶中的阳性标本进行常规培养,获得的纯菌落采用VITEK 2 COMPACT微生物分析系统进行检测,并将MALDI-TOF MS检测结果与VITEK 2 COMPACT结果进行对比。若检测结果有差异,则进一步进行基因测序法予以确定。结果 321例阳性血培养标本中共分离出180株革兰阴性杆菌, MALDI-TOF MS鉴定准确率为97.78%,无鉴定错误,但4株无鉴定结果;分离出的141株革兰阳性菌中,主要以革兰阳性球菌为主, MALDI-TOF MS鉴定准确率为84.39%, 1株蜡样芽胞杆菌误鉴定为大肠埃希菌,出现了菌属水平鉴定错误,其余为种类鉴定错误。结论与传统血培养及生化鉴定比较, MALDI-TOF MS在血流感染中的鉴定符合率较高,且鉴定方法简便、迅速。     

感染性疾病多学科交叉研究专题基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术在病原菌鉴定中的应用

目的 探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)在快速鉴定血流感染病原菌的应用价值,并分析MALDI-TOF MS方法鉴定病原菌的准确性.方法 收集321例血流感染患者的血液标本进行血培养,微生物室细菌培养结果均为阳性.从血培养阳性瓶中取病原菌至分离胶促凝管中,应用MALDI-TOF MS对富集的病原菌进行菌种鉴定.同时,对血培养瓶中的阳性标本进行常规培养,获得的纯菌落采用VITEK 2 COMPACT微生物分析系统进行检测,并将MALDI-TOF MS检测结果与VITEK 2 COMPACT结果进行对比.若检测结果有差异,则进一步进行基因测序法予以确定.结果 321例阳性血培养标本中共分离出180株革兰阴性杆菌,MALDI-TOF MS鉴定准确率为97.78％,无鉴定错误,但4株无鉴定结果;分离出的141株革兰阳性菌中,主要以革兰阳性球菌为主,MALDI-TOF MS鉴定准确率为84.39％,1株蜡样芽胞杆菌误鉴定为大肠埃希菌,出现了菌属水平鉴定错误,其余为种类鉴定错误.结论 与传统血培养及生化鉴定比较,MALDI-TOF MS在血流感染中的鉴定符合率较高,且鉴定方法简便、迅速.     

MALDI-TOF MS在人工关节置换术后病原菌快速鉴定中的价值

目的了解基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)联合HBL微生物培养系统(简称HBL系统)在人工关节置换术后病原菌快速鉴定中的价值。方法收集104例人工关节置换术后患者关节液样本,分别接种于血培养瓶及常规培养琼脂平板,将阳性培养物分别进行2种直接MALDI-TOF MS鉴定、常规MALDI-TOF MS鉴定和平板培养鉴定,比较4种方法鉴定结果及鉴定时间。结果直接和常规MALDI-TOFMS均检测到84.8%(84/99)的阳性结果,但平板培养仅检测到60.6%(60/99)的阳性结果。HBL系统处理后直接MALDI-TOF MS鉴定革兰阳性菌和革兰阴性菌,检出率分别为86.9%和91.9%,高于分离胶富集细菌后直接MALDI-TOF MS(78.3%和83.8%)和平板培养(70.1%和67.6%)。HBL系统处理后直接MALDI-TOF MS鉴定的阳性结果中,金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌检出率较高。HBL系统处理后直接MALDI-TOF MS的鉴定时间为5～14 h,低于常规MALDI-TOF MS(45.2 h)和平板培养(54.3 h)。结论与常规培养比较,HBL系统处理后直接MALDI-TOF MS鉴定病原菌用时短,且具有一定的准确率,对人工关节置换术后病原菌的快速诊断有一定价值。     

MALDI-TOF MS在细菌耐药性检测中的应用进展

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)已经发展成为微生物实验室鉴定菌种的常规工具。MALDI-TOF MS在微生物学耐药性检测中的应用尚处于研究阶段。该文就MALDI-TOF MS在细菌耐药性检测中的方法及其适用病原体的研究现状做一综述。     

基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱在临床病毒学中的应用

基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是一种新型的微生物鉴定技术,具有准确、快速、高通量等特点,目前在细菌和真菌的鉴定方面已比较成熟,但在病毒方面应用较少。本文从病毒的诊断、分型及耐药基因检测3个方面对MALDI-TOF MS在临床病毒学中的应用作一综述。     

MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌的实验条件优化

目的 构建用于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)鉴定马尔尼菲篮状菌的数据库,并探索用于MALDI-TOF MS鉴定马尔尼菲篮状菌的最佳培养条件和前处理方法 .方法 利用8株马尔尼菲篮状菌构建自建数据库,比较不同培养基[沙保弱葡萄糖琼脂培养基(SDA)、沙氏葡萄糖肉汤培养基(SDB)]、培养...     

两种MALDI-TOF MS系统快速鉴定血培养中白念珠菌以外酵母样真菌

目的评价2种基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统(Autoflex MALDI-TOF MS和Vitek MALDI-TOF MS)在快速鉴定血培养中分离的白念珠菌以外酵母样真菌的应用。方法收集复旦大学附属中山医院2010年10月至2013年1月住院患者血培养中分离的白念珠菌以外酵母样真菌59株,以真菌内转录间隔区(ITS)测序鉴定结果为金标准,比较Autoflex MALDI-TOF MS、Vitek MALDI-TOF MS和API 20C AUX 3种系统鉴定的准确性。结果 59株菌株包含了11种真菌,其中近平滑复合体30株(占50.8%)、热带念珠菌11株(占18.6%)、光滑念珠菌8株(占13.6%)、克柔念珠菌2株(占3.4%)、新生隐球菌2株(占3.4%)、异常威克汉姆酵母2株(占3.4%)、季也蒙念珠菌复合体1株(占1.7%)、葡萄牙念珠菌1株(占1.7%)、阿萨希毛孢子菌1株(占1.7%)和酿酒酵母1株(占1.7%)。3种系统鉴定真菌总的准确性分别为Autoflex MALDITOF MS 93.2%、Vitek MALDI-TOF MS 83.1%和API 20C AUX 79.7%,2种MALDI-TOF MS比较,差异无统计学意义(P=0.155)。其中对白念珠菌以外酵母样真菌的鉴定准确性分别为Autoflex MALDI-TOF MS 100.0%、Vitek MALDI-TOF MS 84.9%和API 20C AUX 84.9%,2种MALDI-TOF MS比较,差异具有统计学意义(P=0.006)。对念珠菌属外的少见真菌鉴定准确性分别为Autoflex MALDI-TOF MS 33.3%、Vitek MALDI-TOF MS66.6%和API 20C AUX 33.3%。结论 MALDI-TOF MS系统和目前常规生化鉴定方法相比,具有快速、操作简便、结果准确等优点;对于临床血培养分离真菌的鉴定,Autoflex MALDI-TOF MS鉴定准确性和Vitek MALDI-TOF MS相似,但对常见非白念珠菌的鉴定,Autoflex MALDI-TOF MS鉴定准确性优于Vitek MALDI-TOF MS。     

MALDI-TOF MS微生物鉴定的室内质量控制体系建立

基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDITOF MS)具有快速、准确、低成本、操作简单的特点,是临床微生物鉴定的首选技术之一。MALDI-TOF MS的准确鉴定依赖于良好的仪器状态、有效的菌株蛋白质抽提及规范的操作与结果判读原则,任一环节的失误均直接影响鉴定结果的准确性。因此,严格的室内质量控制对MALDI-TOF MS微生物鉴定至关重要。该实验室根据6年的应用经验及研究,建立了一套较为完整的MALDI-TOF MS微生物鉴定室内质量控制体系,覆盖硬件、软件及人工操作各个环节,内容包括仪器参数设置、维护与校准,菌株与试剂的准备以及谱图采集与结果判读分析,使鉴定结果异常时可迅速溯源并及时处理。     

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在临床微生物检验中的应用与发展

正基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)自20世纪90年代开始成功用于细菌的快速鉴定,其原理是根据不同细菌的特征性蛋白指纹图谱进行细菌鉴定,打破了传统生化反应方法烦琐的鉴定流程,大大缩短了检测时间,降低了检测成本,且具有准确、高通量等优势,为临床微生物检验带来了革命性的发展。MALDI-TOF MS     

MALDI-TOF MS在细菌耐药性分析中的临床应用

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)具有快速、高通量、高准确性和低成本等特点,为临床微生物的鉴定带来了革命性的变化,也给细菌耐药性分析提供了一条新思路。常规细菌耐药性检测方法有纸片法、稀释法、E-test等,这些方法均需要长时间的培养,不能满足临床对快速药物敏感性指导的需求。MALDI-TOF MS用于细菌耐药性的检测具有巨大的应用价值与前景。已有一些关于MALDI-TOF MS在细菌耐药性检测的实验和临床应用的报道。文章就近年来MALDI-TOF MS在细菌耐药性分析相关的病原体种类、检测方法和检测效果等方面作一综述。     

MALDI-TOF MS技术在临床微生物检验领域的应用进展分析

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometr y,M A LDI-TOF MS)是近年来开始应用于临床微生物检验领域的一种新技术。本文将系统综述MALDI-TOF MS技术的检测原理及特点,在临床微生物鉴定、细菌分型、同源性分析和细菌耐药检测中的应用。MALDI-TOF MS技术的采用不仅明显缩短了临床微生物检验的TAT时间,更好地服务于感染性疾病的诊断与抗菌药物合理使用,同时也为临床微生物检验的自动化打下了基础。