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相似文献
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1.
丁匀乔  杨波  彭海生  蒋蕾  张文远 《药学研究》2022,41(10):639-644
目的 通过网络药理学和分子对接技术探究“酸枣仁-当归”药对治疗失眠的重要靶标。方法 通过中药系统药理学数据库(TCMSP)检索“酸枣仁-当归”药对活性成分及相应靶点;通过GeneCards数据库检索失眠相关靶点;在Cytoscape3.7.2软件中构建“酸枣仁-当归”药对-活性成分-靶点网络图;构建韦恩图得到该药对与疾病的交集靶点。构建蛋白质互作(PPI)网络筛选核心靶点,通过Autodock等软件进行分子对接。借助R studio对交集靶点进行GO富集和KEGG通路分析。结果 得到“酸枣仁-当归”药对有效成分11个,靶点88个,失眠相关靶点1 348个,交集靶点20个,6个核心靶点。分子对接分析发现丁子香萜与MAOB结合能力最强。GO富集和KEGG通路分析得到,肾上腺素能受体信号通路、神经递质受体的活动等,通过神经活性配体受体相互作用、5-羟色胺能突触等达到治疗失眠的作用。结论 “酸枣仁-当归”药对可能通过MAOB、ACHE、SLC6A4等靶标调控胆碱能突触、多巴胺能突触、钙信号通路、5-羟色胺能等信号通路来起到多因素共同治疗失眠的作用。  相似文献   

2.
目的 通过网络药理学和分子对接技术探索“柴胡-当归”药对治疗乳腺增生的潜在作用机制。方法 基于网络药理学,通过TCMSP、UniProt等数据库检索获得“柴胡-当归”药对的活性成分及其对应靶点蛋白。在Genecards数据库检索乳腺增生相关靶点,利用Draw Venn Diagram在线作图网站获得其与“柴胡-当归”作用靶点的交集基因。通过Cytoscape 3.6.0软件及STRING数据库构建药对-活性成分-作用靶点-疾病网络和靶点间蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,根据度值大小筛选出排名前5的靶蛋白,并利用RCSB PDB数据库、Autodock Vina 1.1.2等软件预测其与“柴胡-当归”药对活性成分的结合活性。采用RStudio软件对交集基因进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,最终构建活性成分-关键靶点-关键通路网络。结果 数据库中筛选获得药对活性成分共18种;其中活性成分的靶点与乳腺增生疾病的交集基因共150个,根据度值排名大小获得5个核心靶标,包括蛋白激酶、白细胞介素-6、肿瘤蛋白p53、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等。经分子对接分析发现,“柴胡-当归”药对的活性成分与核心靶标结合能力较强。结论 “柴胡-当归”药对的主要活性成分可能通过调节蛋白激酶、白细胞介素-6、肿瘤蛋白p53、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等核心靶点,参与调控白介素-7(IL-7)信号通路、内分泌耐药、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等途径,发挥对乳腺增生的治疗作用。  相似文献   

3.
目的 基于网络药理学分析防风-乌梅药对治疗荨麻疹的物质基础及分子机制。方法 根据文献报道,结合口服利用度≥ 30%和类药性分析≥ 0.18,在TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库筛选防风-乌梅药对活性成分及靶点,GeneCards数据库筛选荨麻疹靶点,通过靶点映射确定药对活性成分作用的荨麻疹靶点;借助Cytoscape 3.5.1软件构建活性成分-靶点网络图,STRING平台构建靶蛋白互作网络,应用DAVID数据库对靶点进行KEGG通路分析,利用Cytoscape软件中BiNGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析。结果 从防风-乌梅药对中筛选得到槲皮素、山奈酚、汉黄芩素、欧前胡素、升麻素等16个活性成分,作用于IL-6、TNF、SRC、EGFR、IL-8、PTGS2等62个荨麻疹相关靶点,调控TNF信号通路、PI3K/Akt信号通路、NF-kB信号通路、低氧诱导因子1信号通路、NOD样受体信号通路等8条信号通路,参与调节炎症反应、肽-酪氨酸磷酸化、蛋白质分解代谢等生物过程。结论 充分揭示了防风-乌梅药对多成分、多靶点、多通路治疗荨麻疹的科学内涵。  相似文献   

4.
目的 通过网络药理学研究三七的主要活性成分、作用靶点、相关信号通路和疾病等几方面的关联性,揭示其发挥药效的作用机制。方法 从中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库中获得三七的化学成分,并把口服生物利用度(OB)≥ 30%和类药性(DL)≥ 0.15作为筛选条件,获得三七的主要活性成分和相关作用靶点。通过UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,并用CTD网络在线分析平台获得与靶点相关的疾病和信号通路。最后用Cytoscape 3.6.1构建"活性成分-靶点""靶点-信号通路"和"靶点-疾病"网络图,采用Cytoscape 3.6.1的Network Analyzer插件分析网络图,探讨三七的多重药理作用机制。结果 共获得槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、人参皂苷rh2等9个主要活性成分;这些成分可作用于176个靶点,其主要靶点有PTGS2、PTGS1、HSP90AB1、ER、PDE3A等,这些靶点与肿瘤、高血压、中枢神经系统障碍、自身免疫疾病等45种疾病相关,涵盖癌症、心血管系统、神经系统、免疫系统等几大类疾病。三七的主要活性成分通过作用于靶点而影响相关的信号通路发挥治疗疾病的作用,其影响的信号通路主要包括信号转导通路、免疫通路、Cytokine信号通路、癌症通路等,其中肿瘤、免疫相关的占绝大部分。结论 三七是通过多成分、多靶点、多信号通路的协调作用发挥治疗疾病的作用,其中在治疗肿瘤疾病和增强人体免疫力方面具有潜在的优势。  相似文献   

5.
目的 基于网络药理学方法和分子对接技术探究冬虫夏草抗肿瘤的作用机制。方法 利用TCMSP、CNKI、PubMed、Drugbank、Stitch和Swiss target prediction等平台检索冬虫夏草的化学成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库筛选肿瘤相关基因,运用Cytoscape 3.7.2构建冬虫夏草活性成分-靶点网络,通过String数据库对关键靶点构建网络互作(PPI)网络,并进行基因本体(GO)基因和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后利用AutoDock Vina软件和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果 共得到冬虫夏草22个化合物,86个抗肿瘤共同靶点,主要包括环加氧酶(PTGS)2、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、胱天蛋白酶3(CASP3)、JUN基因等关键靶点。GO分析与KEGG通路结果显示,冬虫夏草抗肿瘤涉及到多种生物学过程以及PPAR、花生四烯代谢、5-羟色胺信号通路等多种信号通路。将关键化合物和靶点进行分子对接,提示冬虫夏草抗肿瘤可能的前5个主要活性成分11,14-二十碳二烯酸、花生四烯酸、黄豆黄素、胆甾醇和豆甾醇与关键靶点PTGS2、PTGS1、PGR、HMGCR和CNR1均能自发结合。结论 初步探讨了冬虫夏草抗肿瘤的主要活性成分、相关靶点及相关通路,发现冬虫夏草可以通过多成分、多靶点、多通路抗肿瘤,为后期实验验证提供了参考依据。  相似文献   

6.
李新  刘肖莹  蒋蕾  杨波  彭海生 《药学研究》2022,41(6):357-364,372
目的 运用网络药理学及分子对接技术探究丹参-川芎-葛根有效活性成分抗高血压的相关靶点及分子机制。方法 通过检索TCMSP、Uniport数据库,获得丹参-川芎-葛根的主要活性成分和相关靶点。通过Genecards数据库获得高血压相关靶点。运用Venny数据库构建丹参-川芎-葛根和疾病靶点韦恩图,得到交集靶点;并将得到的交集靶点导入STRING数据库得到蛋白质相互作用关系。使用RStudio 1.4.1106软件对交集靶点进行GO功能富集和KEGG信号通路富集分析。并利用Cytoscape 3.6.0软件对“药材-活性成分-靶点”、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、“活性成分-靶点-通路”网络进行可视化。采用AutoDock Tools 1.5.6软件将关键活性成分和核心靶点进行分子对接,运用PyMOL对对接结果进行可视化。结果 通过筛选共获得68个活性成分,759个高血压相关靶点,62个交集靶点。经KEGG通路富集分析发现,丹参-川芎-葛根通过调节流体剪切应力和动脉粥样硬化、钙信号通路、AGE-RAGE、松弛素、cGMP-PKG等通路起到抗高血压的作用。分子对接结果显示,丹参酮ⅡA、隐丹参酮、β-谷甾醇与NOS3、FOS、VEGFA、AKT1等核心靶点结合能力较好。结论 证实了丹参-川芎-葛根多成分、多靶点、多途径的作用规律。  相似文献   

7.
目的 利用网络药理学探究活血化瘀药治疗子宫内膜异位症(endometriosis,EM)的可能作用机制。方法 以桃仁、红花、泽兰、丹参、益母草、川牛膝、王不留行等七味临床常用活血化瘀中药为研究主体。利用中药化学成分数据库TCMSP平台,检索获取七味活血化瘀药有效活性成分,通过Targets information软件获得有效成分对应靶点。使用GeneCards数据库收集EM相关靶基因,利用韦恩图工具得到活血化瘀药有效成分治疗EM的靶基因。应用Cytoscape 3.6.0软件构建活性成分-作用靶点-疾病网络。应用KEGG数据库分析获得靶点基因富集的信号通路。结果 七味活血化瘀药共筛选出94种活性成分,119个作用靶标。其中槲皮素、木犀草素、山柰酚等为关键活性成分,PTGS2、PTGS1、NCOA2、NCOA1等为关键靶点。七味中药共有20条EM相关KGEE通路,涉及性激素、炎症、细胞调亡以及血管生成等各个方面,其中PI3K-Akt、IL-17、TNF-α等炎症相关通路为主要通路。结论 活血化瘀药治疗EM具有多成分、多靶点、多通路的特点,针对EM的疼痛、炎症以及月经紊乱状态均有治疗作用。  相似文献   

8.
目的 基于网络药理学方法探讨生姜治疗类风湿关节炎(RA)的可能分子作用机制。方法 通过TCMSP平台筛选生姜主要活性成分,利用UniProt数据库将相应靶点蛋白名称进行转化为基因名,经Cytoscape 3.8.2软件构建网络图;在GeneCards数据库、OMIM数据库、TTD数据库中检索“rheumatoid arthritis”,获取RA疾病靶点,制作韦恩图获取生姜药物成分和RA共同靶点,并进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析、基因本体论(GO)功能富集及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。利用分子对接技术预测有效成分与靶点的潜在结合活性。结果 获取生姜5个成分及55个潜在靶点,RA疾病4 836个相关靶点,生姜与RA共同靶点26个,PPI网络中自由度靠前的3个靶点基因为前列素内环氧化物合成酶2(PTGS2)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3),GO功能富集分析和KEGG通路分析分别得到185个结果和59条信号通路。结论 生姜治疗RA具有多成分、多靶点效应,并涉及多条信号通路,这可能通过PTGS2、JUN、CASP3等靶点调控炎症反应、免疫调节作用治疗RA。  相似文献   

9.
目的 通过狗肾细胞(MDCK细胞)与小鼠观察加味香薷口服液的抗流感作用,并结合网络药理学预测其治疗流感的作用机制。方法 观察不同浓度加味香薷口服液对甲型流感病毒3型致MDCK细胞病变的影响,以及对流感病毒感染小鼠的保护作用。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集各味药的有效成分及作用靶点。采用GeneCards 5.14数据库、OMMI等数据库收集流感疾病相关靶点,构建网络图。借助STRING数据库及Metascape数据库构建PPI网络图、GO富集和KEGG通路分析。利用AutoDockTools和PyMOL软件完成分子对接及三维可视化展示。结果 体外实验表明加味香薷口服液对流感病毒引起的MDCK细胞病变及血凝现象有明显的抑制作用;体内实验表明其可延长甲型流感病毒感染小鼠存活时间,提高病毒感染小鼠的死亡保护率、降低小鼠肺指数及肺组织病毒滴度。筛选出82个活性成分和168个共有靶点,其中胡萝卜苷、叶酸、3`-甲氧基大豆黄素、柯伊利素、山柰酚为关键成分;TNF、AKT1、EGFR、STAT3、SRC、MMP9、PTGS2为核心靶点;KEGG通路富集分析显示其主要作用机制可能为通过TNF信号通路、趋化因子信号通路、PI3K/Akt信号通路、VEGF信号通路发挥抗流感病毒作用。结论 药效学结果表明加味香薷口服液可有效治疗流感疾病,其机制可能与“多成分-多靶点-多通路”协同调节有关。  相似文献   

10.
目的 采用网络药理学方法对增液汤中活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、靶点及通路间的相关关系。方法 运用中药系统药理学成分分析平台(BAT-MAN)数据库获取增液汤的作用靶标基因,采用Cytoscape 3.5.1软件构建活性成分-靶点网络,STRING平台构建靶蛋白互作网络,利用BiNGO和MCODE插件对相互作用的靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析,借助生物学信息注释数据库对靶点进行KEGG信号通路分析。结果 增液汤中23个药效成分作用于268个潜在靶点,聚类分析862个GO生物过程得到物质合成代谢、氧化应激、细胞离子平衡、炎症反应、凝血调节等23个子簇。KEGG信号通路富集主要涉及代谢、神经递质、氨基酸合成、信号转导、心血管和其他等6大类22条信号通路。结论 本研究揭示了增液汤活性成分、靶点及多维药理作用机制,为其临床治疗价值拓展提供新的线索。  相似文献   

11.
目的 采用网络药理学方法,揭示菊苣抗高脂血症的活性成分、潜在药物靶点和作用机制。方法 通过公共数据库中获取菊苣的活性成分、潜在药物靶点以及高脂血症的相关基因,并结合相关软件进行网络药理学分析,包括蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、基因本体(GO)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析。结果 从TCMSP数据库共筛选菊苣活性成分12个,包括β-谷甾醇、木犀草素等核心成分,涉及相关基因靶点156个。PPI网络涉及56个潜在药物靶点,Degree值排名前5的核心靶点分别是AKT1、IL6、TP53、TNF、VGEFA。GO功能分析共获得269个条目(P<0.05),KEGG通路富集得到71条信号通路(P<0.05),包括VEGF信号通路、脂肪细胞因子信号通路、细胞凋亡等通路。结论 菊苣抗高脂血症是多成分、多靶点、多通路的综合效应,其机制可能与参与脂质合成、炎症反应、细胞凋亡等过程相关。  相似文献   

12.
目的 采用生物信息学和分子对接技术,探讨当归六黄汤(DGLHD)治疗溃疡性结肠炎(UC)的作用机制。方法 采用公共数据库(TCMSP、DrugBank和UniProt)寻找当归六黄汤的有效活性成分和相应的靶基因,构建DGLHD活性成分-靶蛋白相互作用网络。基于DisGeNET数据库、Genecards数据库和DrugBank数据库检索溃疡性结肠炎相关基因,获取当归六黄汤与溃疡性结肠炎的交集靶点基因。利用STRING在线数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)分析,获取核心靶点基因。采用Metascape在线数据库进行基因本体(GO)功能注释及KEGG通路富集。通过DiscoveryStudio 2016进行分子对接,确定药物活性成分与核心靶标相互作用的分子基础。结果 共筛选出82种活性化合物和132个交集靶基因。核心靶点基因涉及信号传导与转录激活因子3(STAT3)、TP53、AKT1、MAPK1、JUN和血管内皮生长因子A(VEGFA);通路富集主要为“肿瘤信号通路”、“糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路”“内分泌抵抗”、“NF-κB信号通路”、“Th17细胞分化”。分子对接结果表明,当归六黄汤核心活性成分可以通过氢键等相互作用与核心靶基因形成稳定的对接模式。结论 基于生物信息学和分子对接技术,筛选出当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎的活性成分、核心靶点及主要信号通路,为当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎提供了新的理论基础。  相似文献   

13.
目的 探讨加减香砂六君子汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)恢复期肺脾气虚证的作用机制。方法 利用TCMSP数据库筛选中药活性成分和靶点,利用Gendcars、OMIM数据库筛选疾病靶点,STRING平台对靶点进行PPI网络构建,并进行GO和KEGG分析,利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,然后通过拓扑学参数分析获得加减香砂六君子汤主要活性成分和靶点,最后将主要活性成分与靶点进行分子对接验证。结果 得到槲皮素、木犀草素、山柰酚、柚皮素等115个活性成分,PTGS2、NOS2、PPARG、PTGS1、MAPK14等48个靶点,主要涉及IL-17、TNF、T细胞受体、MAPK、VEGF等155条通路。分子对接显示,槲皮素、木犀草素、山柰酚、柚皮素与3CL水解酶、ACE2、PTGS2具有较好的结合活性,与第七版推荐抗病毒药物结合能相近。结论 加减香砂六君子汤活性成分可通过与3CL水解酶、ACE2、PTGS2结合,调控IL-17、TNF、T细胞受体、MAPK、VEGF等信号通路来抑制炎症反应,调节机体免疫,减轻肺损伤,促进细胞生长分化和肺血管生成,从而改善患者症状,促进恢复期患者康复,提高机体免疫力,降低疾病复发或再感染的风险。  相似文献   

14.
目的 采用网络药理学的方法和思路研究葛根,探讨葛根成分-靶点、成分-疾病、基因-通路和基因-疾病的关联性,揭示其主要活性成分和药理作用机制。方法 针对葛根中的活性成分,根据PubMed、中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库中获得葛根的化学成分和相关作用靶点,构建"成分-靶点"网络;运用UniProt和CTD数据库提取作用靶点的基因名称、信号通路、心血管疾病相关的基因和靶点数据进行富集分析。结果 共获得刺芒柄花素、葛根素等10个主要活性成分;这些成分可作用于112个靶点,其主要靶点有PTGS2、PTGS1、HSP90AB1等,这些靶点与肿瘤、高血压、糖尿病等436种疾病相关,涵盖肿瘤、心脑血管疾病等33大类疾病。葛根主要活性成分作用于心血管疾病的有48个靶点,这些靶点参与肿瘤、高血压等多种生理及病理的生物学过程,如肿瘤坏死因子(TNF)等相关靶点,说明葛根是通过多成分、多靶点的协调作用发挥治疗疾病的作用。结论 葛根具有抗肿瘤、降血压、降血脂等生物活性,具有较好的应用价值,为接下来的药效试验研究提供科学依据。  相似文献   

15.
目的 对参柴颗粒进行网络药理学研究,以探讨其保肝护肝的作用机制。方法 利用TCMSP和TCM Database@Taiwan数据库并结合药动学参数对参柴颗粒中的活性成分进行筛选,结合成分及疾病相关数据库(Drugbank、GeneCards、TTD、Pubmed和PharmGKB)对成分相关靶点进行预测,对得到的靶点进行基因功能和通路注释分析,同时构建靶点间的蛋白互作网络,筛选出核心靶点,并构建参柴颗粒成分-靶点-通路网络,探讨参柴颗粒的保肝护肝作用。结果 从参柴颗粒中共预测得到49个化合物,并筛选出了176个成分作用于肝病的相关靶点。其中槲皮素、山奈酚、黄苓苷、豆甾醇、β-谷甾醇、千层纸黄素、芒柄花黄素可能为主要的活性成分,ALB、IL-6、TNF、JUN、AKT1、TP53、VEGFA、MAPK3、SRC、PTGS2可能为保肝护肝作用的主要靶点。KEGG通路富集分析表明、参柴颗粒可能是通过调控靶点作用于肿瘤通路,乙型肝炎,丙型肝炎,非酒精脂肪肝,胰岛素抵抗,TNF、HIF-1、FoxO、PI3K-Akt、ErbB信号通路等通路发挥保肝护肝作用的。参柴颗粒成分-靶点-通路网络表明,参柴颗粒活性成分作用于多个靶点,影响不同的代谢通路、相互作用、相互协调,从而起到对肝脏的保护机制。结论 参柴颗粒可通过多成分-多靶点-多通路的调控网络发挥保肝护肝的功效,对参柴颗粒保肝护肝作用的网络药理学研究期望可以为中医药对肝病治疗的分子机制研究提供参考。  相似文献   

16.
目的 通过构建升麻Cimicifugae Rhizoma化学成分-靶点-代谢信号通路网络,探讨其治疗乳腺癌的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和PharmMapper获取升麻化学成分与作用靶点,将其与乳腺癌疾病靶点取交集得到升麻治疗乳腺癌的作用靶点,进一步利用靶点-成分反向筛选得到治疗乳腺癌的升麻潜在活性成分;通过GeneMANIA数据库获取间接靶标和“蛋白-靶点”互作网络,并通过蛋白-蛋白相互作用筛选关键靶标;采用Cytoscape构建“成分-靶点”网络图,使用分子对接将潜在活性成分和关键靶标配对,以证实前期靶标筛选和反向药效团匹配的可靠性;通过DAVID网站对作用靶点进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,利用R语言和在线绘图网站(omishare tools)将结果可视化。结果 获得升麻潜在活性成分共68个,与乳腺癌相关疾病靶点48个,关键靶点为ESR1、SRC和HRAS。GO功能富集分析得到生物过程(BP)条目484条,细胞组成(CC)条目7条,分子功能(MF)条目75条。KEGG通路富集筛选获得到21条信号通路。分子对接结果显示关键靶标与升麻潜在活性成分匹配性较好。结论 升麻主要通过作用于ESR1、SRC、HRAS等靶点,调节癌症通路、蛋白多糖通路和雌激素信号通路等起到治疗乳腺癌的作用。  相似文献   

17.
目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨当归四逆汤治疗系统性硬化症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索当归四逆汤中的活性成分并以Swiss Target Prediction数据库预测各活性成分的靶点,采用GeneCards数据库收集系统性硬化症疾病靶点,取其中共同靶点作为潜在的作用靶点并导入String数据库建立蛋白相互作用(PPI)网络,以Cytoscape软件进行网络拓扑分析。将PPI靶点导入DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析并以OmicShare平台将结果可视化。构建“通路–靶点”网络并筛选其中关键靶点,并采用CB-Dock平台将作用靶点与活性成分进行分子对接以筛选潜在药效成分。结果 收集得到141个当归四逆汤活性成分及1 047个相关靶点,系统性硬化症疾病靶点1 568个。筛选出潜在作用靶点266个,其中关键靶点6个,分别为蛋白激酶B1(Akt1)、血管内皮生长因子受体2(KDR)、V-Ha-Ras肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)、促分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、促分裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。主要涉及MAPK信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信号通路、Rap1信号通路、黏着斑、脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等通路的调节。分子对接结果显示,水鬼蕉宾碱、芍药苷、酸枣仁皂苷A等活性成分为治疗中的潜在药效成分。结论 当归四逆汤以多组分、多靶点、多通路干预系统性硬化症,其机制涉及免疫、血管损伤和细胞外基质合成等的调节。  相似文献   

18.
目的 采用网络药理学方法对加味逍遥散治疗气滞痰阻型桥本氏甲状腺炎(HT)作用机制进行研究。方法 通过TCMSP、TCMID、TCMIP数据库收集筛选加味逍遥散当归、茯苓、白芍、白术、柴胡、半夏、厚朴、紫苏叶8味中药的主要化学成分并通过PubChem数据库收集各化合物化学式结构。分别通过Swiss Target Prediction、GeneCards、TCMIP数据库收集中药、疾病、证型的靶点,通过Bioinformatics Gent韦恩图收集“中药-疾病-证型”交互靶点,并分别通过STRING、WebGestal数据库对交互靶点进行PPI、GO、KEGG富集分析。结果 加味逍遥散有效活性成分:当归2个,茯苓15个,白芍13个,白术7个,柴胡17个,半夏13个,厚朴2个,紫苏叶14个;“中药-疾病-证型”交互靶点共43个;PPI结果显示,IL-6、VEGFA、AKT1、CASP3、TNF、HRAS、PTGS2等蛋白-蛋白相互作用关系最强;生物过程(BP)富集246个,细胞成分(CC)富集70个,分子功能(MF)富集12个类别、KEGG富集105条信号通路。结论 整合文献报道及网络药理学结果,加味逍遥散可能通过维持Th1/Th2平衡,调节炎症因子——白介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)-α、TNF-β表达,通过HIF信号通路介导血管内皮生长因子(VEGF)在甲状腺细胞中广泛表达,通过VEGF信号通路参与调控甲状腺组织中血管新生的生理病理过程,在气滞痰阻型HT中发挥作用,同时预测加味逍遥散可能在HT转化成甲状腺乳头状癌(PTC)中发挥作用。  相似文献   

19.
目的 探讨抗幽门螺杆菌(HP)活性挥发油的药效物质,初步预测潜在活性成分及其作用机制。方法 微量稀释法(96 微孔板)测定丁香、广藿香、紫苏、牛至、枳实、厚朴、薄荷、肉桂 8 种挥发油对 HP 的抑制率,筛选出抑菌活性最强的 3种挥发油。气相色谱-质谱法联用(GC-MS)分析 3 种挥发油的化学成分,利用 TCMSP、Swiss Target Prediction、PubChem数据库获取 3 种挥发油主要活性成分及其对应靶点信息;网络药理学技术预测其潜在活性成分、相关通路及关键靶点;AUTO DOCK Vina 软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接,初步验证潜在活性成分及关键靶点。结果 广藿香、牛至和肉桂挥发油抑制 90% 细菌生长的最低药物浓度(MIC90)分别为 0.250、0.250、0.125 μL·mL-1,具有较强的抑菌活性;从以上 3 种挥发油中分别鉴定出 27、26、15 个化学成分,共筛选出 15 个活性成分,涉及 232 个基因靶点,影响了与抑制 HP相关的癌症通路、化学致癌-受体激活及 EGFR 酪氨酸激酶抑制剂耐药性等 275 条信号通路;分子对接验证结果显示 3 种挥发油抗 HP 与 SRC 蛋白密切相关,15 个活性成分与关键靶点 SRC 的结合较为稳定。结论 广藿香、牛至、肉桂 3 种活性挥发油通过多成分、多靶点、多通路的形式发挥抗 HP 作用。  相似文献   

20.
目的 基于网络药理学方法探讨柴胡达胸合剂治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在药理作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选柴胡达胸合剂活性成分和对应的作用靶点,并通过Uniprot数据库标准化靶点名称;在GeneCards和OMIM数据库检索冠状病毒相关基因,并与柴胡达胸合剂作用靶点取交集,筛选出治疗作用靶点;利用Cytoscape 3.7.2软件,构建和分析“药材-活性成分-靶点”网络图;通过String平台分析靶点蛋白相互作用,并使用R软件的相关包进行GO基因注释和KEGG信号通路分析。结果 筛选出165个有效成分和51个作用靶点,进一步分析发现主要活性成分为β-谷甾醇和11个黄酮类化合物,核心作用靶点为CASP3、MAPK3、IL-6、MAPK8、IL-10、CXCL8、MAPK1、IL-1B等。GO基因注释得到GO条目共1 722个(P<0.05),其中生物学过程条目1 612个,细胞组成条目30个,分子功能条目80个。KEGG信号通路筛选出信号通路156条(P<0.05),富集基因较多的信号通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、甲型流感、IL-17信号通路、TNF信号通路和乙型肝炎。结论 该研究初步揭示了柴胡达胸合剂多成分、多靶点、多通路对COVID-19发挥治疗作用的特点,为进一步阐明柴胡达胸合剂治疗COVID-19的药理作用机制提供理论依据。  相似文献   

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