基于16S rRNA技术分析α-乳白蛋白对大鼠肠道菌群的影响

探究不同添加量α-乳白蛋白(α-lactalbumin,α-LA)对肠道菌群多样性及其结构的影响,研究婴儿配方奶粉中α-LA科学添加量十分重要。本实验将4组SD大鼠分别灌喂等剂量的生理盐水(对照组)、高添加量α-LA(200 mg/kg)、中添加量α-LA(100 mg/kg)、低添加量α-LA(20 mg/kg),在灌喂第14、28天时无菌取结肠粪便,扩增肠道菌群16S rRNA基因的V3-V4区,通过高通量测序分析α多样性、β多样性及基于门、属水平的物种组成。结果发现,高添加量蛋白组、中添加量蛋白组提高了肠道菌群的丰富度、均匀度,更好地调整了菌群结构。在门水平上,24份样品的肠道菌群均以厚壁菌门和拟杆菌门为主,各添加量蛋白组对于门水平的调节与母乳相似。在属水平上,高添加量蛋白组会降低乳杆菌、布鲁氏菌、阿克曼氏菌的相对丰度,而中、低蛋白组有一定的促进作用;各添加量组均能使普氏菌属成员、拟杆菌的相对丰度有不同程度的降低,作用效果随添加量降低而提高;各添加量组均能提高木质真菌相对丰度并维持瘤胃球菌科、毛螺旋菌科成员、梭菌科下的未知属相对丰度恒定。中添加量蛋白在提高菌群多样性的同时,提高或...     

黄酒对高脂血症模型大鼠血脂及肠道菌群的影响

该实验研究了黄酒对高脂血症模型大鼠血脂及肠道菌群的影响。 结果表明,黄酒高、中、低剂量组的大鼠体质量增量、肝脏 指数显著低于高脂模型组（P＜0.05）;血清总胆固醇（TC）、甘油三酯（TG）、高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）和低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）含量与高脂模型组相比差异不显著（P＞0.05）。高通量测序结果显示,黄酒能有效抑制高脂饲料引起的大鼠肠道菌群中厚壁菌门（Firmicutes）的上升和拟杆菌门（Bacteroidetes）的下降,使二者的含量和比值更接近于空白对照组,改善并提高了高脂大鼠 肠道内艾克曼菌属（Akkermansia）和拟杆菌属（Bacteroides）的组成比例。 在实验周期内,黄酒改善了高脂饲料引发的大鼠肠道菌群结 构的改变以及体质量和肝脏指数的升高,对高脂大鼠的降血脂作用不明显。     

合生元制剂对小鼠抗氧化能力和肠道菌群的影响

为研究合生元制剂对小鼠抗氧化能力、细胞因子和肠道菌群的影响,随机将48只BALB/c小鼠分为对照组、低剂量组(L)、中剂量组(M)和高剂量组(H),并灌胃生理盐水和不同剂量合生元制剂,14 d后收集小鼠粪便进行菌落计数和16S rDNA高通量测序,测定小鼠肝脏、小肠组织中抗氧化指标,检测血清中细胞因子白介素-6(int...     

骆驼乳对慢性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群的影响

目的:探究骆驼乳对慢性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群多样性及结构的影响。将雄性C57BL/6NCr小鼠随机分为4组:对照组(Con,n=6)、模型组(Et,n=6)、骆驼乳剂量组(EtCM,n=6)和牛乳剂量组(EtNM,n=6);实验期为8周,前4周饲喂Lieber-DeCarli液体饲料(含对照),后4周在饲喂Lieber-DeCarli液体饲料的基础上,灌胃相应的乳或生理盐水。灌胃结束后,按照5 g/kg剂量一次性灌胃31.5%酒精溶液,建立NIAAA模型。检测血清LPS含量,并在无菌条件下取小鼠结肠粪便,进行16S rRNA测序,分析肠道菌群α多样性、β多样性及基于门、属水平的物种结构。血清指标结果显示,EtCM组和EtNM组小鼠血清LPS显著降低(P<0.01)。16S r RNA测序结果表明,骆驼乳和牛乳能显著提高ALD小鼠结肠肠道菌群的丰度和均匀度,更好地调整肠道菌群结构,其中骆驼乳较牛乳显示出更好的α多样性。在门水平上,骆驼乳和牛乳显著提高拟杆菌门的丰度,降低厚壁菌门的丰度。在属水平上,骆驼乳和牛乳显著提高副拟杆菌属、拟杆菌属、阿克曼菌属的丰度,降低瘤胃菌科下的未知属Ruminococcaceae_UCG-013丰度。其中,骆驼乳的有益菌丰度较牛乳高出9%。结论:骆驼乳通过改变ALD小鼠肠道菌群环境,来调节肠道菌群结构,可作为调节肠道菌群的功能性乳制品,可预防慢性ALD引起的肠道屏障功能障碍。     

基于16S rRNA测序分析罗伊氏乳杆菌酸乳对健康小鼠肠道菌群的影响

目的:通过16S rRNA测序,探讨新型罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)发酵酸乳对健康小鼠肠道菌群的影响。方法:将24只KM小鼠分为4组,空白组(Ctr组,灌胃无菌水),对照组(BS组,灌胃传统酸乳,即保加利亚乳杆菌(Lactobacillus bulgaricus)和嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)发酵酸乳),混合发酵酸乳组(LBS组,灌胃L. reuteri、L. bulgaricus和S. thermophilus 3菌混合发酵酸乳),以及L. reuteri单独发酵酸乳组(L组,灌胃L. reuteri发酵酸乳)。连续灌胃10 d后收集各组小鼠粪便,通过16S rRNA测序分析各组小鼠肠道中菌群丰度、多样性及菌落组成结构。结果:与BS组相比,LBS组和L组小鼠体重增加百分比显著降低(P<0.0001);PCA与门水平菌群聚类分析表明,L组与Ctr组PCA空间距离以及2组菌群比例最为接近;属水平菌群分析表明,LBS和L组中另枝菌属(Alistipes)和副拟杆菌属(Parabacteroides)两类潜在益生菌的丰...     

基于IPTW法筛选高脂血症人群的差异肠道菌群

目的：研究高脂血症患者与非高脂血症人群肠道菌群的差异。方法：采用Illumina HiSeq二代测序技术分析肠道菌群组成和丰度,利用逆处理概率加权法（IPTW）校正混杂因素,通过QIIME2 ANCOM筛选高脂血症的差异菌群,运用R Tax4Fun包进行功能预测。结果：高脂血症组和非高脂血症组共有7个差异扩增序列变体（ASVs）（ASV_232、ASV_63、ASV_173、ASV_46、ASV_393、ASV_283、ASV_41）;甘油三酯组和非甘油三酯组（TG组与非TG组）只有1个差异ASV（ASV_422）;高密度脂蛋白胆固醇组与非高密度脂蛋白胆固醇组（HDL-C组和非HDL-C组）共有18个差异ASVs（ASV_9、ASV_15、ASV_28、ASV_36、ASV_50、ASV_56、ASV_80、ASV_99、ASV_153、ASV_45、ASV_636、ASV_243、ASV_109、ASV_516、 ASV_13、ASV_74、ASV_96、ASV_259）。功能预测结果显示：高脂血症组与非高脂血症组样本菌群功能组成高度相似,没有发现显著差异,大多数功能基因与能量代谢有关。结论：高脂血症患者与非高脂血症人群的差异肠道菌群为毛螺菌科、疣微菌科,双歧杆菌属、粪杆菌属、拟杆菌属、瘤胃菌属_UCG-013、Agathobacter、Subdoligranulum、Lachnoclostridium、Lachnospiraceae_UCG-010属,该结果说明碳水化合物代谢和氨基酸代谢所占比例较大。     

基于16S rRNA测序探究葛根芩连汤对抗生素相关性腹泻肠道菌群结构的影响

应用16S rRNA测序方法,观察葛根芩连汤对抗生素相关性腹泻SD大鼠肠道菌群结构的影响;将60只SD大鼠适应性喂养1周后,随机分为2组分别为空白组（C）（10只）和造模组（50只）,其中空白组给予生理盐水灌胃,而造模组SD大鼠给予克林霉素250 mg/kg灌胃造模,两组均为1次/d,连续7 d。造模成功后,将其随机分为5组：丽珠肠乐组（P）、模型组（M）、葛根芩连汤高、中、低剂量组（GQD-H、GQD-M、GQD-L),每组10只。丽珠肠乐组（双歧杆菌活性菌胶囊,0.15 g/kg）、葛根芩连汤高剂量组（10.08 g/kg）、中剂量组（5.04 g/kg）低剂量组（2.52 g/kg）分别给予对应药物进行灌胃干预。空白组及模型组给予等体积生理盐水灌胃,1次/d。各组连续给药7 d后,在无菌操作下提取各组大鼠粪便DNA,进行16S rRNA测序并分析其结果。通过Alpha与Beta多样性分析发现,GQD具有增加抗生素相关性腹泻大鼠肠道菌群多样性的作用;GQD可在门水平增加厚壁菌门、拟杆菌门的丰度,在属水平增加乳酸杆菌属、拟杆菌属的丰度。通过LEfse分析,发现GQD能增加乳酸杆菌、拟杆菌丰度,降低变形菌丰度。提示GQD可能通过改善肠道微生态结构治疗抗生素相关性腹泻。     

基于16S rDNA高通量测序技术分析北京豆汁儿微生物多样性和功能预测的研究

以北京不同城区具代表性的6家豆汁儿店的豆汁儿为研究对象,采用16S rDNA测序分析对豆汁儿中所含优势菌进行研究。结果表明:乳杆菌属(Lactobacillus)是豆汁儿中的优势菌属,乳杆菌目(Lactobacillales)占比达到95.8%以上。优势菌种为食窦魏斯氏菌(Weissella cibaria)、沙克乳酸杆菌(Lactobacillus sakei)。对豆汁儿中乳杆菌目(Lactobacillales)进行功能预测分析,推测豆汁儿中的风味物质来源于氨基酸代谢,发酵过程中产生β-低聚半乳糖及GOS,益于肠道菌群健康。     

植物乳杆菌P9对头孢曲松钠作用小鼠肠道菌群的影响

为了探究植物乳杆菌P9对抗生素致肠道菌群失调小鼠肠道菌群的影响,建立小鼠肠道菌群失调模型,再灌胃不同剂量植物乳杆菌P9菌粉,酶联免疫吸附法测定血清中炎症细胞因子水平,可见分光光度法测定肝脏和小肠组织中抗氧化指标,菌群计数和16S rDNA高通量测序探究小鼠肠道菌群的变化。结果显示,植物乳杆菌P9能够降低小鼠因抗生素造成的炎症反应,提高脏器氧化应激水平。菌群计数结果显示植物乳杆菌P9能够增加抗生素导致的双歧杆菌、乳酸杆菌的减少。16S r DNA测序结果显示,抗生素使小鼠肠道对抗生素耐药细菌丰度增加,而植物乳杆菌P9则降低耐药细菌丰度,植物乳杆菌P9具有调节小鼠肠道菌群的作用。     

高通量测序研究益生菌对小鼠肠道菌群的影响

采用高通量测序技术分析复合益生菌对昆明雄性小鼠肠道菌群的影响。利用0.9 mg/(g·d)青霉素钠灌胃建立肠道菌群失调小鼠模型。将50只小鼠随机分为5组:空白对照组、自然恢复组、复合菌液高、中、低3个剂量组(复合益生菌浓度分别为10~9、10~8、10~7 CFU/m L)。0.2 m L/(d·10 g)连续灌胃14 d后,收集小鼠粪便,采用高通量测序技术对各组小鼠粪便菌群进行分析。结果表明:复合菌液高剂量组小鼠肠道菌群物种多样性最高(ACE值为22 101.63和Chao1值为13 791.40),自然恢复组最低;另外,小鼠肠道中有益菌与致病菌比例在各组之间差异显著,复合菌液各剂量组中有益菌群的比例均大于自然恢复组,而致病菌比例最高的为自然恢复组(56.36%),因此复合菌液对小鼠的肠道菌群失调具有调节作用。     

膳食5’-核苷酸对酒精性肝损伤大鼠肠道菌群的影响

目的:研究膳食5’-核苷酸对酒精性肝损伤大鼠肠道菌群的影响,并进一步探讨可能的作用机制。方法:雄性Wistar大鼠随机分为对照组、酒精组、葡萄糖等热量对照组、普通饲料组、质量分数0.04%、0.16%5’-核苷酸干预组,连续饲养7周,测定大鼠体质量、脏体比、血清乙醇体积分数、血清转氨酶活力、血脂水平及总蛋白含量等相关指标;平板培养大鼠粪便中的乳酸杆菌、双歧杆菌、大肠杆菌、肠球菌,计算大鼠粪便中各种细菌的菌落数。结果:膳食5’-核苷酸能够增加酒精引起的大鼠体质量降低,轻度抑制血清乙醇体积分数的升高,抑制酒精引起丙氨酸氨基转移酶、乳酸脱氢酶活力和甘油三酯水平等升高(P0.05),增加血清总蛋白、白蛋白及球蛋白含量(P0.05);并能够增加肝体比,减少盲体比(P0.05);膳食5’-核苷酸能够增加肠道乳酸杆菌数量,同时减少大肠杆菌及肠球菌的数量(P0.05)。结论:膳食5’-核苷酸能够改善酒精引起的大鼠肝脏损伤,调节肠道菌群可能是其作用机制之一。     

熊果酸对酒精性肝损伤大鼠肠道菌群的影响

目的：探究熊果酸（ursolic acid,UA）补充对酒精性肝损伤大鼠肠道菌群的影响,为酒精性肝损伤的 防治拓展思路。方法：健康2 月龄雄性Wistar大鼠30 只随机分为3 组（每组10 只）,分别为正常对照组（生理盐 水）、酒精模型组（酒精）、UA干预组（酒精＋UA）,实验持续8 周。末次灌胃后12 h,麻醉后进行腹主动脉 取血,同时留取肝脏组织及粪便。苏木精-伊红染色法观察各组大鼠肝脏组织病理学变化;赖氏法检测血清转氨 酶活力;显色基质鲎试剂盒检测大鼠血浆内毒素水平;改良紫外酶促法检测血浆D-乳酸浓度;基因间重复共有序 列（enterobacterial repetitive intergenic consensus,ERIC）-聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）、 PCR-变性梯度凝胶电泳（denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE）技术获取粪便肠道菌群指纹图谱,并进行 大鼠肠道菌群多样性分析;实时荧光定量PCR技术检测各组大鼠肠道内大肠杆菌、粪肠球菌、长双歧杆菌和嗜酸 乳杆菌的含量。结果：苏木精-伊红染色病理学观察显示,酒精模型组大鼠肝小叶结构模糊,脂肪变性及炎性浸润 增多;与酒精模型组相比,UA干预组肝组织损伤程度明显得到改善,且血清转氨酶活力明显降低（P＜0.05）。此 外,UA的补充显著抑制了酒精引起的血浆D-乳酸浓度及内毒素水平升高（P＜0.05）。ERIC-PCR和PCR-DGGE结 果显示,UA干预改善了酒精所致肠道菌群结构的紊乱,使其朝着正常组大鼠肠道菌群结构方向趋近。实时荧光定 量PCR结果显示,UA干预组大鼠肠道内长双歧杆菌和嗜酸乳杆菌含量明显高于酒精模型组（P＜0.05）,大肠杆菌和 粪肠球菌含量较酒精模型组显著减少（P＜0.05）,且均接近于正常对照组。结论：适量地补充UA能够有效改善酒精 引起的大鼠肝脏损伤,其作用机制可能与UA调节酒精引起的肠道菌群结构和数量的改变、改善肠道微生态有关。     

无佐剂卵清蛋白致敏BALB/c小鼠的肠道菌群变化

研究无佐剂条件下卵清蛋白（ovalbumin,OVA）致敏BALB/c小鼠的肠道菌群变化,挖掘与OVA过敏关联的特征肠道菌群。构建OVA致敏小鼠模型,采用过敏症状评分、血清免疫球蛋白E (immunoglobulin E,IgE)水平检测及结肠组织形态学观察评估小鼠过敏反应。通过16S rRNA扩增子测序法进行肠道菌群分析,包括多样性分析、物种组成分析和功能预测。结果表明,OVA致敏组过敏症状评分、血清总IgE、OVA特异性IgE及结肠组织HE染色结果均出现显著变化,表明模型构建成功。肠道菌群分析结果显示：致敏组菌科水平的Pseudomonadaceae丰度显著上升,Lachnospirales-Lachnospiraceae与Desulfovibrionales-Desulfovibrionaceae丰度显著下降;菌属水平的Pseudomonas丰度显著上升,Lachnospiraceae NK4A136 group丰度显著下降,推测Bacteroidales可作为OVA过敏的特征菌群。     

16S rDNA序列关键位点的信息论分析

16S rDNA中含有较多的菌种特异性信息,但是如何使用这些信息进行菌种鉴定却因不同菌种间序列的特征变化缺少规律而变得困难。作者使用信息论方法对那些种内较保守,种间变异明显的关键位点进行研究。结果表明,16S rDNA序列中仅有少数位点对菌种的分类是重要的。基于少数关键位点的相似度比传统的全序列鉴定有着更好的统计学特性。     

木薯淀粉介导肠道菌群加剧小鼠肥胖症的机制

肥胖症是体内脂肪过度积累而导致超重的一种慢性代谢疾病.木薯淀粉属于可消化淀粉,目前对其研究多集中于对结构的解析和体外功能评价方面.本研究基于小鼠肥胖模型,采用高通量测序技术研究造模肥胖小鼠摄入木薯淀粉后血液中总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG),免疫指标免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白M(IgM...     

高通量测序检测米线中的食源性致病菌

为了解米线中食源性致病菌的污染情况,分析其细菌多样性随时间变化趋势,研究从原料到餐桌中各个环节米线样品中食源性致病菌的变化.采用高通量测序对10个米线样本中细菌16S rDNA区域进行测序分析,测序结果一共注释到5个门、11个纲、19个目、24个科和29个属的微生物信息.分析表明,在所有样品中,变形菌门均占据50％以上...