综合医院非伤寒沙门菌感染腹泻患者病原学分析

目的了解综合医院腹泻患者非伤寒沙门菌感染情况,分析非伤寒沙门菌的血清分型、耐药性和分子特征。方法对2009年9月-2011年6月腹泻病患者送检的767份粪便标本进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果从767份腹泻粪便标本中分离到36株非伤寒沙门菌,阳性检出率为4.56%;以儿童为主,占65.71%;共分为10种血清型,主要以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主,分别占37.14%和28.57%;10个血清型非伤寒沙门菌对头孢类和环丙沙星的敏感率>84.00%,除斯坦利沙门菌和山夫登宝沙门菌外,其他血清型均对多种抗菌药物产生不同程度的耐药或交叉耐药;将13株鼠伤寒沙门菌和10株肠炎沙门菌共分离出19个PFGE分型,其中2株肠炎沙门菌PFGE同型,3株鼠伤寒沙门菌PFGE同型,存在不同耐药谱。结论综合医院引起感染性腹泻的非伤寒沙门菌主要为鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,儿童多见;非伤寒沙门菌多药耐药严重,临床在应用氟喹诺酮类治疗非肠外沙门菌属感染时,应根据药敏结果慎重选择。     

江苏省2001～2003年伤寒、副伤寒沙门菌病原学监测研究

目的 了解江苏省2001～2003年伤寒、副伤寒菌株的耐药情况及伤寒菌株的噬菌体分型情况，掌握伤寒、副伤寒的流行规律，为今后的防制工作提供科学依据。方法 对江苏省2001～2003年收集的181株伤寒、副伤寒进行耐药性监测，对其中的136株伤寒菌株进行噬菌体分型。结果 江苏省2001～2003年136株伤寒菌株可分为14个型，分型率73．21％，主要噬菌体菌型为J1、M1和D2，分别占可分型菌总数的14．29％、13．39％和10．71％。不同年份、不同地区伤寒菌株的分型率不同，2002和2003年以里下河地区的分型率相对较高。伤寒、副伤寒菌株均对磺胺、红霉素、复方新诺明和氨苄青霉素具有不同程度的耐药性，副伤寒菌株的耐药谱较伤寒菌株宽。结论 伤寒噬菌体分型结果显示，江苏省的主要流行菌型变化不大。     

河南省2011-2015年非伤寒沙门菌病原学与耐药监测

目的 检测与分析2011-2015年自河南省腹泻多病原监测系统腹泻病例粪便中分离的1 351株非伤寒沙门菌血清型别及耐药表型。方法 采集河南省5家监测哨点医院肠道门诊及住院病例腹泻样本,进行沙门菌分离培养、生化鉴定与血清学分型;根据美国临床与实验室标准协会（CLSI）沙门菌K-B法药敏测试方案,对其进行8类12种抗生素的药敏测试与表型分析。结果 1 351株非伤寒沙门菌感染病例男女比例1.5：1（811：540）,以低龄儿童和青壮年为主;分离时间多集中于每年的5-10月,具有较典型的春夏季节特征。1 351株非伤寒沙门菌共分为58个血清型,以肠炎（S.enteritidis）、鼠伤寒（S.typhimurium）、阿贡那（S.agona）等7种血清型为主。药敏结果显示,其对广谱合成类青霉素氨苄西林（AMP）、三代头孢类抗生素头孢他啶（CAZ）、头孢噻肟（CTX）、四代头孢类抗生素头孢吡肟（FEP）、三代氟喹诺酮类抗生素环丙沙星（CIP）、氨基糖苷类抗生素庆大霉素（GEN）等12种抗生素均存在不同程度的耐药与多重耐药性。结论 河南省感染人群的非伤寒沙门菌血清型别众多;部分菌株对临床常用的12类抗生素具有较高的耐药率且多重耐药问题日益严重。     

广东省2018-2022年侵袭性非伤寒沙门菌病原学特征分析

目的 了解2018-2022年广东省侵袭性非伤寒沙门菌（iNTS）的血清型分布、耐药性以及分子流行情况,为沙门菌侵袭性感染的防治提供科学依据。方法 对2018-2022年广东省分离自血液和粪便样本的沙门菌进行血清学鉴定、药敏试验、多位点序列分型（MLST）和全基因组测序。同时利用微生物基因注释系统对测序结果开展耐药基因与毒力因子注释。结果 136株iNTS分为25种血清型,肠炎沙门菌占38.24%（52/136）。以鼠伤寒变种沙门菌作为对照计算其余iNTS血清型的OR值,奥雷宁堡、里森和波摩那3种沙门菌血清型的OR值较高,分别为423.50、352.92和211.75。iNTS耐药率在0.74%~66.91%之间,普遍低于非iNTS株（3.90%~77.21%）。iNTS耐药以氨苄西林和四环素为主,耐药率分别为66.91%（91/136）和50.00%（68/136）,而对环丙沙星（5.88%,8/136）、头孢他啶（5.88%,8/136）、庆大霉素（5.13%,7/136）和头孢西丁（0.74%,1/136）耐药率较低。iNTS携带多种耐药基因与毒力因子,但尚未发现共同毒力因子分布特征。MLST聚类分析显示,iNTS分为26种序列型别,ST11型占38.24%（52/136）。结论 2018-2022年广东省iNTS以肠炎沙门菌为主,其中奥雷宁堡、里森和波摩那3种血清型可能与更高的侵袭性感染风险有关。iNTS对临床一线治疗药物（头孢类和氟喹诺酮类抗生素）敏感,序列呈现高度多样性且具有明确的系统发育分支,以ST11型为本地优势克隆群。     

一起鼠伤寒沙门菌引起食物中毒的病原学鉴定

沙门菌引起的食物中毒,在细菌性食物中毒中最为常见,尤以鼠伤寒沙门菌为主.2009年6月19日中午阆中市民举办婚宴,就餐后陆续有38人出现发热、恶心、呕吐、乏力、腹泻等症状.首例患者发病时间为19日18时30分,末例发病时间为20日17时,发病高峰时间为19日晚20时.38例患者中年龄最大的70岁,最小的6岁.调查发现患者均食用凉菜,未食用凉菜者不发病.38例患者主要临床表现为发热、恶心、呕吐、头晕、乏力、寒战、腹泻症状.患者均到阆中市人民医院就诊治疗,经抗菌治疗,7 d内全部出院,无死亡病例.根据流行病学调查,结合临床症状及实验室病原学诊断,确诊为一起由鼠伤寒沙门菌感染所致的食物中毒,现将实验室病原菌的分离鉴定结果报告如下.     

152例非伤寒沙门菌肠炎临床及耐药情况分析

目的:研究近年来本地区非伤寒沙门菌感染肠炎患者的临床特征、流行病学特征及其耐药情况,为本地区的流行病学研究及临床合理用药提供依据。方法:用SS琼脂及伊红美兰琼脂培养基培养阳性的沙门菌,采用血清凝集法鉴定分型,同时采用K-B纸片法检测药物敏感性,采用NCCLS质控标准。结果:沙门菌肠炎主要是由肠炎血清型和鼠伤寒沙门菌所引起,任何年龄均可患病,幼儿发病率比较高,与不洁饮食有一定关系,春、秋季为该病新的发病高峰。该病以发热,腹痛,腹泻为主要临床表现,152株非伤寒沙门菌药敏结果显示该菌对喹喏酮类药物耐药率较高。结论:非伤寒沙门菌肠炎是临床常见的腹泻性疾病,近年该菌在流行病学方面表现出新的特征,且对临床常用抗菌药耐药率逐渐增加,患者临床表现仍以发热、腹痛、腹泻为主,加强其对喹喏酮类药物的监测是非常必要的。     

腹泻儿童非伤寒沙门菌感染的病原学及耐药性分析

目的探究苏州地区腹泻儿童非伤寒沙门菌(NTS)感染的病原学特征及耐药性变迁。方法回顾性收集2016年至2021年苏州大学附属儿童医院收治的1265例NTS感染相关腹泻患儿的临床数据并进行统计分析。结果本研究共分离得到1265株NTS,平均检出率为11.79%,主要以5岁以下低龄儿童为主,夏季为高发流行季节(20.00%),优势血清群为B群(63.95%)和D群(17.00%),其中以鼠伤寒沙门菌(54.47%)和肠炎沙门菌(15.18%)为主;药敏结果显示,苏州地区腹泻患儿分离得到的NTS对广谱合成类青霉素敏感性较低(耐药率均>70%),而对含酶抑制剂的青霉素复合制剂较为敏感(耐药率均<10%),对三代头孢菌素及其复合制剂、碳青霉烯类抗生素敏感性也较好;不同血清型沙门菌的耐药性也存在差异,D群沙门菌环丙沙星和复方新诺明总体耐药率均低于其他血清群(χ²值分别为20.71、147.24,P<0.05);2020—2021年分离的NTS对三代头孢菌素和氟喹诺酮类药物的耐药率较往年明显下降(χ²值分别为29.02、11.55,P<0.05)。结论NTS是导致苏州地区儿童感染性腹泻的主要病原菌,临床医生应认识到NTS的病原学特征及耐药性改变,帮助早期诊断和合理使用抗菌药物,延缓耐药菌株的产生。     

江苏省伤寒沙门菌噬菌体分型与耐药性监测报告

伤寒是我省常见和重点控制的肠道传染病.为掌握伤寒流行规律,为伤寒防治提供依据,我们在省内设立监测点开展了伤寒病原学噬菌体分型及耐药性监测.现将1995～2000年结果报告如下.     

广东省2009-2011年鼠伤寒沙门菌监测及菌株分子分型的研究

目的 了解广东省鼠伤寒沙门菌监测现况及菌株分子分型特点,并初步建立数据库,为食源性疾病暴发追踪污染源及传播途径提供基线数据。方法 参考国际PulseNet公布的沙门菌脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型方案及 7 个位点的鼠伤寒沙门菌多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）方法,分析广东省2009-2011年10个市275株鼠伤寒沙门菌分型特点,利用BioNumerics软件建立分子分型数据库。结果 2009-2011年广东省沙门菌年均检出率为4.03%;鼠伤寒沙门菌年均检出率和构成比分别为1.38%和34.29%,均呈双峰形分布趋势,流行高峰为5和9月。275株鼠伤寒沙门菌经XbaⅠ酶切和PFGE分析,获得124种带型,其分型D值为 0.928 6,而MLVA分型获得143种型别,D值为0.966 5,分辨能力高于单酶切的 PFGE分型。对其中>3株的相同带型进一步采用PFGE-XbaⅠ- BlnⅠ双酶切分型,获得分型共174种,D值为0.989 1,与采用MLVA方法相同,即对同一菌株的分辨结果具有较高一致性。结论 广东省鼠伤寒沙门菌具有遗传多样性。初步建立的菌株分子分型数据库显示采用MLVA 分型方法可完成菌株聚集性分析,以确认鼠伤寒沙门菌引起的暴发。     

2016年江阴市伤寒沙门菌耐药监测及分子分型分析

目的分析江阴市2016年伤寒沙门菌的耐药状况及同源性,为伤寒的临床用药和防控提供科学依据。方法按照WS 280-2008《伤寒和副伤寒诊断标准》对江阴市伤寒监测哨点医院的患者进行诊断,按照GB/T 4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》对患者样本进行分离鉴定。选择10种常见抗菌药物,运用K-B法对从伤寒患者体内分离到的73株伤寒沙门菌进行耐药性试验,并运用脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Eletrophoresis,PFGE)对16株有代表性的伤寒沙门菌进行分子同源性分析。结果江阴市2016年报告伤寒发病率6.56/10万,共分离伤寒沙门菌77株。对73株菌株进行耐药试验,所有菌株对萘啶酸和利福平100.00%耐药,对阿莫西林、头孢噻吩和头孢噻肟100.00%敏感,菌株多重耐药率为39.72%,多重耐药谱为:萘啶酸-利福平-甲氧苄啶。16株菌株经PFGE聚类分析后,呈现4种不同型别,其相似度均>80.00%,其中13株菌株相似度为100.00%。结论江阴市伤寒沙门菌耐药形势严峻,萘啶酸和利福平不再适合用于伤寒治疗,头孢菌素类及青霉素类抗菌药物为孕妇及儿童感染伤寒沙门菌时的首选。PFGE显示13份伤寒菌株与XQ镇井水中分离到的伤寒菌株同源,结合流行病学分析后,确认为暴发菌株。     

广东省2008－2009 年沙门菌监测

目的 了解广东省腹泻患者中沙门菌的感染及沙门菌暴发的情况以及沙门菌株的血清型别、耐药性和分子特征.方法 对纳入研究的腹泻病患者进行沙门菌的检测,对日常监测中分离到的菌株和暴发监测收集到的菌株进行血清分型、药物敏感试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型.结果 2008年共检测1922份粪便标本,分离到7l株沙门菌,阳性率为3.7%;2009年检测2110份粪便标本,分离到85株沙门菌,阳性检出率为4.0%;156株菌共分37种血清型,鼠伤寒和肠炎沙门菌居多;监测到10起由沙门菌污染引起的食物中毒事件,其中有4起由肠炎沙门菌引起,有3起由鼠伤寒沙门菌引起;发现1起疑似肠炎沙门菌暴发,并开展流行病学调查,结果提示4名病例中有2名病例是感染同一来源的肠炎沙门菌;229株沙门菌对头孢类和喹诺酮类抗菌药物敏感率达80%以上,59.3%是多重耐药沙门菌.结论 在广东省引起感染性腹泻和食物中毒的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌.

Abstract：

Objective To understand the infection of Salmonella (S.) in patients with diarrhea and outbreaks caused by Salmonella to identify the serotypes, resistance to antibiotics and PFGE types of the strains from the surveillance program in Guangdong province. Methods S. strains from patients with diarrhea were detected, and all the positive strains collected in routine and outbreak surveillance programs, were tested by serum agglutination, antibiotic susceptibility and PFGE.Results 71 S. strains were isolated from 1922 stool samples in 2008, with positive rate as 3.7%.85 S. strains were isolated from 2110 stool samples in 2009, with positive rate as 4.0%. All the 156 strains were divided into 37 serotypes, with S. serotype typhimurium and enteritidis as the most common serotypes. 10 incidents of food poisoning were detected, of which 4 were caused by enteritidis and 3 by typhimurium. A suspected outbreak by enteritidis was discovered and under epidemiological investigation. The findings indicated that 2 of the 4 patients from this outbreak were infected with identical enteritidis isolates. 80% of the 229 isolates were found susceptible to cephalosporins and quinoione and 59.3% of them were muitiresistant to the antibiotics. Conclusion S. enteritidis and S. typhimurium were the most common serotypes that caused infectious diarrhoea and food poisoning in Guangdong province.     

福建省2005-2017年流行性腮腺炎疫情及病原学监测分析

目的 分析福建省2005-2017年流行性腮腺炎（腮腺炎）的流行病学及病原学特征。方法 通过中国疾病预防控制传染病报告信息管理系统,收集2005-2017年福建省腮腺炎报告病例,主动搜索、访谈收集腮腺炎疫苗接种信息,对新发病例采集咽拭子标本进行腮腺炎病毒（mumps virus,MuV）细胞培养、基因定型及基因序列分析。结果 2005-2017年福建省累计报告腮腺炎病例83 959例,年平均发病率为17.6/10万,2007年后发病率总体呈先上升后下降趋势,到2017年为监测以来的历史新低（7.5/10万）;发病时间呈明显的季节性双峰特征,但第1个发病高峰（4-7月）有减弱趋势,而第2个发病高峰（10月至次年1月）有增强趋势;发病人群以学生、托幼儿童、散居儿童为主（占总病例数89.2%,5 814/6 517）,其中5~9岁年龄组年平均发病数达2 527例（占总病例数38.8%）;发病无明显的地域性特征。病原学监测表明福建省存在MuV G基因型病毒株的流行。序列分析发现2015年MuV G基因型病毒株在核苷酸上的突变导致了SH基因编码区6个氨基酸位点变异,进一步加大了与A型疫苗株在核苷酸及氨基酸上的同源性差异。结论 2005-2017年福建省腮腺炎发病逐年下降,预防工作需重点关注中小学生,MuV G基因型病毒株在福建省存在传播链,且在SH基因编码区发现部分氨基酸变异。需加强福建省腮腺炎流行病学及病原学监测工作。     

2010年北京市丰台区食源性致病菌监测

目的:了解北京市丰台区各类食品食源性致病菌污染状况,为控制和降低食源性疾病提供依据.方法:按照<全国食源性疾病监测工作手册>要求抽取13类196件食品,监测7种食源性致病菌和污染指示菌大肠菌群.结果:食源性致病菌总检出率为5.11%(10/196),共检出3种致病菌:沙门氏菌检出率为2.55%(5/196)、金黄色葡萄...     

2007 - 2014年武汉市儿童流感病原学监测结果分析

目的 对武汉市2007 - 2014年儿童流感病原学监测资料进行分析,掌握其流行规律、病毒分型和活动水平,为儿童流感的预防和流行提供依据。方法 对流感样病例采集咽拭子标本,用Real time-PCR分子生物学法进行流感病毒检测,对不同流感病毒的流行进行季节和年龄分布的统计学分析。结果 共采样5 232份,病毒分离阳性率为22.23%,其中A型流感病毒占71.53%,B型流感病毒占28.47%。2007年 - 2011年,季H3亚型阳性率在7 - 9月达到高峰,2012年后,每年12月 - 次年3月阳性率出现次高峰。新甲H1亚型、B型Yamagata系和Victoria系阳性率高峰均保持在每年12月至次年3月。3岁以下、3～5岁、6～10岁、11～15岁和16～18岁年龄段儿童流感病毒分离阳性率分别为14.97%、22.83%、40.45%、40.96%和75.00%。 结论 季H3亚型的流行时间由夏季高发转变为夏季和冬春季均高发;新甲H1亚型、B型Yamagata系和Victoria系为冬春季高发。流感病毒阳性率与年龄存在线性趋势,5岁以下儿童和中小学生属易感人群。     

青海省海南州2007—2012年鼠疫流行监测分析

目的分析青海省海南州鼠疫的流行特征,探讨其鼠疫流行态势,为今后鼠疫防治工作提供科学依据。方法海南州是国家级鼠疫监测点,按照《全国鼠疫监测方案》开展监测工作,收集、汇总2007-2012年海南州境内的鼠疫监测数据和人间鼠疫疫情资料,应用描述流行病学方法进行统计分析。结果 2007、2009年发现3份阳性犬血清,2010年发现4份旱獭阳性血清和1份沙狐阳性血清,滴度最高达到1∶20 480。海南州动物鼠疫一直在流行;兴海县于首次发现鼠疫60年后的2009年再次暴发人间肺鼠疫,说明该地区动物间鼠疫传播给人的风险较大。结论海南州动物间鼠疫处于活跃状态,人间鼠疫防控态势非常严峻。     

2002～2005年广西食品中沙门氏菌的监测与分析

目的了解广西食品中沙门氏菌的污染状况,初步确定易受污染的食品,为防范由沙门氏菌引起的食物中毒和食源性疾病监测提供科学依据。方法在广西南宁等6个城市建立食品污染物监测点,定期随机采集6类农贸市场的食品,检验方法按照中国疾病预防控制中心营养与食品安全所统一的沙门氏菌检验方法进行。结果2002~2005年共监测6类食品1872份,检出沙门氏菌128株,检出率为6.84%,分属6个群、19个血清型。结论在广西食品中不同程度受到沙门氏菌的污染,以生畜禽肉污染严重。应加强畜、禽类屠宰、运输、加工过程的卫生管理和监测,减少食源性疾病的发生。     

2006--2007年吉林省蜚蠊种群监测

目的掌握吉林省蜚蠊种群分布和季节性消长等动态变化规律。方法统一使用粘蟑纸诱捕。结果吉林省9个市（州）的美洲大蠊所占比例较少，德国小蠊已占95％以上。蜚蠊以3月和7—9月为活动高峰期。结论德国小蠊现已成为吉林省各地的绝对优势种。提示应将其列为今后防治的重点。     

四川省1990-2008年克山病监测

目的 探索四川省克山病病情演变规律与流行特点.方法 采用描述流行病学方法,收集汇总1990-2008年资料数据,并进行统计分析.结果 四川省克山病19年间,急型、亚急型克山病累计发病87例.病例均为农业户儿童,彝族儿童居多,发病年龄最小5月龄,最大18岁,2～6岁最多,年发病率波动在0/10万～1.73/10万之间,以1999年最高(1.73/10万);临床慢型、潜在型克山病累计检出310例,总检出率0.28%～2.8%,以1992年最高;19年间的病区人群硒营养水平,1995年最低(0.1345μg/g),1990-2000年次之(0.1558 μg/g),属于病区硒水平.结论 四川省克山病病情演变过程可分为5个阶段,2个上升阶段,3个下降阶段,各阶段差异均有统计学意义,而病情下降的3个阶段均为采取了以补硒为主要手段的防控措施之后,表明贫硒与克山病发病关系密切.