肝素酶HLA-A2限制性CTL表位肽的筛选及其活性鉴定

目的 预测并鉴定新的人乙酰肝素酶(Hpa)抗原的HLA-A2限制性CTL表位,为恶性肿瘤多肽疫苗的免疫治疗提供依据. 方法 采用SYFPEITHI和BIMAS软件预测方法,对肝素酶HLA-A2限制性CTL表位进行预测,合成候选表位肽;利用T2细胞特点,对合成的候选肽与HLA-A2分子进行亲和力分析;利用乳酸脱氢酶释放试验检测待检肽特异性CTL诱导活性;利用ELISPOT检测T细胞活性. 结果 在所筛选的6条候选CTL表位肽中,Hpa(310～318)FLNPDVLDI与HLA-A2分子具有高亲和力,在体外可有效诱导肝素酶特异性CTL的产生,对肝素酶阳性且HLA-A2限制性的HCC-LM6肝癌细胞及SW-480结肠癌细胞具有明显的杀伤效应,且能有效诱导IFN-γ分泌,增强免疫活性. 结论 首次发现Hpa(310～318)FLNPDVLDI可能是肿瘤肝素酶抗原的HLA-A2限制性CTL表位.     

肿瘤抗原TRAG-3 HLA-A2.1限制性CTL表位的鉴定

目的寻找并鉴定TRAG-3来源的HLA-A2．1限制性CTL表位，为临床开展基于TRAG-3表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法应用超基序和量化基序方案，预测TRAG-3 HLA-A2．1限制性CTL表位。用计算机分子模拟的方法，对预测表位进行分子模拟。用流式细胞仪分析测定各肽与HLA-A2．1分子的结合力。最后，应用HLA-A2．1阳性健康志愿者外周血单个核细胞(PBMC)对其体外诱导的CTL效应进行鉴定。结果应用超基序和量化基序方案，预测出4个候选表位肽，用计算机分子模拟发现其中只有TRAG-3（37-45)不符合HLA-A2．1限制性CTL表位的特点。在上述4个九肽中，TRAG-3(58-66)与HLA-A2．1分子的结合力最高。在进一步的CTL诱导实验中，发现TRAG-3(58-66)能够诱导健康志愿者PBMC产生特异性CTL。结论表位预测、计算机分子模拟、结合力分析和体外CTL诱导实验的一致性较好。4种方法一致认为，TRAG-3（58-66）(ILLRDA-GLV)为HLA-A2．1限制性CTL表位。该表位肽可望用于基于TRAG-3抗原多肽疫苗的临床实验。     

骨髓瘤抗原Sp17 HLA-A*0201限制性CTL表位预测及初步鉴定

目的鉴定骨髓瘤抗原Sp17的HLA-A＊0201限制性CTL表位。方法采用超基序和量化基序法预测Sp17的HLA-A＊0201限制性CTL表位；用T2细胞亲和力实验和稳定性实验对该表位进行初步鉴定。结果超基序和量化基序法预测得出Sp17抗原的4个CTL表位（LLEGLTREI（19-27）、ILREQPDNI（27-35）、SLLEKREKT（45-53）、KEKEEVAAV（111-119）），亲和力实验结果表明LLEGLTREI（19-27）、ILREQPDNI（27-35）、SLLEKREKT（45-53）有较高亲和力，而KEKEEVAAV（111-119）肽亲和力较低；稳定性实验表明ILREQPDNI（27-35）、SLLEKREKT（45-53）与HLA-A＊0201分子结合稳定性较好。结论ILREQPDNI（27-35）、SLLEKREKT（45-53）有可能是骨髓瘤抗原Sa17 HLA-A＊0201限制件CTL表位。     

肿瘤抗原MAGE-3 HLA-A2限制性CTL表位的预测

目的 预测肿瘤抗原ＭＡＧＥ－３的ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位。方法 以肿瘤特异性抗原ＭＡＧＥ－３为研究目标,采用基序方案和二级锚点相结合的ＣＴＬ表位预测方法。结果 预测出了ＭＡＧＥ－３的６个ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位。结论：所预测出的６个ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位经后续实验筛选、鉴定后,可用于基于ＭＡＧＥ－３的肿瘤治疗性多肽疫苗的设计研究。     

轮状病毒结构蛋白VP7 HLA-A2.1限制性CTL表位的初步鉴定

目的 预测并初步鉴定轮状病毒Wa株结构蛋白VP7 HLA—A2．1限制性CTL表位。方法 用BIMAS软件预测VP7 HLA—A2．1限制性CTL表位;分子模拟技术对分值最高的4条肽进行分子模建;最后测定候选肽与HLA-A2．1分子的亲和力及结合稳定性。结果 结合BIMAS及分子模拟的预测结果,选择4条肽QLYCDYNLV（132—140）、LLNYILKSV（18—26）、VLMKYDQSL（140—148）及VNWKKWWQV（287—295）作为候选表位肽;4条肽与HLA—A2．1结合的荧光系数（FI）值分别为2．58、3．83、3．19及0．82,肽-HLA-A2．1复合物半数解离时间（DC50）分别为2-4、6-8、8及2h。结论 QLYCDYNLV（132—140）、LLNYILKSV（18—26）及VLMKYDQSL（140—148）为潜在的HLA-A2．1限制性CTL表位。     

Survivin-△Ex3蛋白HLA-A2．1限制性CTL表位的基因疫苗抗肿瘤效果初探

预测并合成survivin-△Ex3 HLA-A2．1限制性CTL表位的基因疫苗,探讨携带表位基因的减毒鼠伤寒沙门氏菌口服疫苗对小鼠移植肝癌模型的保护作用。将表位基因序列连接,构建pVAX1-STEs-EGFP真核表达载体,转化入减毒鼠伤寒沙门氏菌作为口服疫苗。实验动物分为未免疫对照组、口服沙门氏菌组、pVAX1质粒转染的减毒鼠伤寒沙门氏菌组;口服pVAX1-Survivin-△3（T34A）！ EGFP质粒转染的的减毒鼠伤寒沙门氏菌组和口服pVAX1-STEs ！ EGFP质粒转染的的减毒鼠伤寒沙门氏菌组。结果表明：在5组肿瘤模型小鼠中,肿瘤瘤块平均直径分别为：15．11±2．43 mm、13．70±2．97 mm、13．05±1．77 mm、7．46±2．61 mm、9．05±2．18 mm;表位疫苗组与其他组相比,有显著性差异（P＜0．01）。说明小鼠口服携带survivin-△Ex3 HLA-A2．1限制性CTL表位的基因疫苗后,能抑制小鼠肝癌细胞的增殖和扩散。     

慢性白血病抗原CML28 HLA-A*0201限制性CTL表位预测

目的鉴定慢性白血病肿瘤抗原CML28的HIA-A*0201限制性CTL表位。方法 采用超基序和量化基序结合的方法初步预测CM128的HLA-A*0201限制性CTL表位；利用T2细胞亲合力实验初步验证预测结果。结果 在预测的4个候选CTL表位中，ALVDAGVPM和ALDSDGTLV有较高的亲和力，ALFCGVACA和SLLACCLNA仅有低度亲和力。结论ALVDAGVPM与ALDSDGTLV最有可能是慢性白血病肿瘤抗原CML28的HLA-A*0201限制性CTL表位。     

HPV16E7抗原HLA-A2限制性CTL表位预测及其合成

目的：预测、合成、纯化及鉴定人乳头瘤病毒E7抗原的HLA－A2限制性细胞毒性T淋巴细胞表位，为表位抗原特异性鉴定和临床研究提供靶肽。方法：采用超模体、多项式和量化模体方案相结合的方法，对靶抗原HPV16E7的HLA－A2限制性细胞毒性T淋巴细胞（Cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位进行预测，并运用固相合成法合成多肽，经RP－HPLC纯化及纯度分析，用质谱进行定性鉴定。结果：分别预测出了16个、10个和3个九肽表位，确定其中5个九肽为候选合成表位，各合成肽的纯度都在95％以上。经质谱分析，各肽的分子量测定值与理论值相符。结论：超模体、多项式和量化模体方案联合应用可提高预测效率，避免了在研究E7抗原表位时盲目合成多肽；所合成的多肽为高纯度靶肽，可用于后续实验研究。     

HIV-1 Gag抗原HLA-A*0201限制性低亲和性CTL表位预测及改造分析

初步筛选HIV-1 Gag抗原的HLA-A*0201限制性低亲和性CTL表位,预测并初步鉴定修饰后的表位与HLA-A*0201之间亲和性的变化。采用超基序、蛋白酶解预测等相结合的办法筛选HLA-A*0201限制性低亲和性CTL表位,通过氨基酸置换适当修饰,并以T2细胞株测定肽与HLA-A*0201分子的亲和力和稳定性试验来评价修饰后表位与HLA-A*0201之间亲和性。结果:筛选出3个低亲和性CTL候选表位,经修饰后的表位与HLA-A*0201之间的亲和性均有不同程度的提高。YIYKRWIIL(259-267Y1),YQANFLGKI(429-437Y1)和YTNNPPIPV(249-257Y1)与HLA-A*0201呈高亲和力结合,荧光系数(flurorescene index,FI)分别为2.68、2.54和2.35,同时肽-HLA-A*0201复合物半数解离时间(dissociation complex50,DC50)均大于8h。预测的低亲和力表位经过修饰可能会成为潜在的HLA-A*0201限制性表位。     

人Ⅱ型胶原的HLA-A~*0201限制性CTL表位的预测及初步鉴定

目的预测和初步鉴定类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)主要自身抗原Ⅱ型胶原(CollagenⅡ,CⅡ)的HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes,CTL)表位,为基于CⅡ抗原表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法选取BIMAS、SYFTEPITHI、IEDB、SVMHC、AntiJen预测工具预测该抗原HLA-A*0201限制性结合肽;人工合成待测表位肽,利用T2细胞株通过直接免疫荧光法测定各肽与HLA-A*0201分子的结合力。利用酶联免疫斑点检测(enzyme-linked immunospotassay,ELISPOT)方法检测候选肽刺激关节滑液单个核细胞(synovial fluid mononuclear cell,SFMC)分泌IFN-γ的能力。结果综合BIMAS、SYFTEPITHI、IEDB、SVMHC、AntiJen预测结果筛选出来可能与HLA-A*0201结合的5条肽。MHC亲和力实验表明,在候选的5条肽中,P1261、P1365及P1399具有与HLA-A*0201分子结合的能力,平均荧光强度分别为:1.35、2.53、1.78。ELISPOT试验结果表明,P1365具有刺激SFMC分泌IFN-γ的能力。结论表位预测结果与初步鉴定结果具有一致性,两者联合应用初步认为P1365是HLA-A*0201限制性CTL表位的可能性最大,为下一步表位鉴定及基于人CⅡ抗原表位的特异性免疫治疗奠定理论基础。     

CTL识别的HLA-A2限制性人卵巢癌相关抗原OVA66表位的鉴定

目的：鉴定CTL识别的HLA—A2限制性人卵巢癌相关抗原OVA66表位。方法：以细胞因子从外周血单个核细胞(PBMC)中诱导树突状细胞(DC)，通过形态学观察和流式细胞术进行鉴定。用表位预测法选取并合成两种肽分子，分别脉冲成熟的DC，并刺激HLA—A2^ 健康人自体CD8^ T细胞，1wk后，用脉冲肽的自体PBMC以每7d的间隔刺激该CD8^ T细胞3次。以共接受4次抗原肽刺激的T细胞作为CTL，用乳酸脱氢酶(LDH)释放试验，检测CTL对靶细胞的杀伤效应。用酶联免疫斑点法(ELISPOT)．检测CTL中抗原特异性分泌IFN-γ的T细胞数。结果：形态学和流式细胞术的结果显示．PBMC可诱生成熟的DC。肽1235(FLPDHINIV)诱导的CTL．可特异性杀伤1235脉冲的T2细胞和OVA66^ 、HLA—A2^ 的SW480细胞，且L235诱导的特异性分泌IFN-γ的T细胞数增加。结论：卵巢癌相关抗原OVA66的HLA—A2限制性CTL表位1235．能激发对肿瘤抗原的特异性免疫应答，为制备肿瘤特异性肽疫苗奠定了实验基础。     

Expression of the breast differentiation antigen NY-BR-1 in a phyllodes tumor of the vulva

We describe a phyllodes tumor of borderline malignancy in the labium majus of a 49-year-old woman. The histogenetic origin of phyllodes tumors in the vulva is controversial. Strong immunoreactivity for NY-BR-1, a novel breast differentiation antigen, was demonstrated within the epithelial components of the phyllodes tumor. A similar expression pattern was observed in mammary-like glands of the vulva. These findings provide further evidence that phyllodes tumors of the vulva might derive from mammary-like glands in the labium majus or from ectopic breast tissue.     

肿瘤抗原MAGE-A3新的HLA-A2限制性CTL表位的发现与鉴定

目的:鉴定肿瘤抗原MAGE－A3新的HLA-A2限制性CTL表位。方法:采用CTL表位预测的基序法与二级锚点相结合预测 MAGE-A3的 HLA-A2限制性CTL表位;用计算机分子模拟进行表位的初步筛选;以标准51Cr释放试验检测特异性CTLs诱导活性。结果:在所筛选的4个候选CTL表位中,MAGE-A3201-209可在体外有效诱导特异性CTLs的产生,杀伤靶细胞。结论:MAGE-A3201-209为肿瘤抗原MAGE-A3的新的HLA-A2限制性CTL表位。为基于MAGE-A3的肿瘤治疗性多肽疫苗的设计、研究奠定了基础。     

SARS冠状病毒M蛋白HLA-A*0201限制性CTL表位的预测

目的 预测SAR冠状病霉M蛋白的HLA-A*0201限制性CTL表位。方法 联合应用简单基序法和延展基序法。结果 预的测出4个九肽CTL表位。结论通过对SARS冠状病毒M蛋白抗原CTL表位进行预测，从而为SARS冠状病毒M蛋白CTL表位的实验探测和鉴定提供了线索，为认识CTL介导的细胞免疫机制以及基于CTL表位的疫苗研制提供了基础资料。     

Identification of ribosomal proteins S2 and L10a as tumor antigens recognized by HLA-A26-restricted CTL

Recent identification of cytotoxic T lymphocyte (CTL)-directed peptides binding to the HLA-A2 and -A24 alleles has opened the door to peptide-based cancer immunotherapies. However, subsequent studies have succeeded in identifying no more than a few CTL-directed peptides that bind to alleles other than HLA-A2 and -A24, thus hampering development of immunotherapies directed at other alleles. We have shown in this study that two genes coding for ribosomal proteins (S2 and L10a) encoded tumor antigens recognized by HLA-A26-restricted CTLs. The S2 mRNA was expressed in all of the cancer cells and non-malignant cell lines tested, but was not expressed in normal tissues except for the testis, muscle, and peripheral mononuclear leukocyte cell (PBMC). In contrast, the L10a mRNA was expressed in all of these cancer and non-malignant cell lines, and also normal tissues, although the expression levels in normal tissues were mostly low. One S2-derived peptide and two L10a-derived peptides had the ability to induce HLA-A26-restricted and peptide-specific CTLs reactive to tumor cells in PBMCs of cancer patients, respectively. These ribosomal protein-derived peptides, and particularly the S2-derived peptide, could be suitable for use in peptide-based immunotherapy for HLA-A26+ cancer patients.