RAPD在枇杷品种鉴定中的应用

运用RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA,即随机扩增多态性DNA)分析技术,对16个枇杷品种的基因组DNA进行RAPD分析,从几个随机引物中筛选出2个随机引物能从各个品种的基因组DNA扩增出DNA片段,在16个枇杷品种中2个引物扩增出19个DNA片段,其中3个为公共,16个为多态性或单态性DNA片段,表明不同枇杷品种基因型间存在着极为丰富的遗传多样性,扩增的DNA指纹图谱可将16个品种一一区分,为枇杷品种鉴定提供了新的方法,同时也为分子标记辅助育种提供了依据。     

应用RAPD技术对、李、桃亲缘关系的探讨

 利用RAPD 技术对、桃、李部分南方品种进行鉴定, 并探讨了与桃李之间的亲缘关系。聚类分析结果显示, 不是桃和李的杂交种, 或李的变种, 应当是李属的一个种或亚种。RAPD 技术能很好地用于桃、李、种间和品种之间的鉴定。     

应用RAPD技术对、李、桃亲缘关系的探讨

利用RAPD技术对、桃、李部分南方品种进行鉴定 ,并探讨了与桃李之间的亲缘关系。聚类分析结果显示 ,不是桃和李的杂交种 ,或李的变种 ,应当是李属的一个种或亚种。RAPD技术能很好地用于桃、李、种间和品种之间的鉴定     

苹果RAPD分析体系的建立

对富士苹果（Ｍａｌｕｓ Ｐｕｍｉｌａ Ｍｉｌｌ．ｃｖ．Ｆｕｊｉ）ＲＡＰＤ（Ｒａｎｄｏｍ Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ＤＮＡ）分析体系的优化研究表明,ＲＡＰＤ反应体系中,ＤＮＡ、Ｔａｑ酶、引物和Ｍｇ＾２＋４种主要成分的最适用量分别为：２０ｎｇ、１．０Ｕ、０．２μｍｏｌ．Ｌ＾－１和３．０μｍｏｌ．Ｌ＾－１。采用该优化体系,以ＯＰＪ０３为引物,构建了我国及世界范围内苹果生产中重要的２８个     

RAPD及其在果树上的应用

就ＲＡＰＤ的特点,操作及其在果树品种鉴定,遗传多样性检测。系谱解析和遗传图谱的建等方面的应用和进展进行了简要的阐述。     

菜薹KASP-SNP指纹图谱构建及品种鉴定

利用前人已开发的200个芸薹种KASP-SNP分子标记对89份菜薹品种进行基因分型,共有131个标记分型成功,转化率为65.50%,缺失率为0.06,次要等位基因频率（MAF）为0.21,观测杂合度为0.21,多态性信息含量（PIC）为0.27,并将这些标记用于系统进化树构建及群体结构分析。进一步基于次要等位基因频率大于0.25,多态性信息含量大于0.35,缺失率小于0.03,杂合率小于0.6等参数,筛选出18个核心KASP-SNP分子标记,并构建了89份菜薹品种的SNP指纹图谱,证明了KASP技术在菜薹品种鉴定中的可行性。     

中国部分兰花品种RAPD分析

用随机引物扩增多态DNA（RAPD）分析技术，对中国兰花迸行品种鉴定和分类研究。使用10种20个碱基的引物，对19个中国兰花品种的基因组DNA进行扩增，其产生83条扩增带，其中80条大多态性带。每个兰花品种都有其特有的扩增带可与其它品种区别开来。这种特异的条带可作为一个品种的分子标记应用于品种鉴定和分类RAPD对基因组的分析结果与传统分类学的结果基本相符。各个种内的不同品种问亲缘关系接近，而不同种间差异较丸RAPD技术为中国兰花品种的鉴定和分类提供了新的途径     

枸杞RAPD反应体系的优化

现以枸杞基因组DNA为模板,对其RAPD反应体系进行优化以确定最佳反应体系。结果表明:在总体积25μL中Mg2+(2.5 mM)、模板DNA(25 ng)、引物浓度(0.6μM)、dNTPs(0.25 mM)和TaqDNA聚合酶(2.0 U)时,PCR扩增效果最好并能获得较清晰的枸杞DNA指纹图谱。     

辣椒抗疫病研究中的RAPD反应体系优化

以高抗疫病的perenial、高感疫病的83-60,及perenial×83-60的F2代辣椒苗为材料,采用CTAB法提取辣椒基因组DNA,研究RAPD-PCR反应的相关影响因子,建立并优化了一组适合辣椒抗疫病研究的RAPD-PCR反应体系和程序。     

杏品种的RAPD分析

实验从S系列(Sangon公司)100个引物中筛选出能稳定扩增的18个引物,用这些引物首次对新世纪与红丰等20个杏品种进行了扩增,均具有多态性。共扩增出218条带,106条具有多态性,多态性比例为48.6%;建立了红丰及新世纪等优新品种的DNA指纹图谱,找到了它们的特异谱带。利用特异谱带结合DNA指纹,可将参试品种鉴别出来。同时利用STATISTIC软件,根据RAPD标记相似系数采用UPGAM聚类策略,对20个杏品种进行了聚类分析。在LD=0.4时划等值线,将参试品种分为7类。     

中国枣种质资源的RAPD分析

利用ＲＡＰＤ技术对枣６４个品种及类型的遗传变异进行了研究。从１２０个１０ｂｐ随机引物中筛选出４０个多态性引物用于正式扩增,共扩增出４９２条ＤＮＡ带,其中多态性ＤＮＡ带２９３条,占５９．５５％,平均每个引物扩增的ＤＮＡ带的数目为１２．３１条。有１３个品种及类型扩增出了１个以上的特有ＲＡＰＤ标记,据此可以进行品种鉴定或早期性状预选。利用ＤＮＡ扩增结果进行聚类分析,把供试的６４个品种及类型分为８类,并对     

李属植物DNA提取及RAPD反应体系的优化

以1号李,6号李和公主红为试材,对李属植物DNA提取方法进行改良并进行RAPD反应体系的优化.结果表明:改良CTAB(3%)法提取的DNA产量高,可满足RAPD扩增的需要.25 μL反应体系中,DNA聚合酶、Mg2 、引物、模板DNA和dNTPs 5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:1.0 U、2.0mmol/L、10 pmol/L、20 ng和1.0mmol/L.     

利用正交设计建立洋桔梗RAPD最佳反应体系

利用正交设计法对影响洋桔梗RAPD反应的Mg2 、dNTPs、Taq DNA 聚合酶、引物和模板等主要因素的作用进行了比较分析,建立了洋桔梗RAPD的最佳反应体系:即在25 μL反应体积中,10×PCR buffer为2.5 μL ,Mg2 浓度为2.0 mmol/L,dNTPs浓度为0.4 mmol/L,引物浓度为0.2 μmol/L,模板浓度为50 ng/μL,Taq DNA聚合酶用量为1.0 U;在此基础上,比较了不同退火温度对RAPD扩增产物的影响,退火温度经筛选选定为41℃;最后再将该反应体系应用于不同引物,结果表明该优化结果具有较好的稳定性和通用性.     

梨属种质资源的RAPD分析

 对梨属40 个品种及类型进行了RAPD 扩增, 根据相似系数进行UPGMA 法聚类,将起源于欧洲的西洋梨与起源于中国的3 个种明显区分开, 起源于中国的3 个种虽未完全各自聚类, 但各材料间都有不同的遗传距离, 证明RAPD 技术可作为梨种质分类鉴定的依据。     

杏43个品种资源的RAPD分类

对 43个杏品种进行RAPD扩增 ,根据相似系数进行UPGMA法聚类 ,结果发现 ,品种间表现出较强的地理分布集中性 ,也有广泛遗传信息交流。个别古老品种地缘关系很近 ,却与其他当地品种差距很大 ,可能是其基因较为原始保守所致。     

苹果RAPD分析体系的建立

对富士苹果（Ｍａｌｕｓ　ｐｕｍｉｌａ　Ｍｉｌｌ．ｃｖ．Ｆｕｊｉ）ＲＡＰＤ（Ｒａｎｄｏｍ　Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ　Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ　ＤＮＡ）分析体系的优化研究表明,ＲＡＰＤ反应体系中,ＤＮＡ、Ｔａｑ酶、引物和Ｍｇ２＋４种主要成分的最适用量分别为：２０ｎｇ、１．０ Ｕ、０．２ｕｍｏｌ·Ｌ－１和３．０ｕｍｏｌ·Ｌ－１。采用该优化体系,以 ＯＰＪ０３为引物,构建了我国及世界范围内苹果生产中重要的２８个品种的ＲＡＰＤ指纹图谱,分析了其遗传多样性,区分了供试的２８个苹果品种中的１５个,区分率达５３．６％。讨论了ＲＡＰＤ鉴定苹果品种的应用及其主要影响因素。