新疆结核病人外周血circular RNA差异表达分析

目的:了解新疆结核病患者全血环状RNA (circRNA)差异表达谱，并预测其靶基因，探索circRNA与结核病发生发展的关系。方法：选取新疆肺结核患者43例与健康对照者40例，利用表达谱芯片对病例组和对照组各3例全血circRNA进行检测，筛选差异表达的circRNA，同时选择43例肺炎患者全血进行qRT-PCR验证，再用circRNA靶基因预测数据库进行差异circRNA靶microRNA的预测。结果：芯片结果显示新疆结核病患者全血中存在差异表达的circRNA 835个，其中249个表达上调，586个表达下调，筛选出4个有显著差异的circRNA进行qRT-PCR验证，结果表明hsa_circ_0008276、hsa_circ_0003452、hsa_circ_0001846(P＜0.05)和hsa_circ_0090508表达均下调(P＜0.05)。circRNA 靶基因预测结果提示，has-miR-1294、has-miR-604、has-miR-616、has-miR-663b、has-miR-486-3p可能是hsa_circ_0090508的潜在靶基因。结论：hsa_circ_0090508在结核病患者的表达下调显著，并且相较于其他三个circRNA特异性更高，其可能通过靶基因影响结核病的调控机制。     

储存红细胞中表达降低的circRNA以及其靶基因预测的研究

目的探讨储存红细胞中表达降低的circRNA靶基因预测及其与储存损伤的关系。方法 3(人)份血样来自健康无偿献血者血液制备的悬浮红细胞,滤除白细胞后均分为新鲜组(0 d),4 ℃储存20 d红细胞组(储存组);对2组标本用高通量测序检测,选取下降明显的10个circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析,以此筛选到可能与储存损伤密切相关的circRNA。结果 20 d与0 d组对比,hsa_circ_0005413、hsa_circ_0008937、hsa_circ_0040340、hsa_circ_0003126、hsa_circ_0007995、hsa_circ_0023937、novel_circ_0000402、hsa_circ_0028281表达量显著下降(P0.05);hsa-miR-7160-5p、hsa-miR-122-5p、hsa-miR-4534的表达量显著上升(P0.05);CASP8、CDK4、TMOD3显著下降(P0.05)。生物信息学分析显示这些circRNA的靶基因参与红细胞凋亡与抗凋亡、红细胞膜的稳定、红细胞氧化损伤、铁代谢等生理过程。结论本研究构建了几个差异表达的circRNA-miRNA-mRNA网络,发现hsa_circ_0005413-hsa-miR-7160-5p-CASP8、hsa_circ_0040340-hsa-miR-122-5p-CDK4、hsa_circ_0007995-hsa-miR-4534-TMOD3可能参与了红细胞储存损伤的生物学过程。     

重症继发性肺结核患者差异表达基因和IL-1β表达的验证

目的对基因表达谱芯片中筛选的差异表达基因IL-1β进行验证,分析其表达下调与重症继发性肺结核免疫病理的关系。方法 (1)用Affymetrix基因表达谱芯片对重症继发性肺结核(重症)、轻症继发性肺结核(轻症)患者和正常对照者(对照)筛选差异表达基因;(2)用实时荧光定量PCR(RT-PCR)扩增来测定重症、轻症患者和对照IL-1β相对表达量;(3)ELISA法测定IL-1β在重症、轻症患者和对照血浆中的蛋白表达量;(4)用方差分析和非参数检验统计方法判断组间比较的差异,P<0.05为差异有统计学意义。结果 (1)芯片筛选差异基因显示重症肺结核患者IL-1β表达下调13.06倍,参与30个信号通路;(2)RT-PCR结果显示IL-1β在重症和对照组表达下调,P<0.05;(3)ELISA验证IL-1β在重症及轻症组和重症及对照组均表达下调,P<0.05,与芯片结果相符。结论重症继发性肺结核患者IL-1β表达下调,IL-1β可能是其肺结构免疫病理损伤发生发展的重要因素之一。     

多囊卵巢综合征中环状RNA差异表达的生物信息学分析

目的 利用生物信息学探讨多囊卵巢综合征中环状RNA(circular RNA,circRNA)的差异表达,并预测与之相结合的微RNA(microRNA,miRNA)。方法 通过基因表达综合数据库查找多囊卵巢综合征的卵丘细胞基因芯片表达谱,采用数据库自带的GEO2R工具筛选出差异circRNA,并利用DAVID 6.8数据库对差异circRNA基因进行基因本体分析及京都基因和基因组数据库信号通路分析,使用Circular RNA interactome预测潜在调控的miRNA,并利用Cytoscape软件建立circRNA-miRNA网络图,预测差异最显著的上调和下调的circRNA潜在调控的miRNA各5个。结果 共获得多囊卵巢综合征差异circRNA 247个,预测到与上调circRNA基因结合的miRNA共277个,与下调circRNA基因结合的miRNA共125个,前10个能够与多个差异circRNA结合的miRNA分别为hsa-miR-557、hsa-miR-507、hsa-miR-224、hsa-miR-136、hsa-miR-127-5p、hsa-miR-579、hsa-m...     

储存红细胞中circRNA变化对泛素介导蛋白水解通路调控的预测分析

目的探讨储存红细胞中circRNA对泛素蛋白水解通路调节的可能机制及其在红细胞储存损伤中可能发挥的作用的预测分析。方法健康无偿献血者3(人)份血液制备的悬浮红细胞,过滤白细胞后平均分为新鲜组(0 d组),4 ℃储存20 d红细胞组(20 d组),4 ℃储存40 d红细胞组(40 d组);对3组标本用高通量测序检测,然后做KEGG和GO分析,选取母基因在泛素介导的蛋白水解通路中的circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析。用circRNA interactome预测circRNA的RBP结合蛋白。结果与泛素蛋白水解调控相关的hsa_circ_0036044、hsa_circ_0024173、hsa-miR-4530表达量,20 d组均高于0 d组,差异有统计学意义(P0.05),20 d组的hsa_circ_0035761和TRAF2表达量低于0 d组,差异有统计学意义(P0.05);40 d组hsa_circ_0002502表达量低于0 d 组,且差异有统计学意义(P0.05);40 d 组的hsa_circ_0024173和hsa-miR-4530表达量低于与20 d 组,且差异有统计学意义(P0.05),40 d组的hsa_circ_0028196、hsa_circ_0035761、TRAF2表达量高于20 d组,且差异有统计学意义(P0.05)。进一步通过生物信息学分析预测显示hsa_circ_0035761参与抗凋亡生理过程。结论本研究发现了多个体外储存红细胞中与泛素介导的蛋白水解通路的circRNA表达呈差异变化,发现和验证了hsa_circ_0035761—hsa-miR-4530—TRAF2轴,并揭示了hsa_circ_0035761还具有抗凋亡作用。与多种RNA结合蛋白结合能力,可能是这些circRNA表达量升高主要机制。     

氧化低密度脂蛋白诱导人脐静脉内皮细胞凋亡中microRNA表达谱分析

目的:研究氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导人脐静脉内皮细胞(HUVECs)凋亡过程中micro-RNA(miRNA)表达谱的变化,对差异miRNA调控的靶基因进行初步预测。方法:建立体外ox-LDL诱导HUVECs凋亡模型,采用miRNA芯片技术筛选表达变化显著的miRNA,实时荧光定量PCR验证结果,并对差异miRNA调控的靶基因进行生物信息学分析。结果:miRNA芯片检测发现,在ox-LDL诱导HUVECs凋亡过程中有4个表达上调和11个表达下调的miRNA。实时荧光定量PCR对其中2个上调(hsa-miR-142-3p、hsa-miR-365)和2个下调(hsa-miR-590-5p、hsa-miR-33a)miRNA的验证结果与芯片检测所示有较好的一致性。生物信息学分析发现,差异miRNA调控的靶基因与细胞增殖、凋亡、代谢及原癌基因表达等生物学功能相关。结论:经ox-LDL诱导凋亡的HUVECs其miRNA表达谱发生明显改变,提示miRNA可能参与内皮细胞功能障碍和动脉粥样硬化的发生。     

直肠腺瘤和直肠癌中 microRNA 表达谱差异

目的对直肠癌miRNA表达谱进行初步研究,以期发现在直肠癌发生过程中与直肠腺瘤miRNA的差异表达谱,并预测可能受其调控的靶基因。方法选择2011年1～3月于解放军第306医院肠镜检查的直肠癌及直肠腺瘤进行检测,筛选直肠癌、直肠腺瘤组织差异表达的miRNA,并运用生物信息软件分析其靶基因。结果通过miRNAs芯片检测,发现直肠腺癌与直肠腺瘤相比,上调的miRNA 34种,下调8种。预测ZFHX4可能为miR-375的靶基因,预测SMAD2等可能为miR-18a的靶基因。结论与直肠腺瘤相比,直肠腺癌有其特异的miRNA表达谱,miRNA在直肠癌的发生中可能起到重要作用。     

储存红细胞ATP代谢circRNA筛选及功能预测

目的筛选4℃储存前、后期红细胞差异表达的circRNA并初步预测其功能。方法采集健康无偿献血者5(人)份血样200 m L/份,制备成悬浮红细胞,滤除白细胞后(悬浮滤白红细胞)分为3组:4℃储存0、20及40 d组,对3组标本用第2代高通量测序技术检测,根据FDR0.05且|log2FC|1这2个条件,以火山图和表达模式聚类分析筛选出差异基因并用cytoscape作出mRNA—circRNA—miRNA网络图;通过KEGG和GO分析筛选出与ATP代谢相关的circRNA验证;最后通过生信软件预测hsa_circ_0007470—hsa-miR-155-5p—MRP4的分子结合具体区域及生物学功能。结果红细胞储存20 d较0 d时差异表达的circRNA有119个,40 d较20 d时差异表达的circRNA有110个,2个储存阶段都有差异表达的circRNA共有41个。KEGG和GO分析显示在差异表达的circRNA中hsa_circ_0007470的亲本基因MRP4富集于c AMP代谢通路。mireap、miranda、targetscan、circBase、miRBase、mirTar Base软件分析及序列比对显示hsa_circ_00007470可与hsa-miR-155-5p结合;hsa-miR-155-5p可与MRP4结合。经PCR验证,红细胞储存在0、20、40 d时,hsa_circ_00007470、MRP4、hsa-miR-155-5p的变化倍数分别为1.00±0.02、1.36±0.09、0.53±0.16,1.00±0.01、1.87±0.48、0.45±0.20,1.00±0.02、0.43±0.20、0.98±0.29。红细胞储存0、20、40 d时,总ATPase(U/gHb)分别是40.87±5.883、18.300±2.847、10.21±1.636;ATP(U/gHb)分别是8.708±1.25、3.082±0.166、2.462±0.252。结论储存红细胞中存在circRNA,且含量会随储存时间发生改变,储存20 d后红细胞的hsa_circ_00007470与ATPase及ATP表达呈同向相关性,hsa_circ_00007470或许能解除hsa-miR-155-5p对MRP4的抑制作用,通过ATP代谢途径改善红细胞变形能力。     

circERBB2在卵巢癌中的表达及作用机制研究

目的 探讨circERBB2在卵巢癌中的表达及作用机制。方法 基于GEO数据库筛选卵巢癌差异表达环状RNA(circRNA),并查找circRNA相关靶基因,绘制韦恩图得到GSE79572数据集中差异表达基因与Targetscan 7.1预测所得微小RNA-187-3p(miR-187-3p)靶基因的交叉基因。收集20例卵巢癌患者的卵巢癌组织和癌旁正常组织,培养人正常卵巢细胞系HOSEpiC和人卵巢癌细胞系OVCAR-3、SKOV-3、3AO、OV90,采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测circERBB2、miR-187-3p、BCL6表达水平。通过双荧光素酶报告基因实验和RNA下拉实验验证circERBB2、miR-187-3p、BCL6三者间的相互作用。通过多项细胞实验分析circERBB2、miR-187-3p、BCL6对卵巢癌细胞侵袭、迁移、增殖及细胞周期的影响。结果 数据库分析结果显示,卵巢癌中差异表达circRNA为circERBB2, circERBB2靶向的miRNA为miR-187-3p,绘制韦恩图取交集后得到BCL6等7个交叉基因,circERBB2与m...     

HBV相关肝脏纤维化患者血清miRNA差异表达谱建立及筛选

目的：分析并筛选HBV相关肝脏纤维化患者血清中差异表达miRNA。方法：选择2019年3月至2020年3月进入我院确诊为肝纤维化S2~S3期患者10例,以10例健康人作为对照,以血清作为研究样本。采用Illumina miRNA深度测序分析血清miRNA的表达。比较两组间差异表达的miRNA,对序列读数进行分析,以评估统计学意义。采用R平台进行分层聚类分析,以发现肝纤维化特异性表达的候选miRNA。采用qRT-PCR验证候选miRNA在各组中的表达,采用2-ΔΔCT分析miRNA的相对表达量。预测差异表达miRNA的靶基因,对靶基因进行GO分析。结果：在肝纤维化组和健康组之间,共筛选出78个表达具有显著性差异的miRNA。与健康组相比,肝纤维化组中表达上调的miRNA有30个,表达下调的miRNA有23个。其中,miR-505-3p、miR-197-3p、miR-500a-3p和miR-139-5p下调水平最高,miR-1273g-5p、miR-33a-5p 、miR-3960上调水平最高。选择表达变化最显著的miRNA进行qRT-PCR验证,结果与Illumina miRNA测序结果一致。结论：肝纤维化患者血清中miRNA的表达具有特异性,表达差异显著的miRNA有望成为新的肝纤维化临床诊断标志物。     

结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤的基因表达谱分析

目的:应用寡聚核苷酸基因表达谱芯片研究鼻型NK/T细胞淋巴瘤基因表达谱的变化.方法:应用包括人类全基因组47 000个转录本的Affymetrix U133plus 2.0 Array基因表达谱芯片,检测3例鼻型NK/T细胞淋巴瘤组织,3例正常鼻黏膜组织的基因表达谱,并对差异基因进行基因功能和路径分析.结果:基因芯片筛选出大量差异表达的基因,显著上调的基因数有912个,下调的基因数有1 174个,一些参与重要细胞功能的基因路径中的多种基因呈现明显的差异表达,包括细胞因子-细胞因子相互作用、自然杀伤细胞介导细胞毒作用、Jak-STAT信号转达通路等.结论:鼻型NK/T细胞淋巴瘤基因表达谱与正常对照组织间存在明显差异,一些基因及其涉及的基因路径的表达失调可能与疾病发病机制相关.     

表达谱芯片与DNA甲基化芯片综合分析探索鼻咽癌发生、发展的分子靶标

目的综合分析表达谱芯片与DNA甲基化芯片,探索鼻咽癌发生、发展的分子靶标与潜在治疗靶点。方法在GEO公共数据库下载编号为GSE64634的表达谱芯片数据以及编号为GSE52068的DNA甲基化芯片数据;利用R语言的相关工具包对表达谱芯片进行差异表达分析,对DNA甲基化芯片进行差异甲基化位点分析;利用DAVID数据库对筛选出的差异表达基因进行基因功能分析和信号通路分析;利用实时荧光定量PCR和甲基化特异性PCR进一步验证生物信息学分析的结果。结果表达谱芯片分析获得筛选出2 327个差异表达基因,其中1 777个基因表达下调,550个基因表达上调;DNA甲基化芯片分析获得2 321个差异甲基化位点,其中2 228个低甲基化位点,93个高甲基化位点;对表达谱芯片和DNA甲基化芯片进行综合分析,找到4个表达水平升高且甲基化修饰水平降低的基因,并利用定量PCR、表达谱芯片和DNA甲基化芯片成功验证该结果。结论综合分析表达谱芯片和DNA甲基化芯片,筛选出4个与鼻咽癌发生、发展相关的分子靶标和潜在的治疗靶点。     

七氟醚预处理对缺氧果蝇保护作用的全基因表达谱分析

目的:观察果蝇七氟醚预处理与缺氧后基因差异表达,探讨七氟醚预处理对缺氧损伤保护作用的分子生物学机制。方法:用CapitalBio的Drosophila Genome Oligo Set基因表达谱芯片对七氟醚预处理35 min与缺氧4 h果蝇的差异基因进行检测,与保护作用相关的基因我们用基因本体进行分析。结果:按差异显著阳性标准,从14593个基因中筛选出七氟醚预处理35min差异表达基因206条,其中170条表达上调,36条表达下调,缺氧4h差异表达基因66条,其中23条表达上调,43条表达下调,包括免疫诱导蛋白、信号转导、细胞外基质、细胞骨架蛋白、转录因子及核糖体蛋白等相关编码基因。结论:用cDNA表达谱芯片分析七氟醚预处理与缺氧基因表达,能快速筛选出七氟醚预处理保护作用相关基因,可以进一步探究七氟醚预处理保护作用的分子机制。     

CLU基因干扰肾癌786-O细胞差异基因表达的研究

目的:观察CLU基因干扰前后肾癌细胞株786-O的基因表达谱差异,探讨肾细胞癌与CLU基因相关基因及传导通路。方法:CLU基因干扰慢病毒载体及空病毒载体转染肾癌786-O细胞样本与RocheNimbleGen表达谱芯片杂交,比较干扰前后基因表达谱差异,并行GO分析及Pathway分析。结果:六份样本中,共筛选出差异表达基因1731个,其中共同上调基因1154个,共同下调基因577个。差异表达基因中生物进程、细胞成分、分子功能方面均以下调为主。通路分析显示29条通路上调,如细胞黏附、异体排斥、吞噬体。31条通路下调,如mTOR、MAPK、非小细胞肺癌。结论:采用全基因组芯片检测CLU基因干扰后肾癌786-O基因表达谱获得差异表达基因,为以CLU基因为靶点的肾癌基因研究提供了实验依据。     

血清外泌体 hsa_circ_0001439 , hsa_circ_0001492 、 hsa_circ_0000896在肺腺癌中的筛查价值

摘要:目的探讨血清外泌体来源的环状RNA( circRNA )hsa_circ_0001439,hsa_circ_0001492, hsa_circ_0000896作为肺腺癌分子标志物的临床筛查价值。方法﹐共收集3个批次样本。第一批为血清外泌体组:收集肺腺癌患者127例,健康人对照组53例。第二批为血清组:收集肺腺癌患者87例,健康人对照组41例。第三批为手术前后血清外泌体组:收集手术前后肺腺癌患者26例。分离各组研究对象的血清及外泌体,采用荧光定量PCR( qRT-PCR)检测各组血清及外泌体中 hsa_cire_0001439、hsa_eirc_0001492,hsa_circ_0000896的表达水平,统计并分析手术前后肺腺癌患者血清外泌体circRNA 的表达水平及其与患者临床病理参数的关系。采用ROC曲线评估3个血清外泌体cireRNA对肺腺癌的临床筛查效能, Peatson分析血清外泌体cincRNA与各项肿瘤标志物的相关性。结果qRT-PCR结果显示,与健康人对照组比较,肺腺癌组血清外泌体hsa_circ_0001439 ,hsa_circ_0001492,hsa_circ_00896的表达水平分别为0.38±1.362,1.650主1.329,2.064+1.621(t值分别为6.794,6.237,6.456,P<0.05) ;与术后比较,术前3个血清外泌体的表达水平分别为0.9891.746,3.084+2.013,3.330+2.088(t值分别为5.289,4.197,4.966 ,P<0.05)。血清外泌体 hsa_eirc_0001439,hsa_circ_01 492,hsa_circ_0000896筛查肺腺癌的ROC 曲线下面积(AUC")分别为0.777,0.766,0.793,当 cut-of值分别为1.08,2.16,2.59时,其敏感性分别为73.23% 、68.50%,66.14% ,特异性分别为67.92%、79.25%、82.35%。此外,与健康人对照组比较,肺腺癌组血清hsa _ circ _0001439、hsa_eirc_0001492,hsa_circ_0000896的表达水平分别为0.318+2.077,1.932±1.971,2.141±1.815(t值分别为3.741,4.677,4.496,P<0.05);血清hsa_cire_0001439, hsa_airc_0001492,hsa_cire_0000896筛查肺腺癌的AUC"分别为0.676,0.739,0.738,当cut-off值分别为0.29,1.88 ,2.44时,其敏感性分别为35.63%,48.28%6 ,51.72% ,特异性分别为95.12% ,90.24% ,85.37%。肺腺癌患者血清外泌体 hsa_cire_0001439水平与T分期(P=0.042),T''NM分期(P=0.032)相关;而血清外泌体hsa_irc_0001492水平与年龄(P=0.027),M分期(P=0.028),T分期(P=0.004) ,TNM分期(P=0.009)相关;血清外泌体 hsa_circ_0000896水平与年龄(P=0.027) ,T分期( P=0.001)、TNM分期( P=0.009)相关。Pearson分析显示血清外泌体cireRNA与各项肿瘤标志物均无相关性(P>0.05)。结论﹐ 血清外泌体lhsa_circ_0001439,hsa_circ_0001492, hsa_aire_000896的差异表达可用于肺腺癌的临床筛查。     

口腔黏膜扁平苔藓差异基因筛选及其通路分析

目的应用基因芯片技术筛选口腔扁平苔藓（OLP）差异表达基因及其相关通路分析。方法分别从15例患者OLP组织和5例健康者口腔黏膜组织中提取总RNA,随后用反转录的方法将两种组织的mRNA分别进行荧光标记,与含有32050个基因的人类基因芯片进行杂交。探针长度为60mer,杂交信号用Genepix4000B扫描仪扫描,用芯片图像分析软件（GenepixProV6.0和Genesring）进行分析。结果经过杂交筛选并与正常组织比较,从32050个基因中筛选出有统计学意义的差异表达基因142个,其中上调表达基因25个,下调表达基因117个。有差异表达的通路8个。与OLP密切相关的通路有参与感染类疾病的幽门螺杆菌感染的上皮细胞信号传导通路（epithelial cell signaling in Helicobacterpylori infection）等。结论应用基因表达谱芯片可初步筛选出OLP差异表达基因和通路,OLP发生、发展过程中存在着多个不同基因及多条功能通路表达调控的改变。     

延边地区膝骨性关节炎患者滑膜组织基因谱的表达

背景：原发性骨性关节炎的发展是多种相关基因表达失常的缘故。采用mRNA基因表达谱芯片技术,检测膝关节骨性关节炎滑膜差异表达基因,有助于阐明骨性关节炎病理过程的相关机制。目的：比较延边地区膝关节骨性关节炎和正常关节滑膜的基因表达谱变化,筛选出与膝关节骨性关节炎相关的差异表达基因,并探讨其在骨性关节炎发病机制中的意义。方法：选择延边地区原发性膝关节骨性关节炎患者9例及正常对照者3例,应用mRNA基因表达谱芯片技术检测所获得的滑膜组织中表达差异的基因,筛选出表达差异基因并对其进行GO分析。结果与结论：膝关节骨性关节炎及正常对照者滑膜的差异表达基因分析结果显示,延边地区膝关节骨关节炎滑膜中的差异表达基因共有1261个,其中上调的基因有451个,下调的基因有810个。差异表达基因GO统计分析显示,信号转导、翻译调节、趋化作用、炎症应答、细胞增殖等多种基因的表达有差异。基因芯片技术能有效地筛选出骨性关节炎差异表达的基因,并进一步证实了骨性关节炎的病理过程是多种功能基因参与的复杂的病理过程。     

新发和完全缓解的重型再生障碍性贫血间microRNA差异表达谱（英文）

检测miRNA在新发与完全缓解SAA患者中的表达差异及预测其靶基因。方法:用miRNA芯片方法检测初发和完全缓解(CR)SAA患者骨髓单个核细胞中miRNA表达谱。结果:完全缓解SAA患者与初发SAA患者相比,上调miRNA为35个,下调miRNA为37个。此外,通过预测差异表达的miRNA靶点发现,其靶点与T细胞受体信号通路和细胞黏附分子相关。结论:某些miRNA可能与SAA患者发病机制相关。     

基于TCGA数据库筛选微小RNA（miRNA）用于原发性乳腺癌早期诊断的生物信息学分析

目的　基于肿瘤基因图谱（the cancer genome atlas,TCGA）数据库筛选微小RNA（miRNA）用于原发性乳腺癌的早期诊断。方法　从TCGA上下载原发性乳腺癌miRNA表达数据,将癌症组与正常组比较获得差异表达miRNA。用miRwalk2.0软件分析差异miRNA的靶基因。在c-Bioportal数据库中筛选出原发性乳腺癌突变发生率大于5%的突变基因。分析差异miRNA作用的靶基因与乳腺癌高频突变基因之间的关系,得到备选miRNA,将备选miRNA与乳腺癌前20 名差异表达的miRNA求交集,得到目标miRNA,将目标miRNA做受试者工作曲线（ROC曲线）分析。结果　TCGA数据包含原发性乳腺癌组织1 075例,正常对照乳腺组织95例,共有1 870条miRNA的表达数据。共得到差异表达显著miRNA 129个（P＜0.05）,其中乳腺癌组织中表达升高至3倍以上的miRNA 90个,下调至1/3的miRNA 39个,预测到相对应18 413个靶基因,筛选出原发性乳腺癌突变基因12个。18 413个靶基因中包含12个高频基因,此12个基因是差异miRNA的靶基因同时也是高频基因,故将此12个基因对应的63个miRNA作为备选miRNA。将备选miRNA与乳腺癌前20 名差异表达的miRNA求交集得到目标miRNA 6个:hsa-mir-4732,hsa-miR-486,hsa-miR-592,hsa-miR-449b,hsa-miR-187和hsa-miR-196a,将这 6个miRNA构建ROC曲线（P＜0.05）,预测其作为肿瘤标志物的诊断能力。结论　基于TCGA数据库的生物信息学方法可简便而可靠地筛选目标miRNA进行后续研究,有较高的参考价值。