SARS相关冠状病毒

自从 2 0 0 2年 11月从中国广东省出现首例SARS病例以来 ,全世界已有 31个国家报告有SARS病例。SARS是一种由新冠状病毒引起的严重急性呼吸综合征 (severeacuterespiratorysyndrome ,SARS)。2 0 0 3年 3月下旬 ,香港大学、亚特兰疾病预防和控制中心及其他研究机构的研究人员相继报告从SARS病人中分离出一种新的冠状病毒。 4月 16日世界卫生组织正式宣布新冠状病毒是SARS的病原体。已知的冠状病毒可引起人和动物的多种疾病 ,本文将就冠状病毒的一般生物学特性、SARS病原体的确定及SARS冠状病毒的研究进展作一介绍。1　冠状病毒…     

生物信息学在基因组和蛋白质研究中的应用

目的:人类基因组计划在世界范围内的开展促进了生命科学的进步,在此过程中产生了大量的基因组与蛋白质结构和序列数据库资源,促进了生物信息学的发展;同时生物信息学在基因组和蛋白质研究中也起着重要的作用。资料来源:应用计算机检索Medline1990-01/2006-01文章,检索词“bioinformatics”,并限定语言种类为English;同时手工检索2000-01/2006-01的相关文章,限定语言为中文,检索词为“生物信息学;基因组;蛋白质结构”以及基因组相关方面的书籍。资料选择:对资料进行初审,纳入标准:生物信息学的发展及其在基因组和蛋白质研究中的应用。排除标准:重复性研究。资料提炼:从检索资料选取34篇(含2篇中文文献或书籍)关于生物信息学及其应用的文章,进行综述。其中与基因组研究相关的文献4篇,与蛋白质研究相关的文献20篇,其他文献10篇。资料综合:随着人们对基因组和蛋白质研究的深入,对基因表达模式、蛋白质结构、蛋白质-蛋白质相互作用等分析得到的数据越来越多,为生物信息学提供了丰富的资源,促进了生物信息学的发展;同时生物信息学在基因序列比对、大规模基因功能表达谱的分析、新基因的发现与鉴定等方面以及蛋白质序列比较分析、蛋白质空间结构和功能预测等研究中也起着重要的作用,促进了DNA和蛋白质的研究。结论:基因组和蛋白质组研究与生物信息学技术互相推动,并行发展;生物信息学在基因组和蛋白质研究中发挥着重要的作用。     

生物信息学在基因组和蛋白质研究中的应用

目的：人类基因组计划在世界范围内的开展促进了生命科学的进步，在此过程中产生了大量的基因组与蛋白质结构和序列数据库资源，促进了生物信息学的发展；同时生物信息学在基因组和蛋白质研究中也起着重要的作用。 资料来源：应用计算机检索Medline1990—01／2006—01文章，检索词“bioinfonnatics”，并限定语言种类为English；同时手工检索2000—01／2006—01的相关文章，限定语言为中文，检索词为“生物信息学；基因组；蛋白质结构”以及基因组相关方面的书籍。 资料选择：对资料进行初审，纳入标准：生物信息学的发展及其在基因组和蛋白质研究中的应用：排除标准：重复性研究。 资料提炼：从检索资料选取34篇（含2篇中文文献或书籍）关于生物信息学及其应用的文章，进行综述：其中与基因组研究相关的文献4篇，与蛋白质研究相关的文献20篇，其他文献10篇。 资料综合：随着人们对基因组和蛋白质研究的深入，对基因表达模式、蛋白质结构、蛋白质-蛋白质相互作用等分析得到的数据越来越多．为生物信息学提供了丰富的资源，促进了生物信息学的发展；同时生物信息学在基因序列比对、大规模基因功能表达谱的分析、新基因的发现与鉴定等方面以及蛋白质序列比较分析、蛋白质空间结构和功能预测等研究中也起着重要的作用，促进了DNA和蛋白质的研究。 结论：基因组和蛋白质组研究与生物信息学技术互相推动，并行发展；生物信息学在基因组和蛋白质研究中发挥着重要的作用。     

冠状病毒及SARS病毒概述

目前已确定世界范围内流行的非典型肺炎的病原体为一种新变异的冠状病毒，本文就冠状病毒的结构、分类及致病性以及SARS冠状病毒的特征作一综述。     

冠状病毒感染对造血系统影响及潜在干预药物的生物信息学分析及其对新型冠状病毒肺炎的意义

目的:分析预测冠状病毒感染对造血系统影响及潜在干预药物,探索其对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的意义.方法:利用基因表达数据库(GEO),筛选冠状病毒感染相关的全基因组表达数据,使用R语言包对数据进行差异表达分析及KEGG和GO富集分析.使用STRING在线分析网站进行PPI网络分析,筛选出核心基因.再应用自主研...     

《科学》杂志公布“非典”病毒基因组序列

本报讯　美国《科学》杂志 5月 1日刊登了两份“非典”病毒基因组序列研究论文 ,这是首批经过同行评议的“非典”病毒基因组序列研究结果。新成果使科学家第一次观察到了新病毒的分子组成结构。由美国和加拿大研究人员组成的两个研究小组在论文中证实 ,“非典”病毒是一种全新的冠状病毒。他们发现 ,“非典”病毒与其他三类已知的冠状病毒虽然总体结构相同 ,但在蛋白质的氨基酸结构上却存在差异。通过对这些差异进行统计分析 ,研究人员得出结论是 ,“非典”病毒是一种崭新的冠状病毒 ,而非某种已知冠状病毒的近期变种。美、加研究人员介绍说…     

SARS冠状病毒S蛋白研究进展

随着严重急性呼吸综合征 (severeacuterespiratorysyn drome,SARS)病原体的确定 ,对SARS冠状病毒 (SARScorona virus,SARS CoV)的研究已取得了突飞猛进的发展。许多研究表明SARS CoV的S糖蛋白 (spikeprotein)在病毒的感染过程中起重要作用。它在病毒与宿主细胞表面受体结合及介导膜融合进入细胞的过程中 ,起关键性作用 ,也是冠状病毒的主要抗原。因此本文将就SARS CoVS蛋白的基因、蛋白质结构及其可能的受体和抗原表位等方面的研究进展作一综述。1　编码S蛋白的基因SARS CoV基因组全长 2 975 1nt(TOR2株 ) ,有 11个预测的…     

“武大”发现SARS冠状病毒致命点

经过近六年努力,武汉大学科研人员近日发现了SARS冠状病毒致命点,是一组叫“非结构蛋白nsp14”的基因编码。研究人员表示,此次重要发现可为筛选抗击SARS病毒药物奠定基础,进而研发成小分子药物。     

SARS冠状病毒对血液系统的影响及可能的机制

2002年11月在广东发现首例严重急性呼吸综合征（俗称“非典型性肺炎”）病例。2003年2月世界卫生组织（WHO）在越南河内正式确认此疾病为新的人类传染病，并命名为严重急性呼吸综合征（severe acute respiratory syndrome,SARS）。2003年3月在香港发现其病原体为新的冠状病毒（coronavirus)，称之为SARS冠状病毒（SARS-CoV）。SARS患常常出现异常的血液学改变，包括淋巴细胞减少（在成人为68%-90%；在儿童为100%，n=10），血小板减少（成人20%-45%，儿童50%),和白细胞减少（成人20%-34%，儿童70%）。同时在部份患D-二矣体水平可见升高。初步的研究表明SARS冠状病毒可侵犯造血细胞，但作用机制尚不清楚。我们推测其病理生理过程可能包括：（1）通过CD13或CD66a受体，SARS病毒直接侵入造血细胞或感染骨髓基质细胞等，加重细胞凋亡，引致造血抑制；（2）通过生成自身抗体或免疫复合物等免疫介导造成细胞损害。肺部损害也可部分解释血小板减少。肺部可能是成熟巨核细胞释出血小板的器官之一。SARS病人有广泛肺泡损害，包括充血、水肿、透明膜成，也引致血小板消耗及破坏增加。由于SARS病人常有淋巴细胞减少及免疫功能受损，我们认为造血生长因子如G-CSF，通过动员自身造血干细胞和内源性生长因子，可以增强免疫功能对抗病毒。造血生长因子和造血干细胞在SARS的治疗上，可能有一定的价值。     

SARS冠状病毒Mc区克隆及序列分析

目的：构建SARS冠状病毒（SARS-CoV）GD322株M基因膜内区（Mc区）重组表达质粒，并对目的序列进行序列分析。方法：根据GenBank中公布的SARS-CoV Tor2株M基因序列，设计一对引物，采用RT-PCR法从SARS-CoV GD322株基因组中扩增Mc区．克隆至pET-32a（＋）载体中，转化大肠杆菌BL21后测序，利用Clustal X分析所测序列翻译的氨基酸与81株SARS-CoVMc区翻译的氨基酸序列的差异。结果：测序结果表明该区与Tor2株对应核苷酸序列同源性为100％。与已收集的81株SARS-CoVMc区所译氨基酸（Mc蛋白）相比，与77株（占95．1％）Mc蛋白完全同源．与4株（占4．9％）仅有一个氨基酸改变。结论：本试验成功构建SARS-CoV Mc区重组表达质粒：SARS-CoV各毒株间Mc蛋白氨基酸序列差异极小，提示利用任一毒株Mc蛋白制备单抗和疫苗具有普遍意义．     

生物信息学数据库的研究及进展

生物信息学和生命科学是目前的前沿学科，而数据库技术是其重要的组成部分，本文主要阐述了生物信息学数据库技术及其研究的新进展，并介绍了一些典型的数据库和一些生物信息学的网络资源。     

2003年美国SARS病与冠状病毒检测情况

世界卫生组织 (WHO)和美国疾病预防控制中心 (CDC)现正在继续调研各国严重呼吸系统综合征 (SARS)的暴发情况。新冠状病毒 (Coronavirus)感染可能是SARS的病因。截止 2 0 0 3年 4月 9日 ,已鉴定了 5名美国居民的临床史摘要 ,其中 2例为疑似SARS ,并有新冠状病毒感染的实验室证据。SARS的流行病学和实验室调查现正在进行中。CDC临时SARS疑似病例定义是根据SARS临床表现、流行病学联系和SARS社区传播等接触情况而确定的 ,对可疑病例不要求胸片的发现。WHO对可能SARS定义包括胸片上出现与肺炎或严重呼吸系统综合征 (RDS)一…     

156例SARS患者血清抗SARS冠状病毒抗体的观测

本研究的目的是观察严重急性呼吸综合征 (severeacuterespiratorysyndrome ,SARS)患者抗SARS 冠状病毒 (SARS CoV)抗体IgG和IgM的产生及抗体效价变化特征 ,探索采集SARS痊愈患者抗血清的时机。应用ELISA方法对随机抽取的 156名SARS患者血清标本进行抗SARS CoV抗体IgG和IgM抗体效价测定。结果表明 ,156名SARS患者于病后 3至 9周期间 ,IgG抗体阳性率为 75.6% ,IgM抗体阳性率为 41.7% ,IgG和IgM抗体均阳性为 41% ,IgG和IgM抗体均阴性为 2 3 .7% ;IgG抗体阳性患者中抗体效价为 18.2 3± 2 4.72 ,IgM抗体阴性患者抗体效价为 2 .18± 1.13 ;IgG和IgM抗体效价与SARS患者的性别、年龄、病程、体温正常天数无显著相关性。结论 :并非所有SARS患者都能产生抗SARS CoV抗体 ,即使产生抗体 ,其效价的个体差异也较大 ,并不能通过性别、年龄、病程及体温正常天数等因素较准确地评估抗体的效价。因此 ,在SARS抗血清采集前 ,应重新进行抗体效价测定 ,遴选具有高效价抗SARS CoV抗体的SARS痊愈患者进行抗血清的采集 ,才能提高所采集的抗血清在临床的治疗效果 ,同时又可为患者抗体输注提供量化指标     

SARS冠状病毒S蛋白研究进展

SARS冠状病毒是引起传染性非典型肺炎的病原体,它具有4种结构蛋白,其中S蛋白含有主要的中和抗原表位,并有受体结合和膜融合活性,与SARS冠状病毒的组织嗜性、细胞融合性和病毒毒力密切相关,是制备保护性疫苗的重要靶位.     

无偿献血者血清SARS冠状病毒抗体(IgM+IgG)检测分析

SARS冠状病毒是引起SARS的病原体 ,属于ssRNApostive strandviruses家系的Nidovirales族中的coronaviridaet系 ,是冠状病毒家属中新发现的一个分类 ,其生物学性状和流行病学特征尚不很清楚。冠状病毒颗粒外形不规则 ,直径6 0～ 2 2 0nm ,具有病毒外壳和包膜 ,病毒外壳携带S、E、M3种蛋白 ,其中S蛋白是主要的抗原蛋白 ,E为衣壳蛋白 ,含量较少 ,M为膜蛋白 ,主要与膜的转运有关。人体感染SARS病毒后 ,血清中出现IgM和IgG抗体 ,目前认为IgM为早期感染的标志 ,IgG继IgM之后出现 ,是既往感染的标志 ,IgG是否具有保护性尚需进一步证…     

SARS研究近况

严重急性呼吸综合征(SARS)传染性强且病死率高，对社会生活及经济影响巨大，引起了世界各国的高度重视，全球病例8422，死亡率10．8％，医务人员感染占21％。一种新型的冠状病毒（coronavirus)满足了从患病的宿主体内能分离到病毒；宿主细胞能够培养该病毒，病毒能够通过滤菌器；培养的病毒能够使相同的或相近的宿主产生类似的症状；能够从实验感染的宿主体内重新分离到病毒；能检测到针     

咽拭子和痰标本中SARS冠状病毒核酸检测

目的 建立SARS冠状病毒的RT—PCR核酸检测方法。方法 合成针对SARS冠状病毒特异性引物，从SARS病人及疑似病人标本中提取RNA，经反转录和巢氏PCR扩增出相应大小的DNA片段。对这些片段克隆后进行DNA序列分析，并将序列与SARS冠状病毒和其它已知冠状病毒进行同源性分析。结果 从SARS病人痰、咽拭子或血液标本中得到多例RT—PCR阳性片段，其中8个片段经克隆和DNA序列分析证实为SARS冠状病毒序列(同源性100％)，而所有参照标本RT—PCR均为阴性。结论 该方法可用于SARS冠状病毒的RT—PCR核酸检测。