深圳市2007年H3N2亚型流感病毒基因特性分析

目的了解深圳市2007年H3N2亚型流感病毒流行情况及血凝素基因特性。方法用狗肾传代细胞（MDCK）和鸡胚进行流感病毒分离。收获病毒后提取病毒RNA，进行逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR），扩增产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定后送大连宝生物公司纯化及测序。测序结果用Simmonic软件和Mega3．1软件进行序列分析。结果H3N2亚型流感毒株为深圳市2007年流感流行的优势株，与2006年的深圳株比较未发生明显变异，但与2007年的疫苗株相比，有多个位点的氨基酸发生了替换，造成了其间的抗原性发生了一定的变化。结论深圳市2007年H3N2亚型流行株，并未形成一个新的变种。推测是由于与疫苗株之间的抗原性的变异导致了2007年深圳市H3N2亚型流感的流行。     

广西医科大学2007年新生H3N2亚型流感病毒抗体调查

目的：调查广西医科大学2007年新生H3N2亚型流感病毒抗体,了解健康青年人群血清中H3N2亚型流感病毒抗体的水平,从而预测广西H3N2流感病毒引起的流感流行的趋势。方法：抽取广西医科大学2007年新生血清168份,通过血凝抑制实验进行抗体检测。结果：以血凝抑制抗体滴度≥1：10为H3N2亚型流感病毒抗体阳性,H3N2亚型流感病毒抗体阳性率为26．19％,抗体滴度≥1：40的占阳性的22．73％。结论：H3N2亚型流感病毒引起的流感在广西有流行,但流行强度不高,抗体滴度水平对人群的保护能力较低。     

2008年深圳市甲3亚型流感病毒基因特异性分析

目的了解2008年深圳市H3N2亚型流感流行及病毒变异情况。方法用狗肾传代细胞(MDCK)和鸡胚进行流感病毒分离,收获病毒后提取病毒RNA,进行逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),扩增产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定后送大连宝生物公司纯化及测序,测序结果用SIMMONIC软件和MEGA3.1软件进行序列分析。结果深圳2008年流行的H3N2亚型流感病毒血凝素与深圳2007年流行的差异不大,而与同期疫苗毒株A/Wisconsin/67/2005比较有一定的差异,B抗原决定簇上有1个位点发生替换,158位R替换了K;1个糖基化位点增加,在122位氨基酸由D变成了N;与世界卫生组织推荐的2009年流感疫苗毒株比较差异不大。结论深圳市2008年流行的H3N2亚型流感病毒并未形成新的变种,其漂移趋势与世界H3N2亚型流感漂移趋势一致。     

2009年成都市流感活动情况及H3N2亚型流感病毒HA1基因特性分析

目的 分析2009年成都市流感流行情况,探讨甲3流感病毒(H3N2)亚型分离毒株的流行及HA1基因变异和进化.方法 MDCK细胞对咽拭子样品进行病毒分离鉴定,提取病毒核酸,用RT-PCR法扩增HA1基因,对H3N2分离株核酸及氨基酸序列进行亲缘关系分析.结果 甲型流感H1N1、H3N2、甲1、B型流感病毒分离率分别为2...     

鸡流感病毒H9N2亚型毒株RNA4节段基因序列测定及分析

目的 弄清新分离到的鸡H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸全序列及它与禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)之间的内在关系。方法 病毒RNA经逆转录合成cDNA,经聚合酶链反应(PCR)扩增,产物纯化,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果 香港鸡流感病毒(ckHK997)禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)的H9N2亚型RNA4节段长度分别是1951和1683个核苷酸,编码血凝素(HA)蛋白。与禽H9N2代表株的同源性在89.0％。结论 新分离到的鸡H9N2亚型毒株与代表株的同源性差异较大。     

海南省2019—2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因特性

目的 了解海南省2019—2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因遗传进化规律与氨基酸变异情况。方法 选取2019—2020监测年度海南省5家流感监测网络实验室分离的16株H3N2亚型流感毒株进行一代全基因组测序,利用MEGA 10.1.8构建血凝素基因系统进化树,并分析氨基酸位点替换情况,应用DNA Star 7.0.1软件进行血凝素基因同源性分析。结果 系统进化树显示,相比于疫苗株A/Kansas/14/2017 (2019—2020）,16株H3N2亚型流感病毒分离株血凝素基因在进化树上与疫苗株A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016（2018—2019）亲缘关系更近,属于3C.2a1分支,核苷酸与氨基酸同源性范围分别为98.5%~98.9%、97.9%~98.4%。16株分离株在抗原性位点发生8处氨基酸位点替换,涉及5个抗原决定簇;15株分离株在糖基化位点发生2处缺失。结论 2019—2020年监测年度海南省H3N2亚型流感病毒与2018—2019年疫苗株亲缘关系较近,血凝素蛋白抗原性位点在5个决定簇均有变异,易造成较大流行,WHO 推荐的2019—2020年疫苗株保护效果可能不理想。应密切关注H3N2亚型流感病毒的流行与基因变异情况,为流感病毒疫苗株推荐及防控提供科学依据。     

南宁市2007～2009年H3N2亚型流感病毒NA基因变异分析

目的 对2007～2009年度南宁市流行性感冒病毒NA序列分析,阐明NA基因变异和进化特征.方法 提取2007 ～ 2009年30株(每年10株)H3N2亚型病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,利用VectorNTI 9.0对测序结果分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树.结果 南宁市2007 ～ 2009年H3N2亚型流感病毒被分为3个分枝,其中疫苗株A/Wisconsin/67/2005独立形成一个分支(类群Ⅰ),A/Brisbane/59/2007与2007年毒株(除339外)形成类群Ⅱ,2008和2009年毒株聚集成类群Ⅲ.NA基因在质尾区域、极性跨膜区、柄部区域有个别毒株个别位点发生了替换.抗原区域328～ 336替换频率较高,2008年毒株抗原位点更活跃.A/nanning/242/2007在酶活性位点发生了D151E替换,可能导致NA对扎纳米韦和奥斯他韦的轻微耐药性;A/nanning/242/2007、A/nanning/561/2008分别在非活性位点N234D,在G286D的替换则可能影响NA介导的病毒粒子的释放从而影响NA蛋白的活性.结论 南宁市2007～2009年毒株NA均发生了较大变异,当年疫苗株均滞后南宁流行株.     

海南省2019—2020年H3N2亚型流感病毒神经氨酸酶基因特性

目的 分析海南省2019—2020年H3N2亚型流感病毒神经氨酸酶基因遗传进化特征与关键氨基酸位点变异情况。 方法 从海南省流感监测网络实验室分离的流感毒株中按照不同时间选取16株H3N2亚型分离株进行一代全基因序列测定,应用DNA Star 7.0.1软件进行神经氨酸酶基因同源性分析,应用MEGA 10.8.1软件构建神经氨酸酶基因系统进化树,并分析耐药性位点与抗原决定位点氨基酸替换情况。 结果 神经氨酸酶基因同源性分析与系统进化分析显示,16株分离株与疫苗株A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016（2018—2019）核苷酸与氨基酸相似性分别为98.5%~99.1%、98.3%~98.7%,进化上属于3c.2a1分支。14株分离株发生神经氨酸酶抗原性位点N329S变异,11株分离株发生E344K变异,未发生耐药性位点氨基酸替换。 结论 2019—2020年海南省流行的H3N2亚型流感病毒属于3c.2a1分支,与2018—2019年疫苗株亲缘关系较近;大部分分离株在神经氨酸酶抗原决定位点发生了一定的改变,但变异程度不大,未发生耐药位点变异。今后应持续加强流感病毒病原学监测,密切关注H3N2亚型流感病毒耐药性基因变异,及时跟踪关键氨基酸位点替换情况,为科学防控提供理论依据。     

2017—2020年深圳市盐田区H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析

目的 分析2017—2020年深圳市盐田区H3N2亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因变异情况。方法 对盐田区2017—2020年分离的34株流感分离株HA基因进行扩增及序列测定,从GISAID流感数据库下载推荐疫苗株序列信息并利用MEGA X和NetNGlyc 1.0 Server在线分析软件对HA基因进行分析。结果 2017—2020年盐田区H3N2分离株位于3c.2a分支,2017年上半年分离株位于3C.2a2分支,7月份之后位于3C.2a1分支;2018—2020年位于3C.2a1b分支。2019—2020年流感分离株与当年疫苗株的核苷酸一致性与氨基酸同源性均低于其他年份。与同年疫苗株相比,2017—2018年分离株A区存在T135N(2/13)和R142K/G(13/13)变异;2018—2019年分离株A区存在T135K(10/10)和S137F(10/10)变异、B区存在F193S(8/10)和S198P(1/10)变异;2019—2020年分离株A区存在T135K(11/11)和S137F(11/11)变异、B区存在N158S(4/11)、N17...     

2010年青海省流感病毒病原学监测及H3亚型HA1基因序列分析

目的监测青海省2010年季节性流感病毒型与亚型分布,并了解2010年部分A/H3N2分离株血凝素(HA)基因变异情况。方法采集全省各监测哨点医院鼻咽双拭子标本,接种MDCK细胞,采用标准抗血清鉴定阳性分离株型与亚型,并对2010年部分H3亚型流感病毒进行HA基因测序,分析HA基因变异情况。结果2010年全省哨点医院送检标本中共分离63株流感病毒,其中42株为A/H3N2,B型15株,AH1N1流感病毒6株,型与亚型有明显分布强弱特征。选取10株H3N2亚型分离株进行HA序列分析,发现与同期南京分离株接近,与WHO2010年度疫苗推荐株相距甚远,不在同一分支。结论 2010年青海省流行的H3N2亚型流感病毒的抗原性和基因特性发生了改变。     

甲型H1N1流感病毒的分子特征

当前新型甲型H1N1流感病毒的暴发,引起全球的关注。本文对甲型H1N1流感病毒的分类地位、结构特征、基因复制、蛋白功能进行介绍,说明新型甲型H1N1流感病毒是甲型流感病毒通过抗原漂移和抗原转换所产生的,对奥塞米韦(达菲)敏感,但对金刚烷胺有抗药性。     

A Novel Reassortant H2N3 Influenza Virus Lsolated from China

Objective To analyze the genetic composition of a novel H2N3 virus isolate identified from a duck cage swab in a live poultry market （LPM） in 2009 in Guangdong province of China. Methods PCR-positive specimens were inoculated into embryonated chicken eggs and subtyped by conventional RT-PCR. All segments of the virus A/environment/Guangdong/2/2009 were sequenced, and phylogenetic trees were constructed and analyzed. Results The genes of this virus belong to Eurasian-lineage avian viruses. The virus is a reassortant with the HA gene from an H2N2 virus and the NA gene from an H5N3 virus. The PB1, PB2, and NP genes were from an H4N6 virus, the PA was from an H3N8 virus, the M gene was from an H1N3 virus, and the NS gene was from an H10N6 virus. Conclusion market. Its A novel avian-origin reassortant H2N3 influenza virus was detected in a live poultry potential impacts and evolution should be closely monitored.     

杭州新型甲型H1N1流感住院病例调查

[目的]研究杭州地区新型甲型H1N1流感的临床表现和流行病学特点。[方法]用统计指标和图表来描述杭州地区104例新型甲型H1N1流感住院病例的临床表现和血液化验数据,比较各年龄组和不同时间段组的新型甲型H1N1流感的临床表现。[结果]在104例病例中20岁及20岁以下的人群占57.7%。20岁及20岁以下与20岁以上的新型甲型H1N1流感病人的病程长短和白细胞计数的差异没有统计学意义(P>0.05),不同时期发病的新型甲型H1N1流感病人的病程长短和白细胞计数的差异没有统计学意义(P>0.05)。[结论]杭州地区的新型甲型H1N1流感青少年、学生较多,65岁以上老年人较少;重症和死亡病人较少,咳嗽是新型甲型H1N1流感的主要症状,各年龄层次新型甲型H1N1流感的临床表现差异不大。     

甲型H1N1流感患者Th1/Th2细胞因子水平的观察

 目的 通过检测甲型H1N1流感患者血清中细胞因子的水平，初步了解重症甲型H1N1流感患者的免疫应答特点。方法 收集2009年11月14日到12月31日于中国医科大学附属盛京医院就诊并确诊为甲型H1N1流感患者作为病例组，同时随机选择同时期的健康体检者作为对照组，采用ELISA法分别检测两组血清法分别检测2组血清IFN-γ(干扰素-γ)，IL-4(白细胞介素-4)及IL-10(白细胞介素-10)浓度。结果 与对照组相比，IFN-γ及IL-10均显著增高，P<0.05。IL-4显著降低，P<0.05。结论 在甲型H1N1流感病毒感染的进程中Th1和Th2细胞的平衡被打破，患者细胞免疫相对增强，体液免疫不同程度的受到了抑制。     

2006年广东省流感病毒流行的分子基础

目的了解广东省2006年流行性感冒（流感）流行情况的分子基础。方法选择广东省流感监测网络实验室分离的11株流感毒株,对血凝素基因进行基因和抗原性的分析。此外,还检测人群抗体水平。结果2006年流行的H1N1亚型病毒血凝素蛋白重链（HA1）区氨基酸序列与A/New Caledonia/20/99（H1N1）相比,同源性为95.7%～96.3%,有2个抗原决定簇的氨基酸发生了替换。Victoria系的HA1区基因与B/HongKong/330/2001相比,同源性为97.2%～97.5%,有6个位于抗原决定簇的氨基酸发生了替换,这种变化和B/Malaysia/2506/2004相一致,这在B型的基因种系发生树也得到证实。同时发现人群针对H1N1亚型和B/Victoria的抗体水平较低。结论2006年广东H1N1亚型和B/Victoria系病毒株发生了一定程度的变异,以及人群保护性抗体水平较低,共同造成其在本地的流行。     

我国甲型H1N1流感防控工作面临的挑战与对策

随着甲型H1N1流感防控形势进一步严峻,基于我国具有数量庞大的脆弱人口和基层公共卫生和医疗卫生网络比较薄弱的国情,为确保在疫情大流行时正常的社会秩序维护与稳定,我国防控工作应进一步加强。我国应对甲型H1N1流感的策略包括加强公共卫生监测工作,继续强化突发公共卫生事件反应机制的建设,对人群实行分类管理,重视健康管理和健康教育等非药物手段,提高国民的文明素养和健康素养,重视信息沟通。     

H7N9禽流感病毒对人类致病的分子基础分析

【目的】 了解H7N9禽流感病毒对人类致病的分子特征,为更好地预防与治疗H7N9人禽流感提供科学依据。【方法】 从GISAID数据库中下载中国2013年分离的所有H7N9禽流感病毒株的基因及蛋白序列,并从NCBI数据库中下载其他相关的流感病毒序列,运用生物信息学软件分析H7N9禽流感病毒基因的系统进化特征?受体结合位点?宿主特异位点?飞沫传播关键氨基酸位点?致病及毒力相关位点?耐药性位点及潜在糖基化位点等的变异情况。【结果】 2013年中国流行的H7N9禽流感病毒为四源重组病毒, 所有基因片段均来源于禽类,不含任何人流感病毒基因;病毒HA的受体结合位点发生了2个关键氨基酸的变异(G186V和Q226L);在与飞沫传播有关的关键氨基酸位点中,个别氨基酸已发生了变异(T160A? Q226L);该病毒具有8个毒力增强位点;所有分离株的M2均发生了 S31N变异;分离株A/Shanghai/1/2013的NA的耐药位点发生了R294K变异;所有毒株的潜在糖基化位点均相对保守。【结论】 H7N9禽流感病毒为四源重组的新型禽流感病毒。该病毒具有与人呼吸道上皮细胞SAa-2,6 Gal受体结合的分子基础,但目前尚未获得经飞沫传播的充分条件,人传人的可能性不大。该病毒具有低致病性禽流感病毒的分子特征,表明对禽类致病性不强,但其对人类呈高致病性,这可能与其毒力位点的特征有关。所有分离毒株均发生了对离子通道抑制剂金刚烷胺类药物的耐药性突变,个别毒株已发生了对神经氨酸酶抑制剂奥司他韦(达菲)的耐药性突变。     

Potential infections of H5N1 and H9N2 avian influenza do exist in Guangdong populations of China

Background Southeast China is one of the sites of influenza origin. During 2003-2004, nine avian influenza outbreaks took place in Guangdong Province. But no human case was reported. To examine the status of potential human infection by human influenza （H1N1, H3N2） and avian influenza （H5N1, H7N7, H9N2） in the avian influenza epidemic area of Guangdong Province, China, we conducted a seroepidemiologic survey in the people of this area from April to June of 2004.
Methods Three out of 9 H5N1 avian influenza affected poultry areas in Guangdong were randomly selected, and the population living within 3 kilometers of the affected poultries were chosen as the survey subjects. One thousand two hundred and fourteen people were selected from 3 villages at random. Human and avian influenza antibody titers were determined by hemagglutination-inhibition （HI） test and microneutralization test （MNT）.
Results The positive rate of antibody to H5N1 was 3.03% in the occupational exposure group and 2.34% in general citizens group; that of H9N2 was 9.52% in the occupational exposure group and 3.76% in the general citizens group. Moreover one case in the occupational exposure group was positive for H7N7. One year later, all previously positive cases had become negative except for one H5N1-positive case.
Conclusion The observations imply that H5N1 and H9N2 avian influenza silent infections exist in Guangdong populations.     

402例甲型H1N1流感病例流行病学特征分析

目的 了解深圳市福田区甲型H1N1流感病例的流行病学特征,为甲型H1N1流感预防控制提供科学依据.方法 应用描述性流行病学方法分析402例甲型H1N1流感病例的流行病学特征,包括病例的年龄、性别、职业分布、地区分布等.结果 402例甲型H1N1流感病例男性占58.71％,女性占41.29％; 90.55％的病例集中在0～30岁年龄段,11～20岁年龄段病例最多,占总病例数的41.79％;从职业构成看,所有病例中,绝大多数为学生,占总病例数的64.18％.结论 学生是甲型H1N1流感的危险人群,应当注重学校等场所的甲型H1N1流感防控工作.     

An overview of the recent outbreaks of the avian-origin influenza A (H7N9) virus in the human

Since the first human infection with influenza A (H7N9) viruses have been identified in Shanghai on March 31, 2013, the latest variant of the avian flu virus has spread across four Chinese provinces recently. Human infections with avian influenza are rare and this is the first time that human infection with a low pathogenic avian influenza A virus has been associated with fatal outcome. To date (May 5^th, 2013), China had reported 128 confirmed H7N9 infections in human, among 27 died. Most reported cases have severe respiratory illness resulting in severe pneumonia and in some cases have died. No evidence of sustained human-to -humans at this time, however, there is one family cluster with two confirmed cases for which human-to-human transmission cannot be ruled out. Recent evidence showed that the gene sequences of this novel H7N9 virus is primarily zoonotic and may be better adapted than other avian influenza viruses to infect human. Effective global infection control is urgently needed, and further surveillance and analyses should be undertaken to identify the source and mode of transmission of these viruses.