基因芯片技术筛选卵巢癌紫杉醇耐药差异表达基因的研究

目的应用基因芯片技术研究人卵巢癌紫杉醇耐药细胞株OC3/Tax300与其敏感细胞系OC3之间的基因表达谱差异,筛选耐药相关基因.方法分别提取OC3/Tax300与OC3细胞的总RNA并纯化mRNA;将等量的mRNA逆转录,以Cy5和Cy3标记的cDNA做探针,在BiostarH140S基因表达谱芯片上进行杂交.扫描芯片荧光信号图像,用基因图像分析软件对扫描图像进行数字化处理和分析.结果共筛选出显著表达差异基因234种,其中217种基因表达水平下调,17种基因表达上调;下调基因主要为EB病毒编码核蛋白（EBNA-3）、信号蛋白（COP9）,上调的基因主要是酪氨酸激酶（JAK2）、热休克蛋白（HSPs）、还原型辅酶烟胺腺嘌呤二核苷酸（NADH）等.结论本研究筛选出的基因可能为进一步探讨卵巢癌肿瘤细胞耐药机制提供新的途径.     

基因芯片在肝癌诊断与治疗中的应用

基因芯片包括DNA芯片(又称DNA微阵列)与cDNA芯片(又称cDNA微阵列)，是目前应用最广泛的生物芯片，它以DNA杂交技术为基础，采用微加工和微电子技术，在玻璃、硅、塑料等固相表面上固定成千上万个分子识别探针，能在同一时间平行检测大规模的基因分子信息，主要用于肿瘤的DNA测序、基因表达、突变、诊断、药物筛选和遗传图谱等研究。肝     

急性低氧诱导人肝癌细胞差异表达基因的筛选及其功能

目的探讨急性低氧诱导人肝癌细胞(Huh-7、Hep3B)差异表达基因的筛选及其功能。方法常规培养Huh-7、Hep3B细胞,随机取部分细胞置于常氧条件(空气、5%CO₂)下培养,取部分细胞置于低氧条件(1%O₂、5%CO₂、94%N₂)下培养,均培养20 h后收样。采用Gene Chip Clariom S Array芯片筛选急性低氧诱导和常氧处理细胞的差异表达基因,筛选条件为错误发现率<0.05且|log₂FC|>1;用Kolmogorov-Smirnov和KOBAS version 2.0对差异表达基因进行基因本体论功能分析和京都基因与基因组百科全书通路分析。结果与常氧处理的细胞相比,急性低氧诱导的Huh-7细胞中差异表达基因共计392个,其中表达上调基因266个,表达下调基因126个;急性低氧诱导的Hep3B细胞中,差异表达基因共计2 260个,其中表达上调基因847个,表达下调基因1 413个。急性低氧诱导的Huh-7、Hep3B细胞共同的差异表达基因共17...     

基因芯片技术在胰腺癌中的应用进展

基因芯片技术是近几年发展起来的一项生物技术,可同时对大量基因的表达、突变和多态性进行快速、准确的检测。基因芯片技术为研究肿瘤发生、发展中基因功能分析,提供了强有力的工具。胰腺癌在我国的发病率逐年增长,利用基因芯片技术,为胰腺癌的分子病理诊断、临床预后判断及治疗方案的选择提供理论指导。这必将加速对胰腺癌发生、发展机制的了解,为进一步诊断和治疗提供理论基础。     

应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因

目的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14000种人类基因PCR产物按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上，制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA，将等量的RNA分别逆转录合成荧光分子掺人的cDNA一链作探针，混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray 4000扫描仪扫描芯片荧光信号图像，每点上两种荧光信号的强度分别代表Cy5-dCTP和Cy3-dCTP的量，获得的荧光信号图像用计算机分析。结果按差异显著性标准，从14000个基因中筛选出在胰腺癌组织中共同差异表达基因189条，其中已知基因101条，新基因88条。在筛选出的已知基因中，有50条表达上调，51条表达下调。结论基因芯片技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选胰腺癌相关基因。并高效对基因功能进行研究。胰腺癌基因表达谱的分析有助于认识肿瘤发病机制。     

应用基因芯片技术筛选大鼠再生肝中差异表达基因

目的应用基因芯片技术筛选大鼠再生肝中差异表达基因,为探讨急性肝功能衰竭的发病机制提供基础。方法雄性SD大鼠行95％肝部分切除术,用含1176个基因的大鼠尼龙膜微阵列筛选大鼠再生肝组织中差异表达的基因。RT—PCR随机验证若干差异表达基因在微阵列中的表达。结果再生肝组织有138个基因明显较对照组织表达高,它们主要是生长因子基因、核受体基因、核糖体蛋白基因、应急反应蛋白基因、细胞周期调节基因、神经递质基因等;下调基因共50个,主要为代谢酶基因、激素受体基因及表面抗原基因等。结论cDNA微阵列技术有助于研究急性肝功能衰竭的发病机制,并提供诊断和治疗的潜在靶点。     

基因芯片技术在肺癌研究中的应用

基因芯片技术是一项新的生物学技术。该技术以其迅速及高通量特点，而在肺癌及其它恶性肿瘤研究中具有广泛的用途。本文综述了新近用基因芯片技术在肺癌基因表达及基因功能等研究方面的应用。     

基因芯片技术在肺癌研究中的应用进展

基因芯片技术是一项新的生物学技术,该技术具有高通量、大规模、高灵敏性等特点,在肺癌及其他恶性肿瘤研究中具有广泛的用途.本文就基因芯片技术在肺癌的早期诊断、耐药基因检测和转移相关基因检测中的应用情况作一综述.     

基因芯片技术在呼吸系统疾病研究中的应用

基因芯片技术是一项新的生物学技术，近年发展势头迅猛。该技术以其高通量及高度精确性的特点，在疾病研究中具有广泛的用途。本文综述了新近用基因芯片技术，在部分呼吸系统疾病中的研究应用，并简述了其在本系统疾病研究中的应用前景。     

基因芯片技术及其在疾病研究中的应用

人类基因组计划(human genome project,HGP)的完成,极大地带动了人类疾病相关基因的定位、克隆、结构与功能研究.人类基因组草图基本绘就之后,人类基因组计划也由此加入到功能基因组时代;生命科学的重点也由基因序列研究上升为基因功能研究,基因芯片就是在这个背景下发展起来的一项先进技术.与传统方法相比,它具有快速、高通量、高准确性、低成本等特点,能够满足临床基因检测的要求;且其操作简单、易于标准化、适于推广,显示出广阔的临床应用前景.本文就基因芯片技术的研究进展及其在疾病研究中的应用做一简要综述.     

基因芯片技术在法医学中的应用进展

基因芯片,又称DNA芯片或DNA微阵列,是生物芯片的一种,是将大量可寻址的基因序列信息,即DNA序列有序地固定在固体介质上而成.……     

基因芯片技术在呼吸系统疾病研究中的应用

基因芯片技术是一项新的生物学技术 ,近年发展势头迅猛。该技术以其高通量及高度精确性的特点 ,在疾病研究中具有广泛的用途。本文综述了新近用基因芯片技术 ,在部分呼吸系统疾病中的研究应用 ,并简述了其在本系统疾病研究中的应用前景     

利用基因芯片技术研究大鼠脂肪肝相关基因

本研究应用基因芯片技术探讨脂肪肝形成过程中基因表达的情况,以进一步阐明脂肪肝的发病机制,并为诊断和治疗脂肪肝提供新的靶点。     

基因表达谱芯片在胰腺癌组织差异表达相关基因筛选中的应用

目的：探讨基因表达谱芯片技术筛选胰腺癌组织和癌旁正常组织基因表达谱差异的可行性。方法应用Agilent公司生产的包含27958条DNA的基因芯片检测4例胰腺癌患者胰腺癌组织和癌旁正常组织的基因表达谱,筛选差异表达基因,并用半定量RT-PCR法检测差异基因CD151、S100A4、TIMP-3和NME3表达情况。结果共筛选出46条基因表达谱差异基因,其中26条表达上调、20条表达下调。差异基因CD151、S100A4、TIMP-3和NME3的表达情况与基因表达谱芯片检测结果一致。结论基因表达谱芯片技术可以筛选出胰腺癌组织差异表达相关基因,为胰腺癌分子标志物研究提供了可靠依据。     

应用基因芯片技术筛选肝硬化相关基因

目的:探讨基因表达谱芯片技术在筛查肝硬化相关基因群表达中的作用.方法:按TRIzol法抽提肝硬化及正常肝脏组织总RNA,分离纯化两种组织的mRNA.经逆转录合成掺入生物素标记的cDNA合成探针,与基因芯片(涵盖18 400个转录本,代表14 500个明晰的基因)杂交,扫描芯片荧光信号图像,计算机分析,比较二种组织基因表达谱差异.结果:2例肝硬化组织与正常肝脏组织相比,有1424条基因(9.82%)共同表达差异,其中共同上调基因980条和共同下调基因444条.对1424条共同差异表达基因作了初步功能分类,这些基因与肝硬化的发病机制存在相关性.结论:基因表达谱芯片技术可以筛选出肝硬化表达异常的相关基因群,对其进一步研究有助于认识肝硬化的发病机制.     

基因芯片在哮喘研究中的应用

基因芯片技术具用快速、高效和多参量的特点,它是目前分子生物学最前沿的方法,在疾病的研究方面具用广泛的用途,本文就近几年基因芯片技术在哮喘方面的研究应用及其应用前景做一综述.     

基因芯片筛选大鼠海马中的敌敌畏中毒相关基因

有机磷类化合物是我国应用最广的农业杀虫剂，每年约有10万余例有机磷急性中毒，重度中毒患者的死亡率在4％～30％之间，其中敌敌畏中毒占的比例最大。有研究表明有机磷化合物在中枢神经系统（CNS）的中毒机制涉及胆碱能系统和非胆碱能系统等多个方面。     

基因芯片筛选7例患儿哮喘基因的研究

目的对7例支气管哮喘(简称哮喘)患儿的差异表达基因进行生物信息学分类。方法实验组7例,对照组8例,抽取外周血并分离出淋巴细胞RNA,进行cDNA合成、标记及杂交,通过聚类分析来揭示标本之间可辨识的基因表达谱,最后用GO分析和Pathway分析测定这些差异表达基因的作用。结果在29890个基因中,发现4725个基因存在差异表达,其中1660个表达上调,3065个表达下调。GO分析发现这些基因在生物学过程、细胞组分及分子功能中存在不同的调节。Pathway通路分析发现共有88条通路,其中基因表达上调通路有22条,下调有66条,进一步对这些通路的差异表达基因进行分析,发现有不少在3条以上的通路富集。结论实验组基因表达与对照组相比存在很大差异,这些差异基因涉及多种生物学过程,表明小儿哮喘的发病是一个复杂的病理生理过程。     

基因芯片筛选7例患儿哮喘基因的研究

目的 对7例支气管哮喘(简称哮喘)患儿的差异表达基因进行生物信息学分类.方法 实验组7例,对照组8例,抽取外周血并分离出淋巴细胞RNA,进行cDNA合成、标记及杂交,通过聚类分析来揭示标本之间可辨识的基因表达谱,最后用GO分析和Pathway分析测定这些差异表达基因的作用.结果 在29 890个基因中,发现4 725个基因存在差异表达,其中1 660个表达上调,3 065个表达下调.GO分析发现这些基因在生物学过程、细胞组分及分子功能中存在不同的调节.Pathway通路分析发现共有88条通路,其中基因表达上调通路有22条,下调通路有66条,进一步对这些通路的差异表达基因进行分析,发现有不少有3条以上的通路富集.结论 实验组基因表达与对照组相比存在很大差异,这些差异基因涉及多种生物学过程,表明小儿哮喘的发病是一个复杂的病理生理过程.