基于网络药理学的六味地黄丸治疗高血压作用机制探讨

目的:基于网络药理学探索六味地黄丸治疗高血压的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集六味地黄丸的有效化合物,在PharmMapper数据库中预测化合物可能的靶点,与GeneCards数据库中高血压相关靶点相映射,获得六味地黄丸调节高血压的可能作用靶点;对这些靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的构建、基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,以揭示六味地黄丸治疗高血压可能的作用机制;运用AutoDock进行分子对接验证。结果:共筛选出六味地黄丸中的69个化合物及269个作用靶点,其中作用于高血压的相关靶点有14个;PPI网络显示,血清白蛋白(ALB)、一氧化氮合酶3 (NOS3)、表皮生长因子受体(EGFR)、肾素(REN)是4个联系最多的靶点,涉及对胆固醇的反应、血小板活化的负调节等生物过程,作用机制与调控黏附分子表达、破骨细胞分化、FoxO信号通路、肾素-血管紧张素系统等生物学通路有关。结论:六味地黄丸治疗高血压的主要成分有茯苓酸、泽泻醇、芍药苷、谷甾醇、豆甾醇等,ALB、NOS3、EGFR、REN是其主要作用靶点。     

基于网络药理学探讨二陈汤异病同治机制

目的 应用网络药理学对二陈汤治疗高血压、糖尿病、慢性心衰、肺炎、高血脂、冠心病、肾炎、关节病、脑卒中、哮喘十种病的主要活性成分的作用靶点、信号通路等进行探索,从而揭示二陈汤异病同治的分子机制.方法 基于网络药理学,通过TCMSP,CooLGeN,Venny 2.1,DAVID,NCBI,STRING,Cytoscape...     

GEO芯片联合网络药理学探究六味地黄丸治疗系统性红斑狼疮作用机制及核心靶点分析

目的 运用网络药理学及生物信息学探究六味地黄丸治疗系统性红斑狼疮（SLE）的作用机制,并对核心靶点基因进行深入分析。方法 利用TCMSP、SwissTargetPrediction、本草组鉴（HERB）数据库检索六味地黄丸的主要活性成分及其相关靶点,通过R软件limma包对GEO数据库SLE数据集GSE49454进行差异分析。利用R软件VennDiagram包进行交集靶点分析,clusterProfiler包对交集靶点基因进行GO和KEGG通路富集分析。采用Cytoscape3.8.2软件进行活性成分-靶点-通路网络构建与分析。通过STRING平台构建蛋白相互作用网络并利用Cytoscape3.8.2软件筛选核心靶点基因。利用PyMOL软件对核心活性成分与核心靶点基因进行分子对接验证;通过临床数据与TRRUST数据库进行表达量、转录因子与免疫浸润分析。结果 共筛选出有效活性成分69个,相关靶点813个,基因芯片差异基因703个。KEGG通路富集分析显示,主要涉及NOD样受体等信号通路。筛选出5个核心成分（槲皮素、山柰酚、海风藤酮、玉兰脂素B、羟基芫花素）及5个核心靶点基因（TLR4、C...     

交泰丸对糖尿病、抑郁和失眠症“异病同治”的网络药理学机制分析

目的：从分子水平探讨交泰丸对糖尿病、抑郁和失眠症“异病同治”的作用机制。方法：运用网络药理学技术,通过数据库检索,以交泰丸的有效成分、作用靶点、治疗疾病种类为网络节点,使用Cytoscape构建相互作用网络,MAS进行生物信息学分析。结果：交泰丸中的20个化合物可作用于92个靶点发挥对3种疾病的治疗作用,HTR2A和HTR2C为交泰丸治疗糖尿病、抑郁和失眠的共同靶点。交泰丸治疗糖尿病的靶点主要富集在抗细胞凋亡生物过程和Toll样受体信号通路,治疗抑郁的靶点主要富集在信号转导生物过程和神经活性配体-受体相互作用通路,治疗失眠的靶点主要富集在5-羟色胺受体,磷脂酶C激活途径生物过程和神经活性配体-受体相互作用通路。结论：交泰丸具有多成分、多靶点、多途径的特点,该研究为交泰丸“异病同治”的作用机制提供参考。     

六味地黄丸治疗糖尿病肾病作用机制的网络药理学研究

目的:通过网络药理学方法建立六味地黄丸"活性成分-靶点-通路"图,初步探讨六味地黄丸治疗糖尿病肾病的药理机制。方法:通过TCMSP获取六味地黄丸各单药的活性成分和潜在靶点,运用Genecard筛选得分≥20分的糖尿病肾病相关靶点,STRING构建蛋白相互作用网络,Cytoscape拓扑分析网络图,R语言进行GO和KEGG通路富集分析。结果:网络分析得出41个活性成分,共涉及21个靶点和63条通路。其中槲皮素和山奈酚是主要化合物,关键靶点AKT、VEGFA、NOS3、IL6、SERPINE1富集在重要通路AGE-RAGE信号中。结论:为进一步研究六味地黄丸治疗糖尿病肾病的潜在活性成分及其可能的作用机制提供了思路和理论基础。     

生脉饮“异病同治”糖尿病和心力衰竭的网络药理学作用机制研究

目的采用网络药理学方法探讨生脉饮"异病同治"糖尿病和心力衰竭的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM数据库收集生脉饮组方药物的所有化学成分,通过UniProt数据库获取药物作用靶点,通过DisGeNET和GeneCards数据库筛选与糖尿病和心力衰竭相关的靶点,将药物有效成分作用靶点与疾病靶点比对筛选后,分别构建生脉饮治疗糖尿病和心力衰竭的化合物-靶点相互作用网络图;利用String平台绘制蛋白相互作用(PPI)网络,找出关键基因靶点;分别使用DAVID数据库和Cytoscape3.6.1对核心靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集,并分析PPI网络数据。结果共筛选出生脉饮50个活性成分和3754个潜在作用靶点,糖尿病、心力衰竭相关靶点分别为218、317个,生脉饮治疗糖尿病、心力衰竭作用核心靶点分别为109、196个;经KEGG通路富集分析,分别筛选出生脉饮对糖尿病和心力衰竭具有作用的通路,根据度值对PPI网络数据分析选取生脉饮治疗糖尿病和心力衰竭的主要药效靶点各10个。结论生脉饮治疗糖尿病和心力衰竭具有多成分、多靶点、整体调节的作用特点,可为其活性成分研究和实验研究提供依据。     

基于网络药理学与分子对接技术探究冬虫夏草治疗支气管哮喘和慢性肾衰竭“异病同治”作用机制

目的 以中医“异病同治”理论为依据,采用网络药理学与分子对接方法探究冬虫夏草对支气管哮喘和慢性肾衰竭的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及SwissTargetPrediction数据库检索获取冬虫夏草活性成分及潜在靶点,利用TTD、DrugBank、GeneCards等多数据库获取疾病靶点,将两者取交集获取共有靶点,通过STRING 11.5数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,使用Cytoscape 3.9.0构建冬虫夏草“成分-靶点-疾病”网络,利用Metascape平台工具对共有靶点进行富集分析,运用Autodock 4.2软件进行分子对接。结果 筛得疾病与药物共有靶点60个,核心靶点主要涉及蛋白激酶B1（Akt1）、非受体酪氨酸激酶肉瘤病毒蛋白（Src）、TP53、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）、前列腺素G/H合酶2（PTGS2）等,潜在靶点主要富集在肾素-血管紧张素系统（RAS）,Rap1,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）,丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等多条信号通路中。结论 冬虫夏草中多种活性成分通过多靶点、多途径发挥抑制炎症反应、降低纤维化和细胞凋亡作用,初步揭示了冬虫夏草“异病同治”支气管哮喘与慢性肾衰竭的潜在靶点与现代生物学机制,为深入研究开展实验及临床应用提供参考。     

基于网络药理学探讨六味地黄丸合缩泉丸治疗尿崩症的作用机制

目的：基于网络药理学探讨六味地黄丸合缩泉丸治疗尿崩症(DI)的作用机制。方法：利用TCMSP和UniProt数据库获取六味地黄丸合缩泉丸的有效成分和作用靶点,通过GeneCards、OMIM、DrugBank数据库预测疾病靶点,将有效成分靶点与疾病靶点取交集,构建韦恩图获取共同靶点,运用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,经拓扑分析得到关键靶点,并进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：共获得六味地黄丸合缩泉丸有效成分31个,作用于185个靶点,DI靶点共897个,六味地黄丸合缩泉丸与DI交集靶点39个,主要有效成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、薯蓣皂苷元等,关键靶点包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、基质金属蛋白酶(MMP9)、过氧化物酶体增生激活受体(PPARG)、趋化因子(CCL2)、肿瘤蛋白TP53(p53)等。GO功能富集得到1667个条目,包括生物过程1582个、分子功能78个、细胞组分7个;KEGG通路富集得到110条通路,...     

基于网络药理学和分子对接探究枸杞子-菟丝子“异病同治”2型糖尿病性骨质疏松症和肾病综合征的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨枸杞子-菟丝子“异病同治”2型糖尿病性骨质疏松症（DOP）和肾病综合征（NS）的作用机制。方法：通过TCMSP数据库筛选枸杞子-菟丝子的主要活性成分和作用靶点,利用UniProt数据库及Perl语言进行规范以及转化为标准基因名称,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络。通过GeneCards、OMIM及PharmGkb数据库搜集DOP和NS相关疾病靶点,将疾病靶点与药物靶点取交集,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络并筛选核心蛋白;对交集蛋白运用Rx4.1.3软件及R脚本进行GO功能富集和KEGG通路分析,运用Autodock 4.2软件进行分子对接。结果：筛选后得到枸杞子-菟丝子活性成分42个,作用靶点208个;DOP、NS疾病靶点分别为2834个、2114个,共有靶点915个,疾病和药物交集靶点86个。GO富集分析得到分子功能121条;KEGG通路富集分析获得126条信号通路,靠前的通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、IL-17信号通路,...     

基于网络药理学研究六味地黄丸治疗腰椎间盘退变作用机制

目的:通过网络药理学方法预测六味地黄丸治疗腰椎间盘退变的作用机制。方法:应用TCMSP、Gene Cards、OMIM数据库检索,取交集后得到六味地黄丸与腰椎间盘退变的共同作用靶点。构建共同靶点蛋白互作网络及共同靶点的互作网络图,并对共同作用靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:共筛选出六味地黄丸有效成分69个,作用靶点102个,腰椎间盘退变疾病靶点990个,取交集后获得共同作用靶点30个,出现频次较高的有MAPK8、ESR1、IL-6、VEGFA等。GO分析显示,以上共同作用靶点主要参与组蛋白去乙酰化、细胞凋亡、细胞基因转录、整合素结合等细胞生物过程。KEGG富集结果显示,共同作用靶点富集的信号通路中与腰椎间盘退变相关的主要有细胞凋亡相关信号通路、TNF、HIF-1等信号通路。结论:六味地黄丸通过MAPK8、ESR1、IL-6、VEGFA等靶点干预腰椎间盘退变,涉及组蛋白去乙酰化、细胞凋亡、细胞基因转录、整合素结合等分子功能,作用机制可能与细胞凋亡、TNF、HIF-1等信号通路相关。     

基于网络药理学探讨大柴胡汤对2型糖尿病的治疗作用机制＊

目的 运用网络药理学的方法探讨大柴胡汤治疗2型糖尿病的作用机制，对作用靶点和信号通路进行预测和筛选。方法 首先在SymMap中医药生物信息学平台获取大柴胡汤的潜在作用靶点信息，在CTD疾病数据库获取2型糖尿病的潜在治疗靶点，将两者取交集即得筛选出的药物疾病靶点；使用STRING构建靶点的PPI网络；运用CluGO工具对靶点进行GO功能和KEGG信号通路富集分析，并筛选大柴胡汤治疗糖尿病的活性化学成分。结果 获取大柴胡汤靶点476个，其中与2型糖尿病相关联的靶点有41个，主要参与了葡萄糖跨膜转运、调节胰岛素分泌、葡萄糖稳态、胰岛素受体信号通路的调节等生物过程；还参与调控了胰岛素抵抗、青少年的成年人型糖尿病、2型糖尿病、胰岛素信号通路等相关通路。结论 通过网络药理学分析显示，大柴胡汤对2型糖尿病的治疗作用可能与直接参与调节胰岛素的分泌相关作用途径有关。     

黄连-葛根药对治疗2型糖尿病的网络药理学研究

目的:运用网络药理学研究方法对黄连-葛根药对治疗2型糖尿病(T2 DM)的作用机制进行分析.方法:采用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选出黄连-葛根(C...     

基于数据挖掘和网络药理学的2型糖尿病用药规律及机制分析

目的:挖掘中医药治疗2型糖尿病(T2DM)的组方用药规律,并探讨高频药物作用机制。方法:以中国知网、万方医学网收录的期刊文献为资料来源,使用Excel 2013,SPSS Modeler 14.1,SPSS Statistics 19.0软件,对纳入标准的中药进行关联规则分析、因子分析和系统聚类分析,使用BATMAN-TCM系统对高频药物进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,构建靶点-通路-疾病关联图,揭示潜在作用机制。结果:在纳入标准的92首方剂中,单药黄芪最为常见,药物四气以温、寒为主,五味中甘、苦味为主,归经中肝经居多,使用最多的药物类别为补虚药、活血化瘀药。关联规则分析中发现关联强度最高的药对组合为6种,因子分析中提取7个公因子,系统聚类分析中归为6大类。KEGG通路分析发现高频药物黄芪富集疾病与T2DM有关的有6种,生物学通路共有24条。结论:T2DM的治疗多以甘温药黄芪(补虚药)为主,临床使用可与甘平药茯苓、苦寒药丹参、甘寒药生地黄等组合用药,以及可随证配伍活血化瘀、清热等药物。高频药物黄芪治疗T2DM的作用机制可能是通过干预磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt),淀粉和糖代谢等相关信号通路,作用于核苷酸外焦磷酸酶/磷酸二酯酶(PDEs),腺苷A1受体基因1(ADORA1),腺苷A2A受体基因(ADORA2),神经肽第二受体(NPY2R),内皮一氧化碳合成酶(NOS3)靶点有关。     

基于网络药理学探讨石斛治疗2型糖尿病的作用机制

目的:通过网络药理学方法分析石斛(Herba Dendrobii)在治疗2型糖尿病(T2DM)中的作用及相关分子机制。方法:通过检索有机小分子生物活性数据库(Pubchem)等数据库获取石斛已知活性成分及靶蛋白;利用人类基因数据库(GeneCards)获取T2DM相关疾病基因;运用Cytoscape 3.8.0软件分别构建“石斛活性成分-靶蛋白”相互作用网络和“石斛靶蛋白-T2DM基因”蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析网络拓扑结构;采用OmicShare网站进行石斛治疗T2DM靶点京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析和基因本体(GO)富集分析。结果:筛选获得石斛15个活性成分及其对应的57个靶蛋白,其中主要活性成分为木犀草素、芹菜素等,关键蛋白为雌激素受体α(ESR1)、酪蛋白激酶2α(CSNK2A1)等。GO富集结果提示石斛涉及代谢过程、对内源性刺激反应等生物学过程;参与酶结合、蛋白结合、转录因子结合等分子功能的调节。KEGG通路富集结果暗示,石斛可能通过作用于叉头框O(FOXO)、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGEs-RAGE)、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)等信号通路,调节细胞炎症反应、氧化应激和胰岛素抵抗等,治疗T2DM。结论:石斛治疗T2DM涉及多个靶点和信号通路,可能通过抗氧化应激、抑制炎症反应和胰岛素抵抗等过程进行干预。     

消渴丸治疗2型糖尿病随机平行对照研究

[目的]观察消渴丸治疗2型糖尿病疗效。[方法]使用随机平行对照方法,将150例住院及门诊患者按抛硬币法分为两组。对照组75例降糖舒,1.2g/次,3次/d,饭前温服。治疗组75例消渴丸,2.5g/次,3次/d,饭前温服。连续治疗60d为1疗程。观测临床症状、不良反应。治疗1疗程,判定疗效。[结果]治疗组治愈8例,好转59例,未愈8例,总有效率89.33%。对照组治愈2例,好转35例,未愈38例,总有效率49.33%。治疗组疗效优于对照组(P<0.05)。[结论]消渴丸治疗2型糖尿病效果显著,值得推广。     

基于网络药理学与分子对接技术的水蛭治疗2型糖尿病和糖尿病肾病作用机制比较

目的：基于网络药理学和分子对接技术比较分析水蛭治疗2型糖尿病（T2DM）及糖尿病肾病（DN的作用靶点及通路,初步探讨水蛭治疗糖尿病及其微血管并发症的作用机制。方法：通过TCMID、ETCM、BATMAN-TCM、中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、TCM Database@Taiwan等数据库并结合文献报道收集水蛭的化学成分和对应靶点;在疾病相关数据库CTD、TTD和GeneCards中检索T2DM和DN靶点;采用STRING平台获取蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）信息及基因本体（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路信息,并进行数据可视化分析;结合网络药理学预测到的关键靶点与成分,采用分子对接技术对其进行验证。结果：通过数据库和文献共收集到水蛭中93个成分,其中65个成分匹配到对应化学结构,并预测了448个成分相关靶点。在疾病数据库中分别获取到1667个T2DM靶点和874个DN靶点,将疾病靶点分别与水蛭成分靶点求交集后获得118、111个潜在作用靶点。通过PPI网络得到水蛭治疗T2DM的关键靶点为白蛋白（ALB）、蛋白激酶B1(Akt1)、胰岛素样生长因子1 (...     

六味地黄汤联合激素治疗原发性肾病综合征30例

目的：观察六味地黄汤联合激素治疗原发性肾病综合征的临床疗效。方法：将60例患者随机分为治疗组、对照组各30例。2组均给予低盐、优质高蛋白饮食及利尿、保护肾功能等基础治疗,同时给予常规激素治疗,治疗组在此基础上加用六味地黄汤,水煎分服,1剂/d。2组均连续治疗3个月。结果：总有效率治疗组为90.3%,对照组为83.3%,2组比较差异有统计学意义（P〈0.05）;血清白蛋白、24小时尿蛋白定量2组治疗后与治疗前组内比较,差异有统计学意义（P〈0.05）;治疗后组间比较,差异亦有统计学意义（P〈0.05）。结论：六味地黄汤联合激素治疗原发性肾病综合征临床疗效显著。     

基于网络药理学的小陷胸汤治疗2型糖尿病的药理机制

目的:利用网络药理学探索小陷胸汤治疗2型糖尿病(T2DM)的药理机制。方法:在中药系统药理学技术平台(TCMSP)网站检索小陷胸汤的主要活性成分、对应的作用靶点及靶标基因,通过人类基因数据库(Gene Cards)获得T2DM的相关靶标基因,将药物活性成分靶点与T2DM靶点相映射,获得交集靶点即为小陷胸汤作用于T2DM的预测靶点。利用Cytoscape 3. 7. 1软件构建药物活性成分-交集靶点网络模型,选出关键活性成分。利用STRING网站构建交集靶点蛋白相互作用网络(PPI),选出关键靶点基因。利用DAVID 6. 8在线工具对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:小陷胸汤作用于T2DM的活性成分有30个,相关靶点156个,关键有效成分14个,关键靶点基因18个。GO分析显示,小陷胸汤治疗T2DM潜在基因的生物功能主要涉及转录调控、氧化应激、蛋白结合和炎症反应等;KEGG通路富集显示小陷胸汤治疗T2DM影响的通路主要有缺诱导因子-1(HIF-1)信号通路,肿瘤坏死因子(TNF)信号通路,Toll样受体信号通路,甲状腺激素信号通路,磷脂酰肌醇氧3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路,乙肝,丙肝,酪氨酸激酶受体2(Erb B)信号通路,钙离子信号通路和核转录因子-κB(NF-кB)信号通路等。结论:小陷胸汤治疗T2DM机制可能是通过抑制炎症因子分泌,参与抗炎反应,降低氧化应激,升高细胞内钙离子浓度,阻断胰高血糖素信号通路,激活PI3K/Akt通路等来改善胰岛素抵抗,提高胰岛素敏感性,降低血糖。     

黄精干预2型糖尿病的网络药理学研究

目的:利用网络药理学的方法探讨黄精对2型糖尿病干预的潜在靶点.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出黄精活性成分及潜在靶点,然后通过Gene Gards、OMIM两大数据库筛选与2型糖尿病有关的基因靶点,运用软件Cytoscape和String绘制药物-成分-靶点疾病及蛋白互相作用的网络图,利用网...