表达基因鉴定的一种新策略：筛选poly（dA／dT）—cDNAs

低丰度表达基因及组织细胞等特异基因的鉴定是人类表达基因鉴定的瓶颈,Wang等认为cDNA中的长序列poly(dA/dT)是限制低丰度表达基因等鉴定效率的主要原因,为此提出了一种新策略,即用3′端锚定oligo(dT)11代替常规oligo(dT)引物逆转录合成cDNA,并将3′端携带11个（dA/dT)s序列的cDNA称之为poly(dA/dT)^-cDNA,筛选poly(dA/dT)^-cDNAs差减文库可以提高这些基因的鉴定效率。     

核基质结合序列（MAR）与基因表达调控

核基质结合序列（MAR）是能在体外与核基质特异结合的DNA序列,广泛存在于染色质Loop结构的边界序列中。随着研究的深入,发现MAR序列不仅在染色质折叠中起到重要作用,影响邻近内源基因表达,而且将MAR序列构建到外源基因表达盒两侧转化动植物时,也影响外源基因的表达。因此,MAR序列是基因组中一种重要的基因间边界序列,为阐明非编码序列在基因表达中的作用和构建真核生物高效表达载体提供了新途径。     

基因表达系列分析技术在动物科学中的研究进展

基因表达系列分析（serialanalysisofgeneexpression,SAGE）是一种快速分析特定组织或细胞内基因表达信息的技术,不但可以比较不同组织细胞在不同时间、空间条件下基因表达的差异,还能发现新基因。近几年来,SAGE技术在动物基因表达研究中的应用取得了飞速发展。就SAGE技术的原理、实验路线、优缺点和改进以及SAGE在动物科学研究中的研究现状及应用前景作一简要介绍。     

多聚嘧啶序列结合蛋白（PTB）与HBV转录后调节元件（HPRE）结合抑制HBV表面抗原的基因表达

采用RT-PCR验证PTB与HPRE在体外的特异性结合。用HepG2.2.15细胞系、HBs-HPRE瞬时转染Hela细胞探讨PTB对HBV基因表达的影响。结果显示PTB能与HPRE特异性地结合。功能性研究证明PTB可以抑制HepG2.2.15细胞的HBsAg表达量,并呈浓度依赖性。由HPRE引起的HBsAg表达的增加也能被PTB所抑制。实验数据证明PTB通过与HPRE相互作用抑制HBsAg的基因表达。     

抗香蕉枯萎病的野生蕉抗病基因类似序列的克隆与表达

野生蕉是香蕉遗传改良的天然基因库。为了分离野生蕉中的抗病基因类似序列,根据核苷酸结合位点（nucleotide binding site,NBS）和丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶域设计简并性引物,以经过鉴定的抗香蕉枯萎病4号生理小种的野生蕉（Musaacuminata）叶片cDNA为模板进行PCR扩增。经过对扩增产物进行克隆和测序,获得了6个500bp左右的RGAs片段。其中有2个RGA（WNB1和WNB2）具有NB—ARC保守结构域特征,并且WNB1具有连续的ORF。其余4个RGAs（WST1、WST2、WST3和WST4）均具有丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶域特征,且WST3编码的氨基酸序列与水稻抗叶斑病基因Xa21同源性很高。用半定量PCR分析枯萎病菌诱导后野生蕉叶片中RGAs的表达情况,结果表明WNB1和WST3受枯萎病菌诱导后表达量增强,这表明wNB1和WST3的表达可能与香蕉枯萎病抗性相关。     

水稻蜡质基因5‘上游区中31bp序列增强基因表达的作用

为研究水稻腊质基因（ＷＸ）５‘上游区中一个与胚乳核蛋白绫的３１ｂｐ在基因表达中的作用,将一系列包含或不包含此序列的长度不同的Ｗｘ启动区与β－葡萄糖苷酸酶基因（ＧＵＳ）编码区连接,成嵌合质粒。针这些质粒通过杆菌介导转化水稻幼胚愈伤组织发化产生转朱。分别测定抗性愈伤组织中与转基因株未成熟种子胚乳中的ＧＵＳ酶活性,结果表明含有３１ｂｐ序列的比不含此序列的ＷＸ启动区使ＧＵＳ报告基因的表达水平高出２～３倍。     

MDR3（ABCB4）、BSEP（ABCB11）和FIC1（ATP881）基因在人绒毛和正常妊娠胎盘组织表达的研究

目的检测肝脏胆盐载体FIC1（ATP881）、BSEP（ABCB11）和MDR3（ABCB4）在正常绒毛和胎盘组织中转录水平和蛋白水平的表达情况,探讨肝脏胆盐载体在人类胎盘胆汁酸排泌过程中的作用和功能。方法选择正常妊娠6～12周的孕妇（早孕组）15例和妊娠38～40周的孕妇（晚孕组）20例,采用实时定量逆转录一聚合酶链反应技术（realtimeRT．PCR）检测绒毛和胎盘组织中上3种载体的mRNA,采用免疫组织化学（S-P）法分别检测后两种载体蛋白在上述35例胎盘组织中的表达,并通过免疫印迹技术分析这两种载体在胎盘组织中的含量。结果在所有绒毛和胎盘组织中均检测到3种载体的mRNA。MDR3mRNA在正常绒毛中的表达量较低为（0．15±0．04）,正常晚期妊娠胎盘中表达量为（0．58±0．06）,两者比较有显著性差异（P〈0．05）。与早孕组相比,FIC1mRNA表达水平明显由（0．65±0．03）下降至（0．23±0．04）,差别有非常显著意义（P〈0．01）。而BSEPmRNA表达无改变（0．06±0．01和0．05±0．01）（P〉0．05）。MDR3蛋白、BSEP蛋白在正常绒毛和胎盘组织中均有表达,且两种载体在正常早孕绒毛及晚期妊娠胎盘分布范围基本一致,主要分布在绒毛合体滋养细胞母体面游离缘。MDR3、BSEP蛋白在绒毛和晚期妊娠胎盘中的表达趋势与其mRNA相似,MDR3蛋白Western印迹条带的光密度值为（11357±3618）（早孕组）和（46753±2834）（晚孕组）,两组比较有显著性差异（P〈0．05）。BSEP蛋白早孕组Western印迹条带的光密度值为（1296±436）,晚孕组为（1798±575）,两组比较差异无显著性（P〉0．05）。结论3种肝脏胆盐载体FIC1、MDR3和BSEP在正常绒毛和胎盘组织中均有表达,可能参与了胎盘胆汁酸的排泌功能。妊娠期间MDR3、FIC1和BSEPmRNA和蛋白表达发生变化,可能与胎儿生长发育的需要有关。     

用图论方法研究核酸序列的密码子使用与基因表达水平的关系

研究了Escherichiacoli（115个基因）和SacharomycesYeast（97个基因）核酸序列的密码子使用频率与基因表达水平的关系．将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子：最适密码子（H）、非最适密码子（L）和稀有密码子（R）,对每一基因序列的编码区,算出它们各自出现的概率P（H）,P（L）和P（R）．以P（H）和P（R）为指标,用图论法聚类,发现每种生物的高低表达基因明显分开,基因表达水平被分为四级：甚高表达基因（VH）、高表达基因（H）、较低表达基因（LM）和低表达基因（LL）．每类基因的表达水平与实验结果保持了很好的相关性,与E．coli和Yeast的现有资料相比,符合很好．     

不同调控序列控制下的GUS基因在水稻和毛白杨愈伤组织中的瞬时表达

用CaMV35S启动子、玉米Ubil启动子、TMVΩ增强子(Ω序列)以及拟南芥18S rRNA基因同源序列构建的6种GUS基因表达载体分别转化水稻和毛白杨愈伤组织,研究不同调控序列对外源基因表达的调控作用.结果表明:(1)在水稻中,以独立Ubil启动子驱动下的GUS基因表达水平为最高,CaMV35S启动子附加18SrRNA基因同源序列调控下的GUS基因为最低.而在毛白杨中,则呈相反趋势;(2)在水稻中,CaMV35S-Ubil复合启动子的表达活性比独立CaMV35S启动子提高了近1.5倍.而在毛白杨中,前者比后者的低;(3)Ubil启动子附加Ω序列,使GUS基因在毛白杨中的表达水平提高一倍以上.但CaMV35S-Ubil复合启动子附加Ω序列,对GUS基因在毛白杨及水稻愈伤组织中的表达活性均没有明显的增强作用.     

无载体主干序列的bar和cecropin B 基因表达框共转化水稻

基因枪等直接转化法可将去除质粒载体主干序列的外源基因表达框导入植物基因组,消除质粒主干序列对植物基因组的影响,同时由于转基因分子较小,比较容易实现多个基因的共转化,在植物基因工程育种上有重要的应用价值,研究了基因枪介导外源基因表达框（包括启动子、基因开放阅读框和终止子）转化水稻的影响因素和转基因的整合模式,结果表明：（1）基因枪介导外源基因表达框转化水稻的频率约在0.1%～0.5%之间,非选择标准基因与选择标记基因的共转化频率约为50%～60%,增加基因表达框DNA浓度可提高转化率。相同基因构建物对不同品质水稻的转化率不同,基因构建物的侧边序列对基因枪转化的品种差异可能具有重要影响。（2）非选择标记基因cecropin B表达框在水稻基因组内整合模式简单,仅有1～3个拷贝;筛选标记基因bar表达框却比完整质粒转化后的整合模式复杂得多,插入拷贝数在4～14个之间,线形基因表达框的游离DNA末端和CaMV 35S启动中子重组热点介导的转基因重组可能是导致bar基因表达框复杂整合的重要原因。     

Adenovirus－mediated expression of pig α（1，3）galactosyltransferase reconstructs Gal α（1,3） Gal epitope on the surface of human tumor cells

Gal alpha(1, 3) Gal (gal epitope) is a carbohydrate epitope and synthesized in large amount by alpha(1, 3) galactosyltransferase [alpha(1, 3) GT] enzyme on the cells of lower mammalian animals such as pigs and mice. Human has no gal epitope due to the inactivation of alpha(1, 3) GT gene but produces a large amount of antibodies (anti-Gal) which recognize Gal alpha(1, 3) Gal structures specifically. In this study, a replication-deficient recombinant adenoviral vector Ad5sGT containing pig alpha(1, 3) GT cDNA was constructed and characterized. Adenoviral vector-mediated transfer of pig alpha(1, 3) GT gene into human tumor cells such as malignant melanoma A375, stomach cancer SGC-7901, and lung cancer SPC-A-1 was reported for the first time. Results showed that Gal epitope did not increase the sensitivity of human tumor cells to human complement-mediated lysis, although human complement activation and the binding of human IgG and IgM natural antibodies to human tumor cells were enhanced significantly after Ad5sGT transduction. Appearance of gal epitope on the human tumor cells changed the expression of cell surface carbohydrates reacting with Ulex europaeus I (UEA I) lectins, Vicia villosa agglutinin (VVA), Arachis hypogaea agglutinin (PNA), and Glycine max agglutinin (SBA) to different degrees. In addition, no effect of gal epitope on the growth in vitro of human tumor cells was observed in MTT assay.     

白粉病菌诱导的小麦表达序列标签（EST）研究

白粉病是我国小麦的主要病害之一,尝试用表达序列标签（expressed sequence tage,EST）技术,研究了经白粉病菌诱导后的小麦基因表达。从构建的普通cDNA库中随机挑取约1500个阳性克隆并进行测序,获不重复ESTs序列387条,不重复序列均获GenBank的存储号,其中49.4%的序列与已知基因同源,196条序列功能未知,84条序列为新ESTs。将不重复序列制备成高密度点阵膜,用差示杂交法筛选到几个抗病相关序列。     

与拟南芥抗寒性相关的CBF3和AtGolS3基因克隆及其表达载体的构建

用RT—PCR技术从拟南芥（Arabidopsis thaliana）克隆到抗寒相关基因CBF3,AtGoIS3,序列分析后用BLAST软件作同源序列分析的结果显示,它们的核苷酸序列与GenBank中登录的拟南芥CBF3（AF074602）,AtGoIS3（AB062850）核苷酸序列完全相同。CBF3丹和AfGoIS3基因分别与植物表达载体pVKH相连构建pVKH-35S-CBF3-pA、pVKH．35S-AtGolS3．pA以及通过中间载体pRT101,将AtGolS3连接到pVKH-35S-CBF3-pA上,成为各自带有35S启动子及PolyA终止子的双价植物表达载体pVKH一35S—CBF3-pA-35S-AtGolS3-pA。     

大豆11S球蛋白Gy5(A3B4)的基因克隆和序列分析

大豆11Ｓ球蛋白(Ｇｌｙｃｉｎｉｎ)是大豆种子的主要贮藏蛋白,分子量为360ｋＤ,由6对相同的蛋白亚基(每对亚基的分子量约60ｋＤ)构成。每对亚基又是由一个酸性Ａ肽(35～45ｋＤ)和一个碱性Ｂ肽(22ｋＤ)通过二硫键连接而成。Ａ肽和Ｂ肽源自同一个基因,即首先由一个大的ｍＲ?..     

重组腺相关病毒载体基因表达效率与辐射的关系

重组腺相关病毒(rAAV)载体被认为是最有希望的临床应用基因治疗载体之一。rAAV载体基因传递的有效性与病毒衣壳蛋白的免疫原性之间的矛盾是制约该类基因药物开发的关键难题,提高其表达效率是rAAV载体研发的主攻方向之一。研究发现,紫外线、γ射线等辐射可以提高rAAV载体的基因表达效率,其作用效果与辐射种类和剂量、细胞种类和状态、载体感染指数和感染时间等因素有关。其机制可能与DNA损伤反应,特别是DNA双链断裂修复有关。对辐射与rAAV载体的表达效率之间关系的深入了解,为两者的联合应用打开方便之门。本文将对UV、γ射线等辐射提高rAAV载体表达效率的机制、影响因素及其在基因治疗领域的应用进展进行综述。     

中国地方品种香猪的肌肉特异组织表达序列标签（ESTs）的分析

通过构建香猪肌肉组织cDNA文库,并在文库中随机挑选克隆进行测序的方法,获得了131个香猪肌肉EST序列。在这131个EST序列所代表的109个单一克隆中,有99个为人类及其他物种的同源序列,3个为已知的猪的ESTs,7个为未知ESTs。对这10个已知、未知ESTs进行开放阅读框预测并进行BlastX分析,没有找到高度同源的氨基酸序列。对上述EST所对应的基因功能分析结果表明,除去27．27％的EST未能分类外,克隆到的EST大多来自与基因／蛋白的表达调控相关的基因（占45．46％）。来自具有其他功能的基因的EST依次是细胞代谢占10．10％、细胞结构／迁移占10．10％、细胞／机体防御占5．05％和细胞信号／传导占2．02％。没有发现和细胞分裂相关的已知功能基因。本研究结果为中国地方品种香猪提供了第一个骨骼肌的基因表达谱,为今后寻找猪肌肉生长和肉用品质的候选基因奠定了基础。