1株脓肿分枝杆菌临床分离株的鉴定

正脓肿分枝杆菌是一种不产色素的快速生长的分枝杆菌,与龟分枝杆菌亲缘关系较近。在快速生长的分枝杆菌引起的疾病中,60%~80%的慢性肺病由该菌导致,该菌也是引起创伤后伤口感染的主要病原体。在我国有脓肿分枝杆菌造成肺部病变和软组织损害的报道[1-3]。1资料与方法1.1一般资料患者,男,74岁。因气短、咳嗽咳痰20余年,     

一株罕见Ihumii放线菌的分离和鉴定

正放线菌大多存在于健康人口腔、上呼吸道、胃肠道和泌尿生殖道等与外界相通的腔道,是寄居人体的一种正常菌群[1-2]。当机体免疫力减弱、口腔卫生不良、拔牙或外伤时,可侵入组织导致皮肤、皮下组织,肌肉,骨骼及中枢神经系统化脓性感染[3]。根据感染的途径和涉及的器官不同,临床上分为面颈部、胸部、腹部和中枢神经系统感染。其主要特征为慢性化脓性肉芽肿病变,以向周围组织扩展形成瘘管并排出带     

痰标本中金黄色葡萄球菌的分离鉴定方法研究

目的：探索一种基于16S rRNA 基因的细菌快速鉴定方法,为临床标本中未知病原菌的诊断提供新的方法思路。方法对1份临床发热伴呼吸道症候群患者的痰标本进行分离培养,获得3种不同的菌落。直接以纯菌落为模板,以通用引物扩增未知菌的16S rRNA 基因片段,产物直接测序后进行基于局部比对算法的搜索工具比对,根据序列同源性鉴定病原细菌。结果3种菌落分别为不易致病的表皮葡萄球菌、龋齿罗特放线菌及致病性的金黄色葡萄球菌,后者继续用特异性引物扩增检测鉴定,确认为金黄色葡萄球菌。结论本研究建立了一种利用16S rRNA 基因扩增快速鉴定临床标本中未知病原菌的简便方法。     

鲍曼不动杆菌临床分离株分子生物学鉴定分析

目的了解目前鲍曼不动杆菌临床鉴定分析的准确性及可能存在的问题。方法本研究随机抽取100株临床鉴定为鲍曼不动杆菌的临床分离鉴定株开展了扩增核糖体DNA限制酶切分析,16S rRNA编码基因及16S~23S rRNA间区测序鉴定分析。结果鉴定出5个不动杆菌种,分别为鲍曼不动杆菌(77%),菌种3(9%),菌种10(6%),菌种13TU(3%),琼氏不动杆菌(2%),还有3%为非不动杆菌。结论目前临床实验室对鲍曼不动杆菌的鉴定准确性较低,可能影响对不动杆菌不同种的流行病学特征和临床状况的认知,临床不动杆菌的鉴定能力有待加强。     

5株玫瑰单胞菌的临床分离、鉴定和特征分析

目的：对2011－2013年我院收集的5株来源临床的玫瑰单胞菌进行分析,探讨玫瑰单胞菌的病原学特点。方法：采用生化鉴定、API 20NE、Vitek系统GN卡、RapID NF和16S rRNA基因测序对该5株菌进行鉴定,Kirby-Bauer法进行药敏试验。结果：玫瑰单胞菌不在API 20NE和Vitek鉴定的数据库范围内;RapID NF数据库涵盖了玫瑰单胞菌,但仅2株正确鉴定为玫瑰单胞菌属。采用16S rRNA基因测序分析,5株菌分别鉴定为黏液玫瑰单胞菌（3株）、吉氏玫瑰单胞菌（1株）和河口玫瑰单胞菌（1株）。药敏结果显示,5株菌对碳青酶烯类、氨基糖苷类和喹诺酮类药物均敏感,对单环内酰胺类、青霉素类和头孢类等抗菌药物呈现广泛耐药。结论：16S rRNA基因测序是玫瑰单胞菌最佳的临床鉴定方法,玫瑰单胞菌对抗菌药物呈现耐药应引起临床重视。     

金黄色葡萄球菌临床分离株spa分型和耐药特征研究

目的研究临床分离金葡菌的耐药性和分子特征。方法对2011年511月在成都某医院分离的56株金葡菌进行抗菌药物敏感性检测,检测菌株携带mecA基因和pvl基因情况,并进行spa基因分型分析。结果56株金葡菌中,共检出耐甲氧两林金葡菌（MRSA）21株（37．5％）,其中mecA基因阳性20株（95．2％）;甲氧西林敏感金葡菌（MSSA）35株（62．5％）。与MSSA相比,MRSA对利福平、左氧氟沙星、莫西沙星、环丙沙星、庆大霉素和四环素的敏感率显著降低（P〈0．05）,MRSA对万古霉素、利奈唑胺、替加环素、喹奴普丁达福普汀和呋喃妥因全部敏感。MRSA分为6个spa型别,以t030（66．7％）为主,MRSA～t030、MRSA—t002具有突出的多药耐药特征。MSSA共分为18个spa型别,以t189、t377和t034列前3位,分别占14．3％、／4．3％和1I．4％,并在脓液标本榆出I株新spa基因型new1。检出5株杀白细胞毒素（PVL）阳性菌株,其中3株为MSSA—t189。结论t030是医院MRSA临床分离株中的spa优势型别,具有突出的多药耐药特征,在医院内广泛传播。MSSA遗传多样性高,以t189、t377和t034列前3位。     

不同基因型金黄色葡萄球菌临床分离株体外侵袭力差异性研究

目的：分析不同基因型金黄色葡萄球菌临床分离株体外侵袭能力的差异,为进一步阐明金黄色葡萄球菌致病机制及防控医院感染提供新的实验依据。方法采用脉冲场凝胶电泳（ PFGE ）和多位点序列分型法（ MLST）对43株金黄色葡萄球菌临床分离株进行分子分型,采用抗菌药物保护试验和流式细胞内化试验检测不同基因型金黄色葡萄球菌体外侵袭能力。结果按照80％相似度为计算依据,43株金黄色葡萄球菌共分12个PFGE基因型,2个优势型（Ⅰ和Ⅱ型）分别占25．6％（11／43）和34．9％（15／43）,其它型别为少见型,占39．5％（17／43）。体外药物敏感性试验结果显示,Ⅰ型和少见型主要为甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌（ MSSA ）（85．7％,24／28）,而Ⅱ型均为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（ MRSA）（100．0％,15／15）。 MLST结果显示,Ⅱ型菌株为ST-239型,Ⅰ型及其它型菌株ST型不定。抗菌药物保护试验结果显示,侵袭能力最强的3株菌的侵入率分别为3．27％、3．15％和3．09％,侵袭力最弱的3株菌的侵入率分别为0．22％、0．24％和1．16％。Ⅰ型菌株和Ⅱ型菌株比较差异不明显（P＞0．05）;Ⅰ型和Ⅱ型菌株体外侵袭力均显著高于少见型（P均＜0．01）。结论不同基因型金黄色葡萄球菌体外侵袭力差异显著,优势克隆株特别是ST-239型MRSA菌株显示出较强的体外侵袭能力。金黄色葡萄球菌分离率较高的科室应对该克隆株给予更多关注,加强感染防控措施,降低其医院内传播及感染率。     

金黄色葡萄球菌临床分离株ermA，ermB，ermC和msrA基因检测分析

目的：分析金黄色葡萄球菌对红霉素、克林霉素耐药相关基因与耐药表型的关系,探讨其耐药机制。方法对武汉大学人民医院检验科微生物室分离出的76株金黄色葡萄球菌进行革兰阳性球菌药敏组合试验,同时采用 PCR方法检测 ermA,ermB,ermC和msrA等耐药相关基因。结果76株金黄色葡萄球菌对红霉素和克林霉素耐药相关基因 ermA, ermB和 ermC阳性的有29株,msrA 阳性的有2株。ermA,ermB,ermC 和 msrA 检测与红霉素耐药表型的符合率为82.9％;与克林霉素耐药表型的符合率为89.5％。结论该院金黄色葡萄球菌对红霉素、克林霉素耐药与其耐药相关基因 ermA,ermB,ermC和msrA的编码相关。     

皮肤软组织及创伤感染金黄色葡萄球菌分离株的毒素基因检测

目的了解皮肤软组织及创伤感染的金葡菌携带的杀白细胞素(Panton—Valentine Leukocidin,PVL)基因、表皮剥脱性毒素(ETs)基因、中毒性休克综合征毒素-1(TSST-1)的tst基因的特点。方法对连续收集的皮肤软组织感染中分离的90株金葡菌,采用多重PCR同时检测金葡菌特异性16SrRNA基因、mecA基因、PVL基因,采用PCR法检测TSST-1及EtsA、B基因。结果金葡菌mecA基因阳性47株(占金葡菌52.2%)为耐甲氧西林金葡菌(MRSA)。有1株MRSA的EtsB基因阳性,1株MRSA的TSST-1阳性,有7株金葡菌携带PVL基因,其中3株为mecA基因阳性株(MRSA)。结论金葡菌可分泌多种毒素,携带PVL毒素的金葡菌常可以引起严重的侵袭性感染,尤其对产毒的MRSA感染引起足够的重视,是防控的重点。     

复方三黄液对60株骨科分离金黄色葡萄球菌体外抑菌效果研究

目的：了解复方三黄液对金黄色葡萄球菌的体外抑菌效果,为临床应用提供实验室依据。方法采用肉汤稀释法,以复方三黄液为抑菌药,观察其对骨科感染分离出的60株金黄色葡萄球菌的最小抑菌浓度（MIC）和最小杀菌浓度（MBC）。结果42株 MSSA 中32株 MIC 为7．8μg/mL,10株 MIC 为15．6μg/mL;18株 MRSA 中14株 MIC 为7．8μg/mL,4株 MIC为15．6μg/mL。MRSA 组均值为9．6μg/mL,MSSA 均值为9．5μg/mL。结论复方三黄液对金黄色葡萄球菌体外抑菌效果明显,并能避免耐药菌的产生。     

痰标本中金黄色葡萄球菌的耐药性监测

目的回顾性分析痰标本中金葡菌的临床分布和耐药情况,为制订预防控制措施提供依据。方法对2009年1月至2012年9月临床分离的276株金葡菌进行分析,细菌鉴定采用VITEK 2 Compact全自动细菌培养鉴定仪,药敏试验结果按CLS1标准判断。结果耐甲氧西林金葡菌（MRSA）的检出率为79.0%（218/276）;临床分离的金葡菌主要分布为神经内科76株（27.5%）、ICU 70株（25.4%）、神经外科50）株（18.1%）、呼吸内科25株（9.1%）。金葡菌对万古霉素、替考拉宁和奎奴普丁-达福普汀的耐药率均〈0.5%;MRSA对甲氧苄啶-磺胺甲噁唑的耐药率低于甲氧西林敏感金葡菌（MSSA）;MRSA对其他大多数抗菌药物的耐药率高于MSSA。结论 MRSA的检出率和耐药率较高,临床应依据药敏试验结果合理选择抗菌药物。     

骨科专科医院金黄色葡萄球菌临床分布及耐药性分析

摘要 目的 了解骨科专科医院金黄色葡萄球菌临床分布及耐药性,为临床合理使用抗菌药物提供依据。方法 回顾性分析2012-2017年骨科专科医院住院患者分离的4 121株金黄色葡萄球菌的感染情况及耐药性。结果 分离出金黄色葡萄球菌4 121株,其中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)1 055株,占25.6%。金黄色葡萄球菌主要分离自分泌物、呼吸道、尿道和血液,分别占78.1%、9.2%、4.6%和4.2%;MRSA在ICU和骨内科的检出率较高,分别为55.2%和24.3%;MRSA除对万古霉素和利奈唑胺敏感100%,对呋喃妥因、喹奴普汀／达福普汀和利福平的耐药率均<25%外,对其他抗菌药物均有不同程度的耐药。结论 骨科专科医院金黄色葡萄球菌特别是MRSA对多种抗菌药物产生不同程度的耐药性,应加强对MRSA耐药性的监测,指导临床合理使用抗菌药物。     

Virulence potential of Staphylococcus aureus strains isolated from diabetic foot ulcers: a new paradigm

OBJECTIVE—The purpose of this study was to assess the virulence potential of Staphylococcus aureus strains isolated from diabetic foot ulcers and to discriminate noninfected from infected ulcers.RESEARCH DESIGN AND METHODS—Diabetic patients hospitalized in a diabetic foot department with a foot ulcer were prospectively enrolled if they had been free of antibiotic treatment over the previous 6 months. At admission, ulcers were classified as infected or noninfected on the basis of clinical examination, according to the International Working Group on the Diabetic Foot system. Only patients carrying S. aureus as the sole pathogen were included. In individuals with a grade 1 ulcer, a second bacterial specimen was obtained 1 month later. Using virulence genotyping markers, clonality tools, and an in vivo Caenorhabditis elegans model, we correlated the virulence of 132 S. aureus strains with grade, time of collection, and ulcer outcome.RESULTS—Among virulence genes, the most relevant combination derived from the logistic regression was the association of cap8, sea, sei, lukE, and hlgv (area under the curve 0.958). These markers were useful to distinguish noninfected (grade 1) from infected (grades 2–4) ulcers and to predict wound status at the follow-up. With use of the nematode model, S. aureus strains isolated from grade 1 ulcers were found to be significantly less virulent than strains from ulcers at or above grade 2 (P < 0.001).CONCLUSIONS—This study highlights the coexistence of two S. aureus populations on diabetic foot ulcers. A combination of five genes that may help distinguish colonized grade 1 from infected grade ≥2 wounds, predict ulcer outcome, and contribute to more appropriate use of antibiotics was discovered.Foot ulcers are common in diabetic patients, with prevalence as high as 25% (1). These ulcers frequently become infected, and spread of infections to soft tissue and to bony structures is a major causal factor for lower-limb amputation (2). Early diagnosis and adequate treatment are essential. Because microorganisms are always present on skin wounds, diagnosis of infection must be based not on microbiological findings but on clinical criteria, as emphasized by the Infectious Diseases Society of America and the International Working Group on the Diabetic Foot (IWGDF) and more recently by the French Society for Infectious Pathology (3–5). However, because of the confounding impact of neuropathy and ischemia on local and systemic inflammatory response, diagnosing foot infection at an early stage in diabetic individuals may be difficult.Recently, we demonstrated the value of using a miniaturized oligonucleotide array covering different genes of Staphylococcus aureus, by far the most common and virulent pathogen in diabetic foot infection (3), and we showed that the virulence gene profile of S. aureus enables us to distinguish grade 1 from grades 2–4 ulcers because the former generally displayed a very low level of virulence genes (6). One of the main limitations in that work was the limited panel of genes used. Here we analyzed the most prevalent virulence-associated genes and the in vivo virulence potential of the different S. aureus strains isolated from diabetic foot ulcers. The aim was to detect genetic markers to distinguish noninfected and infected ulcer and to predict outcome of grade 1 ulcers.     

50株临床分离金黄色葡萄球菌分子流行病学及药物敏感性分析

目的研究北京电力医院2009年10月至2010年3月连续分离的金葡菌的分子流行病学特征及药物敏感性状况。方法收集在此期间临床连续分离的金葡菌,采用多位点序列分型(MLST)和葡萄球菌蛋白A基因(spa)分型技术进行分子生物学分型,同时进行Panton-Valentine(PVL)毒素基因检测,并对其中的33株甲氧西林耐药金葡菌(MRSA)进行SCCmec分型;采用琼脂稀释法作MRSA对14种抗菌药物的药敏试验。结果 50株金葡菌中,检出MRSA33株,占66.0%,其中1株为社区获得性(CA)-MRSA。MRSA有6种克隆型,其中ST239-t030-Ⅲ型占绝对优势,并且发现了国内罕见的新克隆型(ST239-t2270-Ⅲ)的传播;相比较,MSSA分子分型则呈散在分布。药敏试验结果显示,糖肽类抗生素及替加环素对MRSA的抗菌作用最强。CA-MRSA携带PVL毒素基因,其耐药谱与医院获得性(HA)-MRSA有较大差异。结论相比于MSSA,MRSA的克隆型别相对集中,提示MRSA更容易引起医院内的传播。MRSA以ST239-t030-Ⅲ为最常见型别,与我国总体趋势一致。     

血液感染金黄色葡萄球菌耐药性及甲氧西林耐药株危险因素分析

目的分析血液感染金黄色葡萄球菌耐药性及甲氧西林耐药株感染的危险因素。方法对本院2009~2011年金黄色葡萄球菌血液感染患者流行病学资料进行回顾性研究。将感染患者分为甲氧西林敏感(MSSA)组和耐药组(MRSA),然后采用1∶2成组病例对照方法选取同时期非金黄色葡萄球菌感染患者作为对照组,对MRSA血液感染危险因素进行分析。结果血液标本分离的289株金黄色葡萄球菌中192株为甲氧西林耐药株,占66.90%,MRSA组耐药性明显高于MSSA组。甲氧西林耐药组和敏感组感染患者的病死率均高于对照组,但是MRSA组与MSSA组病死率比较差异无统计学意义。Logistic回归分析显示,重症监护室(ICU)入住(>7d)、中心静脉置管、联合用药大于2种和抗生素使用时间大于2周是MRSA感染的独立危险因素。结论血液分离金黄色葡萄球菌MRSA株检出率高、耐药性强,患者的病死率高。MRSA血液感染具有多个独立危险因素,加强对这些独立危险因素的控制可有效预防其感染扩散。     

Detection of biofilm-forming strains of Staphylococcus epidermidis and S. aureus

The formation of biofilm represents an important virulence factor of certain strains of Staphylococcus epidermidis and S. aureus. The ability of bacteria to aggregate, forming biofilms, is strictly related to the capacity of producing an extracellular mucoid substance often referred to as slime, whose main component is of polysaccharidic nature and consists of glycosaminoglycans. In recent years, new molecular techniques based on PCR have come alongside more traditional methods for identification of virulent biofilm-forming strains. The detection of the genes governing the production of such extracellular polysaccharide and, in particular, the icaA, the icaC and the icaD genes, provides us with a rapid and accurate technique for strain characterization. However, well-established methods, such as the Congo red agar test are still needed in order to confirm the phenotypic expression in the case of possible phase-variant strains. In future, the complete knowledge of the genetic mechanisms of phenotype modulation, comprehending all regulatory genes, could permit the characterization of the isolates just by molecular means in a single step.     

Detection of metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa strains isolated from burn patients in Ahwaz, Iran

The antimicrobial activities of 6 common antimicrobial agents including carbapenems were tested against 100 clinical Pseudomonas aeruginosa isolates using a disk diffusion method. All imipenem (IPM)-resistant isolates were screened for metallo-beta-lactamase (MBL) production by Etest assay and were subsequently subjected to polymerase chain reaction (PCR) analysis with the bla(IMP) and bla(VIM) genes. Of 41 IPM-nonsusceptible isolates detected, 8 (19.51%) appeared to produce MBL, as determined by Etest. Using PCR assay, these isolates were positive for bla(VIM) genes, whereas none were positive for bla(IMP) genes.     

北京市健康从业人员携带金黄色葡萄球菌肠毒素特征分析

目的 了解健康从业人员携带金黄色葡萄球菌的肠毒素分布情况。方法 收集北京市朝阳区健康从业人员鼻部携带金黄色葡萄球菌100株,对20种肠毒素和类肠毒素基因进行检测,并进行spa分型和多位点序列分型（MLST）分析。结果 100株金黄色葡萄球菌菌株中,64株菌（64%）携带1种或多种肠毒素基因。最常见的肠毒素基因分别为sea、seg、selm、seln、sell和seb。最常见的肠毒素类型为sea和selp,检出率均为10%。肠毒素sea主要分布在ST6（29.4%,5/17）和ST401（29.4%,5/17）型菌株。携带单一selp肠毒素基因的菌株50%均属于spa t796型。结论 健康从业人员金黄色葡萄球菌肠毒素基因的高携带率可能成为食物中毒不可忽视的危险因素。     

168株金黄色葡萄球菌的临床分布与耐药分析

目的 了解该院金黄色葡萄球菌的临床分布特点及耐药情况,指导临床合理用药,减少耐药菌株的产生.方法 对临床送检的合格标本进行细菌培养,采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析系统进行鉴定和药物敏感试验.结果 从各类标本中分离出金黄色葡萄球菌168株,其中耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌（MRSA）59株,检出率为35.1%（59/168）,分离的金黄色葡萄球菌标本主要来源于分泌物51.2%（86/168）、痰液22.0%（37/168）、全血5.4%（9/168）、置管液5.4%（9/168）.MRSA分布的科室以神经科（30.5%）、普外泌尿科（22.0%）、骨科（15.2%）、心胸外科（8.5%）、呼吸科（8.5%）多见.对MRSA和非耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌（MSSA）耐药率为0的抗菌药物有万古霉素、利奈唑胺、替考拉宁、奎努普汀/达福普汀、呋喃妥因,青霉素、复方磺胺甲噁唑对MRSA的耐药率分别为100%、6.8%,对MSSA的耐药率分别为91.7%、12.8%,其余9种抗菌药物对MRSA的耐药率均高于MSSA.结论 加强耐药菌株的监测,规范临床用药,有利于控制感染.