随机引物多态性DNA及其在微生物分型中的应用

用于微生物分型的现代技术包括表型和基因型方法。随机扩增我态性ＤＮＡ是在ＰＣＲ技术基础上发展起来的一种新的基因分型法。主要特点是利用随机寡核苷酸引物扩增基因组ＤＮＡ片段，进而通过弟胶电泳分析其批纹图特征借以显示不同菌株间存在细微差别，这种方法简单、快速，现已在许多微生物分型中得到运用。     

随机引物多态性DNA及其在微生物分型中的应用

用于微生物分型的现代技术包括表型和基因型方法。随机扩增多态性DNA（RandomAmplifictedPolymorphicDNA简称RAPD）是在PCR技术基础上发展起来的一种新的基因分型法。主要特点是利用随机寡核苷酸引物扩增基因组DNA片段，进而通过凝胶电泳分析其指纹图特征借以显示不同菌株间存在细微差别。这种方法简单、快速，现已在许多微生物分型中得到运用。     

随机的多态性DNA及其在微生物分型中的应用

用于微生物分型的现代技术包括表型和基因型方法。随机扩增多态性ＤＮＡ （Ｒａｎｄｏｍ Ａｍｐｉｌｆｉｃｔｅｄ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ＤＮＡ简称ＲＡＰＤ）是在ＰＣＲ技术基础上发展起来的一种新的基因分型法。主要特点是利用随机寡核苷酸引物扩增基因组ＤＮＡ片段，进而通过凝胶电泳分析其指纹图特征供以显示不同菌株间存在细微差别。这种方法简单、快速、现已在许多微生物分型中得到运用。     

金黄色葡萄球菌随机引物扩增DNA多态性的分型研究

随机扩增ＤＮＡ的多态性(ＲＡＰＤＤＮＡ)分型是近年来继质粒谱分析、脉冲场电泳、探针杂交等分子生物学分型方法之后,发展起来的又一基因分型技术,在建立后的短短几年内,它已在医院感染菌株基因多态性分析中,显示了巨大的优势。为此,我们对金黄色葡萄球菌进行ＲＡＰＤ基因分型,以探讨其在医院感染研究中的意义。一、材料与方法1菌株来源:1998年2月～1999年4月住广州市三所综合性医院患者,分别取自痰、血液、伤口分泌物、腹水等临床标本,经分离鉴定确定为金黄色葡萄球菌,共85株。医院感染72株,社区感染13株。由一个实验室统一鉴定到种。所有…     

金黄色葡萄球菌随机扩增多态性DNA分型及其应用

目的 利用随机扩增多态性DNA（random amplified polymorpohic DNA,RAPD）分析技术，对金黄色葡萄球菌进行基因分型，并观察临床耐药型与其基因型之间的关系。方法 利用自己合成的随机引物，建立RAPD检测分析方法，并利用这一方法对5株金黄色葡萄球菌进行基因分型的研究。结果 5株金黄色葡萄球菌中，2株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）为同一基因型，另外3株为两种基因型，均是敏感菌株。结论 从RAPD分析的初步结果可以看出，金黄色葡萄球菌的临床表现型与基因型存在一定的关系，本法有望且于临床金黄色葡萄球菌耐药的快速检测。     

8种细菌随机扩增多态性DNA引物筛选与反应体系优化

随机扩增多态性ＤＮＡ(ＲＡＰＤ)是一种新兴的基因分型方法 ,可对细菌等病原微生物进行基因分型并广泛应用于分子微生物学的追踪调查及医院感染的分析[1 ] 。该方法的最大特点是可对模板序列未知 ,而随机引物可以是任意 1 0个ｂｐ的单链寡聚核苷酸片段。本研究以临床常见的 8种细菌为对象 ,各筛选 2 0 0条随机引物 ,并应用反应曲面设计 (ＲＳＤ)方案[2 ] 对反应体系中关键反应成分 (模板、引物及镁离子 )浓度进行了优化 ,旨在为相关细菌的ＲＡＰＤ反应体系标准化及分型提供科学依据。一、材料与方法1 .菌株 :大肠埃希菌ＡＴＣＣ 2 592 2和金…     

随机扩增DNA多态性技术在肠球菌流行病学分型中的应用

目的 探讨运用随机扩增DNA多态性技术对肠球菌流行病学分型的方法。方法 采用随机扩增DNA多态性技术对分离的肠球菌进行基因水平的同源性分析。结果 显示明显可见10～20条数的DNA指纹图谱,经RAPD、PHYLIP和Treeview分析软件分析,分为3个聚类群。结论 随机扩增DNA多态性技术对肠球菌感染流行监测是一个有效的方法。     

细菌随机扩增多态性DNA分析中随机引物的筛选与反应体系的优化

目的 筛选出最佳随机引物并优化其反应体系用于8种细菌的随机扩增多态性DNA（RAPD）分析。方法 对200条随机引物进行过筛，应用反应曲面设计（RSD）进行RAPD反应体系的优化。结果 8种细菌各有1条最佳随机引物，相应的优化反应体系（关键反应成分）浓度差别较大，其中模板浓度差别最大达100倍。结论 以最佳随机引物及优化反应体系，才可使RAPD分型条件“标准”化。     

应用随机扩增多态性DNA技术分型大肠艾希菌

目的对大肠艾希菌（E．coli）进行随机扩增多态性DNA（RAPD）法基因分型并应用于医院感染的判断。方法以优化的随机引物、反应体系和扩增条件对临床分离的161株E．coli进行RAPD法基因分型并按指纹图上DNA条带数及片段大小绘制基因分型图谱，同时对E．coli的医院内感染进行了观察与分析。结果161株临床分离E．coil共得RAPD型120种：E．coli的医院内感染确实存在。结论RAPD法可将E．coli分型120种并有效应用于E．coli医院内感染的判断。     

随机扩增多态性DNA分型法用于肠球菌基因分型

目的研究适于本实验室肠球菌随机扩增多态性NDA分型法(RAPD)分型的最佳实验条件.方法在改变引物、模板、Mg2+浓度、Taq多聚酶用量及循环参数等不同条件下,采用RAPD法对肠球菌进行基因分型.结果经优化后的RAPD方法能很好地对肠球菌进行分子生物学分型.结论RAPD是从分子水平对微生物感染进行病原学、流行病学研究较理想的一种经济、快速、可靠的基因分型方法.     

随机扩增多态性DNA分型法用于肠球菌基因分型

目的 研究适于本实验室肠球菌随机扩增多态性NDA分型法（RAPD）分型的最佳实验条件。方法 在改变引物、模板、Mg^2 浓度、Taq多聚酶用量及循环参数等不同条件下,采用RAPD法对肠球菌进行基因分型。结果 经优化后的RAPD方法能很好地对肠球菌进行分子生物学分型。结论 RAPD是从分子水平对微生物感染进行病原学,流行病学研究较理想的一种经济、快速、可靠的基因分型方法。     

随机扩增多态性DNA(RAPD)技术及其在医学原虫学中的研究进展

随机扩增多态性 DNA(RAPD)分析技术以其高效、快速、简便等优点而被广泛应用。本文介绍了该技术的原理、影响因素和局限性 ,并重点综述了其在医学原虫分类鉴定、世系发育、地理分布、虫株毒力及抗药性研究中的应用     

鲍曼不动杆菌随机扩增多态性DNA法基因分型

目的建立鲍曼不动杆菌(A.baumannii)随机扩增多态性DNA(RAPD)法基因分型图谱。方法以优化的随机引物和反应体系对临床分离的176株鲍曼不动杆菌进行RAPD法基因分型,并按DNA条带数及片段大小绘制指纹图谱。结果176株临床分离鲍曼不动杆菌共得122种RAPD指纹图谱,以第68、58和66型为主要型别,分别为18、15和10株。结论RAPD技术可将临床分离鲍曼不动杆菌分型122种,本院的主要流行基因型为第68、58和66型。     

随机扩增多态性DNA分型技术在肠球菌基因分型及耐药性的研究

目的 建立随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)分型技术,对肠球菌进行基因分型,探讨其在肠球菌基因分型及耐药性中的应用.方法 对医院临床标本中分离的64株肠球菌进行RAPD基因分型,并分析基因型与耐药性的关系,同时对实验数据进行分析处理.结果 RAPD分型技术能有效地对肠球菌进行基因分型,分型率为100%.64株肠球菌根据扩增片段的差异分为8种基因型,均有共同的697bp扩增片段.结论 RAPD分型技术可有效地对肠球菌进行基因分型,并且肠球菌的RAPD分型与其耐药性有一定关系.     

随机扩增多态性DNA9RAPD）技术及其在医学？…

随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析技术以其高效、快速、简便等优点而被广泛应用。本文介绍了该技术的原理、影响因素和局限性，并重点综述了其在医学原虫分类鉴定、世系发育、地理分布、虫株毒力及抗药性研究中的应用。     

随机扩增多态DNA分型在假丝酵母菌医院感染研究中的应用

由于广谱抗生素的长期应用、器官移植手术的开展、免疫抑制剂的大量应用、导管介入治疗、癌症患者及艾滋病患者增多等原因,临床上真菌感染呈明显上升趋势,其中假丝酵母菌(Candida)感染在医院中最为常见[1]。因此对假丝酵母     

DNA工作站在HLA测序分型中的应用

目的 建立从全血样本中高通量提取基因组DNA的方法,以应用于HLA常规测序分型.方法 采用DNA工作站及2 ml深孔板,从400份全血样本中提取基因组DNA.用紫外分光光度仪测定其浓度和A<,260>/A<,280>值,并采用琼脂糖电泳检测DNA的完整性.扩增产物经纯化后作为测序模板,产物经酒精/EDTA/NaOAc法纯化,用ABI Prism<'TM>3730测序仪电泳检测.相关的分析软件分析HLA基因型.结果 使用400μL全血中400份样本的DNA产量平均为(3.217±0.715)μg,A<,260>/A<,280>值平均为1.710±0.103;琼脂糖电泳表明DNA的分子量均大于15×10<'3>;HLA-A、HLA-B和HLA-DRB1座位序列碱基峰高均在2000以上,测序评分在75分以上.48份HLA-A、B和DRB1基因型已知的室内质控样本,经本文的方法提取DNA并进行HLA基因分型,经盲检质控检测,所得到的结果与已知的HLA基因型相一致.结论 采用本方法所提取的DNA能稳定、可靠地应用于骨髓捐献者样本的HLA-A、B和DRB1座位测序分型,具有快速、高通量化的特点和广泛的应用前景.     

随机扩增多态性DNA及其在医院感染中的应用

随机扩增多态性DNA是在PCR技术基础上发展起来的一种新的基因分型方法,其主要特点是利用随机寡核苷酸引物扩增基因组DNA片段,进而通过凝胶电泳分析其指纹图特征来显示不同菌株间存在的细微差别。这种方法简单、快速,并已在医院感染研究中有着重要的应用。