RASSF1A和p16 转录本在非小细胞肺癌中的表达及启动子区甲基化

 目的 研究RASSF1A和p16基因在国人非小细胞肺癌（NSCLC）组织中的转录及启动子区甲基化情况，探讨其转录失活的机制，为NSCLC的诊断和治疗寻找新的途径。方法 应用半定量RTPCR和甲基化特异性PCR法分析96例NSCLC及远癌正常肺组织中RASSF1A和p16基因mRNA的表达和启动子区甲基化情况。结果 （1）53．12％（51／96）的NSCLC中RASSF1A表达明显下调或缺失；36．46％（35／96）的p16表达下调或缺失，而远癌正常肺组织均表达良好。（2）96例NSCLC中RASSF1A甲基化率48．96％（47／96），该基因表达明显下调或缺失的51例中39例（76．5％）出现甲基化，表达正常的45例中8例（17．8％）出现甲基化，两组对比差异有统计学意义（P〈0．05）；96例NSCLC中33例（34．38％）检测到p16启动予区甲基化，p16基因表达明显下调的35例中20例（57．1％）出现该基因CPG岛的甲基化，而表达正常的61例中13例（21．3％）出现甲基化，两组比较差异显著（P〈0．05）。96例远癌正常肺组织均未检测到此两基因启动子有甲基化。结论 RASSF1A和p16基因mRNA在国人NSCLC中较高比例的表达下调或缺失；甲基化可能是两基因表达失活的主要原因。     

卵巢上皮性恶性肿瘤组织RASSF1A基因启动子区甲基化的研究

目的 探讨RASSF1A基因启动子区异常甲基化与卵巢上皮性恶性肿瘤发生、发展的关系。方法 应用甲基化特异性PCR方法,检测80例卵巢上皮性恶性肿瘤组织RASSF1A基因启动子区异常甲基化。结果 80例卵巢上皮性恶性肿瘤组织中,RASSF1A基因启动子区甲基化的发生率为52．5％,而相应痛旁正常组织中,RASSF1A基因启动子区均未发生甲基化（P〈0．05）。浆液性癌、黏液性癌和内膜样癌中,RASSF1A基因启动子区甲基化的发生率分别为54．2％、52．4％和45．5％,差异尤统计学意义。临床Ⅰ期、Ⅱ期卵巢上皮性恶性肿瘤RASSF1A基因启动子区甲基化的发生率分别为21．4％和16．7％,明显低于临床Ⅲ期（66．7％）和Ⅳ期（77．8％）。高分化组和中分化组RASSFlA基因启动子区甲基化的发牛率分别为34．5％和35．0％,均低于低分化组（80．6％）。结论 卵巢上皮性恶性肿瘤组织中存在RASSF1A基因启动子区的异常甲基化,甲基化与卵巢上皮性恶性肿瘤的临床分期和组织学分级有关。     

贲门腺癌中RASSF1A基因的甲基化状态及表达

 目的 研究贲门腺癌（gastric cardiac adenocarcinoma,GCA）中RASSF1A基因的甲基化状态及其蛋白表达情况。 方法 分别应用甲基化特异性PCR（MSP）、RT-PCR及免疫组织化学SP法检测贲门癌组织及相应癌旁组织的RASSF1A甲基化情况和mRNA水平及蛋白表达情况。 结果 92例贲门癌组织中有54例发生了甲基化,甲基化率为58.7%,显著高于癌旁正常组织（P<0.01）。Ⅲ期和Ⅳ期贲门癌患者中RASSF1A基因发生甲基化的比率显著高于Ⅰ期和Ⅱ期患者（P<0.05）。92例贲门癌组织中有43例RASSF1A基因蛋白表达阴性,与相应癌旁正常组织相比有显著性差异（P<0.01）。Ⅲ期和Ⅳ期贲门癌RASSF1A基因蛋白表达显著低于Ⅰ期和Ⅱ期患者（P<0.05）。发生甲基化的贲门癌组织中RASSF1A的mRNA水平的表达显著低于未发生甲基化的贲门癌组织（P<0.01）。 结论 RASSF1A基因启动子区发生甲基化导致的基因沉默可能是贲门腺癌发生的机制之一。     

MSP法检测胃癌组织中RASSF1A基因启动子区甲基化改变

目的:探讨抑癌基因RASSF1A启动子区CpG岛甲基化与胃癌及临床病理特征的关系.方法:采用甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)法检测60例胃癌组织及相应癌旁组织和30例对照组织中RASSF1A基因启动子区甲基化状态.结果:胃癌组织中RASSF1A基因启动子区CpG岛甲基化率为65.0%(39/60),显著高于癌旁组织6.7%(4/60),及对照组0%(0/30)(P＜0.01).胃癌组织中不同年龄、性别、分化程度及淋巴结转移与否的RASSF1A基因甲基化率的差异均无统计学意义.结论:胃癌中RASSF1A基因启动子区的高甲基化提示其与胃癌的发生密切相关,MSP法对RASSF1A基因启动子区甲基化的检测有望成为胃癌早期监测的重要方法.     

MSP法检测胃癌组织中RASSF1A基因启动子区甲基化改变

目的：探讨抑癌基因RASSF1A启动子区CpG岛甲基化与胃癌及临床病理特征的关系。方法：采用甲基化特异性PCR（methylation—specific PCR,MSP）法检测60例胃癌组织及相应癌旁组织和30例对照组织中RASSF1A基因启动子区甲基化状态。结果：胃癌组织中RASSF1A基因启动子区CpG岛甲基化率为65．0％（39／60）,艋著高于癌旁组织6．7％（4／60）,及对照组0％（0／30）（P〈0．01）。胃癌组织中不同年龄、性别、分化程度及淋巴结转移与否的RASSF1A基因甲基化率的差异均无统计学意义。结论：胃癌中RASSF1A基因启动子区的高甲基化提示其与胃癌的发生密切相关,MSP法对RASSF1A基因启动子区甲基化的检测有望成为胃癌早期监测的重要方法。     

新型肺癌候选抑癌基因RASSF1A研究进展

Ras相关区域家族1A(RASSF1A)是最近从3p1.3上发现的新型候选抑癌基因,在肺癌、乳腺癌和结肠癌等十几种恶性肿瘤中均出现高频率表达失活和异常高甲基化.将该基因转染入肺癌、肾癌等肿瘤细胞株中均可显著抑制癌细胞生长,逆转其恶性表型,提示该基因的失活可能在肺癌等多种肿瘤的发生发展中发挥重要作用.     

NSCLC患者血清RASSF2基因甲基化检测临床意义分析

目的:探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者血清中RASSF2基因启动子区域甲基化状况及其临床意义.方法:甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)法检测62例NSCLC和30例肺部良性疾病患者及16名健康体检者血清中RASSF2启动子区域甲基化状况,并分析其与临床特征的关系.结果:RASSF2甲基化检出率在NSCLC患者中为38.71％(24/62),而肺部良性疾病患者和健康体检者血清未检出,x2=22.89,P＜0.01.NSCLC患者血清RASSF2基因甲基化检出率与年龄、性别、病理类型、临床分期和分化程度无明显相关(P＞0.05),不吸烟者RASSF2甲基化率高于吸烟者(61.90％ vs 26.83％,x2=7.20,P＜0.05).结论:RASSF2甲基化可能在NSCLC发生、发展中起重要作用,有望成为NSCLC辅助诊断的分子标记.     

鼻咽癌组织中RASSF1A基因甲基化的研究

目的观察RASSF1A基因在鼻咽癌组织和慢性鼻咽炎的甲基化情况。方法采用甲基化特异性PCR技术检测16例鼻咽低分化未角化癌和10例鼻咽黏膜慢性炎组织中RASSF1A基因的甲基化。结果RASSF1A基因的高甲基化率在鼻咽癌组织中为93．75％（15／16）,在慢性鼻咽炎组织中为0,两组病例的RASSF1A基因高甲基化率差别显著,P〈0．005。结论RASSF1A基因在鼻咽癌组织中呈高甲基化,可能是影响鼻咽癌发生发展的抑癌基因之一。     

血清RASSF1A甲基化评估PD-1单抗治疗非小细胞肺癌疗效的临床价值

[目的]评价RASSF1A基因甲基化水平变化评估程序性细胞死亡蛋白1(programmed cell death,,PD-1)单抗治疗晚期转移性非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)疗效以及预后中的价值.[方法]研究纳入70例Ⅳ期NSCLC患者,在PD-1单抗治疗前(基线)、每...     

RASSF1A基因启动子外周血和组织甲基化在乳腺癌中的意义

目的通过对乳腺癌、癌旁组织及同一患者对应的术前外周血中RASSF1A基因甲基化的检测,加深对乳腺癌发病分子机制的了解并为乳腺癌早期诊断和预后判断提供候选指标。方法采用甲基化特异性PCR方法,分别检测156例乳腺癌患者血浆、肿瘤组织及癌旁正常组织和39例乳腺良性病变血浆及其正常组织中RASSF1A基因启动子甲基化状况。结果早期乳腺癌组织RASSF1A基因启动子甲基化发生率为62.2%(23/37),同一患者外周血甲基化发生率为56.7%(21/37),Kappa值为0.6553(P<0.001),40例血浆RASSF1A甲基化的患者中,37例发生淋巴结转移92.5%(37/40),3例未发生淋巴结转移7.5%(3/40),差异有显著性(P=0.0003);乳腺癌组织和外周血中的RASSF1A甲基化水平与乳腺癌的年龄、家族史、分型、分期、ER、PR、CerbB-2无关;晚期癌复发的86例中,其中癌组织甲基化病例的复发率为25.5%(13/51),癌旁组织甲基化的复发率为75.7%(53/70),两组差异有显著性(P<0.0001)。结论乳腺癌血浆RASSF1A甲基化与组织中的变化较为一致,可作为早期病例筛查和判断淋巴结转移的候选指标之一;晚期乳腺癌癌旁RASSF1A甲基化可能参与肿瘤复发,可作为预测晚期病例预后的候选指标之一。     

非小细胞肺癌ＳＦＲＰ１基因甲基化的研究

目的　检测ＳＦＲＰ１基因在非小细胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）组织和血浆中的甲基化状态,分析其临床意义。方法　留取７８例ＮＳＣＬＣ患者术中癌组织、正常肺组织及术前血浆标本,２５例肺部良性病变组织及５０例肺部良性病变患者或健康志愿者血浆标本为对照,甲基化特异性聚合酶链反应（ＭＳＰ）检测ＳＦＲＰ１基因启动子区甲基化情况,并分析与临床病理特征之间的相关性。结果　７８例ＮＳＣＬＣ组织中,ＳＦＲＰ１基因启动子甲基化比例为３２.１％,高于正常组织的７.７％和２５例肺部良性病变组织的０（Ｐ＜０.０１）;ＳＦＲＰ１基因启动子甲基化与患者淋巴结转移相关（Ｐ＝０.０３９）。ＮＳＣＬＣ术前血浆ＤＮＡ中ＳＦＲＰ１甲基化比例为２８.２％,高于对照组的４.０％（Ｐ＜０.０１）,且血浆ＤＮＡ甲基化状况与组织中具有良好的一致性。结论　血浆ＤＮＡ中ＳＦＲＰ１甲基化检测可能对ＮＳＣＬＣ早期诊断有益。     

Prognostic significance of RASSF1A promoter methylation on survival of non-small cell lung cancer patients treated with gemcitabine

The epigenetic inactivation of genes plays an important role in lung cancer. We have investigated the methylation status of the promoter region of seven genes (APC1A, DAPK, FHIT, p14(ARF), p16(INK4a), RARbeta, RASSF1A) in serum DNA of NSCLC patients. The objective of our study was to reveal the influence of such alterations on overall survival. Blood samples were drawn pretherapeutically. Genomic DNA was purified from serum, treated with sodium bisulfite and hypermethylation was detected by a nested methylation-specific PCR in a group of 92 patients with histologically confirmed stage IIIB and IV NSCLC. All patients received gemcitabine first-line alone or in combination with other drugs. The vast majority (n=87) showed at least one epigenetic alteration. The methylation frequencies of individual genes varied between 25.9 and 47.3%. The hypermethylation status of none of the genes had a significant influence on median overall survival of the total population. In contrast, patients with a methylated RASSF1A gene who showed a partial response survived significantly longer (33.6+/-10.4 month) compared to those with a wild-type allele (12.9+/-4.7 month, P=0.0045). This effect became even more pronounced in combination with p14(ARF) (P=0.0004). This difference was not seen in patients with stable or progressive disease. A multivariate analysis confirmed that RASSF1A methylation was an independent prognostic factor. Our results show that the hypermethylation frequency of single genes and the accumulation of epigenetic alterations in individual samples of NSCLC patients may vary considerably. Molecular parameters such as hypermethylation of RASSF1A or p14(ARF) may be useful prognostic markers in subpopulations.     

Analysis of RASSF1A promoter hypermethylation in serum DNA of non-small cell lung cancer

OBJECTIVE: To detect the hypermethylation status of RASSF1A promoter in serum DNA of non-small cell lung cancer (NSCLC) patient and evaluate its correlation with clinicopathological parameters. METHODS: Serum DNA was extracted from the peripheral blood of 75 NSCLC patients and another 35 patients with benign pulmonary disease and 15 healthy donors. The methylation status of RASSF1A promoter was determined using methylation-specific PCR (MSP), and the correlation of methylation profiles with clinicopathological parameters was statistically analyzed. RESULTS: Aberrant methylation of RASSF1A was detected in 23 of 75 (30.7%) cancer patients, but in none of patients with benign pulmonary disease or in healthy donors (P <0.001). RASSF1A hypermethylation status was found to be correlated with late stage and poor differentiation (P < 0.05), but not with gender, age or histopathology in NSCLC patients. CONCLUSION: Hypermethylated RASSF1A promoter is frequently found in the serum DNA of non-small cell lung cancer patient, and RASSF1A may become a promising novel biomarker for diagnosis and prognosis prediction in lung cancer.     

RASSF1A promoter methylation and Kras2 mutations in non small cell lung cancer

In the present studies, we investigated the correlation between RASSF1A promoter methylation status and Kras2 mutations in 65 primary non small cell lung cancer (NSCLC) including 33 adenocarcinomas, 12 large cell carcinomas, and 20 squamous cell carcinomas. Mutational analysis of Kras2 showed: 30% (10 of 33) of adenocarcinomas, 25% (3 of 12) of large cell carcinomas, and only 5% (1 of 20) of squamous cell carcinomas contained activated Kras2 mutation at codon 12 or 13. RASSF1A promoter region CpG island methylation was detected in adenocarcinomas (55%), large cell carcinomas (25%), and squamous cell carcinomas (25%). Interestingly, combined RASSF1A methylation and Kras2 mutation data show that only - 7% adenocarcinomas/large cell carcinomas exhibited both KRASSF1A promoter methylation and Kras2 mutation, whereas 24% adenocarcinomas, 50% large cell carcinomas, and 70% squamous cell carcinomas showed neither Kras2 mutation nor RASSF1A promoter methylation. These results showed that the majority of the primary NSCLCs with Kras2 mutations lack RASSF1A inactivation, and both RASSF1A inactivation and Kras2 mutation events occur frequently in adenocarcinomas and large cell carcinomas. Our results indicate a trend of inverse relationship between Kras2 activation and RASSF1A promoter methylation in the majority of human lung adenocarcinomas and large cell carcinomas.     

非小细胞肺癌患者血清Ras相关区域家族1A基因启动子异常甲基化检测及其临床意义

目的 研究非小细胞肺癌(NSCLC)患者血清Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区域的甲基化状态及其临床意义.方法 采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术,检测75例NSCLC患者血清RASSF1A基因启动子区域的甲基化状态,并分析其与临床病理参数之间的相关性.结果75例NSCLC患者血清RASSF1A基因启动子区域异常甲基化检出率为30.7%(23/75),而35例肺部良性疾病患者和15例健康志愿者中检出率均为0,差异有统计学意义(P＜0.001).RASSF1A启动子异常甲基化与NSCLC患者的年龄、性别、病理类型无显著相关性,但在晚期及肿瘤分化程度较低的患者中检出率较高(P＜0.05).结论 RASSF1A启动子异常甲基化在NSCLC的发生、发展中起重要作用,有望成为NSCLC辅助诊断和预后判断的分子标记.     

K-ras mutations and RASSF1A promoter methylation in colorectal cancer

Human cancer is characterized by genetic and epigenetic alterations. In this study we provide evidence for the interruption of Ras signaling in sporadic colorectal cancer (CRC) by either genetic activation of the K-ras oncogene or epigenetic silencing of the putative tumor suppressor gene RASSF1A. Paraffin embedded tumor tissue samples from 222 sporadic CRC patients were analysed for K-ras codon 12 and codon 13 activating mutations and RASSF1A promoter hypermethylation. Overall, K-ras mutations were observed in 87 of 222 (39%) and RASSF1A methylation was observed in 45 of 222 (20%) of CRCs. Mutation of K-ras alone was detected in 76 of 222 (34%) CRCs. RASSF1A promoter methylation with wild-type K-ras was observed in 34 of 222 (15%) CRCs. In 101 of 222 (46%) CRCs neither K-ras mutations nor RASSF1A methylation was observed and 11 of 222 (5%) CRCs showed both K-ras mutations and RASSF1A methylation. These data show that the majority of the studied CRCs with K-ras mutations lack RASSF1A promoter methylation, an event which occurs predominantly in K-ras wild-type CRCs (P=0.023, Chi-square test).     

非小细胞肺癌组织中Apaf-1基因表达及启动子区甲基化研究

目的:探讨Apaf1基因表达及启动子区甲基化在非小细胞肺癌(nonsmallcelllungcancer,NSCLC)发生中的作用。方法:应用免疫组化、半定量RTPCR和甲基化特异性PCR方法分析45例NSCLC及癌旁正常对照组织中Apaf1(apoptoticproteaseactivatingfactor1)基因的表达及启动子区甲基化情况。结果:60%(27/45)NSCLC组织Apaf1表达明显下调,与癌旁正常组织相比差异有统计学意义,P=0.0005。在Apaf1基因表达明显下调的27例NSCLC中19例出现甲基化,表达水平无明显变化的18例NSCLC中5例出现甲基化;二者对比差异有统计学意义,P=0.005。45例癌旁正常对照组织未检测到Apaf1基因启动子甲基化,提示启动子区甲基化是Apaf1基因表达下调的主要原因。结论:Apaf1基因与NSCLC相关,启动子区甲基化是该基因失活的重要机制。     

非小细胞肺癌EGFR启动子区甲基化和mRNA表达临床意义的探讨

目的:研究表皮生长因子受体(EGFR)的表达与非小细胞肺癌(NSCLC)组织学类型和淋巴结转移的关系,分析EGFR启动子区甲基化与其mRNA表达的关系.方法:应用免疫组织化学法检测60例非小细胞肺癌组织中EGFR的表达,统计EGFR与病理类型及淋巴结转移的关系.用实时定量PCR方法检测其中30例非小细胞肺癌组织和对应的癌旁组织中EGFR mRNA的表达,用甲基化特异性PCR(MSP)方法检测EGFR启动子区的甲基化状态.结果:鳞癌中EGFR阳性率为38.5％(10/26),明显低于腺癌中EGFR阳性率76.5％ (26/34),差异有统计学意义,x2=8.87,P=0.002 9;且有淋巴结转移的NSCLC中EGFR的阳性率为73.7％(28/38),而无淋巴结转移的NSCLC中EGFR的阳性率为45.5％(10/22),差异有统计学意义,x2=4.78,P=0.028.30例有癌旁组织的标本中,11例患者肿瘤组织EGFR的表达高于其癌旁组织;12例标本中存在肿瘤组织EGFR基因启动子区甲基化水平与EGFR mRNA表达呈负调节关系.结论:EGFR的表达与NSCLC的病理类型及淋巴结转移相关,部分NSCLC患者中存在EGFR基因启动子区甲基化水平与EGFR基因mRNA表达呈负调节关系.