深红红螺菌吸氢酶缺失突变株在管式光合反应器中的产氢

本研究设计了一种2 L分体式管式光合反应器, 并研究了深红红螺菌(Rhodospirillum rubrum)吸氢酶缺失突变株在该反应器中分别利用人工光源(持续光照与光暗交替)和自然光的产氢规律。结果表明在人工光照条件下R. rubrum的产氢可维持5 d, 持续光照和光暗交替条件下(12 h: 12 h)的氢产量可分别达到5752 mL/PBR ± 158 mL/PBR和5012 mL/PBR ± 202 mL/PBR; 自然光条件下, 最适产氢光照强度为30000 Lux~40000 Lux; 在此光照条件下, R. rubrum产氢可维持6 d~ 10 d, 最高氢产量可达到2800 mL/PBR。尽管利用自然光的氢产量比利用人工光源氢产量低, 但是利用自然光的产氢比较经济, 并且该光合产氢系统操作简单, 该工艺有望开发为低成本的光合细菌产氢技术。     

用PCR方法从基因组DNA中扩增人睫状神经营养因子基因

用ＰＣＲ方法从基因组ＤＮＡ中扩增人睫状神经营养因子基因杜方勇,甘思德,范明,刘淑红（北京军事医学科学院基础医学研究所１００８５０）ＰＣＲ方法具有操作方便、对模板要求不高、能快速高效地从原材料中得到微克水平的基因片段等优点,但用它从基因组ＤＮＡ扩增长片...     

用DNA扩增法检测镰状细胞基因

本文报道应用DNA扩增技术对国内首例镰状细胞特征患者(Hb s杂合子)进行基因诊断。方法是从患者干血标本中微量抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应(PCR)扩增其β珠蛋白基因,经限制性内切酶MstⅡ消化后作电泳分析直接检测Hb S基因。本文介绍的DNA诊断技术快速、灵敏、简便,它不需要放射性同位素标记的探针,可以采用干血抽提的DNA,因此,对遗传病基因诊断和携带者的筛查具有重要价值。     

由小麦赤霉病菌菌丝快速提取DNA用于PCR扩增反应

采用加玻璃珠混合振荡１８００ｒ／ｍｉｎ１５分钟并９５℃水浴加热１０～２０分钟的物理破壁方法由真菌菌丝直接提取ＤＮＡ用于ＰＣＲ扩增,具有所提ＤＮＡ可扩增性好,提取方法简便易行,便宜等优点,相同引物或不同引物的二次扩增产物均好于一次扩增,且以引物Ｂ１和Ｂ３扩增后再且引物Ｆｇｌ和Ｆｇ２扩增的效果最好,此法可广泛应用于大量样品的ＰＣＲ和ＲＡＰＤ扩增实验。     

扩增大段靶DNA的PCR方法

扩增大段靶ＤＮＡ的ＰＣＲ方法陈尚武,王章（中山大学生命科学学院,广州）ＰＣＲ和分子克隆是扩增遗传物质的常用技术。热稳定Ｔａｑ（Ｔｈｅｒｍｕｓａｑｕａｔｉｃｕｓ）ＤＮＡ聚合酶的应用以及ＰＣＲ技术所固有的迅速、简便、廉价等优点,使ＤＮＡ片段的ＰＣＲ扩增成...     

促髓细胞分化的锌指基因单向PCR扩增直接测序的研究

锌指基因是一种造血调节基因,编码锌指结构蛋白,主要在髓细胞中表达,促进髓细胞分化在急性早幼粒白血病维甲酸治疗中,促使病情缓解,本文报道了我们从基因分子上研究锌指基因作用中,探索并建立了单向聚合酶链反应扩增特定单链ＤＮＡ,直接测序的新方法,它能产生质和量均佳的单均ＤＮＡ,无需纯化即可直接用于测序,使复杂的测序研究简便易行,可在２,３天内完成,这各单向ＰＣＲ扩增特定单链ＤＮＡ直接测序的方法,经对锌指基     

对PCR扩增片段克隆操作的几点体会

PCR,技术的应用,极大方便了对已知序列基因某一片段的克隆,但在实际操作中某些容易忽视的因素有可能导致实验失败,以下将我们在这方面工作中的几点体会总结如下以供借鉴。1．引物设计。在引物5＇端设计酶切位点序列时一般要加保护碱基,如BamHI识别序列为5＇-GGATCC,应设计成5＇－CGGGATCC,这样才能保证下一步酶切反应的正常进行,因为5＇端裸露的位点往往不能为限制酶识别,具体何种位点加什么保护碱基可参阅NewEnglandBiolabs96／97Catalog或其它有关材料。2．片段处理。PCR扩增片段最好用酚：氯仿抽提以除尽Taq酶,单纯…     

简并PCR技术及其在基因克隆中的应用

本文简要介绍简并PCR技术,包括什么是简并引物,如何设计简并引物,进行简并PCR的反应条件,应用简并PCR获得全长基因的方法和简并PCR技术的应用范围,并对简并PCR技术的局限性及其新进展进行讨论。在此基础上,简述基因的克隆策略以及简并PCR技术在基因克隆中的应用。简并PCR技术是寻找和发现“新”基因或蛋白质家族新成员的一种非常有用的工具。Abstract:Degenerate PCR is introduced in this paper,including what is degenerate PCR,how to design degenerate primers,how to optimize degenerate PCR parameters,how to applying degenerate PCR to obtain full-length gene and which fields can apply degenerate PCR.The limits and recent advances of degenerate PCR are also discussed.Based on this introduction,strategies of gene cloning and applications of degenerate PCR in gene cloning are summarized in brief.Degenerate PCR is a very useful tool for searching and discovering new genes and new members of a protein family.     

Improved PCR primers for the detection and identification of arbuscular mycorrhizal fungi

A set of PCR primers that should amplify all subgroups of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF, Glomeromycota), but exclude sequences from other organisms, was designed to facilitate rapid detection and identification directly from field-grown plant roots. The small subunit rRNA gene was targeted for the new primers (AML1 and AML2) because phylogenetic relationships among the Glomeromycota are well understood for this gene. Sequence comparisons indicate that the new primers should amplify all published AMF sequences except those from Archaeospora trappei. The specificity of the new primers was tested using 23 different AMF spore morphotypes from trap cultures and Miscanthus sinensis, Glycine max and Panax ginseng roots sampled from the field. Non-AMF DNA of 14 plants, 14 Basidiomycota and 18 Ascomycota was also tested as negative controls. Sequences amplified from roots using the new primers were compared with those obtained using the established NS31 and AM1 primer combination. The new primers have much better specificity and coverage of all known AMF groups.     

PCR技术应用的新进展

近年来,随着PCR技术方法学的逐步改进和完善,更加显示出它的实用性.这不仅扩大了其用武之地,也促进了分子生物学的快速发展.文章着重介绍PCR在基因工程和蛋白质工程应用中的某些新进展,包括不需连接的克隆技术、随机引导／定位PCR、cDNA末端随机快速扩增、重组PCR和大引物PCR．     

单引物预掺入PCR与抗体可变区基因的体外放大

用针对引导序列的5′-引物和针对恒定区的3′-引物,常规PCR程序只使所选5株单抗10个可变区cDNA中的4个得到放大.新设计的程序增设了一个反应时相:94℃ 1 min,37℃ 6-8min,循环1-3次,只加入5′-引物,补充3′-引物后,转入常规PCR循环,10个可变区cDNA均获放大.此程序被命名为“单引物预掺入PCR”.     

A PCR-based method for the identification of important wood rotting fungal taxa within Ganoderma, Inonotus s.l. and Phellinus s.l

Two multiplex PCRs, based on 10 taxon-specific primers designed on rRNA gene regions, were developed for the identification of taxa within the lignivorous genera Ganoderma, Inonotus s.l. and Phellinus s.l., each comprising both secondary and primary aggressive decay fungi. Each multiplex PCR proved to correctly identify 1 x 10(-2) pg of fungal target DNA directly from wood. This method can be helpful in detecting decay in standing trees independent of its stage of advancement, and to identify the associated decay agents.     

applications of electroporation of adherent cellsIn Situ,on a partly conductive slide

One of the most important factors affecting the quality of PCR is the choice of primers. In general, the longer the PCR product the more difficult it is to select efficient primers and set appropriate designing primers, and in general, the more DNA sequence information is available, the better the ch0ance of finding an optimal primer pair. Efficient primers can be designed by avoiding the following flaws: primer-dimer formation, self-complementarity, too lowT _m of the primers, and/or their incorrect internal stability profile. Tips on subcloning PCR products, calculating duplex stability (predicting dimer formation strength), and designing degenerate primers are given.     

PCR引物特异性核查系统(PSC)的构建与应用

聚合酶链式反应(PCR)虽已广泛用于分子生物学研究中,然而PCR实验中的非特异性产物问题将直接影响PCR的效率,在多重PCR实验中更是如此。为了最大限度地降低非特异性产物的出现率,同时避免用户频繁使用Blast比对检查非特异性,我们开发了基于NCBI-Blast的引物评估和模板DNA特异性结合能力评估的核查系统PSC(Primer Specificity Checking,http://biocompute.bmi.ac.cn/PSC),并基于虚拟PCR实验确定了用于引物质量核查计算的多种参数,能够在线提供多个物种的引物特异性核查结果。该系统可以有效地对引物序列可能产生的所有非特异性扩增进行预测,有助于实验前引物优化或者对非特异扩增结果进行解释,最终达到提高PCR效率的目的。     

2例PCR扩增失败的分析与探讨

根据GenBank报道的序列设计引物,PCR扩增克隆玉米乙醇脱氢酶1(Adh)核基质结合区序列及大鼠脑啡肽基因。扩增的序列电泳分析条带与预期的片段大小基本一致,但测序分析均为非目的片段,为非特异PCR产物,一例为非靶序列间的重复序列配对造成,一例为一侧引物单独引起,重新设计引物,采用巢式PCR获得了目的基因片段。     

程序化设计简并引物与克隆小菜蛾酯酶基因

利用遗传密码简并性 ,针对特定的氨基酸序列设计简并引物 ,是克隆蛋白质家族cDNA的常规方法。文章介绍了利用blastp ,blockmaker,CodeHop ,SwissProt,SpTrEMBL等网络工具及数据库设计昆虫抗性酯酶的简并引物。用这对引物从抗有机磷杀虫剂的小菜蛾Plutellaxylostella中克隆了 1段cDNA。经blastx检索genebank,发现此cDNA产物与其它昆虫抗性酯酶基因有高度的相似性。研究表明 ,程序化设计的简并引物可信性强 ,阳性率高 ,能迅速得到满意结果     

随机引物在分子生物学研究中的应用

随机引物指非特异序列的寡聚核苷酸作为DNA合成过程中的引物, 是相对于特异引物的概念.90年代它与PCR技术结合衍生了几项新技术:采用不同长度随机引物进行DNA指纹分析而衍生出的RAPD、AP-PCR及DAF方法; 进行mRNA多态分析的“差异显示”; 以及rPCR, T-PCR等技术. 以RAPD为例介绍了随机引物PCR的技术特点及其在分子生物学研究中的应用.