端粒长度及变化规律

端粒是位于染色体末段的一种特殊结构 ,具有维持染色体稳定的功能。不同的细胞 ,同一细胞的不同染色体具有不同的端粒长度 ;端粒长度是由基因控制的 ,并受到各种外界因素的影响 ;端粒长度随细胞的增殖与分化而缩短或者延长 ,细胞内在的端粒长度调控机制控制着端粒长度在一定的范围内变化。本文还分析了在端粒长度研究方面存在的问题     

荧光定量PCR技术及其应用

荧光定量ＰＣＲ是新研制出的一种核酸定量技术。该技术在ＰＣＲ反应系统中引入了荧光标记探针,具有高灵敏性、高特异性和高精确性的特点。目前已被应用于病原体测定、肿瘤基因检测、基因表达、突变和多态性研究等多个领域。     

荧光定量PCR技术研究进展

基于荧光能量传递技术的荧光定量PCR技术可实时监测PCR反应 ,准确敏感地测定模板浓度及检测基因变异等 ,它的出现 ,极大地克服了原有PCR技术存在的不足如交叉污染等问题 ,并改善了PCR技术的应用如可广泛应用于临床观测患者病情发展及预后 ,判断药物疗效等。本文概述了目前几种荧光定量PCR技术即Taqman、Amplisensor、分子信标、Lightcycler及复合探针法的原理及特点。便于更好地理解及应用这项技术。     

应用实时荧光定量PCR快速分子诊断唐氏综合征

目的探讨一种快速、准确诊断唐氏综合征的方法。方法采用实时荧光定量PCR技术，对25例唐氏患者、50名正常人外周血标本，扩增21号及1号、19号染色体上的多态位点，定量分析比较正常组及唐氏患者组的4对△Ct值。结果唐氏患者组△Ct值明显低于正常组，两组比较差异有统计学意义（P〈0．001）。初步建立了临床应用的参考值范围，可以有效区分出唐氏样本和正常样本。结论应用实时荧光定量PCR技术可快速、准确诊断唐氏综合征，为唐氏综合征的快速产前诊断开辟了新的途径。     

双色竞争性荧光定量PCR检测唐氏综合征

目的 建立一种快速检测唐氏综合征(Down syndrome,DS)的双色竞争性荧光定量聚合酶链反应(dual-color competitive quantitative fluorescent polymerase chain reaction,DCC-QF-PCR)方法,并探讨其应用于DS产前诊断的可能性.方法 提取30例DS患者和60名正常人的外周血DNA,设计DSCR和USC2两基因的特异共用引物和双色特异性TaqMan探针,同一反应管中进行两基因的DCC-QF-PCR,并与DSCR和GAPDH两基因的QF-PCR实验结果进行比较.提取46份羊水胎儿细胞的DNA进行DSCR和USC2两基因的DCC-QF-PCR,并与染色体核型分析结果对比;克隆出DSCR和USC2的单克隆基因片段,定量后进行定量配比的DCC-QF-PCR,并计算DSCR∶USC2拷贝数的比值.结果 DCC-QF-PCR检测中,DS患者DSCR∶USC2拷贝数比值范围为1.41～1.74,显著高于正常人的0.93～1.15;而QF-PCR检测中,DSCR∶GAPDH拷贝数比值范围较DSCR∶USC2增大.46份羊水检测中,3份DSCR∶USC2拷贝数比值分别为1.61、1.64和1.54,为DS患儿,其余43份正常,与染色体核型分析结果一致;DSCR与USC2基因定量配比的DCC-QF-PCR所得DSCR∶USC2拷贝数比值范围与配比值差异无统计学意义(P＞0.05),检测结果较为稳定.结论 DCC-QF-PCR具有准确、快速、需模板量少和费用低廉等特点,该方法在DS的基因诊断和产前基因诊断中有较为广泛的应用前景.     

实时荧光定量PCR在医学遗传学方面的应用

实时荧光定量 PCR是近年来发明使用的一种核酸检测技术 ,因高精确度、高灵敏性、污染少 [2 ,3]等优点已在生物医学基础科研及医学临床中得到广泛应用 ,本文就其在遗传学方面的应用作简要综述     

实时荧光定量PCR在医学遗传学方面的应用

实时荧光定量PCR是近年来发明使用的一种核酸检测技术，因高精确度、高灵敏性、污染少^[2,3]等优点已在生物医学基础科研及医学临床中得到广泛应用，本文就其在遗传学方面的应用作简要综述。     

端粒长度与卵巢功能的相关性研究

目的探索端粒长度变化与女性卵巢功能的关系及其临床意义。方法在本院2006.3～2008.7住院治疗的各个年龄段的育龄女性及卵巢早衰患者正常卵巢组织标本66例,常规酚一氯仿法提取组织DNA后与端粒寡聚核苷酸探针进行Southern blot杂交、γ-32P检测及光密度扫描法测定端粒平均长度。结果各年龄段TRF值随着年龄的增长,其TRF值有下降的趋势,在20～35岁,36～55岁两年龄段之间无统计学差异,在35岁后其TRF值为6.64+0.21kb,在56岁后其TRF值为4.41+0.09kb,进行统计学分析后有统计学显著性差异。当FSH值小于30U/L时,其TRF值虽有下降趋势,无明显统计学差异,而FSH为31～40U/L时,其TRF值5.76±0.23kb,与前2组相比较有明显统计学差异;卵巢早衰组与正常绝组的TRF相比有明显统计学差异,卵巢早衰组女性的TRF值明显长于正常绝经组。结论对于正常女性来说,卵巢皮质TRF长度可以在一定程度上反映卵巢功能及生育能力,由于导致卵巢早衰的病因复杂及影响端粒长度的因素较多,导致端粒长度变化与卵巢功能相关性的临床意义尚未完全确定。     

荧光定量PCR检测查菲埃立克体

依据查菲埃立克体16SrRNA基因序列设计特异性引物和TaqMan-MGB探针,以克隆的查菲埃立克体16SrRNA基因片段作DNA模板,建立实时荧光定量PCR检测方法。与套式PCR相比较,荧光定量PCR检测的灵敏度是其30倍;用荧光定量PCR检测其他相关立克次体和细菌DNA样本,检出结果为0;对荧光定量PCR检测重复性进行分析,变异系数(CV)批内和批间误差在0·2%~2·0%之间。结果证明本研究建立的荧光定量PCR方法具有种特异性和良好的重复性,可用于检测感染样本中的微量查菲埃立克体DNA。     

荧光定量 PCR与半定量PCR检测HBV DNA的对比分析

目的：对照分析荧光定量PCR与半定量PCR检测血清HBV DNA的载量，为临床基因检测实验室提供方法学选择依据。 方法： 取164份临床检测标本各用荧光定量PCR与半定量PCR检测，结果作统计学分析。 结果: 两种检测方法的灵敏度和特异度没有显著差异（χ2 =1.75，P>0.05）。 结论: 临床基因检测实验室可用半定量PCR法替代荧光定量 PCR法检测血清HBV DNA的载量。     

实时荧光定量PCR方法检测非霍奇金淋巴瘤患者B淋巴细胞刺激因子表达水平

目的:建立实时荧光定量PCR方法(RFQ-PCR)检测非霍奇金淋巴瘤(NHL)患者B淋巴细胞刺激因子(BAFF)表达水平。方法:47例NHL患者及20例健康对照,采用实时荧光定量PCR方法检测其外周血单个核细胞中的B淋巴细胞刺激因子表达水平。结果:RFQ-PCR检测BAFF含量的示灵敏度为10 pg/ml,低浓度样本批内和批间变异系数(CV)分别为8.56%和11.32%,高浓度样本批内和批间CV分别为0.76%和4.58%。NHL患者和健康对照者BAFF mRNA表达量分别为(0.48±0.023,0.25±0.023),两者具有显著性差异(P=0.0001)。结论:RFQ-PCR检测BAFF mRNA含量的方法,具有较好的检测灵敏度和重复性。NHL患者BAFF mRNA高表达,提示BAFF可能在NHL发生发展中发挥重要作用。     

利用荧光定量PCR技术对人肠道乳酸杆菌进行定量检测

目的应用荧光定量PCR技术对人粪便内乳酸杆菌进行定量检测,建立乳酸杆菌的荧光定量PCR检测体系。方法依据人肠道乳酸杆菌16S rDNA序列设计属特异性引物,应用荧光定量PCR技术检测乳酸杆菌的16S rDNA,对粪便中的乳酸杆菌进行定量检测和分析,并与用传统方法所获得的结果进行比较。结果荧光定量PCR检测乳酸杆菌和传统方法检测乳酸杆菌获得的结果接近,差异无统计学意义（P〉0.05）。结论荧光定量PCR技术比传统方法省时、省力,且敏感性和特异性更高。     

实时荧光定量PCR快速分子诊断唐氏综合征

目的　探讨快速诊断唐氏综合征的检测方法 .方法　采用实时荧光定量PCR技术 ,检测唐氏患者 2 3例、正常人 33例 ,定量分析比较ΔCt值 .结果　正常组和唐氏组ΔCt值有显著性差异 (p <0 .0 0 1) ,并建立了相应的参考值范围 .结论　实时荧光定量PCR具有简单、快速、特异性高等优点 ,可用于快速诊断唐氏综合征     

Rapid detection of chromosome aneuploidies by quantitative fluorescence PCR: first application on 247 chorionic villus samples

We report the results of the first major study of applying quantitative fluorescence polymerase chain reaction (QF-PCR) assays for the detection of major chromosome numerical disorders. The QF-PCR tests were performed on a total of 247 chorionic villus samples, which were analysed blind, without any knowledge of the results obtained using conventional cytogenetic analysis. The aims of this investigation were to evaluate the detection power and accuracy of this approach by testing a large number of fetal samples and to assess the diagnostic value of each of the chromosome specific small tandem repeat (STR) markers used. In addition, we introduced three more markers specific for chromosomes 13, 18, and X to allow an accurate analysis of samples homozygous for a particular STR. Fluorescent labelled primers were used to amplify 12 STRs specific for chromosomes 21, 18, 13, X, and the amylogenin-like DNA sequence AMXY, expressed on the X and Y chromosomes. In this blind study of 247 fetal samples, 222 were correctly diagnosed by QF-PCR as normal for each of the five chromosomes investigated; 20 were diagnosed by QF-PCR as trisomic for chromosomes 21, 18, or 13, in agreement with the cytogenetic tests. Only one false negative result was observed, probably owing to the mishandling of the sample, which had been transferred through three laboratories before being analysed by QF-PCR. The 247 samples also included four cases of mosaicism or translocation; one case of mosaic trisomy 21 was detected by QF-PCR and the other cases were not identified by QF-PCR. The results of this investigation provide clear evidence that the QF-PCR assays are powerful adjuncts to conventional cytogenetic techniques and can be applied for the rapid and accurate prenatal diagnosis of the most frequent aneuploidies.     

Effect of tissue fixatives on telomere length determination by quantitative PCR

Telomere length is a well established marker of cellular senescence and thus biological age. Quantitative PCR allows the determination even from very low amounts of tissue by using telomere specific and single copy gene primers. Comparing a directly processed tissue sample to a 4% formaldehyde fixed one showed a significantly reduced efficiency of PCR reactions (mainly in single copy gene experiments) in a storage time-dependent manner resulting in an artificial increase in reported relative telomere length. This effect was not seen when the tissue was stored in RNA later solution. In summary, telomere length determination from formaldehyde fixed material by quantitative PCR is not a reliable method. Unfortunately therefore, many easily accessible tissue samples from pathology laboratories are unsuitable for this technique.     

实时荧光定量PCR检测幼儿腹泻腺病毒

目的:建立实时荧光定量PCR方法,并检测腺病毒Ad40或Ad41感染的粪便标本。方法:用T-A克隆技术构建含腺病毒基因的载体作为标准模板,采用Taqman探针标记技术,建立实时荧光定量PCR方法。采集幼儿腹泻标本248例,分别用直接免疫荧光法和实时荧光定量PCR检测腺病毒Ad40和Ad41,比较两种方法的阳性检出率。结果:实时荧光定量PCR灵敏度和准确度(95.60%和96.80%)均高于直接免疫荧光法(78.5%和82.40%)(P0.05),而两者特异度差异无统计学意义(97.30%vs 96.70%,P0.05)。248例待检样本,直接免疫荧光法检出率为2.42%(6/248),实时荧光定量PCR检出率为7.66%(19/248),明显高于直接免疫荧光法(χ2=3.675,P0.05)。结论:成功建立实时荧光定量PCR检测腺病毒Ad40或Ad41方法。其灵敏度、准确度和阳性检出率经均优于直接免疫荧光法,且简便快速。     

Quantitative PCR for HTLV‐1 provirus in adult T‐cell leukemia/lymphoma using paraffin tumor sections

Detection of HTLV‐1 provirus using paraffin tumor sections may assist the diagnosis of adult T‐cell leukemia/lymphoma (ATLL). For the detection, non‐quantitative PCR assay has been reported, but its usefulness and limitations remain unclear. To our knowledge, quantitative PCR assay using paraffin tumor sections has not been reported. Using paraffin sections from ATLLs and non‐ATLL T‐cell lymphomas, we first performed non‐quantitative PCR for HTLV‐1 provirus. Next, we determined tumor ratios and carried out quantitative PCR to obtain provirus copy numbers. The results were analyzed with a simple regression model and a novel criterion, cut‐off using 95 % rejection limits. Our quantitative PCR assay showed an excellent association between tumor ratios and the copy numbers (r = 0.89, P < 0.0001). The 95 % rejection limits provided a statistical basis for the range for the determination of HTLV‐1 involvement. Its application suggested that results of non‐quantitative PCR assay should be interpreted very carefully and that our quantitative PCR assay is useful to estimate the status of HTLV‐1 involvement in the tumor cases. In conclusion, our quantitative PCR assay using paraffin tumor sections may be useful for the screening of ATLL cases, especially in HTLV‐1 non‐endemic areas where easy access to serological testing for HTLV‐1 infection is limited.     

荧光定量PCR技术检测结核DNA在不同类型样本中的应用

目的 探讨荧光定量PCR技术检测结核DNA在不同类型样本中的阳性率。方法 收集2016年1月~2018年3月在我院进行结核DNA检测的9020例患者,运用荧光定量PCR技术检测不同类型的样本。结果 9020例患者中,检测结果阳性1220例,总阳性率13.53%;痰液检测5688例,检测结果阳性741例,总阳性率13.03%;肺泡灌洗液检测1799例,检测结果阳性363例,总阳性率20.20%;脑脊液检测704例,检测结果阳性40例,总阳性率5.68%;胸水检测559例,检测结果阳性35例,总阳性率6.26%;腹水检测62例,检测结果阳性6例,总阳性率9.68%;尿液检测193例,检测结果阳性35例,总阳性率18.13%;心包积液检测15例,检测结果阳性0例,总阳性率0。结论 荧光定量PCR技术检测结核DNA具有特异、灵敏、快速、准确等特点,但临床医生应根据症状体征等选择合适的临床标本进行结核DNA的检测,将进一步提高阳性率,明确诊断。