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2016年湖北省部分地区手足口病肠道病毒病原谱及柯萨奇病毒A6型和A10型基因特征分析
引用本文:李静,张婷,邹文菁,杨朝晖,占建波. 2016年湖北省部分地区手足口病肠道病毒病原谱及柯萨奇病毒A6型和A10型基因特征分析[J]. 疾病监测, 2017, 32(6): 462-466. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2017.06.006
作者姓名:李静  张婷  邹文菁  杨朝晖  占建波
作者单位:1.湖北省疾病预防控制中心, 湖北 武汉 430079
基金项目:2017-2018年度湖北省卫生计生委面上项目(No.WJ2017M137)This study was supported by the fund for General Project of Hubei Provincial Health and Family Planning Commission
摘    要:目的 了解2016年湖北省部分地区手足口病病原谱特征,对其中的柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)和A组10型(Cox A10)基因特征进行分析。方法 采集2016年湖北省部分地区手足口病患者阳性标本,提取病毒核酸,通过一步法反转录-PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对其中Cox A6和Cox A10的VP1全长序列进行同源性和系统进化分析。结果 病原学监测结果显示,肠道病毒71型(EV71)阳性率为29.4%(599/2 035),柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)阳性率为25.7%(522/2 035),其他肠道病毒阳性率为44.9%(914/2 035)。对该地区收集的83份肠道通用阳性的非EV71和非Cox A16进行病毒分型分析,Cox A6阳性检出率为56.6%(47/83),Cox A10阳性检出率为22.9%(19/83),还检测出其他肠道病毒如Cox A2(2株)、Cox A4(7株)、CB4(2株)、CB5(2株)、CB6(1株)、Echo5(1株)、Echo9(1株)和Echo25(1株)。对Cox A6和Cox A10的VP1基因同源性比对及系统进化分析显示,2016年湖北省22株Cox A6的VP1基因核苷酸同源性为95.1%~100.0%,11株Cox A10的VP1基因核苷酸同源性为95.2%~100.0%。我国与其他国家Cox A6和Cox A10可分别划分为8个(A~H)和7个基因谱系(A~G)。湖北省Cox A6与我国其他Cox A6位于H基因谱系上;湖北省Cox A10与我国其他Cox A10位于G基因谱系上。结论 2016年湖北省部分地区手足口病病原体除了EV71和Cox A16两种主要病毒外,还检测出Cox A6和Cox A10等手足口病的病原。其他肠道病毒中以Cox A6和Cox A10为主,仍需进一步加强对其他肠道病毒的监测和分子流行病学特征的分析。

关 键 词:手足口病   柯萨奇病毒A组6型   柯萨奇病毒A组10型   VP1基因   基因特征
收稿时间:2017-02-05

Pathogen spectrum of hand,foot and mouth disease and genetic characteristics of VP1 of coxsackievirus A6 and A10 in some areas of Hubei, 2016
LI Jing,ZHANG Ting,ZOU Wen-jing,YANG Zhao-hui,ZHAN Jian-bo. Pathogen spectrum of hand,foot and mouth disease and genetic characteristics of VP1 of coxsackievirus A6 and A10 in some areas of Hubei, 2016[J]. Disease Surveillance, 2017, 32(6): 462-466. DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2017.06.006
Authors:LI Jing  ZHANG Ting  ZOU Wen-jing  YANG Zhao-hui  ZHAN Jian-bo
Affiliation:1.Hubei Provincial Center for Disease Control and Prevention, Wuhan 430079, Hubei, China
Abstract:
Keywords:Hand foot and mouth disease  Coxsackievirus A6  Coxsackievirus A10  VP1 gene  Genetic characteristic
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