|
|||||
|
|
| 急性和慢性髓性白血病细胞中可变剪接事件的识别 | |
| 引用本文： | 郑芳芳,何涛,姜敏.急性和慢性髓性白血病细胞中可变剪接事件的识别[J].军事医学科学院院刊,2015(5). |
| 作者姓名： | 郑芳芳 何涛 姜敏 |
| 作者单位： | 1. 苏州大学电子信息学院，江苏苏州 215006; 军事医学科学院生物工程研究所，北京 100071 2. 军事医学科学院生物工程研究所,北京,100071 3. 苏州大学电子信息学院,江苏苏州,215006 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目 |
| 摘 要： | 目的：为揭示异常的可变剪接在肿瘤中发挥的作用，着重研究急性髓性白血病（ AML）与慢性髓性白血病（CML）内显著差异的可变剪接事件以及剪接异构体。方法基于CML（K562）和AML（THP1、HL－60）细胞系的全转录组测序数据，在全基因组范围内采用TopHat、MATS和Cufflinks计算识别可变剪接事件、重构剪接异构体和分析其差异表达。结果在AML和CML细胞间识别的130个基因在CML细胞系中特异性高表达，80个基因在AML两株细胞系内均表达上调。在CML与AML之间识别了337个差异表达的剪接异构体以及35个差异可变剪接事件。结论 AML与CML细胞系间存在显著差异的可变剪接事件和剪接异构体。白血病相关的可变剪接事件可作为其潜在的标志物或药物靶标。 |
| 关 键 词： | 可变剪接 高通量测序 白血病 |
Identification of alternative splicing events in acute myeloid leukemia and chronic myeloid leukemia cells |
|
| ZHENG Fang-fang,HE Tao,JIANG Min.Identification of alternative splicing events in acute myeloid leukemia and chronic myeloid leukemia cells[J].Bulletin of the Academy of Military Medical Sciences,2015(5). | |
| Authors: | ZHENG Fang-fang HE Tao JIANG Min |
| Abstract: | |
| Keywords: | alternative splicing high-throughput sequencing leukemia |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ | |
