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基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪干预腹膜纤维化的机制
引用本文:朱项君,李柠,吕丹,魏萍,俞曼殊,盛梅笑,张露.基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪干预腹膜纤维化的机制[J].现代药物与临床,2022,37(4):700-707.
作者姓名:朱项君  李柠  吕丹  魏萍  俞曼殊  盛梅笑  张露
作者单位:南京中医药大学附属医院 江苏省中医院,江苏 南京 210009
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81503533);江苏省“六大人才高峰”项目(WSN-021);江苏省自然科学基金面上项目(BK20211393)
摘    要:目的 运用网络药理学方法及分子对接技术探讨黄芪干预腹膜纤维化的可能机制。方法 利用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)检索黄芪的主要化学成分及靶点,并补充文献报道相关药理作用的成分作为潜在活性成分。以"peritoneal fibrosis"为关键词分别在OMIM、Genecards获取目前已知的与腹膜纤维化相关的疾病靶点,后取两者的交集靶点;对交集基因通过STRING数据库与Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络及蛋白互作(PPI)网络并筛选核心网络。基于R软件使用Bioconductor生物信息软件对核心靶点进行GO及KEGG富集分析,最终采用AutoDock软件将主要有效成分与核心靶点进行分子对接,得出其结合能力。结果 筛选出20个黄芪活性成分及文献报道有相关药理作用4个, 457药物作用靶点,与674个腹膜纤维化病靶点取交集,得到86个共同靶点。GO功能富集分析提示黄芪拮抗腹膜纤维化主要参与了蛋白激酶B信号转导的调节、细胞对化学的应激反应、炎症反应的调节等通路; KEGG通路富集分析主要涉及调控肿瘤、磷脂酰肌醇-3-羟激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、人类巨细胞病毒感染、HIF-1信号通路等;分子对接结果显示关键靶点与活性成分具有较好的结合能力。结论 黄芪治疗腹膜纤维化的分子机制,可能与抑制炎症及氧化应激反应、调节多种信号通路等相关。

关 键 词:黄芪  网络药理学  腹膜纤维化  分子对接  机制
收稿时间:2022/1/9 0:00:00

Mechanism of Astragali Radix intervention in peritoneal fibrosis based on network pharmacology and molecular docking technology
ZHU Xiang-jun,LI Ning,LüDan,WEI Ping,YU Man-shu,SHENG Mei-xiao,ZHANG Lu.Mechanism of Astragali Radix intervention in peritoneal fibrosis based on network pharmacology and molecular docking technology[J].Drugs & Clinic,2022,37(4):700-707.
Authors:ZHU Xiang-jun  LI Ning  LÜDan  WEI Ping  YU Man-shu  SHENG Mei-xiao  ZHANG Lu
Affiliation:Affiliated Hospital of Nanjing University of Chinese Medicine, Jiangsu Province Hospital of Chinese Medicine, Nanjing 210009,;China
Abstract:
Keywords:Astragali Radix  network pharmacology  peritoneal fibrosis  molecular docking  mechanism
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