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不明原因复发性流产中铁死亡的生物信息学分析及验证
引用本文:张凤,覃颖,廖玉萍,苏莎,谭雪梅,周卓琳,黄世金,钟琳琳,冯春泉,庞丽红.不明原因复发性流产中铁死亡的生物信息学分析及验证[J].广西医科大学学报,2023(5):843-849.
作者姓名:张凤  覃颖  廖玉萍  苏莎  谭雪梅  周卓琳  黄世金  钟琳琳  冯春泉  庞丽红
作者单位:1. 广西医科大学第一附属医院产前诊断与遗传病诊断科;2. 贵港市人民医院产科;3. 广西医科大学第一附属医院妇产科;4. 广西中医药大学第一附属医院产科;5. 广西地中海贫血防治重点实验室;6. 国家卫生健康委地中海贫血防治重点实验室(广西医科大学);7. 广西医科大学区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室;8. 广西区域性高发肿瘤早期防治研究重点实验室
摘    要:目的:探究铁死亡关键基因在不明原因复发性流产(URSA)发生发展中的作用,初步确定潜在生物标志物。方法:从基因表达综合(GEO)数据库下载数据集GSE26787,利用GEO2R筛选差异表达基因(DEGs);从FerrDb V2数据库下载铁死亡相关基因;DEGs与铁死亡基因取交集获得URSA铁死亡相关基因;利用DAVID数据库对URSA铁死亡相关基因进行基因本体(GO)富集及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;利用String数据库和Cytoscape软件分析蛋白互作网络,筛选Hub基因;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测Hub基因在人工流产组及URSA组患者蜕膜组织中mRNA的表达水平。结果:共筛选出55个URSA铁死亡基因;GO功能富集提示URSA铁死亡相关基因主要在自噬调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录正调控、膜的整体组分、酶及p53蛋白受体结合富集。KEGG通路分析显示URSA铁死亡基因富集最明显的为FoXO信号通路。采用String数据库及Cytoscape软件筛选出的URSA铁死亡关键基因分别为EGFR、SRC、KRAS、MDM2。RT-qPCR检测结果显示,...

关 键 词:不明原因复发性流产  铁死亡  差异表达  关键基因
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