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亚洲带绦虫成虫延伸因子-1基因的克隆和分析
引用本文:庞建新,黄江,胡旭初,徐劲,余新炳,包怀恩,郎书源.亚洲带绦虫成虫延伸因子-1基因的克隆和分析[J].热带医学杂志,2007,7(6):513-515.
作者姓名:庞建新  黄江  胡旭初  徐劲  余新炳  包怀恩  郎书源
作者单位:1. 南方医科大学药学院新药评价中心,广州,510515
2. 贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳,550004
3. 中山大学中山医学院寄生虫学教研室,广州,510080
摘    要:目的分析和预测亚洲带绦虫成虫延伸因子-1(elongation factor 1,EF-1)基因及其编码的蛋白的结构和功能。方法利用生物信息网站如美国国家生物技术信息中心(NCBI,http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http:∥ca.expasy.org/)中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具,结合其它生物信息学分析软件包,从亚洲带绦虫成虫全长cDNA质粒文库中识别延伸因子-1的全长编码基因并预测其蛋白的结构和功能。结果该基因是全长基因,长度988bp,编码区为67~868,编码269个氨基酸,无跨膜区;与GenBank中细粒棘球绦虫同源基因的一致性达87%,相似性达91%;预测三个主要的抗原表位位于135~140,126~131,157~162。结论应用生物信息方法从亚洲带绦虫成虫cDNA文库中筛选出EF-1基因。

关 键 词:亚洲带绦虫  延伸因子-1  生物信息学
文章编号:1672-3619(2007)06-0513-03
修稿时间:2007-01-202007-03-10

Screening of EF-1 Gene, the Functional Gene of Adult Taenia asiatica by Bioinformatical Method
PANG Jian-xin,HUANG Jiang,HU Xu-chu,XU Jin,YU Xin-bing,BAO Huai-en,LANG Shu-yuan.Screening of EF-1 Gene, the Functional Gene of Adult Taenia asiatica by Bioinformatical Method[J].Journal Of Tropical Medicine,2007,7(6):513-515.
Authors:PANG Jian-xin  HUANG Jiang  HU Xu-chu  XU Jin  YU Xin-bing  BAO Huai-en  LANG Shu-yuan
Affiliation:1. School of Pharmaceutical Science, Southern Medical University, Guangzhou 510515; 2. Department of Parasitology, Guiyang Medical College, Guiyang 550004 ; 3. Department of Parasitology , Zhongshan School of Medicine, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510080, China
Abstract:
Keywords:cDNA
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