| 基于mRNA-Seq数据筛选Mn2+调控小鼠巨噬细胞的差异表达基因及功能的初步分析 |
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| 作者姓名： | 吴双双 马金柱 |
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| 作者单位： | 黑龙江八一农垦大学,黑龙江八一农垦大学 |
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| 基金项目： | 黑龙江省自然科学基金联合引导项目（LH2019C047）；留学归国科研启动基金计划项目（ZRCLG201905）；黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目（YJSCX2021-Y104）；大庆市指导性科技项目（zd-2020-62）；大学生创新创业训练计划项目（202110223005，202110223007） |
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| 摘 要： | 对Mn2+调控的小鼠巨噬细胞mRNA进行测序和生物信息学分析，筛选出差异表达的基因并分析其生物学功能，探究Mn2+对小鼠巨噬细胞的调控作用。采用MnCl2 和NaCl分别处理小鼠腹腔巨噬细胞24 h，利用mRNA-Seq方法筛选出Mn2+调控巨噬细胞的差异表达基因，并对差异基因进行京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomesm, KEGG）和基因本体论（Gene Ontology, GO）通路富集分析及qRT-PCR的验证。通过整合数据库信息和分析获得1637个差异表达基因，其中表达明显上调的基因有912个，表达明显下调的基因有725个，其中与免疫相关差异最显著的10个基因qRT-PCR验证结果与mRNA测序分析趋势一致。GO富集分析表明10个差异基因具有免疫吞噬、细胞增殖和分化及转录因子调控等生物活性，KEGG通路主要富集在PI3-Akt、NF-κB信号通路。通过mRNA-Seq数据筛选Mn2+调控小鼠巨噬细胞的差异表达基因及其GO和KEGG富集分析，结果表明Mn2+对巨噬细胞具有明显的免疫调节作用。
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| 关 键 词： | mRNA-Seq分析 巨噬细胞 Mn2+ qRT-PCR |
| 收稿时间： | 2021/9/28 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/1/4 0:00:00 |
Screening and Functional Initial Analysis of Differentially Expressed Genes in Mouse Macrophages Regulated by Mn2+ on mRNA-Seq Data |
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| Authors: | wushuangshuang and majinzhu |
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| Affiliation: | Heilongjiang Bayi Agricultural university |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | mRNA-Seq analysis macrophages Mn2+ qRT-PCR |
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