埃博拉病毒2014年毒株的基因组变异特征分析

目的 2014年在西非国家暴发的埃博拉疫情，与既往的疫情相比，流行病学特征有所改变，即病毒的致死能力减弱、人际传播能力增强。本文拟通过对埃博拉病毒2014年毒株基因组共102株序列的分析，研究其变异特征，探讨病毒基因组变异与其流行病学特征改变之间的关系。 方法 选取NCBI公共数据库中埃博拉病毒全基因组序列，应用mummer3.0软件分析病毒基因组变异特征；使用MEGA5软件进行蛋白进化分析；应用CPHmodels和PyMOL软件，根据蛋白同源性模拟蛋白的三维构型。 结果 埃博拉病毒2014年毒株（扎伊尔型）基因组中，共有606个位点发生变异，其中有49个变异位点是2014毒株特有的、并导致所编码的氨基酸发生非同义突变。特别是NP蛋白第128位、GP蛋白第82位和L蛋白第1951位氨基酸，不仅在2014年之前所有的扎伊尔型毒株中是保守不变的，而且在其余埃博拉病毒亚型之间也是高度保守的，但在2014毒株中却发生了特异性的变异。 结论 埃博拉病毒2014年毒株基因组具有独特的变异特征，使得NP、GP和L蛋白发生变异，特别是GP蛋白第82位氨基酸由丙氨酸突变为缬氨酸，将影响其所在的?螺旋的稳定性，这可能是2014年毒株致死能力减弱和传播能力增强的原因之一。基因组变异是否直接导致此次疫情中病毒流行病学特征改变，还需要进一步的实验研究证实。

Characteristics of genome variations of Ebola viruses in 2014 epidemic